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単一細胞レベルでのmRNA発現解析

単一細胞レベルでのmRNA発現解析の定量評価 | Ricoh Technical Report No.43

単一細胞レベルでのmRNA発現解析の定量評価 | Ricoh Technical Report No.43

... 幅 , 細 胞 特 異 的 な マ ー カ ー mRNA発現解析単一細胞レベルサンプル実証 された.PCRにおいて,サンプル細胞数が100倍 になると,理論値は立ち上がりサイクル数は約 ...

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Vol.24 No.1 (2015) バイオイメージング 特集 顕微鏡で測る (2) ルシフェラーゼを用いた細胞レベルの遺伝子発現動態解析 今井章裕 1* 村田隆 1,2 長谷部光泰 1,2 1 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 生物進化研究部門 2 総合研究大学院大学 生命科学研究科 *E-ma

Vol.24 No.1 (2015) バイオイメージング 特集 顕微鏡で測る (2) ルシフェラーゼを用いた細胞レベルの遺伝子発現動態解析 今井章裕 1* 村田隆 1,2 長谷部光泰 1,2 1 自然科学研究機構 基礎生物学研究所 生物進化研究部門 2 総合研究大学院大学 生命科学研究科 *E-ma

... て青緑色光(最大発光波長 490 nm)が生じる。 発光イメージングに用いる検出装置 発光イメージングは、シグナルを検出する機器として 電子増倍型 CCD (Electron Multiplying –CCD: EM-CCD) カメラが用いられる。EM-CCD カメラは、通常 CCD カ メラと異なり、受光部発生した電荷をデジタル信号に変 ...

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ポスト・ゲノム関連技術 蛋白質レベルでの解析とIT活用

ポスト・ゲノム関連技術 蛋白質レベルでの解析とIT活用

... 方、北京 Bei j i ng G enom i c I ns t i t ut e など 研究グループは、 インディカ型 イネ・ ゲノム 解 読と 、 約 23, 000 個 ESTs 単離をほぼ完了 し、 同グループ W eb Si t e ( ht t p: / / ...) 公開を開 ...

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: Genome Analyzer.99 1 SNP Genome Analyzer 1 RNA ID mrna mrna mrna-seq 3 mrna-seqpcr mrna-seq mrna-seq 3: mrna-seq mrna-seq RNA 1 poly-a RNA RNA cdna

: Genome Analyzer.99 1 SNP Genome Analyzer 1 RNA ID mrna mrna mrna-seq 3 mrna-seqpcr mrna-seq mrna-seq 3: mrna-seq mrna-seq RNA 1 poly-a RNA RNA cdna

... が き ま す。Pipelineソフトウェアは、Genome Analyzer得られる蛍光シグナルから 一次データ取得、ベースコールおよ び信頼スコア計算を実施します。リフ ァレンスゲノムへリードアライメ ントや、遺伝子およびエクソンレベル 発現決定、バリアント同定 ...

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目次 緒論 1 第 Ⅰ 章 M. bovis 刺激下におけるウシ免疫担当細胞および乳腺上皮細胞の網羅的遺伝 子発現解析 1. 序文 4 2. 材料と方法 6 3. 結果 考察 小括 44 第 Ⅱ 章 M. bovis 刺激がウシ免疫担当細胞の機能発現に及ぼす影響 1. 序文

目次 緒論 1 第 Ⅰ 章 M. bovis 刺激下におけるウシ免疫担当細胞および乳腺上皮細胞の網羅的遺伝 子発現解析 1. 序文 4 2. 材料と方法 6 3. 結果 考察 小括 44 第 Ⅱ 章 M. bovis 刺激がウシ免疫担当細胞の機能発現に及ぼす影響 1. 序文

... Interferon-γ(IFN-γ)量が増加したことを報告している。これら サイトカインは、細胞間シグナル伝達物質として、血球増殖、分化、活性 化および抑制にかかわる重要な機能を有しており、単核球、好中球および乳 腺上皮細胞は乳腺組織においてそれら主要な産生細胞とされている。一方、 これらサイトカインを含む ...

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ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現制御機構 同様にいくつかの遺伝子における発現動態の異常が報告されており 15) 初期胚の遺伝子発現を比較解析するためには 様々な手法で作出された胚を用いることが望ましい そこで我々は ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現を個々の胚から抽出した RNA を用いて RT- リ

ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現制御機構 同様にいくつかの遺伝子における発現動態の異常が報告されており 15) 初期胚の遺伝子発現を比較解析するためには 様々な手法で作出された胚を用いることが望ましい そこで我々は ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現を個々の胚から抽出した RNA を用いて RT- リ

... 遺伝子発現制御には様々な機構が存在するが、その なかでも DNA メチル化とヒストン修飾などがよく知ら れている。今回、体細胞クローン胚 DNA メチル化に ついて我々研究結果一部を紹介したが、個々遺伝 子における DNA メチル化パターンや、ヒストン修飾状 態検討など残された課題も多い。そこで現在、我々は ...

