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遺伝子の発現量:遺伝子の共発現

トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析

トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析

... 文 要 旨 トマトは世界中で栽培されている付加価値高い野菜類一つである。肥料投与や栽培環境最適化を 行っても、生育促進や果実収量増加向上には限界があるため、植物ホルモン投与が併用されることが多 い。数ある植物ホルモン中で、オーキシンおよびジベレリンがトマト栽培現場において主に利用されて ...

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共発現遺伝子ネットワークの可視化(R、CytoScape)  script of

共発現遺伝子ネットワークの可視化(R、CytoScape) script of

... Based on the enrichment analysis of biological process and cellular component GO terms, pathway information and gene expression data, module 1 is likely to carry on the biological functi[r] ...

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トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析

トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析

... By co-expression analysis to construct the network of genes related to SlIAA9 and SlDELLA during tomato growth and development, we realized that SlHSP70-1 appeared in both SlIAA9 and S[r] ...

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図 1 ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる因子ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる DNA RNA タンパク質 翻訳後修飾などを示した ヘテロクロマチンとして分裂酵母セントロメアヘテロクロマチンと哺乳類不活性 X 染色体を 遺伝子発現不活性化として E2F-Rb で制御

図 1 ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる因子ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる DNA RNA タンパク質 翻訳後修飾などを示した ヘテロクロマチンとして分裂酵母セントロメアヘテロクロマチンと哺乳類不活性 X 染色体を 遺伝子発現不活性化として E2F-Rb で制御

... へテロクロマチンは初め顕微鏡を用いた解析により、 細胞分裂期だけでなく間期においても凝縮したクロマチ ン構造として定義された。その後解析によりへテロクロ マチン領域では、転写が分裂期・間期を問わず抑制さ れている、減数分裂 DNA 組み換えが抑制されている、 複製期後期に複製されるなど特徴が見いだされた。 へテロクロマチン領域は繰り返し DNA 配列やトランスポ ...

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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析

アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析

... SDAT 両者を合わせて(つまり DAT と同義語として)、AD と広く呼ばれている。また、 65 歳未満で発症する AD には、常染色体優性遺伝を示す家族性アルツハイマー病 (Familial AD : ...tangle:NFT)等 脳組織内異常構造物出現は共通しており、FAD における遺伝子変異をもとにした APP、PS1 及び PS2 ...

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マウスにおける持続的なインターフェロン-γ発現によるアトピー性皮膚炎および癌の遺伝子治療

マウスにおける持続的なインターフェロン-γ発現によるアトピー性皮膚炎および癌の遺伝子治療

... In Chapter I, I showed that the hydrodynamic injection of pCpG-Muγ resulted in prolonged therapeutic serum concentrations of IFN-γ for more than 80 days, and this significa[r] ...

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遺伝子の近傍に別の遺伝子の発現制御領域 ( エンハンサーなど ) が移動してくることによって その遺伝子の発現様式を変化させるものです ( 図 2) 融合タンパク質は比較的容易に検出できるので 前者のような二つの遺伝子組み換えの例はこれまで数多く発見されてきたのに対して 後者の場合は 広範囲のゲノム

遺伝子の近傍に別の遺伝子の発現制御領域 ( エンハンサーなど ) が移動してくることによって その遺伝子の発現様式を変化させるものです ( 図 2) 融合タンパク質は比較的容易に検出できるので 前者のような二つの遺伝子組み換えの例はこれまで数多く発見されてきたのに対して 後者の場合は 広範囲のゲノム

... 東北大学大学院医学系研究科 鈴木未来子 講師(ラジオアイソトープセンター)、山㟢博未 博 士(医化学分野)、清水律子 教授(分子血液学分野)、山本雅之 教授(医化学分野・東北メディカ ル・メガバンク機構 機構長)らは、3番染色体長腕転座および逆位 ※1 を伴う急性骨髄性白血病に ...

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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析

アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析

... MAP1B 発現をノックダウンしたところ、 neurite outgrowth が抑制され、生存細胞数が減少した。一方、MAP ファミリーに属する MAP2 は、MAP1B と相反し、AD/後頭葉皮質— 生理的老化/後頭葉皮質サブトラクションで AD 後頭葉皮質にて発現が 亢進していた。さらに、AD/側頭葉皮質— ...

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Bcr-Abl陽性慢性白血病細胞によるストローマ細胞の遺伝子発現と増殖および機能の修飾

Bcr-Abl陽性慢性白血病細胞によるストローマ細胞の遺伝子発現と増殖および機能の修飾

... 骨髄ストローマ細胞遺伝子発現を修飾することにより、 骨髄微小環境を CML 細胞 生存・増殖に至適な環境へと再構築することを強く示唆するものである。 以上研究は慢性骨髄性白血病による骨髄微小環境変化解明と病態理解 に貢献し、ヒト白血病制御開発に寄与するところが多い。 ...

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PPARγにより発現制御される脂肪肝特異的遺伝子に関する研究

PPARγにより発現制御される脂肪肝特異的遺伝子に関する研究

... LPD3 protein is localized in the peroxisome fraction of the RGZ-treated ob/ob mouse liver, but not PPARγ null ob/ob mouse liver.. Peroxisome fraction was prepared as shown in Figure 23.[r] ...

