蛋白質 構造解析、相互作用解析
蛋白質科学会アーカイブ 蛍光偏光解消法を用いた蛋白質間相互作用の解析法
... 非修飾蛋白質の測定濃度範囲 通常の滴定実験を行う準備にとりかかる際、もしも結合・解離定数の値が大体予測でき ていれば、どの程度、相手方蛋白質の量を振れば良いか、表計算ソフトなどで、シミュレ ーションすることができる。一方、良くわからない場合は、最初に、0, 0.1, 1.0, 10μM ...
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Ⅳ 基質結合に伴う溶液中での蛋白質の構造変化の研究
... 精度データ収集を目指した、 X 線 CMOS 検出器を用いた連続回転データ収集法の開発と実用化を進 めている。さらに、微小結晶構造解析の実用化に重要な、壊れやすい微小結晶を安全かつ簡便に取り 扱うための光ピンセットによる非接触微小結晶ハンドリング技術の開発も進めている。 Ⅲ 脂質メディエータの構造生物学的研究 ...
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プロテオームガイド 発現 精製 & 相互作用解析 同定 Contents: イントロダクション 2 タンパク質発現 4 Flexi HaloTag ORF Clone TNT System タンパク質精製 & 相互作用解析 6 HaloTag System タンパク質分析用プロテアーゼ 8 Prot
... タンパク質の発現実験は非常に煩雑で、結果が得られるまでに数多くの工程が含まれ、多大の労力や培養コストを必要としま す。無細胞発現システムは細胞ベースの発現系に比べてよりシンプルにタンパク質を取得することができます。TNT ® Systemは プラスミドやPCR断片を鋳型としてチューブ内でRNAへの転写／タンパク質への翻訳を行うことのできる便利、迅速なタンパ ク質無細胞発現システムです。手間のかかるin ...
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Microsoft PowerPoint - 流体構造連成解析.ppt
... 解析例ー心臓シミュレータ • 心臓はモデル化に際してマルチフィジックスの現象を取り扱う必要がある挑戦的 なテーマであり、これまで様々な観点から多くの研究がなされてきた • 分子・細胞科学が明らかにするミクロレベルの知見から、一人の人間という個体レベル の間の相互作用を予測することは不可能 ...
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脂質低下薬ゲムフィブロジルの新規代謝物の構造解析および代謝におけるβ－シクロデキストリン誘導体との相互作用に関する研究
... 尿中代謝物を単離精製ならびに種々のイオン化法や誘導体化法で測定したマススペクトロメトリ ー（ＭＳ）、およびＭＳ瓜4Ｓにより得られた情報から構造解析した。その結果、イヌ尿中から10 種の代謝物が検出され、そのうち7種の代謝物については、未報告の新規代謝物であることが明 らかとなった。特に、極性の高い2種の代謝物については、カルポキシル基部分のグルクロン酸 抱合体とフェノー[r] ...
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ポスト・ゲノム関連技術−蛋白質レベルでの解析とIT活用−（13年度更新）
... 白 質 等 の 生 体 関 連 高 分 子 と 、 低 分 子 化 合 物 の 特 異 的 な 相 互 作 用 に よ り 生 体 関 連 高 分 子 の 機 能 の 解 明 を 目 指 す も の で あ る 。 有 機 化 合 物 を 基 礎 と し て 生 命 科 学 研 究 を 行 う こ と か ら 、 生 命 科 学 の 基 盤 と な る だ け ...
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「蛋白質構造データバンクのデータ検証高度化と統合化」KO-MTG発表資料
... 【２】CSD以外の生物学的データ[ゲノム，発現，相互作用など]との統合につい てどのように対応するか これまでのプロジェクト（第二期）で，データ検証ファイル以外のセマンティッ ク・ウェブ化が完了しており，コミュニティーの大きな財産となっています．引き 続き，DBCLSと一緒に他の生物学データとの統合化を計り，より一層の統合 を目指して運営したいと考えております．すなわち，利用者が自ら探しに行か ...
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Ⅳ 基質結合に伴う溶液中での蛋白質の構造変化の研究
... (JASRI) ・大端 通 (JASRI) ・松下智裕 (JASRI) ・古川 行人 (JASRI) ・後藤俊治 (JASRI) ・ 北村英男（理研）・山本雅貴：マイクロビームを用いたタンパク質結晶構造解析の現状，平成 22 年度日本結晶学会年会および総会 60 周年記念年会、 （吹田） 2010 Ⅰ -14 長谷川和也 (JASRI) ・上野 剛（理研） ・引間孝明（理研） ・村上博則（理研） ・古川行人 ...
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ポスト・ゲノム関連技術 蛋白質レベルでの解析とIT活用
... 遺伝子 相互作用 特許平イィウウ1ィ 1エェイ ビネブン ュクポ ケ゜ケ 度ゲｪ法 特定 核酸配列を特定 ハメ゜ブヴを用い 指数的 増幅さ る技術 特公 ィ-①ウエイウ 1エェ① マットヴクゾ゛ドゾンゼ 米 モピギ゜ヘ法 遺伝子 現 抑制技術 遺伝子 断 特許平イ年0エ① 1エェエ ゚ネ゛ベダモセェケ 米 コソグスセハ 塩基 異 ハュヴノ ィ00 /ｻボ平 載 面非多孔性基体 ツｫイウィィ年0イ 1エエ① ...
