• 検索結果がありません。

熊本大学学位論文 

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

シェア "熊本大学学位論文 "

Copied!
148
0
0

読み込み中.... (全文を見る)

全文

(1)

       

熊本大学学位論文 

   

クラスレート形成能を有する

Cyclopentadienone

環化付加体の 分子設計と結晶構造に関する研究

—結晶格子包接における CH/O

型水素結合および

CH/!

相互作用の役割—

                           

2013 

 

安  部  正  樹 

 

 

 

 

(2)

熊本大学学位論文

クラスレート形成能を有する

Cyclopentadienone

環化付加体の 分子設計と結晶構造に関する研究

—結晶格子包接における CH/O

型水素結合および

CH/!

相互作用の役割—

2013  安 部 正 樹

Design of clathrate hosts of cyclopentadienone-cycloadducts and X-ray diffraction studies of inclusion compounds:

Role of CH/O type hydrogen bonds and CH/! interactions in host/host and host/guest networks

2013 

Masaki Abe

(3)

Design of clathrate hosts of cyclopentadienone-cycloadducts and X-ray diffraction studies of inclusion compounds:

Role of CH/O type hydrogen bonds and CH/! interactions in host/host and host/guest networks

Masaki Abe

Relatively weak attractive forces such as CH/O type hydrogen bonds and CH/! interactions, i.e. weak hydrogen bonds, have been found to play an important role in specific molecular recognition of biomolecules. Crystalline host/guest complexes (clathrates) of simple organic molecules are obtained by slow evaporation of a solution of the host compounds in the respective guest solvents. For the property that reversible decomposition to each components is easy, clathrates are used as models for studying weak interactions in molecular recognition and self-assembly.

Specific functional groups in a series of clathrate hosts with typical shapes have been utilized to form strong OH/O type hydrogen bonds. However, the clathrate hosts synthesized via the Diels–Alder reaction of phencyclone with dienophiles, albeit the absence of the strong interactions, formed crystalline inclusion complexes with guests; their crystal structures indicated the presence of weak lattice forces supported by CH/O type hydrogen bonds and CH/!

interactions.

In this study, phencyclone Diels–Alder adducts (hosts) were synthesized and their clathrate formation properties toward a variety of guests were investigated for a better understanding of the weak interactions and molecular recognition, as well as the structural features of the crystalline inclusion complexes and the structural requirements for a clathrate host, leading to the design of new types of clathrate hosts. The results are summarized as follows:

O

3 Ph

Ph

R

3a R = H 3c 3d 3e

O

Ph Ph

4a R = Cl

R = Br R = CH3

O

N O

O R

Ph Ph

5

5c R = 1-naphthyl 5d

5e 5f

R = 2-CH3-Ph R = 3-CH3-Ph R = 4-CH3-Ph 5g R = 2-Et-Ph 5h R = 2-Ph-Ph 5i R = 4-Ph-Ph

5j 5k 5l

R = 2-F-Ph R = 3-F-Ph R = 4-F-Ph 5mR = 2-Cl-Ph 5n R = 3-Cl-Ph 5o R = 4-Cl-Ph 5p

5q 5r

R = 2-Br-Ph R = 3-Br-Ph R = 4-Br-Ph 5a R = CH3

5b R = Ph

1) Styrene-derived hosts 3 formed only a few inclusion complexes, indicating that the clathrate formation was strongly influenced by the high flexibility of the N-aryl moiety derived from the dienophile.

2) X-ray crystal analyses of the crystalline inclusion complexes of phencyclone Diels–Alder adducts indicated that weak CH/O type hydrogen bonds formed via the bridged carbonyl oxygen play an important role in the formation of the inclusion complexes with guests as well as in the host/host networks (e.g. ‘head-to-tail’ connection).

3) Host 4a with a rigid-framework showed excellent inclusion ability for a wide range of guest molecules, which was attributed to the host ‘column’ structure formed by CH/O, CH/! and edge-to-face interactions. Therefore, the rigid and planar structure connected to the phenanthrene ring was confirmed as a steric structural requirement for the clathrate host.

4) It has also been recognized that each of four regions (A, B, C, and S) of the phencyclone adduct structure plays a

characteristic role as a recognition site. The space above the phenanthrene plane on the same side of the bridged

carbonyl (Region A) tends to be occupied by aromatic guests or the aromatic rings of adjacent host molecules,

where the edge-to-face or !/! interaction was operative. In particular, in hosts 5, analysis of the packing structure

suggests the presence of the adjusting mechanism controlled by CH/! or !/! interaction on Region A for switching

between a guest-free structure and a clathrate structure with aromatic guests. On the other hand, the tetracyclone

analogue with a stilbene moiety showed poor inclusion ability because of its high flexibility resulting from the

presence of four phenyl rings. However, the results show that the tetracyclone analogue did not weaken the

inclusion ability over a wide range of guests.

(4)

O

H H

A

B

aromatic ring from guest or host

C

region

R

R' (a)

S

         

A

B

C

(b)

5) The host/host networks linked by parallel-displaced arrangements of the N-aryl groups derived from the dieno- phile via Region B were observed in the non-hydroxylic hosts except in styrene-derived hosts 3. In hosts 5, the resulting host dimers were connected to each other to create a void space for guest inclusion. In hosts 5c, 5d, and 5g bearing N-(2’-substituted)aryl groups, isomers were observed, which were derived from the restricted rotation around the N

imide

–C

sp2

bond due to the intramolecular CH/! interaction between the N-aryl ring and the phenan- threne plane. Moreover, the formation of a conformationally restricted structure owing to the weak CH/! interaction proved quite effective in the formation of a cavity for guest inclusion, further indicating that low flexibility of the host structure is important for clathrate formation.

6) Acetone and aromatic guests were effectively included in Region C, which was mainly utilized to facilitate the formation of dimers by facing the C regions of the counterpart. These dimers were observed in most of the hosts 5, indicating the formation of a tight host/host network.

7) In Region S, the host/host linkages were mainly built by the CH/! interactions and the guest inclusion in this region was usually weak, whereas the guests were firmly held within the cage-type cavity constituted by the host columns in the clathrates of 4a.