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制御性T細胞の遺伝子発現制御におけるforkhead転写因子のDNA認識特性の重要性

制御性T細胞の遺伝子発現制御におけるforkhead転写因子のDNA認識特性の重要性

... Foxp3 1 アミノ酸置換変異 A384T(Ala384 Thr へ置換)において 見られる表現型から研究開始に至る洞察を得た。 A384T 変異は FKH 転写因子間で良く保存さ れた DNA 認識部位に位置し、新たな DNA 結合特異性を賦与する gain-of-function 変異であっ た。また P サブファミリー以外 FKH 転写因子における当該アミノ酸は ...

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SETBP1とASXL1遺伝子変異を起因とする白血病におけるTGFβシグナル経路の発現低下の解析

SETBP1とASXL1遺伝子変異を起因とする白血病におけるTGFβシグナル経路の発現低下の解析

... 論文内容要旨 論文題名 Down regulation of TGFβ pathway in leukemogenesis by SETBP1 mutation in ASXL1-mutated MDS (SETBP1 と ASXL1 遺伝子変異を起因とする白血病における TGFβ シグナル経路発現低下解析) 氏名 齋賀 真言 ...

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日本のイネコアコレクションにおける胚乳澱粉の鎖長分布の多様性と澱粉生合成関連遺伝子の発現解析

日本のイネコアコレクションにおける胚乳澱粉の鎖長分布の多様性と澱粉生合成関連遺伝子の発現解析

... 6~10 短鎖部分はデンプン生合成 に関わるいくつか酵素が作用することが報告されている (Fujita et al.2006 )ことから,JRC 50 品種における重合 度 6 ∼ 10 ...た.JRC SSR マ ー カ ー 多 型 情 報(Ebana et al. 2008)やそれに基づいた系統樹(Ichitani et al.2016)が報 ...

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汽水産端脚類を用いた底質毒性評価へのcDNA-AFLPによる遺伝子発現プロファイリングの適用

汽水産端脚類を用いた底質毒性評価へのcDNA-AFLPによる遺伝子発現プロファイリングの適用

... が確認できた。また、 4 章で得られたニコチン曝露バイオマーカー候補である座位コン トロール条件に対する発現変動は、全 8 座位中 7 座位において、ニコチン曝露と道路塵埃 曝露とで統計的な有意差が見られなかった。この結果から、これら座位はニコチン以外 複数化学物質を含む環境試料であってもニコチン曝露バイオマーカーとして有用で ...

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複合病害抵抗性イネ(WRKY45 遺伝子発現イネ,Oryza sativa L.)栽培実験計画書

複合病害抵抗性イネ(WRKY45 遺伝子発現イネ,Oryza sativa L.)栽培実験計画書

... 後 種 子 は オ ー ト ク レ ー ブ 等 に よ り 不 活 化 し た 後 、 廃 棄 し ま す 。 ② 水 田 に て 栽 培 を 終 了 し た 植 物 体 地 上 部 は 刈 り 取 り 、 オ ー ト ク レ ー ブ 又 は 焼 却 炉 を 用 い 確 実 に 不 活 化 し ま す 。 残 り イ ネ 残 渣 及 び 残 っ た 株 、 畑 ほ ...

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網羅的遺伝子発現解析を用いた白色腐朽菌のリグニン分解酵素生産制御機構に関する研究

網羅的遺伝子発現解析を用いた白色腐朽菌のリグニン分解酵素生産制御機構に関する研究

... 本研究では、培養系を人為的に調節できる完全合成培地を用いた人工培養系におけるリ グニン分解酵素制御に焦点を絞り、複数対照実験を設定した。具体的には、酵素生産開 始前菌体と、細胞内 cAMP 濃度を制御することでリグニン分解酵素生産を制御すると いわれているアトロピンを添加した菌体から得られたサンプル両者を対照区として用い ...

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脂肪肝に特異的に発現する新規PPARγ標的遺伝子に関する研究

脂肪肝に特異的に発現する新規PPARγ標的遺伝子に関する研究

... LPD1b 発現レトロウイルス及び LPD1-shRNA 発現レンチウイルス作製・・・・・・・・82 ...GLUT4 膜へ移行・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・82 ...

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肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析

肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析

... DEseq http://bioconductor.org/packages/release/bioc/ht ml/DESeq.html 群間RNA Seqタグ数や発現差を統計的に抽出 する(Anders and Huber. 2010 Genome Biol)。 融合遺伝子探索 TopHat-fusion ...

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膵β細胞と膵α細胞の分化表現型はホメオティック遺伝子発現の差異と関連する

膵β細胞と膵α細胞の分化表現型はホメオティック遺伝子発現の差異と関連する

... Abbreviations: IAPP, islet amyloid polypeptide; Pdx1, pancreatic-duodenal homeobox 1; PCR, polymerase chain reaction; AP, antero-posterior; RT, reverse transcription; GLP-1, glucagon-lik[r] ...

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酵母におけるRNA結合タンパク質Puf5とCcr4-Not複合体による遺伝子発現の転写後制御

酵母におけるRNA結合タンパク質Puf5とCcr4-Not複合体による遺伝子発現の転写後制御

... protein Puf5 and the Ccr4-Not complex in yeast ( 酵母におけるRNA結合タンパク質Puf5とCcr4-Not複合体による遺伝子発現転写後制御 ) ○ 指 導 教 員 人間総合科学研究科 生命システム医学専攻 入江賢児 教授 ...

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