遺伝子における分子進化的解析
植物科学最前線 7:270 (2016) 特定の遺伝子と形質との関係を明らかにする研究であるが, 研究の初発において形質に注目するのか, 遺伝子に注目するのかという点で異なっている 植物の研究に限らず, 従来の進化発生研究では逆遺伝学的手法が多く取られてきた 分子遺伝学的解析の進んでいるモデル生物に
... や人工マイクロ RNA 等による遺伝子発現抑制では，標的とする内生の遺伝子発現を完全に抑制する 事が難しい事に加え，相同遺伝子の発現も抑制してしまう。そのためこれらの遺伝子発現抑制の方法 では，順遺伝学で得られた変異体の場合のような解析を行う事が難しい。ただし，植物種によっては ...
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つくばリポジトリ H19 分子系統進化学分野
... 自然環境 こ ま 認識さ い い新奇真核生物 単 養株化 こ 目指 い 大規模配列データ解析 真核生物 主要 間 系統関係 子系統学的 解明 大規模遺伝子 タ 必須 あ そこ 系統進化的 興味深い生物種 選び 養 遺伝子 タ 取得 こ い そ タ 大規模配列 タ解析 行い正確 真核生物系統 推測 目指 い ...
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ボツリヌスC型とD型神経毒素を支配するバクテリオファージの遺伝子解析と溶原化の分子機構
... of converting phages obtained from Clostridium botulinum types C and D.[r] ...
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15．多発性骨髄腫患者における塩基除去修復遺伝子多型解析
... 【目 的】 ABO式血液型は個人識別に重要な指標とし て法医学, 犯罪鑑識において利用されている. しかしな がら, 細胞特異的発現, コード領域に変異を伴わない亜 型等の原因は, ...DNA 解析を 行った. 【結 果】 プロモーターアッセイにより ABO 遺伝子第 1イントロン内 ...
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サクラ属のS遺伝子座に連鎖した遺伝子がコードするF-boxタンパク質に関する分子生物学的研究
... ２． DNAブロット解析により、general inhibitor候補遺伝子の多型および変異 を明らかにした。また、それらの遺伝子がコードするタンパク質のSSK1結合能 を調査し、これらのタンパク質が花粉管内でSSK1と複合体を形成して機能する 可能性を示した。さらに、SSK1を発現させた形質転換タバコを用いたプルダウ ...
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JAIST Repository: 代謝系遺伝子の分子系統樹比較によるゲノム構造解析
... 2.1.3 自然淘汰説と分子進化の中立説 Darwin が自然淘汰説を提唱して以来、進化は自然淘汰によって行われていると考考え られてきた。自然淘汰説では、突然変異を２つの種類に分けて考えている。 第一は、変異がおきることによって機能が向上するような変異である。このような変異 は他の個体に比べて生存する可能性が高くなり、子孫を残す可能性が上がるため、時間が ...
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分子病理診断: 進化し続けるバイオマーカー
... ＊ALK融合遺伝子陽性肺癌患者には進行が非常に速く迅速な治療薬開始が必要と判断される患者も含 まれる。このような医学的判断がなされた場合には、IHC検査偽陽性の可能性につき患者・家族に十分 説明の上、FISH検査結果を待たずにALK阻害薬を投与することも選択肢となるであろう。この際は、十分 な精度管理がなされたIHC法である確認、FISH検査のオーダーと後日の結果確認が必要である。 ...
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情報理論的観点からみた進化論 : 進化論における確率概念の哲学的意義(本文)
... 31 暗号である。この暗号では、コドンと呼ばれる三塩基の配列によって一つのアミノ酸が指 定される。コドンを構成する塩基は 4 種類なので、コドンの組合せは 64 通りとなる。それ に対し、アミノ酸は 20 種類しかない。そのため、コドンの塩基配列が異なるにもかかわら ず、同じアミノ酸を指定する場合があり、遺伝暗号は冗長なのである（これを遺伝暗号の 縮重という）。たとえば、アデニン・シトシン・ウラシル（ACU 12 ...
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遺伝子比較解析による珪藻類特異的なSET ドメインタンパク質ファミリーの同定
... 個の遺伝子が珪藻特異的 遺伝子として同定された．F. cylindrus の珪藻特異的遺 伝子を用いてさらに解析を行ったところ，そのうち73 個 がＮ末端に ER シグナルペプチドをコードしていた．73 個のタンパク質の中には，珪藻特異的遺伝子として既に 報告されている silicanin-1 および silicanin-1 様タンパク ...
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知的障害関連遺伝子CHAMP1欠損マウスにおける脳の発生及び行動解析
... 腫瘍制御研究部門 分子腫瘍学研究分野 学籍番号 （＊論文博士は受付番号） Student Number B6MD5089 氏名 Name 永井 正義 Chromosome alignment maintaining phosphoprotein（CHAMP1, CAMP）は、分裂期において、動原 体と微小管の結合の維持に必要なタンパク質である。近年 CHAMP1 ...