8) In hosts 3d and 5, the introduction of a halogen atom made the parallel-displaced arrangements between the N-aryl groups more flexible and resulted in higher inclusion ability. Moreover, C

aryl

–Br/! or CH/F interactions via a halogen atom effectively formed the host/host networks. However, CH/Cl type hydrogen bonds, the existence of which is questioned, are considered to contribute to a lesser extent to the stability of the host/host networks.

9) Based on the results obtained from weak intermolecular interactions, the author attempted to combine two characteristics for guest inclusion over a wide-range of guests by introducing carbonyl group(s) to form OH/O type hydrogen bonds in the phencyclone adduct (non-hydroxylic host). This concept helped us design a new carboxylic clathrate host that showed efficient inclusion behaviour. Furthermore, the crystal structure of a guest-free host could be predicted by analysing the crystal structures of the inclusion complexes of these hosts.

10) Structure optimization of a ‘clathration model’ using the coordinates of the crystal packing was performed by using semi-empirical molecular orbital (MO) calculations. Only the PM6 calculations were found to reproduce the characteristic structural features of the molecular packing. The estimated value of the stabilizing energy calculated by the PM6 method was within the acceptable range based on the high-level MO calculations [CCSD(T) method].

The PM6 method seems to be the most practical of the known MO calculation methods in terms of the calculation

costs and the number of molecules involved; this study demonstrates a possibility of its application in evaluating

intermolecular interactions, understanding molecular recognitions, and molecular design.

(5)

略語表

本論文中では以下の略語を使用した.

1SCF single-point self consistent field

AM1 Austin model 1

B3LYP Becke's three-parameter nonlocal exchange and Lee–Yang–Parr nonlocal correlation functional

CCSD(T) coupled cluster calculations with single and double substitutions with non-iterative triple excitations

CDCl

3

chloroform-d

DFT density functional theory

DTA differential thermal analysis

DMSO dimethyl sulfoxide

HSAB hard and soft acids and bases

MNDO modified neglect of diatomic overlap

MO molecular orbital

MP2 second-order Møller–Plesset

ORTEP Oak Ridge thermal ellipsoid plot

PM3, PM6, PM7 parametric method 3, 6, 7

RM1 Recife model 1

TG thermogravimetry

THF tetrahydrofuran

VDW van der Waals

! H

f

delta heat of formation

(6)

目次

緒言 ... 1

1

章  新規骨格クラスレートホストの検索および構造修飾 ... 5

1

節  ホストの合成,構造解析および包接比の決定 ... 6

1

項  各種スペクトル解析(一般法)

... 6

2

項  クラスレートの形成と包接有無・包接比の決定(一般法)... 7

2

節 Styrene系ホストの包接能の検討 ...10

1

項  ホスト

3a

のX線構造解析

(guest-free 3a) ...10

2

項  ホスト

3c, 3d, 3e

の包接能の検討 ...13

3

項  ホスト

3d

のX線構造解析 (guest-free 3d) ...15

4

項  ホスト

3e

のX線構造解析

(guest-free 3e, 3e•p-xylene) ...17

5

項 

Styrene

系ホストに関する考察(小括)...20

2

章 

Rigid !"#$%&

クラスレートホストの包接能の検討 ...22

1

節  ホスト

4a

の包接能の検討

...22

1

項  ホスト

4a

のX線構造解析 (4a•benzene, 4a•toluene; cage-type clathrate) ...23

2

項  ホスト

4a

のX線構造解析 (4a•1,4-dioxane, 4a•acetone; cage-type clathrate) ...26

3

項  ホスト

4a

のX線構造解析

(4a•pentan-3-one; layer-type clathrate) ...28

4

項  ホスト

4a

のX線構造解析 (4a•o-xylene; channel-type clathrate) ...30

5

項  ホスト

4a

に関する考察(小括)

...31

2

節  計算化学的手法を用いたクラスレート解析

...34

1

項  包接体X線構造をもとにしたクラスレーションモデルの構築 ...34

2

項  クラスレーションモデルを用いた安定化エネルギーの予測および評価 ...36

3

節  スチルベン骨格を有するホスト

7a

の包接能の検討

...39

1

項  ホスト

7a

のX線構造解析 (7a•acetone) ...40

4

節  ホスト

4b, 4c

の包接能の検討 ...42

1

項  ホスト

4b

のX線構造解析

(4b•acetone) ...43

5

節  ホスト

4d, 4e

の包接能の検討 ...45

1

項  ホスト

4d

のX線構造解析 (guest-free 4d, 4d•benzene, 4d•1,4-dioxane, 4d•p-xylene) ...46

2

項  ホスト

4e

のX線構造解析

(guest-free 4e) ...52

(7)

3

章 

Non-hydroxylic

クラスレートホストの包接能の検討 ...53

1

N-arylmaleimide

誘導体ホスト

(5a–i, 7b)

の包接能の検討

...54

1

項  束縛回転を有するホスト

5c

の安定性の予測・評価 ...57

2

項  ホスト

5b

のX線構造解析 (guest-free 5b) ...58

3

項 

Guest-free 5b

のX線構造をもとにしたホスト­ゲスト複合体の安定化エネルギーの評価

...59

4

項  ホスト

5c

のX線構造解析 (5c•butan-2-one) ...59

5

項  ホスト

5e

のX線構造解析 (guest-free 5e, 5e•p-xylene) ...61

6

項 

Guest-free 5e

のX線構造をもとにしたホスト­ホスト複合体の安定化エネルギーの評価

...64

7

項 

5e•p-Xylene

包接体のX線構造をもとにしたホスト­ゲスト複合体の安定化エネルギーの評価

...66

8

項  ホスト

5f

のX線構造解析 (5f•m-xylene) ...67

9

項 

5f•m-Xylene

包接体のX線構造をもとにしたホスト­ゲスト複合体の安定化エネルギーの評価

...70

2

節  ハロゲン置換

N-phenylmaleimide

誘導体ホスト

5j–r

の包接能の検討 ...74

1

項  ホスト

5n

のX線構造解析 (5n•p-xylene) ...76

2

項  ホスト

5l

のX線構造解析

(5l•m-xylene, 5l•acetone) ...77

3

項  ホスト

5o

のX線構造解析 (guest-free 5o, 5o•benzene, 5o•p-xylene) ...80

3

節 

Non-hydroxylic

ホストに関する考察(小括)

