遺伝子発現データの混合モデル
遺伝子発現データの クラスタリングの理論的背景
... 各遺伝子のコドン使用は61次元のベクトルとして表現される aaa aac aag aat aca acg act .. 遺伝子A=(0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.5, 0.0, 0.0, ..) 遺伝子B=(0.0, 0.5, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, ..) 遺伝子C=(0.0, 0.0, 0.0, ...
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p53遺伝子変異を引き起こすAIDによる肝臓発癌の新規マウスモデル
... 全てのマウスが致死的な T細胞リンパ腫を発生するため、上皮性腫瘍の解析が困難である。 申請者らは、幹細胞マーカーである tissue-nonspecific alkaline phosphatase (TNAP) に着目し、 TNAP発現細胞にAIDを発現する遺伝子改変マウス(TNAP-AIDマウス)を作成す ...
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Apc変異による遺伝子発現や細胞動態への影響は細胞種に依存する
... Apc 遺伝子に変異のある大腸癌モデルマウス（Apc min マウス）と Doxycycline を投与することにより全身の 体細胞で初期化因子を発現することができるマウスとを交配し、全身の体細胞で初期化因子を発現することが できる Apc min マウスを作製した。このマウスに発生した大腸腫瘍細胞を初代培養し Doxycycline ...
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肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析
... 田中 知明 千葉大学 p53転写因子複合体によるクロマチン機能調節とiPSリプログラム制御機構の解明 後藤 由季子 東京大学 胎生期大脳新皮質神経幹細胞による多様な細胞の産生機構の解析 坂山 英俊 神戸大学 陸上植物の２倍体多細胞体制の起源をシャジクモ藻類の遺伝子から探る 三室 仁美 東京大学 ...
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遺伝子発現制御機構 クロマチン，転写制御，エピジェネティクス - ダウンロード, PDF オンラインで読む
... ハッセイ サイボウ ブンカ オ ケッテイ スル エピジェネティクス ト イデンシ ハツゲン キコウ : クロマチン コウゾウ ノ ヘンカ テンシャ セイギョ カラ シッカン トノ カカワリ マデ . 発生・細胞分化を決定するエピジェネティクスと遺伝子発現機構 : クロマチン構造の変化 , 転写制御から疾患とのかかわりまで / 押村光雄 , 伊藤敬編集 . ( 実験 医学 ...
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複合病害抵抗性イネ（WRKY45 遺伝子発現イネ，Oryza sativa L.）栽培実験計画書
... に示す敷地内 の 6 カ所で栽培して、観音台第 7 事業場外に遺伝子組換えイネの花粉が飛散していないこと を確認する予定です。 「モチミノリ」は移植時期を数段階に分けてポット栽培し、遺伝子組換 えイネと出穂期の合った集団を使用します。交雑の確認は、キセニア現象（モチ品種にウル ...
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miRNAによる線維芽細胞の活性化・線維化誘導遺伝子発現制御の解明
... silico解析を行って、miRNAのtarget 遺伝子を検索した。TGF-βR2, Hif1αがmiR-20aのtarget遺伝子として予測され、FosがmiR-101bの target遺伝子として予測された。このことから、miR-20aとmiR-101bが肺線維芽細胞の活性化に関 ...
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図 1 ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる因子ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる DNA RNA タンパク質 翻訳後修飾などを示した ヘテロクロマチンとして分裂酵母セントロメアヘテロクロマチンと哺乳類不活性 X 染色体を 遺伝子発現不活性化として E2F-Rb で制御
... はじめに 遺伝情報を失うことなく細胞が増殖するには、その情報 を担う染色体が安定に維持されることが不可欠である。 また、細胞が分化し生物個体が発生するためには、染 色体 DNA に書き込まれた遺伝情報の発現が適宜活性 化・不活性化される必要がある。染色体は DNA、RNA およびタンパク質により構成される巨大な複合体である が、染色体の中でも特に高度に凝縮した機能構造はヘ ...
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制御性T細胞の遺伝子発現制御におけるforkhead転写因子のDNA認識特性の重要性
... Foxp3 の Ala384 が DNA 結合特異性とそれを介した遺伝子発現制御活性を規定 する重要な因子であることを明らかにした。 A384S が A384T と同様に WT よりも強く FKH モ チーフ配列に結合することから、 Foxp3 では Ala384 がこれらの配列に対する結合能の低下に寄 与することを示した。他の FKH ...
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酵母CbHap複合体によるメタノール誘導性遺伝子の発現制御機構
... 一方、CbHap3は、NLSを持たず、CbHap5が欠損した場合には細胞質に局在したこと から、CbHap3はCbHap5依存的に核へ輸送されることがわかった。さらに CbHap2 および CbHap5 が欠損した場合、CbHap3の遺伝子プロモーターへの結合が消失し たことから、CbHap2、CbHap3、CbHap5が複合体を形成してDNAに結合することを示 した。 ...