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IRUCAA@TDC : Streptococcus mutansにおける蔗糖輸送･代謝系の遺伝子解析
... DNA Sequence Analysis Of Sucrose Transport and Metabolism Genes of Streptococcus mutans Yutaka SATO Department of Biochemistry, Tokyo Iental College.. 来およそ20年を経過して,今やあらゆる分野で利用され るに至っているo[r] ...
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がん関連遺伝子のエピジェネティックサイレンシングにおけるMBD蛋白の機能解析
... (7)研究成果 研究目的 がん関連遺伝子はジェネティツクな変化に加え､′ェピジェネティツク な変化により機能を失い､がん化を引き起こす｡がん関連遺伝子のエビジェネ ティツクな転写抑制には､プロモーター領域に存在するCpG配列の高度メチル 化とそれに特異的に結合するメチルCpG結合ドメイン(MBD)蛋白を介した ヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)複合体によるヒストンの脱[r] ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... Pbp1 の Lsm ドメインは Pbp1 の機能に必要であることが示唆された（図 15）。 Pbp1 は Pab1 依存的に khd1Δ ccr4Δ二重変異株の細胞増殖を負に制御する これまでの解析から、 Pbp1 の機能には Lsm ドメインが必要であることが示唆 された。またその他のドメインとして、Pbp1 は C 末端に self-interacting region ...
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頭蓋内主幹動脈狭窄の遺伝子解析研究―もやもや病関連遺伝子RNF213の解析―
... 性動脈硬化頭蓋内狭窄を含めた様々な表現型の頭蓋内 主幹動脈狭窄病変に有意に関連していることが示され た．これまで病因や遺伝的背景が異なると考えられて いたアテローム性動脈硬化の頭蓋内主幹動脈狭窄に， もやもや病と共通の遺伝的要因が存在しているという ことが示されたのが，本研究の新しい知見である． 今後の研究の発展のためには RNF213 の機能解析の 発展が不可欠で，また RNF213 ...
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肺癌の進展に関連した遺伝子の統合的解析
... EML4-ALK については、いくつかの新たな variant の存在が明らかとなった。多数の症 例を用いた検討により、本邦におけるすべての variant を含めた EML4-ALK 肺腺癌の頻 度は切除肺腺癌の 5％前後と考えられる。まだ報告数は少ないが、いくつかの国外からの 報告例から推定すると、米国、欧州、中国などでもほぼ同様の頻度と思われる (Koivunen et al. Clin Cancer Res ...
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Multilocus Sequence Typing 解析法を用いたTrypanosoma cruzi 株における遺伝子比較
... の発症や病態などについて検討した． 遺伝子型の決定は PCR-RFLP 法により行った．この研究 は群馬大学の IRB の承認を得ている（ #770 ）．【結 果】 TNF- α -857C ╱ T 遺伝子多型頻度の比較では健常者に比べ AML 患者で低産生型である C ╱ C 型が有意に少なく（ 145 例（ ...
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IRUCAA@TDC : №２：Treponema denticola におけるBacteriocin ABC transporter 様遺伝子の解析
... のシフトにも関わっている。菌種間の拮抗に関わる 分子には bacteriocin がある。Bacteriocin は，細菌 の分泌するタンパクで，同種や類縁種に抗菌スペ ク ト ル を も つ。 Treponema denticola は，慢 性 歯 周 炎，根尖性歯周炎の病巣より高頻度で分離され，そ の発症と進行に重要な役割を果たしている。本菌は bacteriocin 様遺伝子とその分泌システムと考えら ...
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多発性骨髄腫(MM)患者における塩基除去修復(BER)遺伝子多型解析
... 例, IgG 55例, IgA 15例, IgD 2例, 非 泌型 3例, BJ 型 18例］と 常人 192例を対象とし,BER 遺伝子の OGG1 Ser326Cys, XRCC1Arg399Gln, APE1Asp148Glu, MUTYH Gln324Hisの遺伝子型を PCR-RFLP法によ り決定し, 発症や病期などの臨床背景との関係を検討し た.当研究は,当院の ...
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分子系統解析における様々な問題について 田辺晶史
... 多遺伝子座連結解析の問題 ● パラログ混入や浸透交雑、水平伝播、incomplete lineage sortingで、遺伝子座間で支持する系統樹が異なる ● 連結解析のブートストラップ値悪化やアーティファクトの原因 ...
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浸潤性神経膠腫の分子遺伝学的解析
... そこで, 低悪性から悪性のさまざまな神経膠腫におけ る IDH1遺伝子変異を検索し,TP53変異,1p/19q欠失な どのその他の遺伝子変異との関係, 予後との相関を検討 した. 80∼90％の高頻度の IDH1遺伝子変異を示した腫 瘍型は低悪性度星細胞腫瘍, 退形成性星細胞腫, 二次性 膠芽腫, 乏突起膠腫, 退形成性乏突起膠腫, 乏突起星細胞 腫, および退形成性乏突起星細胞腫であった. ...
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