...81

4

章 

Carboxylic

クラスレートホストの包接能の検討

...84

1

節  モノカルボン酸を有するホスト

6a–f

の包接能の検討 ...85

1

項  ホスト

6c

のX線構造解析 (6c•1,4-dioxane) ...86

2

項 

6c•1,4-Dioxane

包接体のX線構造をもとにしたホスト­ゲスト複合体の安定化エネルギーの評価

88

3

項  ホスト

6e

のX線構造解析 (6e•pentan-3-one) ...89

2

節  ジカルボン酸を有するホスト

6g–l

の包接能の検討 ...91

3

節 

Carboxylic

ホストに関する考察(小括)

...92

5

章  半経験的分子軌道計算の適応性と課題 ...96

総括 ...98

実験の部

...101

化合物情報(物性.構造解析,反応条件,収率)

...102

単結晶X線構造解析 ...114

化合物一覧

...132

引用文献 ...134

謝辞 ...141

(8)

本論文は学術雑誌に収載された次の論文を基礎とするものである.

1

Non-hydroxylic clathrate hosts of [4 + 2]! cycloadducts of phencyclone and N-arylmaleimides:

recognition of aromatic guests

J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 2002, 1611–1619

Yasuyuki Yoshitake, Junichi Misaka, Koji Setoguchi, Masaki Abe, Tomohiro Kawaji, Masashi Eto and Kazunobu Harano

2

Carboxylic acid clathrate hosts of Diels–Alder adducts of phencyclone and 2-alkenoic acids.

Role of bidentate C–H•••O hydrogen bonds between the phenanthrene and carbonyl groups in host–host networks

Org. Biomol. Chem., 2003, 1, 1240–1249

Yasuyuki Yoshitake, Junichi Misaka, Masaki Abe, Masatoshi Yamasaki, Masashi Eto and Kazunobu Harano

3

Clathrate formation of Diels–Alder adduct of phencyclone and acenaphthylene.

Key role of CH/! and bidentate CH/O interactions of the phenanthrene ring in construction of host framework

Tetrahedron, 2012, 68, 3566–3576

Masaki Abe, Masashi Eto, Koki Yamaguchi, Masatoshi Yamasaki, Junichi Misaka, Yasuyuki Yoshitake,

Masami Otsuka and Kazunobu Harano

(9)

緒言

  フランス人

Émile Coué

1857–1926

)は,業務中に遭遇した偽薬効果

(placebo effect)

の経験を機に薬剤 師業を廃したのち,催眠療法(誘導自己暗示法)の第一人者として奇跡的とも言える治療を行ったとされ る.元々化学者を志した彼が薬学ではなく言葉を介した治療を選んだ背景には,根拠に乏しい当時の薬物 治療に対する諦念があったと推察される.

Coué

の死去よりやがて一世紀.化学,薬学そして医学など諸 科学の発展は当時と比較にならないほど目覚ましく,あらゆる分野でエビデンスに基づいた研究が行われ ている.統合失調症患者に対して平然とロボトミー手術(

1935–1975

)が行われた前世紀とは隔世の感が あり,近年では精神科領域においても診断基準が細かく規定され(

DSM-IV-TR

),その発症メカニズムを 究明するために科学的アプローチが試みられている.たとえば,

1906

年に

Aloysius Alzheimer

が発表した 原因不明の疾病アルツハイマー病についても,現在では根治治療が実現可能になるのは

2020

年であるだ ろうと予測されており(第

9

回デルファイ調査),近年それを後押しするかのようにカルパインや

(ß- , ! -)

セクレターゼといった酵素がアルツハイマー病に密接に関与することが明らかとなった.これらの酵素を 標的とした選択的阻害剤を開発することができれば,アルツハイマー病の発症を阻止する根治的治療法と なる可能性がある.

  生体活動のあらゆる過程で機能する酵素とは,特異な三次元構造と触媒活性をもつ有機高分子化合物で あり,酵素‒基質複合体を形成する際に示す基質特異性という点で一般の触媒とは一線を画するものであ る.酵素の特異的な基質認識や生体‒薬物間の選択的な構造認識は,会合する分子間の立体的および相互 作用的な相補性に基づくとする

Fischer

の“鍵と鍵穴

(lock and key)

”の概念で説明されてきた1).しかし,

近年になり生体分子同士の緻密な分子認識機構においては,旧来より知られているいわゆる水素結合や

van der Waals

力に加えて

CH/O

2)

CH/!

3) といった比較的弱い相互作用が重要な役割を果たすことが明

らかとなってきた.このような弱相互作用の本質を究明することは複雑な生体機能を理解する上で必要不 可欠であり,特異的分子認識の化学は分子間相互作用を制御する“超分子化学

(supramolecular chemistry)

の世界へと広がりを見せている4).これらの分子間相互作用の性質を探るモデルの一つとして包接化合物 が挙げられる5)

  包接化合物の存在は

19

世紀の初めから知られ,最も古いものとしては

1810

年に

Davy

により発見され た塩素水和物

Cl

2

•6H

2

O

がある6a).包接化合物

(inclusion compound)

とは「すべて,空洞

(cavity)

または

格子

(lattice)

を有し,その中に適当なサイズのゲスト分子を取り込み,空間的に保持する能力をもつ化合

物」であると,

1952

年に

Cramer

により定義された7).その駆動力のほとんどは

1

次的または

2

次的な原 子価結合力ではなく物理的な拘束力

(physical imprisonment)

である.さらに,包接化合物は

1

分子のホス トがその空洞内にゲストを取り込む分子状のタイプ(分子包接)と,ホストが構成する分子間の空洞や結 晶化の際に誘導されるゲスト特異的な格子構造にゲストを取り込むタイプ(結晶格子包接)の

2

つに分類

される.

1891

年に,

Villiers

によりデンプンの分解物として単離されたシクロデキストリンは前者に該当

し,バケツ状の疎水性空洞に種々の有機化合物を取り込む能力をもつ物質として有名である6b)

  ところが,これほど大きな分子量や複雑な構造をもたない物質でも,簡単な再結晶によって溶媒を取り 込む機能を有することが見いだされた.これが後者のクラスレート

(clathrate)

と呼ばれる結晶格子包接体 である8)

(10)

  通常,クラスレートを形成するホストとゲストの間には強い分子間力は存在せず,ホスト格子(ホスト 間隙)の形状・大きさにゲストが適合するかどうかが生成のための重要な条件となる.すなわち,ゲスト によってホスト間隙を適切に満たす必要があることから,クラスレートは作製するのが最も困難な結晶で あるとされ9),当初そのほとんどは偶然に見いだされたものであった.また,その構造解析やホスト修飾 が困難であったために,分子包接化合物より長い歴史をもつにも関わらず,クラスレート研究は本質が理 解されないまま遅々として進まなかった.