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遺伝子の近傍に別の遺伝子の発現制御領域 ( エンハンサーなど ) が移動してくることによって その遺伝子の発現様式を変化させるものです ( 図 2) 融合タンパク質は比較的容易に検出できるので 前者のような二つの遺伝子組み換えの例はこれまで数多く発見されてきたのに対して 後者の場合は 広範囲のゲノム
... 遺伝子の近傍に別の遺伝子の発現制御領域（エンハンサーなど）が移動してくることによって、そ の遺伝子の発現様式を変化させるものです（図２）。融合タンパク質は比較的容易に検出できるの ...
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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析
... 患者における病理学的変化は、アルツハイマー病発症の十～数十年前からおこるため、 認知症症状が認められない期間が非常に長く、また、脳組織にてアミロイドの沈着や神 経原線維変化が形成されても認知症状を発症しない患者も多い。本研究では、病理学的 及び臨床的にてアルツハイマー病と診断された患者脳組織において遺伝子発現解析を ...
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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析
... MAP2 の 側頭葉・後頭葉における機能は、AD 発症のメカニズムやそれに関わる因子の各部位における役割を示唆 する。また、新規に得られた P9TLDR は、A の毒性に依存したマーカーとなり得るものであり、AD 発症 への関与も興味深い。これら AD 患者脳発現解析結果は、AD 発症及び進行過程を総合的に把握するうえ ...
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脂肪肝に特異的に発現する新規PPARγ標的遺伝子に関する研究
... LPD1b 発現レトロウイルス及び LPD1-shRNA 発現レンチウイルスの作製････････82 ...GLUT4 の膜への移行･･･････････････････････････････････････････････････････82 ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... mRNA の発現量 は両者で差が認められないが、タンパク質レベルでは健常者と比較して、 SCA2 患者では有意に減少した。さらに、 GRB2 mRNA の発現量は健常者と比較して、 SCA2 患者では有意に高いにも関わらず、タンパク質レベルでは有意な差は認め られなかった（ Drost et ...mRNA の 3’ UTR に存在する AU-rich ...
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マウス脳出血モデルに対するSOD1 過剰発現神経幹細胞移植治療の神経保護効果
... が，ホスト組織の劣悪な環境が移植細胞の生着を妨げ，治療効果を減弱させる要因となっている．我々は，こ の幹細胞の傷害機序として，血腫分解物であるヘモグロビンによる酸化傷害に注目し，遺伝子操作により抗酸 化特性を強化した神経幹細胞移植の効果を検討した．内因性の細胞内活性酸素分解酵素である copper/zinc- superoxide ...
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腸腫瘍におけるDclk1陽性細胞の遺伝子発現プロファイリング
... 正常組織に幹細胞が存在するように、腫瘍細胞においてもヒエラルキーがあり、腫 瘍幹細胞が存在するという仮説が提唱されており、腫瘍の治療標的として注目されて いる。京都大学医学部消化器内科学では以前に、腸腫瘍のモデルマウスにおいて Dclk1 が正常組織の幹細胞ではなく、腫瘍幹細胞の特異的なマーカーであり、Dclk1 陽性かつ Lgr5 ...
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日本のイネコアコレクションにおける胚乳澱粉の鎖長分布の多様性と澱粉生合成関連遺伝子の発現解析
... 東条由花・寺石政義・齊藤大樹・奥本 裕 京都大学大学院農学研究科（〒 606-8502 京都市左京区北白川追分町） 要旨：米の澱粉は直鎖状のアミロースと分枝構造をもつアミロペクチンの 2 種類のグルコース重合体によって構 成されている . 澱粉の物理化学的特性は , アミロース含量だけでなくアミロペクチンの鎖長分布や構造に影響を受 ...
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イネ組換え近交系の出穂後の稈におけるデンプン含量およびデンプン代謝関連遺伝子発現量の推移
... 要旨： 出穂前のイネの茎中には同化産物がデンプンの形で蓄積されていて，出穂後にショ糖へ変換，穂へと 転流する．この時，茎中のデンプンを効率的に穂へと転流させることが出来れば，極穂重型品種で問題とな る登熟不良の解決に繋がると考えられる．また，逆にデンプンが茎に蓄積した状態を保つことが出来れば， ...
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指数型混合則を用いた正則溶液モデルによる極性分子含む混合物の気液平衡の相関
... 察を加えた。ここでは、LLE の熱力学的基礎事項につ いてヘプタン＋メタノールおよびオクタン＋メタノー ル 2 成分系 LLE を例として、混合 Gibbs エネルギーと 組成の関係および活量と組成の関係について解説する。 このことより、LLE の熱力学的条件について理解を深 め、GC-MW による LLE 推算における課題について把 握する。 ...
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