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加藤晃一 ( 教授 )(2008 年 4 月 1 日着任 ) A-1) 専門領域 : 構造生物学, タンパク質科学, 糖鎖生物学,NMR 分光学 A-2) 研究課題 : a) NMR 分光法をはじめとする物理化学的手法による複合糖質およびタンパク質の構造 ダイナミクス 相互作用の解析 b) 生化学
... c) ナノテクノロジーと構造生物学の融合による生命分子科学研究 A-3) 研究活動の概略と主な成果 a) プロテアソームによるタンパク質分解活性は，プロテアソーム活性化因子（PA）とよばれるタンパク質複合体により厳 密に制御されている。我々は，サブユニット選択的に重水素で標識した PA28 ヘテロ 7 量体を用いた中性子小角散乱 実験に基づき，本複合体が３つの a サブユニットと４つの b ...
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脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析 [全文の要約]
... (Functional analysis of lipid-droplet associated protein Perilipin 1) 【背景と目的】 Perilipin 1 (Perilipin A, PLIN1) は脂肪細胞において最初に同定された脂肪滴周囲蛋白であ る。脂肪細胞において PLIN1 は脂肪滴表面を覆うように存在し、脂質の貯蔵と分解の双方を調節 ...
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FMO法のリガンド-タンパク質相互作用解析への応用
... LCK-リガンドのドッキングモード作成 ・ 8リガンドをドッキング：CDocker(DiscoveryStudio) ・ 各リガンドで上位モデル複数を選択 ・ リガンド,アミノ酸側鎖をCHARMmで構造最適化 得られたドッキングモードの相互作用エネルギー計算 ...
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「蛋白質発現・相互作用解析技術開発」産業科学技術研究開発基本計画
... 本研究開発は、遺伝子やタンパク質等の生体分子の機能・構造解析等を行うとともに、 それらの研究を強力に推進するためのバイオツールやバイオインフォマティックスの 開発、成果を高度に利用するためのデータベース整備や先端技術を応用した高度医療機 器開発等により、テーラーメイド医療・予防医療・再生医療の実現や画期的な新薬の開 発、医療機器、福祉機器等の開発・実用化を促進することによって健康寿命を延伸し、 ...
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プロテアソーム相互作用タンパク質Ecm29の解析
... Ecm29は26Sプロテアソームと結合するタンパク質として発見され、26Sプロテアソームの安 定化にはたらくことが報告された。しかしながら、出芽酵母プロテアソームの解析により Ecm29 は 20S core particleと19S regulatory particleとの解離を促進するはたらきや、19S regulatory ...
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創薬と結晶構造解析-3.key
... Chem Biol Drug Des 2007; 70: 557–565 ちょっと「どんでん返し」ですが，実は1987年時点で は，レニンのＸ線結晶構造解析は，まだ実現されていませ んでした．たぶん世界中の製薬企業で結晶化の努力がされ ていたはずです．でも，まだ出来ていなかったのです． なので，当時 Ciba-Geigy (Novartis)がSBDDに使用した ...
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グリココルチコイド受容体とc-Junの蛋白間相互作用 : 酵母two-hybrid法による解析
... A/BはN末端側に位寵するドメイン， CはDNA 結合領域， DはCドメインと Eドメインの間に存在するヒ ンジ領域， EはC末端側に位置するホルモン結合領域である.下段に形質転換に用いた融合プラスミドの クローン名とそのプラスミドにサブクローニングされている cDNA 配列に対応するアミノ酸配列を示し た... GAL4 の転写活性化領域はニカ所に存在し， そのいずれ[r] ...
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Wide-q測定における蛋白質の構造解析の検討
... ・各アミノ酸の形状因子を考慮し、よりhigh-q領域に対応できれば 分子間内部、2次構造（ヘリック、βシート）などの相関も積極的に解析したい。 • バルクの水分子配置座標（小原氏･＠spring8 提供）を用い、束縛水及び溶媒の寄 与を考慮した解析法を確立。 ...
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波 - 潮流 - 構造物の相互作用を考慮した有脚式海洋構造物の不規則応答解析
... 1. は じめ に 海洋構造物 は, 波とともに潮汐や地球 自転 に起因する 潮流の影響 を受けるので, 海洋構造物 を適切 に設計する ためには, 潮流が海洋構造物の動的応答 に及ぼす影響を 明らかにす る必要がある. Huangら は1), 海面上昇量の 変動 がパ ワースペ ク トル密度 関数 で表わ され る波を対 象 に, 潮流が波高の分布に及ぼす影響 に[r] ...
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多孔質材で構成したヘルムホルツ型吸音構造の吸音特性解析と住宅への応用 [ PDF
... 3.2 共鳴器の形状と吸音特性の関係 形状と共鳴現象の関係を調べるため，ヘルムホルツ 共鳴器の構成要素である開口部，頸部，胴部を系統的 に変化させたときの吸音率を求めた。検討した形状を 表-3 に示す。表の s，d，L 1 ，L 2 は図-5 に示すヘルム ホルツ共鳴器の各部の寸法を表している。ここで，s， L 1 ，L 2 は 10 mm 刻み，d は 20 mm 刻みであり，多孔質 材 (GW) ...
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重大事故等対策の有効性評価に係るシビアアクシデント解析コードについて（第3部 MAAP）添付3 溶融炉心とコンクリートの相互作用について
... （４）水-炉心デブリ間の熱伝達係数 解析条件 水と炉心デブリの熱伝達には、 Kutateladze 相関式型の限界熱流束モデルを使用し ており、ベースケースでは、水による冷却を伴ったデブリとコンクリートの相互作用 に関する実験に基づき大気圧条件で 0.8MW/m 2 に相当する値を使用している。 WETCOR 実験、CCI 実験では、炉心デブリが高温の場合には、水と炉心デブリ間で ...
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