Powell

によるX線構造解析の結果,

1945

年にようやくヒドロ キノンとメタノールのクラスレート

CH

3

OH•3C

6

H

4

(OH)

2の結晶構造が明らかとなった10a–b).この結晶では ヒドロキノン

3

分子が水素結合により三次元的なかご

(cage)

型構造をつくり,その中にメタノール

1

子が包接された.この例のように,クラスレートでは結晶状態において,一方の分子(ホスト)が

channel

型,

layer

型,あるいは

cage

型といったホスト格子8b–c) をつくり,この格子内の空隙に他方の分子(ゲス

ト)が取り込まれる.

Powell

の成功に続いて,

Schlenk

により尿素の包接体構造10c),そして

von Stackelberg

により塩素水和物

Cl

2

•6H

2

O

の構造 10d) が解明されたことが,共有結合を介さずに構築されるというクラ スレートの概念を定着させ,クラスレート研究への関心を飛躍的に高める契機となった.

  クラスレートの調製や分解は容易であり,しかも再生利用が可能なことから,混合物(異性体,同族体)

の分離・精製11) やキラル認識12),包接空間を反応場とする固相反応(立体選択的光反応)13),化学セン サー 14) など工業的な用途,さらには弱い分子間相互作用についての基礎的情報の収集や分子認識機構の 解明など様々な分野での応用が考えられる.最近では分子設計に基づいて人工的にホストを合成し,クラ スレートの形成を試みる研究も多く進められ,適合誘導

(induced-fit)

15),選択的取り込み

(selective inclusion)

16),蛍光強度増大

(fluorescence enhancement)

17),熱変色

(thermochromic)

18),ゲスト交換

(guest

exchange)

19) などの機能性をもったホストが次々に開発されている.

  初期の合成クラスレートホストの特徴は,かさ高い基本骨格と芳香環を有することであり,以下の基本 骨格に代表されるホスト群について研究がなされた

(Fig. 1)

R2 R1

scissor type

HO C C C C C OH

wheel-and-axle type

C

R1 R2 R4

R3

R1=R4=H R2=R3=COOH

roof-shaped type

R1=H R2=COOH

Figure 1. Model compounds of clathrate host

(11)

  戸田らは

diacetylenediol

誘導体の両端にかさ高い置換基を結合させた化合物がホストとしての性質を有 し,様々なゲストを包接することを報告した20a).この一連の化合物は“車輪‒車軸型

(wheel-and-axle type)

ホストと呼ばれ,これらによってクラスレートホストとして必要な構造要件について多くの情報がもたら

された 20b–d).また,「水素結合に必要な官能基を導入することで,より高い選択性を示す配位結合的なホ

スト‒ゲスト相互作用を形成する」という配位クラスレートの研究が進められ,この概念がホストを設計 する上で大変重要であることが明らかとなった4a,8b).そして,この考えをもとに“ハサミ型

(scissor type)

21) といった特徴的なホストが合成された.さらに,

Weber

らは

rigid

構造を基本骨格とする化合物が再結 晶時に溶媒を取り込む性質をもつことに注目し,

anthracene

を基本骨格とした“屋根型

(roof-shaped type)

22) ホストを合成し,種々の官能基を導入してその包接能を探った.

  屋根型ホストの報告よりもさらに前,原野らは

cyclopentadienone

類のペリ環状反応に関する一連の研究 過程において,

phencyclone

4-bromostyrene

の反応によって得られた

Diels

­

Alder

環化付加体の単結晶X 線解析の結果,偶然にも再結晶時に用いたベンゼンとメタノールを

1 : 1 : 1

の割合で取り込んでいること を発見した23a)

(Fig. 2a)

.さらに,

phencyclone

cyclooctatetraene (COT)

2 : 1

付加体についても同様の 現象が観察されることを報告した23b)

(Fig. 2b)

.これらの付加体の立体構造については屋根型ホストとの 共通点も少なくないが,強い水素結合能をもたないという点で決定的に異なっており,このような化合物 がクラスレートホストとしての性質を有するという報告は当時まだなかった.そこで,

phencyclone

付加 体ホスト群が結晶格子包接を引き起こす要因を解明すべく,衞藤らは新たに類似の骨格を有する

phency-

 

clone

N-(1-naphthyl)maleimide

の付加体ホストを合成した.このホストの

butan-2-one

包接体についてX

線構造解析を行ったところ,

CH/O

CH/! (edge-to-face)

といった弱い相互作用がホスト‒ホスト間やホス ト‒ゲスト間を結びつける役割を果たすことが明らかとなった24a)

(Fig. 2c)

(a) (b) (c)

Figure 2. Crystalline inclusion complexes formed by [4+2]! cycloadducts of phencyclone with dienophiles

(12)

  分子間に働く強い相互作用については,化学反応との関連において古くから研究の対象とされてきたが,

比較的弱い相互作用についてはいまだその研究が遅れている.一般的に,電気陰性度の高い原子

(D)

共有結合した水素原子

(H)

は同じく電気陰性度が高い原子

(A)

D

­

H•••A

という形で水素結合するこ とが知られているが,双極子‒双極子相互作用による静電的な寄与が大きい

OH/O

型や

NH/O

型の水素結 合に比べ,当初

CH/O

型については水素結合能はないとされた.ところが,X線構造解析技術の発展や普 及に伴い,徐々にその存在を示唆する研究結果が報告され始め,長い議論の末に現在では

CH/O

CH/!

などの微弱な相互作用も水素結合の一種として認知されるに至った.これらは

HSAB

25) における

soft

acid

soft base

を介した水素結合であると理解できる.しかし,

OH/O

水素結合などの強い相互作用との

共存下において,わずか数

kcal/mol

程度の弱い分子間力である

CH/O

型水素結合や

CH/!

