アナリシスレポートには、データ解析の成功および失敗（またはそのいずれか）が表示され ます。アナリシスレポートは、Sample Manager に追加されたサンプルすべてに対して作成で きます。データが解析されている場合、レポートには、QV と LOR の要約、および個々のサ ンプル情報とエラーが表示されます。データが未解析の場合、レポートにはステータス情報が 表示されます。レポートは、トラブルシューティングに役立ち、レポートを使用するとデータ クオリティの評価を簡単に行うことができます。これは、タブ区切りファイルとしてエクス ポートし、Microsoft® Excel ソフトウェアで開いて傾向の分析に使用することができます。
アナリシス レポートの 表示
レポートを表示するには、「Analysis」>「Analysis Report」を選択するか、 をクリック
します。Applied Biosystems では、解析の後、レポートを閲覧してから各サンプルファイル
を確認することをお勧めします。
図7-1 アナリシスレポートの例
「 Analysis Report 」 ウィンドウの項目
レポートでは、情報が 4 つの表に分かれています。
「Errors」表 下線付きのサン
プルは、Sample Manager 内の 特定サンプルに リンクされてい ます。
部分的出力と失敗 したサンプルは、
「Errors」表内の 特定のサンプルに リンクされていま す。
QV 範囲の定義
LOR 範囲の定義
ビュー設定は ここで変更します。
右クリックして、
カラムを表示/非 表示させます。
表7-1 アナリシスレポートの項目
表 説明
Summary レポート内の合計サンプル数（Sample Manager 内のサンプル数によ
る）、QV を含むサンプル数、QV 範囲の定義を表示 Length of Read (LOR) LOR 範囲と色の定義、各範囲内のサンプル数を表示
Sample Details サンプルの統計値を表示。
各サンプルは Sample Manager 内の特定のサンプルにリンクされてい
アナリシスレポートについて
「 Summary 」表
レポートのこの部分では、レポート内のサンプル数と Quality Value の要約が表示されます。「 Length of Read (LOR) 」表
レポートのこの部分では、LOR の高さに関する情報の要約が表示されます。
LOR は、使用可能なクオリティの高いまたは高精度塩基の範囲で、Quality Value によって決 定されます。LOR 情報は、アナリシスレポートを開いたときに計算されます。
注：LOR 情報は、KB Basecaller で解析されたサンプルに対してのみ表示されます。
Errors 解析およびポストプロセシング中に発生したエラーを表示。
各サンプルは Sample Manager 内の特定のサンプルにリンクされてい ます。
表7-1 アナリシスレポートの項目（続き）
表 説明
表7-2 「Summary」表の項目
カラム 説明
Sample Files レポート内の合計サンプル数。この数値は、Sample Manager 内の
サンプル数によって決まります。
Sample Files with QV KB Basecaller で解析された QV を含むサンプルの合計数 Low、Medium、または
High QV
QV の高さの範囲
注：範囲は「Display Settings」で定義されています。詳細につい ては、9-4 ページの「「Sample File Display」セクション」を参照 してください。
表7-3 「LOR」表の項目
カラム 説明
Low LOR 低 LOR 結果の範囲と色。*デフォルトの色は赤です。
Medium LOR 中 LOR 結果の範囲と色。デフォルトの色は黄です。
High LOR 高 LOR 結果の範囲と色。デフォルトの色は青です。
「 Sample Details 」表
レポートのこの部分には、各サンプルのリストと、それに関連した解析情報が表示されます。注：QV、サンプルスコア、LOR、シグナル/ノイズの情報は、KB Basecaller で解析された サンプルに対してのみ表示されます。
この表で、「N/A」は未解析、またはこのセッションでは解析不可であることを示しています。
*LOR の範囲と色は「Display Settings」で定義されています。詳細については、9-4ページの「「Sample File Display」セクション」を参照してください。
Sample Manager 内のサンプルにリンクされています。
「Errors」表内のサンプルにリンクされています。
表7-4 「Sample Details」表の項目
カラム 説明
Sample File Name サンプルの名前。ファイルは、Sample Manager 内の特定のサン
プルにリンクされています。
BC Status ベースコーリングに対する成功、クオリティの低いデータ、失敗、
未解析を表示
• 緑のアイコン = 成功
• 黄のアイコン = クオリティの低いデータ、部分的な出力（KB Basecaller で解析されたデータのみ）
• 赤のアイコン = 失敗
• N/A = 未解析またはこのセッションでは解析不可
赤または黄のアイコンがあるサンプルは、「Errors」表内の特定サ ンプルにハイパーリンクされています。
PP Status ポストプロセシングの成功、失敗、未解析を表示。
• 緑のアイコン = 成功
• 赤のアイコン = 失敗
• N/A = ポストプロセシングされていないか、このセッションで
はポストプロセシング不可
赤のアイコンがあるサンプルは、「Errors」表内の特定サンプルに ハイパーリンクされています。
アナリシスレポートについて
「 Errors 」表
レポートで、解析およびポストプロセシング中に発生したエラーを表示する部分です。失敗した各サンプルには、Sample Manager 内の特定のサンプルへリンクされています。
Peak 1 サンプルから取得されたファイル内の最初のデータポイントを表
すスキャン番号（プライマーピークは含まない）
Base Spacing サンプルに対して計算された Spacing を表す値。Spacing は、あ
るピークの頂点から次のピークの頂点までのスキャンポイント数 によって定義されます。
Bases with Low, Medium, or High QVs
QV が低い、中程度、または高い範囲にある塩基の数
Sample Score そのサンプルの Clear Range シーケンスにおける塩基の平均
Quality Value
LOR 使用可能な高品質または高精度塩基の範囲で、Quality Value に よって決定されます。
A、G、C or T S/N 値は、サンプル内の「A」、「G」、「C」、または「T」塩基すべての 平均シグナル/平均ノイズを表しています。
Avg S/N サンプル内の塩基すべての平均シグナル/ノイズ値を表す値
表7-4 「Sample Details」表の項目（続き）
カラム 説明
表7-5 「Errors」表の項目
カラム 説明
Sample File Name サンプルの名前
Step Name ベースコーリングまたはポストプロセシング中にエラーが発生し
た場所
Description エラーの説明
Sample Manager 内のサンプルにリンクされています。
Basecaller と DyeSet/Primer ファイルの不一致によるエラー
• KB DyeSet/Primer ファイルと ABI Basecaller を解析に選択した場合、ベース コーリングは成功
（緑の BC ボックス）ですが、解析されたデータは使用できません。
• DT DyeSet/Primer ファイルと KB Basecaller を解析に選択した場合、ベースコーリングは失敗し ます。次のエラーメッセージが「Errors」表に表示されます。
ハイパーリンク
アナリシスレポートでは、サンプルの評価やトラブルシューティングの際にハイパーリンク を利用できます。• アナリシスレポートの「Sample Details」表と「Errors」表内のサンプルは、Sample Manager 内の特定のサンプルファイルにリンクされています。「Sample File Name」カラム内のサ ンプルをクリックすると、対応するファイルが Sample Manager に表示されます。
• 部分的出力（黄のアイコン）、またはベースコーリングあるいはポストプロセシング（赤 のアイコン）で失敗があるサンプルは、「Errors」表にリンクされています。ファイルの黄 または赤のアイコンをクリックすると、「Errors」表内の対応するファイルがハイライトさ れます。
• ハイパーリンクは、アナリシスレポートから Sample Manager への移動のみが可能で、そ の逆の移動はできません。アナリシスレポートに戻るには、 （Analysis Report）をク リックしてください。