このユーティリティは、ABI PRISM® 310 ジェネティックアナライザまたは ABI PRISM® 377
DNA Sequencer で作成されたデータからマトリックスファイルを作成するために使用します。
マトリックスファイルは、異なる 2 つの種類のデータから作成できます。
• データ内に A、G、C、T が適切に分散されている 1 つのサンプルファイル
• マトリックススタンダードデータファイル
これらのファイルには、サンプル当たり 1 色のみが含まれています。
1 つのサンプル ファイルの使用
1 つのサンプルファイルからマトリックスを作成するには
1. 「Tools」>「Make Matrix」を選択します。「Make Matrix」ダイアログボックスが開きます。
2. 「Single File (all dyes)」のラジオボタンが選択されていることを確認してください。
3. 1 行目の横にあるボタンをクリックします。「Open」ダイアログボックスが開きます。
4. マトリックスに使用するファイルを選択し、「Open」をクリックします。
E
Sequencing Analysis におけるマトリックスファイルの作成
5. 新規のマトリックスファイルの名前を、拡張子 .mtx を付けて入力します。
重要！パスは変更せずに、マトリックス名のみを変更してください。
ファイルがドライブ名:\AppliedBiosystems\SeqA5.1\AppSeqA\bin\Basecaller\
Matrix\matrixname.mtx に保存されていない場合、Sample Manager または Analysis
Protocol 内でマトリックスを選択することはできません。
6. 「Make Matrix」をクリックします。
マトリックスが正常に作成された場合、次のメッセージが表示されます。
「OK」をクリックして、作成されたマトリックスファイルと「Make Matrix」ダイアロ グボックスを閉じます。
マトリックス スタンダード ファイル の使用
4 つのマトリックススタンダードファイルからマトリックスを作成するには
1. 「Tools」>「Make Matrix」を選択します。「Make Matrix」ダイアログボックスが開きます。
4. マトリックスの作成に使用するファイルの 1 つを選択し、「Open」をクリックします。
E
5. 手順 3 と 4 を繰り返して、4 つのファイルすべてを選択します。
重要！緑、青、黄、赤のデータを表すファイルがあることを確認してください。色の順 番は関係ありません。
6. 新規マトリックスの名前を、拡張子 .mtx を付けて入力します。
重要！パスは変更せずに、マトリックス名のみを変更してください。
ファイルがドライブ名:\AppliedBiosystems\SeqA5.1\AppSeqA\bin\Basecaller\
Matrix\matrixname.mtx に保存されていない場合、Sample Manager または Analysis
Protocol 内でマトリックスを選択することはできません。
7. 「Make Matrix」をクリックします。
マトリックスが正常に作成された場合、次のメッセージが表示されます。
「OK」をクリックして、作成されたマトリックスファイルと「Make Matrix」ダイアロ グボックスを閉じます。