相互作用の本質 を正しく評価することは極めて難しい.その点から考えると,強い相互作用が不在の

phencyclone

付加体 ホスト群は弱相互作用を解明するための格好のモデルであると言える.

  ところで,コンピュータの発明以来その計算処理能力の向上はとどまることを知らず,また併せて飛躍 的な発展を遂げた計算化学の恩恵を享受する形で,現在では理論化学を専門としない初学者でも簡便に分 子軌道計算を行える環境が得られている.計算機による実験が優れているのは,未知の分子であっても構 造最適化によって結晶構造自体を推定できる点,そして様々な情報(電子密度,反応性,立体配座,安定 化エネルギーなど)を予測できる点にある.結果として無用な実験を避けることができるため,分子軌道 計算はグリーンケミストリーに繋がる最たる手法であると考えられる.課題である計算の信頼性や精度に 関しても,理論や近似式等の発展に伴い年々実用可能なレベルに近づきつつある.このような諸状況の下,

理論的な予測やホスト設計が求められるクラスレート研究においても,計算モデル 26) を用いた試みが始 められており,分子軌道計算を活用するメリットは非常に大きい.また,各種機器分析や結晶構造解析で 得られない情報を補完し,分子認識機構を理解するためのツールとして単に利用するだけではなく,理論 に基づき自然現象を表現しようという計算化学の試みが実際の実験系に適応可能か検証する上でも,

phe-

ncyclone

付加体ホスト群を用いた研究は理想的であると考える.

  このような背景のもと,著者は

phencyclone

付加体のクラスレートホストとして必要な構造要件やその 包接体構造のみならず,その分子認識機構の一端を解明すべく,新規骨格のクラスレートホストの構造修 飾とそのゲスト包接能の系統的な検討を行った.

(13)

1

章  新規骨格クラスレートホストの検索および構造修飾

  原野らのクラスレートの形成に関する報告 23) を受け,瀬戸口は

phencyclone (1)

をジエン基質とした

Diels–Alder

環化付加体のクラスレート形成能を研究すべく,ジエノフィルとして

styrene

1-vinylnaph- 

thalene

と反応させた.得られた付加体

3a

3b

に対し,各種溶媒を用いて系統的に包接能の検討を行った

ところ,期待した包接現象は観察されなかった (Table 1) 24b)

Table 1. Inclusion properties of hosts 3a and 3b (host/guest molar ratio)

Guest solvent

acetone butan-2-one pentan-3-one alcohols

1,4-dioxane benzene toluene o-xylene m-xylene p-xylene THF

3a 3b

– : No inclusion, a) : Slightly-soluble in the solvent

a)

a) O

1' 2'

3' 4'

3a Ph

Ph

O

Ph Ph

3b

No inclusion

  付加体

3a,3b

が溶媒分子を包接しなかった要因の一つとして,ジエノフィル由来

aryl

基の自由度の高 さが考えられた.そこで著者は,その構造特性とクラスレート形成能の関連について検討するため,ジエ ノフィル部分を構造修飾した

styrene

系付加体群 (3c–e) を用いてクラスレートの形成を試み,DTA/TG

定,1

H NMR

スペクトル測定,単結晶X線解析により得られた情報をもとに詳細な考察を行った.

(14)

1

節  ホストの合成,構造解析および包接比の決定

O Ph Ph

1

N O

O R R

in toluene, reflux in toluene, reflux

O

Ph Ph

3

R

O

Ph Ph

5

N O

O R

O

R1 Ph

Ph

6

R2 O

R1 Ph

Ph

R2

4

carboxylic dienophiles rigid-framework

dienophiles e.g.)

COOH

HOOC e.g.)

Scheme 1. Diels–Alder cycloadducts (3–6) of phencyclone (1) with dienophiles (2)

 

Phencyclone (1)

と各種ジエノフィル

(2)

Diels–Alder

反応させ

(Scheme 1)

得られた付加体群

(3, 4, 5, 6)

の構造解析は,次項に示す

3a

の各種スペクトル解析の手順に準じて行った.以降,各化合物の物性や 構造解析データ,反応条件,収率などの個別の情報については実験の部 (pp. 101–131) に集約した.

1

項  各種スペクトル解析(一般法)

 

3a

の構造解析において,質量分析スペクトル法

(Mass Spectroscopy: MS)

では,

m/z 486

に分子イオンピ ーク (M

)

が観察された.赤外吸収スペクトル法 (Infrared spectroscopy: IR) においては,phencyclone カルボニル基の吸収が

1680 cm

–1であるのに対し,付加体

3a

では共鳴が切れて強く歪んだ橋頭カルボニル

(bridged carbonyl)

部分の吸収が特徴的に高波数シフトして

1776 cm

–1に認められた.一方,核磁気共鳴ス

ペクトル法 (1

H Nuclear Magnetic Resonance spectroscopy:

1

H NMR)

では,endo

H

dのピークが

! 2.36

double doublet

1H

分,

exo

H

cのピークが

! 3.54

double doublet

1H

分,

exo

H

bのピークが

! 4.48

double doublet

1H

分,芳香環由来プロトンのピークが

! 6.64–7.92

multiplet

21H

分,

phenanthrene

環特有の低磁場シフトした

H

aのピークがそれぞれ

! 8.69

! 8.78

doublet

1H

分ずつ観察された

(Table 2).

(15)

Table 2. Physical properties and spectral data of host 3a

O

Hd Hb

Hc

Ha Ha

1' 2'

3' 4' Ph

Ph 1776 cm–1

8.69, 8.78 Appearance

M.p. /ºC MS (m/z) Elemental anal.

IR (KBr) /cm–1

1H NMR (500 MHz, CDCl3)

Colorless prisms from acetone 266–268

486 (M+), 458 (M+–CO) Calcd.: C, 91.33; H, 5.39 Found: C, 91.54; H, 5.39 1776 (bridged >C=O)

2.36 (dd, 1H, J = 6.1, 11.6 Hz, endo-methylene Hd ) 3.54 (dd, 1H, J = 9.8, 11.6 Hz, exo-methylene Hc) 4.48 (dd, 1H, J = 6.1, 9.8 Hz, exo-methine Hb) 6.64–7.92 (m, 21H, aromatic H)

8.69 (d, 1H, J = 8.6 Hz, aromatic Ha) 8.78 (d, 1H, J = 7.9 Hz, aromatic Ha)

3.54

4.48 2.36

  Endo

および

exo

の立体配置はカルボニル炭素と

H

b, c, dとの

long-range (

3

J)

13

C

­

H coupling

の測定結果より 決定した.Tanらは

cyclopentadienone

類の

Diels–Alder

環化付加体の

endo/exo

立体異性体を識別するのに

13

C NMR

スペクトル法が極めて有用であることを報告した27).本法による

endo/exo

決定は,単結晶X線

解析より構造が明らかとなった付加体群においても矛盾がないため,一般法として各付加体に適用した.

