質・核酸等の生体高分子の立体構造が
近畿大学 農学部 生命情報学 生体高分子の立体構造とその予測 Ras MTEYKLVVVGAGGVGKSAL TIQLIQNHFVDEYDPTIED SYRKQVVIDGETCLLDILD TAGQEEYSAMRDQYMRTGE GFLCVFAINNTKSFEDIHQ YREQIKRVKDSDDVP
... ） 構造が決定されているタンパク質 BLASTで構造が予測できるタンパク質 PSI-BLASTで構造が予測できるタンパク質 大腸菌の 4404個のタンパク質に対して、２０００年から２００６年までの各年の年末までに登 ...
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生体高分子構造解析支援システム 遺伝子やタンパク質の研究での情報処理 未知配列の既知配列データべースに対する相同性 (homology) 検索 この配列は何に類似しているか? 配列の持つ機能やその進化の探索 未知配列と特定既知配列とのアライメント操作 これらの配列はどの部分がどの程度類似しているか?
... 生体高分子構造解析支援システム エネルギー計算の背景 (2) ☆分子力学 molecular mechanics 各エネルギー項の調和を取りながら、より安定な立体構造を 導出するために考案された方法。各原子の位置を少しずつ 動かしながら、 E total を小さくしていく ...
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生物物理化学 2007 ; 51 : 15 特集 : タンパク質分析のための最新質量分析装置 AXIMA-TOF 2 TM 新規 MALDI TOF/RTOF 質量分析計による生体高分子分析 島 圭介 市村克彦 SUMMARY With the development of proteomics,
... 4.1．高エネルギー CID Fig. 4 に高エネルギーCID を用いた MS/MS スペクトルの 一例を示す．高エネルギー（20 kV）CID によって，ペプチ ド結合が開裂した b 系列，y 系列のイオンに加えて，更に アミノ酸側鎖が開裂した w 系列，d 系列のイオンが検出さ ...
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生体分子構造学
... Watson の数学的予測 ウイルス粒子のエンベロープは宿主細胞の膜をウイルスがまとっているものだが、外殻タンパク質はウイル ス遺伝子中の遺伝情報を宿主のタンパク質合成機構が翻訳したものである。一般にウイルスの核酸遺伝子は小 ...
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生体分子構造学
... T のことを、T ナンバー（T-number、triangulation number、三角分割数）と呼ぶ。下図は、T = 3 の図である。T = 3 のとき、作られる紙モデルはもっとも単純な表面をもち、正２０面体そのものである。 Ｔナンバーの定義式から、下の表のように、T ...
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高分子素材中でネットワーク構造を 形成する添加剤を用いた 高分子微細発泡体の作製 石原彰太
... 次に、PTFE が成形可能な温度範囲に与える影響について論ずる。PTFE 重量分率が 3.0 wt.%、5.0 wt.%の場合、成形可能な温度範囲が高温側に移行した結果は、結晶化促進効果に 起因すると考えられる。iPP 並びに iPP/PTFE コンポジットでは成形中に結晶化が進行する ため、図 4-4 ...
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YAKUGAKU ZASSHI 127(12) (2007) 2007 The Pharmaceutical Society of Japan 1915 Reviews アミノ酸, ペプチドの化学的性質を利用した生体高分子の選択的認識と検出 梅澤直樹, 秋田昌二, 鴨東美絵, 樋
... な知見が得られてきているが，この方法では，個々 のタンパク質機能に関する限定された基本情報しか 得ることができない．そのため，さらなる機能解析 には異なる戦略が必要と考えられる．その重要な戦 略 の 1 つ に ， 蛍 光 イ メ ー ジ ン グ 法 が 挙 げ ら れ る． ...
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生体内に存在する蛋白質の中には、20種類の基本アミノ酸だけでは機能の発現ができない蛋白質が存在する
... SelB の C 末端側のフラグメント(SelB-M)と、特徴的な二次構造を持つ mRNA である SECIS-RNA の複合体構造解析を行った。SelB-M は DNA 結合モチーフとして 名高い winged helix モチーフを持つ蛋白質であるが、SECIS との結合はこれまでに知 ...
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鎖状高分子のレプテーションならびに架橋に関する分子動力学的研究
... x10 の系では引張りによって分子鎖のすり抜けを生じてからみ点が解消し，2 サイクル目 に応力が上昇しなかったと考えられる．一方，図 ...3.11 の 5000CH 2 の分子鎖では，赤丸 で囲っている両端から 3ヶ所づつのマーカー粒子を見ると分子鎖の形状に沿って移動し ...
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内容 1. 化学結合 2. 種類と特性 3. 反応の種類 4. 反応機構 5. 高分子材料の特性 6. 高分子合成 7. 有機構造解析
... ・反応は、遷移状態を経て進行する ・求核剤 Nuは、脱離基Xの反対側から攻撃する ・生成物の立体配置は反転する（ Walden 反転 ） ・基質 RXのRが嵩高くなるほど求核剤Nuが攻撃しにくくなり ...
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固体高分子形燃料電池システム技術開発
... 選択酸化触媒等の各過程での最適反応条件を把握し、開発触媒 の寿命及び信頼性の評価を行う一方、水素製造装置の金属部材のｺｽﾄ低減及びｵｰﾄｻｰﾏﾙ改質方式 の採用と触媒のﾊﾆｶﾑ化を検討した。本開発の低ｺｽﾄ PEFC ｽﾀｯｸ、高速起動水素製造装置及び二 ...