2

項  クラスレートの形成と包接有無・包接比の決定(一般法)

  合成した付加体群 (3–6) の包接能について,各種溶媒(ケトン類,アルコール類,環状エーテル類,芳 香族類)を用いて検討を行った (Table 3).その手法としては,室温中,付加体ホストをゲスト溶媒に完 溶させ(溶けにくい場合は溶媒を

50

­

70 ºC

の範囲で適宜加温して),ひだ折りろ紙を用いて自然ろ過した 後,ろ液を放置した.自然揮発法により析出した結晶を吸引ろ取し,デシケータ中で約

24 hr

減圧 (約 0.02

MPa)

乾燥した後,速やかに示差熱分析 (DTA),熱重量分析 (TG) および1

H NMR

スペクトルの測定を行

い,ゲスト包接の有無およびホスト

/

ゲスト比を決定した.

Table 3. Guest solvents used for recrystallization (boiling point in parentheses /ºC)

Ketones Alcohols Cyclic ethers Aromatics

acetone (56) butan-2-one (80) pentan-3-one (101.5)

methanol (64.7) ethanol (78) 1-propanol (97) 2-propanol (82) 1-butanol (116–118) 2-methyl-1-propanol (108) 2-methyl-2-propanol (83)

THF (65–67)

1,4-dioxane (100–102)

benzene (80)

toluene (110–111)

o-xylene (143–145)

m-xylene (138–139)

p-xylene (138)

(16)

  示差熱分析 (Differential Thermal Analysis: DTA) においては,物質の融点や沸点の決定,相転移熱,反 応熱や比熱などの熱量の測定,純度の決定,あるいは結晶多形(擬多形)等に伴う構造変化の評価を行う ことができる28).また,熱重量分析 (Thermogravimetry: TG) においては,熱による物質の分解,組成の変 化,たとえば脱水反応などを定量的に測定することができる.本研究では包接されたゲスト溶媒が結晶格 子外へ放出されるときの温度を求める目的で

DTA

測定を行い,それと同時に生じる重量変動を求める目 的で

TG

測定を行った.例として

4a•1,4-dioxane (2 : 1)

包接体の

DTA/TG

チャートを示した (Fig. 3).

O

Ph Ph

4a

O O

1,4-dioxane 1,4-dioxane

–7.50%

A

233 ºC

B

host : guest = 2 : 1

Figure 3. DTA/TG chart of 4a•1,4-dioxane (2 : 1) complex

 

DTA

チャートにおいて,

4a

本来の融点

(307–308 ºC)

付近に現れた吸熱ピーク

(B)

は結晶格子の崩壊 により生じたと考えられる.また,融点より低い温度(233 ºC)でも吸熱ピーク (A) が観測され,併せて

TG

チャートでは重量減少が起こった.すなわち,ピーク

A

はホスト格子内からゲスト溶媒 (1,4-dioxane) が放出されたことを意味し,そのゲスト量に相応する重量減少が

TG

にて検出されたと考えられる.

TG

チャートより重量減少率は約

7.50%と測定され,ホスト/ゲスト比が 2 : 1

の理論値 (7.61%) とほぼ一致し た.ところで,この吸熱ピーク

A

はゲストである

1,4-dioxane

本来の沸点 (100–102 ºC) より大きく上昇し ていた.結晶格子内に取り込まれたゲスト溶媒は本来の沸点とは異なる温度で放出されると予想される.

たとえば,包接されることでゲスト同士での溶媒和を上回る安定化が得られる場合においては,ゲストは その沸点よりも高い温度で放出されると考えられる.したがって,ゲスト放出温度はその包接体における ゲスト保持力の大きさを示すものと考察した.

(17)

 

DTA/TG

測定はホスト/ゲスト比の推定やゲストの放出温度の観測を可能とする優れた手法である一方,

その放出された物質が目的のゲストであるかを特定することはできない.本研究ではこの不得手を補う目

的で1

H NMR

スペクトルの測定を併せて行った.これによりホストと共存する物質の同定だけでなく,条

件が整えばホスト/ゲスト比も精度良く求めることが可能となった (Fig. 4).ここでも

4a•1,4-dioxane (2 : 1)

包接体を例に述べると,

! 5.39

付近に現れるホスト

4a

の基準ピーク

(exo-methine H

b

)

の面積強度を

2H

すると,ゲストである

1,4-dioxane

の基準ピークが

! 3.70

に約

4H

分だけ観察された.ホスト分子と等モル のゲスト溶媒が包接されていれば

8H

分のゲスト基準ピークが必要となり,よって面積強度比からホスト/

ゲスト比は

2 : 1

であると推測した.

O

Ph Ph

4a

Hb Hb

O O

1,4-dioxane Hb

2H

4H = 0.5mol

Figure 4.

1

H NMR spectrum of 4a•1,4-dioxane (2 : 1) complex

(18)

2

節 Styrene系ホストの包接能の検討

1

項  ホスト

3a

のX線構造解析 (guest-free 3a)

  まずはじめに,ゲストを包接しなかった付加体

3a

の単結晶X線解析を行い,それを

phencyclone

付加体 ホストの一例として構造上の特徴について検討した.

3a

endo

付加体であり,

long-range (

3

J) C

H coupling

の測定結果を支持した (Fig. 5).また,bicyclo環部分の

C1‒C2, C2‒C3, C3‒C4

の各結合距離は

1.575(2), 1.557(2), 1.566(2) Å

であり,sp3

–sp

3結合の一般的な距離29) である

1.54 Å

に対し,歪みに起因する結合伸 長が観測された.さらに,

C1

C2

C32

の結合角は

119.1(1)º

であり,

sp

3混成軌道の結合角である

109.5º

りも開いていた.橋頭カルボニル部分の

C1‒C7‒C4

の結合角は

99.3(1)º

であり,単純構造である

acetone

C1‒C2‒C3

結合角が

118.5º

であることを考慮すると非常に歪んだ形状であった.IRスペクトルで観察

された大幅な高波数シフト

(1776 cm

–1

)

はこの高歪構造を支持した.また,

phenanthrene

環の平面性の指 標となる

C12‒C13‒C19‒C18

の二面体角 (dihedral angle)

4.7(2)º

であり,わずかながら環のねじれが認 められたがほぼ平面構造を維持していた.