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Molecular Biophysics II 生体物質構造学 II
... Ⅲ 酸素添加酵素の反応機構の解明 Resonance Raman Elucidation of Reaction Mechanism of Oxygenases 小倉尚志・柳澤幸子 Ogura, T., Yanagisawa, S. インドールアミン 2,3− ジオキシゲナーゼは、ヒトのトリプトファン異化経路の最初に位置し、トリ プトファンに分子状酸素由来の 2 ...
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Molecular Biophysics II 生体物質構造学 II
... I-33 関野実緒（金沢大）・古舘英樹（金沢大）・藤波修平（金沢大）・秋根茂久（金沢大）・酒田陽子 （金沢大） ・野村高志・小倉尚志・鈴木正樹（九州大） ：酸素活性種を含む二核鉄錯体の酸化反 応性、錯体化学会第 65 回討論会、奈良女子大学（奈良市）、ポスター、2015 I-34 東條莉奈（金沢大）・石黒智子（金沢大）・古舘英樹（金沢大）・藤波修平（金沢大）・秋根茂久 ...
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核酸の化学
... きた｡ミトコンドリアの構築や機能に必要なタンパク質の大部分は核DNA の遺伝子でつくられるが、一部はミトコンドリアゲノムにコードされてい る。ゲノムの大きさや遺伝子の構成は種によって大きく異なる。動物で は20kbp以下、植物では数100∼数1000kbp、酵母は約80kbp。１つのミトコ ...
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生物物理 Vol. 45 No. 1 (2005) だけ正確なアラインメントが必要な方 (4) 立体構造とアミノ酸配列の関係, あるいは立体構造と機能との関係に興味がある方 2. おもなサービス 2.1 ペアワイズ3Dアラインメントこれは2つの構造をアラインメントする基本的な機能であり,MATRAS
... 性検索であろう．しかし，同じファミリーのタンパク 質の中でも，アミノ酸配列の一致度が低くなってくる と，配列の類似性だけで議論するのには限界が出てく る．そんな場合，立体構造の情報を使うことをお勧め ...
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磁気双安定な多孔性配位高分子の細孔機能と磁性の相関 大場正昭 九州大学大学院理学研究院化学部門 1. はじめに配位高分子 (Coordination Polymers (CPs)) または Metal-organic frameworks (MOFs) と呼ばれる化合物群の構造と機能への注目が この
... SCO の連動により従来 の PCPs では持ち得なかった特性の発現に成功した。本稿では割愛したが、1_Pd では、固体触媒 として細孔構造内における水素の核スピン異性体の高速変換にも成功している 28) 。本稿で紹介し ...
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生体高分子の構造研究が加速する装置 SAXS は 形状 関連パラメータ さらには溶液中高分子のダイナミクスや相互作用の信頼性の高い判定について 実証済みの実績を持っています 現在までの SAXS 測定は 放射光施設または大量のサンプル量を必要とする処理能力の少ない大規模な研究機関の装置に限られていま
... 現在までのSAXS測定は、放射光施設または大量のサンプル量を必要とする処理能 力の少ない大規模な研究機関の装置に限られていました。 独自の機能を備えたBioXolverは、これらの制限を克服しています。高いデータ品 質、マルチサンプル測定とデータ解析の迅速な完全自動化、非常に少量のサンプル ...
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2. 看護に必要な栄養と代謝について説明できる 栄養素としての糖質 脂質 蛋白質 核酸 ビタミンなどの性質と役割 およびこれらの栄養素に関連する生命活動について具体例を挙げて説明できる 生体内では常に物質が交代していることを説明できる 代謝とは エネルギーを生み出し 生体成分を作り出す反応であること
... ・代謝とは、エネルギーを生み出し、生体成分を作り出す反応であることを説明できる。 ・糖質・脂質・蛋白質の種類と基本構造、役割を説明できる。 ・糖質・脂質・蛋白質の消化・吸収・貯蔵過程を説明できる。 ...
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遺伝子内包高分子ミセルの生理活性向上のためのロッド型およびトロイド型へのpDNA収容構造制御
... 第 5 章では、第 4 章で見出した塩濃度を徐々に変更する手法によって、塩濃度 0mM および 600ｍM においてそれぞれ調製したロッド状構造およびトロイド状構造を、生体 塩濃度である 150ｍM においてそれぞれ独立して得られることを示し、構造と生理活性 との直接比較を可能としたことを述べている。これを基に、ロッド状構造と比較し、ト ...
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10 高分子化学 10.1 高分子序論炭素分子が共有結合で結びついていると 高分子化学物という 例えば ポリエチレンや PET ナイロン繊維などの人工物やセルロース たんぱく質などの生体化合物である 黒鉛は高分子に数えないのが普通である 多くの高分子は 小さな繰り返しの単位が 結びつき 高分子となっ
... 両者とも鎖状構造をもつ。PET の場合、分子鎖が折れ曲がり、絡み合う。不規則であるの で、鎖間に隙間ができる。隙間の間の結合は弱い。ところどころであるが、平行な規則正 しい結晶性の部分ができる。ここでは、鎖間距離が小さいので、分子間力が強く働く。繊 ...
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