17 16

30 29

18

15 31 28

19 14

26 27

36 12

13

35 6

37 1

34

32 33

11

8

5 2

7 O

10 9

4 3 25

20 24

21 23

22 (a)

(b)

Figure 5. (a) ORTEP drawing and (b) numbering sequence of guest-free 3a.

  次に,

guest-free 3a

結晶中のホスト間ネットワークについて検討を行った.ジエノフィル由来のフェニ ル (endo-2-phenyl) 環は,隣接ホストの橋頭カルボニル酸素との

CH/O

型水素結合2) や,さらに別のホス トの芳香環との

CH/!

相互作用3) により認識され,空間的に密接した構造を形成していた (Fig. 6).

  ここで,ホスト同士を

a

軸方向へ連結させる

C4’–H/O=C<

型水素結合について検証を行うと(

Fig. 5

で示したX線解析時の番号づけとは別に一般的な番号づけとして

styrene

由来芳香環の

4

位炭素を

C4’と表

記する),C•••Oの距離 (D) および

H•••O

の距離 (d) はそれぞれ

3.745(3), 2.833(1) Å

であり,C–H•••O

なす角度

( " ) および H•••O=C

がなす角度

( # ) はそれぞれ 161.1(1), 132.9(1)º

であった

(Fig. 6a, 7)

(19)

C(H)/!

3.664 C(H)/! 3.442 4' C(H)/O 3.745(3)

C(H)/! 3.410 4.097

(a) (b)

b c

a o

1

Figure 6. Crystal packing of guest-free 3a: (a) Structure recognition of the phenyl ring derived from dienophile;

(b) ‘Complementary’ host dimer by CH/! interaction.

 

CH/O

型水素結合が成立する条件としては,距離

D

3.0­4.0 Å

の範囲にあり,かつ角度

"

110º

下回らないことが提唱されている2c–d).仮に

C•••O

間の距離が

D > 3.6 Å

の場合であっても

! C–H•••O

関係が直線に近ければ (

" > 150º),CH/O

型水素結合として受け容れられる場合があるが,D < 3.2 Åと非 常に近接していても

!C–H•••O

が極端に曲がった角度 (90º <

" < 110º)

であれば,その存在は疑わしいと されている.ここで取り上げた

C4’–H/O=C<

に関しては,距離

D

3.745(3) Å

3.6 Å

を超えるものの,

角度

"

161.1(1)º

で直線的な関係にあった.以上のことから,C4’–H/O=C<

CH/O

型水素結合である

と判断した.

C H

O C D

!

"

d

Figure 7. Representation of lengths (D, d) and angles ( " , # ) in a CH/O type hydrogen bond

  ところで,芳香環同士を安定化させる力としては,互いが

T

字型に接近する芳香族性の

CH/!

相互作用

(T-shaped aromatic CH/! interaction: Edge-to-face interaction)

3) の存在が知られている.

Fig. 6a

では

styrene

由来フェニル環の両面を挟み込むようにして,隣接ホストの

phenanthrene

環および

bicyclo

1

位のフェ ニル基がそれぞれ

edge-to-face

相互作用を形成していた.Phenanthrene

2

位炭素と

endo-2-phenyl

環の最 小二乗平面の距離

(C2•••!-plane)

3.664 Å

であり,水素原子

(C2)–H

!

平面に対して

2.951 Å

の位置 にまで接近していた.CH/! 相互作用を定義するにあたっては電子密度依存性や方向依存性を考慮する必 要があるが,一般に相互作用を形成する各原子の

VDW

半径から判断すると,C(–H)•••!-plane(最小二乗 平面)の距離が

3.7 Å

以内

(2.0 Å for CH

3

, 1.7 Å for C

sp2

)

30) にあるものについては

CH/!

相互作用している 可能性が高く3h),以後この数値を

CH/!

相互作用の判断基準とした (Fig. 8).

(20)

C H 2.0 1.7 D (C•••! -plane) = 3.7 Å

Figure 8. Representation of lengths (D) and VDW radii (drawn as a circle) in a CH/! interaction

  また,

endo

位のメチレン水素と隣接ホストの

phenanthrene

環も接近した位置に存在し,そこでは互いに

CH/!

相互作用 (C•••plane, 3.410 Å; C–H•••plane, 2.748 Å) が働いていた.このようなエナンチオマーの関係 にあるホスト同士が“相補的な二量体 (complementary dimer)”を形成することで,自由度の高い

styrene

基のコンフォメーションを固定化し,ホストのみで隙間の少ない安定な結晶格子を構築するものと考えら れる.Bicyclo

4

位に置換したフェニル基と隣接ホストの

phenanthrene

環の距離は

4.097 Å (C–H•••plane,

3.194 Å)

であり,基準の

3.7 Å

よりも離れた位置に存在するため,その両者の間には

CH/!

相互作用が働

いていないと判断した.

  前述した

a

軸方向の分子連結(C4’–H/O=C<)以外にも,橋頭カルボニル酸素と隣接ホストの

phenanth- rene

3

位水素との間には C3–H/O=C< 型水素結合が形成され(頭尾連結:head-to-tail connection),この

CH/O

型水素結合が相補的二量体(幅広破線で囲んだ

2

分子)を結晶の

c

軸方向に連結させる駆動力の役 割を果たすと考えられる (Fig. 9).その

C•••O

間の距離は

3.468(2) Å,! C–H•••O

の角度は

142.6(1)º

であ り,ここでも

CH/O

型水素結合としての条件を満たすことが確認された.

C(H)/! 3.875

C(H)/! 3.766

C(H)/O 3.468(2) 'complementary'

host dimer

o

a b

c

Figure 9. Host–host network connected by CH/O and CH/! interactions along the c-axis in guest-free 3a

(red dotted line: CH/O type hydrogen bond; blue dotted line: CH/! interaction).

(21)

  分子間に立体障害がない条件下においては,X–H/O型水素結合 (X = C, N, O) を形成する

X(–H)•••O

の距離

D

X–H

部分の酸性度の影響を強く受けるとされる.さらに,

Desiraju

X–H

部分の酸性度ほど 顕著ではないものの,酸素原子 O(=C<) の塩基性も結合距離

D

に影響を与えると論じている.要するに

X–H

部分の酸性度が高いほど

X–H/O

の結合距離は短くなると考えられるが,

X–H

部分の条件が等しい場 合においてはカルボニル酸素の塩基性の違いが

X–H/O

の結合距離に影響を及ぼす可能性がある.実際に

CH/O

型水素結合を形成した

terminal >C=O

bridged >C=O

を比較すると,C•••O間の距離

D

の平均値は

それぞれ

3.51,3.45 Å

となり,わずかながらも

bridged >C=O

との距離

D

の方が短くなるという結果が報

告された2c)

  このように,

bridged >C=O

の酸素原子は歪みのないカルボニル酸素よりもわずかに塩基性が高く,さら には立体的に隣接分子の水素原子が接近しやすい.これらの性質は

CH/O

型水素結合の受容基として極め て効果的であると考えられる.しかしながら,

phencyclone

付加体ホスト群は

bridged >C=O

を挟んだ両側

(bicyclo

1, 4

位)にそれぞれフェニル基を有する共通の構造をもつため,ホスト間の

head-to-tail

連結

phenanthrene

環と

bridged >C=O

の間の

CH/O

型水素結合のみで形成されることは考えにくい.実際には

その

CH/O

型水素結合に併せて,

phenanthrene

環と

1, 4

位フェニル環

!

電子の間にも

Ar–H/!

相互作用が働 くことで比較的強固なホスト間ネットワークが構築されていた.

  付加体

3a,3b

がゲストを包接しなかった理由としては,ジエノフィル由来の回転可能な芳香環が影響 し,ゲストを包接した場合の充填構造よりもホスト二量体同士を組み合わせた充填構造の方が安定で優先 されたためと考察した.ホスト中に配座が固定されず自由に動きやすい構造を有した場合,ゲストを取り 込む空間や固定する相互作用を形成しにくい.また,ホスト間の空洞が最小となるように結晶化しやすく なると考えられ,包接空間を形成してゲストを保持することで得られる安定化エネルギーがそれを上回ら ない限り,ゲストの包接は困難であると推察される.

2

項  ホスト

3c, 3d, 3e

の包接能の検討

  直接的なゲスト包接に有効と考えられるヒドロキシ基やカルボキシ基などの官能基をもたないホスト においては,ゲストの包接空間をつくり出すためのホスト間ネットワークの構築が必要であると考えた.

そこで,ゲスト空間を生み出すホスト設計としてモデル分子

3a

styrene

残基

4’位に各種置換基 (X = Cl,

Br, CH

3

)

を導入し,これら

4’-X-phenyl

環部分が特異的に認識し合う“ホスト二量体”の形成を目指した

(Table 4)

(22)

Table 4. Inclusion properties of hosts 3c–e (host/guest molar ratio and desolvation temp. in parentheses /ºC)

O

3c Ph

Ph

Cl Guest solvent

acetone butan-2-one pentan-3-one alcohols

1,4-dioxane benzene toluene o-xylene m-xylene p-xylene THF

3c 3d 3e

4 : 3 (159,166)

a)

4 : 3 (149,153)

a)

4 : 3 (162)

a)

b)

O

3d Ph

Ph

Br

O

3e Ph

Ph

CH3

– : No inclusion, a) : Slightly-soluble in the solvent, b) : Ratio dependent on the recrystallization conditions

  著者が企図したのは,いわゆる“parallel-displaced (offset stacked)”と称される芳香環が幾分ずれた位置で 平行対面した配座31b–c) であり (Fig. 10a–b),前述した

Weber

らの車輪‒車軸型ホスト20) の分子構造に着 想を得て,その(中心軸を挟んで両端にかさ高い芳香環構造を有する)構造要件に類似の構造を当ホスト 同士の特異的認識により構築できないかと考えた (Fig. 10c–d).

O

Ph Ph

X

HO C C C C C OH

wheel-and-axle type C

O

Ph Ph

X (c)

(d)

(a) (b)

parallel-displaced (eclipsed) face-to-face d d

H

r

Figure 10. (a, b) Interaction geometries of benzene dimer; (c) Wheel-and-axle type host; (d) Wheel-and-axle like dimer structure linked by parallel-displaced aromatic interaction.

  このような分子認識を実現することでホスト格子内に間隙が生まれ,さらにその空間を埋めるようにゲ ストが包接されることを期待した.実際に過去の報告では,

3d•benzene•methanol (1 : 1 : 1)

包接結晶中にお いてこの構造に類似のホスト二量体が観察された (Fig. 11) 23a).しかし,この例では

4’-Br-phenyl

環の重心

間距離が

5.421 Å

と離れており,しかも

!

電子系の重なりは見られない.また,その面間距離

2.961 Å

parallel-displaced

構造に見られる一般的な面間距離

3.4–3.6 Å

の範囲31a) にないため

parallel-displaced

構造 とは認められないが,4’位を置換した芳香環構造が分子認識において有効であることを示した.

参照

関連したドキュメント

AGs of all withdrawn drugs tested in this study showed short half-lives and peptide adducts formation, but so did those of several safe drugs.. In contrast, only AGs of withdrawn

The objectives of this study were to evaluate the formation of lymphvascular niches in lymph nodes of patients with oral squamous cell carcinoma (OSCC), and investigate the roles

氏名 学位の種類 学位記番号 学位授与の日付 学位授与の要件 学位授与の題目

学位の種類 学位記番号 学位授与の日付 学位授与の要件 学位授与の題目

氏名 学位の種類 学位記番号 学位授与の日付 学位授与の要件 学位授与の題目

氏名 学位の種類 学位記番号 学位授与の日付 学位授与の要件 学位授与の題目

学位授与番号 学位授与年月日 氏名

As a result of the study, the functions of the implemented BMS and the development / operation model (business model) were evaluated and the issues for the advancement of the BMS