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[ 別紙 1] 論文の内容の要旨 論文題目 NK 細胞受容体 NKG2 の発現解析および KIR (Killer cell Immunoglobulin-like receptor) の遺伝的多型解析より導き出せる 脱落膜 NK 細胞による母児免疫寛容機構の考察 指導教官 武谷雄二教授 東京大学大学

[ 別紙 1] 論文の内容の要旨 論文題目 NK 細胞受容体 NKG2 の発現解析および KIR (Killer cell Immunoglobulin-like receptor) の遺伝的多型解析より導き出せる 脱落膜 NK 細胞による母児免疫寛容機構の考察 指導教官 武谷雄二教授 東京大学大学

... NK 細胞発現パターンに差異が見られた。脱落膜 CD56 bright NK 細胞においては、胎児を寛容する 方向に働く抑制型受容体 NKG2A が特に強く発現しており、それに比べて活性型受容体 NKG2C 発現 は弱く、更に NKG2C 発現する細胞には NKG2A ...

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色素細胞系 : 生命機能発現機構解明の1モデルシステム

色素細胞系 : 生命機能発現機構解明の1モデルシステム

... ゼ 活 性 部 位 あ る GERL (Golgi-ER-Lysosome) 領域にその抗原として 局在を検出することができた 4 。そういえばチ ロシナーゼ精製時メラニン挙動に驚いた もこのころある。図 2 はこの過程用いた DEAE セルロースにメラニンが強力に結合し、 ...

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ポスト・ゲノム関連技術−蛋白質レベルでの解析とIT活用−(13年度更新)

ポスト・ゲノム関連技術−蛋白質レベルでの解析とIT活用−(13年度更新)

... 品 研 究 開 発 、 生 産 、 マ ー ケ テ ィ ン グ を 一 貫 化 し た ハ イ テ ク ノ ロ ジ ー 企 業 あ る 。 上 海 交 通 大 学 、 上 海 大 衆 交 通 ( グ ル ー プ ) 股 份 有 限 公 司 、 上 海 茸 北 工 貿 実 業 総 公 司 、 上 海 新 路 達 商 業 ( グ ル ー プ ) 有 限 公 司 、 上 海 国 際 株 式 会 社 な ど ...

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The Ultimate Protein Analysis Tool 包括的タンパク質解析ツール Technology NF-κB の解析例より システムを利用することでタンパク質解析が行える例として NF-κB の解析例を紹介いたします ベクターに p65 遺伝子をクローニングし 細胞内で発現させ

The Ultimate Protein Analysis Tool 包括的タンパク質解析ツール Technology NF-κB の解析例より システムを利用することでタンパク質解析が行える例として NF-κB の解析例を紹介いたします ベクターに p65 遺伝子をクローニングし 細胞内で発現させ

... HeLa 細胞に p65-HaloTag ® 融合タンパク質をコードするプラスミドを トランジェントにトランスフェクションし、発現した p65-HaloTag ® 融 合タンパク質を 5µM HaloTag ® TMR Ligand 37℃、15 分間標識した。 細胞は ...

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年次計画と成果 1. 体細胞核移植クローン技術の開発マウスにおいて再現性が極めて低い体細胞クローン技術の効率の改善および安定化をめざすとともに 再プログラム化機構の解明をめざす (1) 二細胞期体細胞核移植クローン胚における遺伝子発現パターンの解析 ( 図 1) 体細胞核移植クローン (SCNT)

年次計画と成果 1. 体細胞核移植クローン技術の開発マウスにおいて再現性が極めて低い体細胞クローン技術の効率の改善および安定化をめざすとともに 再プログラム化機構の解明をめざす (1) 二細胞期体細胞核移植クローン胚における遺伝子発現パターンの解析 ( 図 1) 体細胞核移植クローン (SCNT)

... (1)二細胞期体細胞核移植クローン胚における遺伝子 発現パターン解析(図 1) 体細胞核移植クローン(SCNT)における低産生効率 は、核移植後に卵細胞質内起こる体細胞ゲノム再プ ログラム化が不完全あることに由来していると考えら ...

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るマウスを解析したところ XCR1 陽性樹状細胞欠失マウスと同様に 腸管 T 細胞の減少が認められました さらに XCL1 の発現が 脾臓やリンパ節の T 細胞に比較して 腸管組織の T 細胞において高いこと そして 腸管内で T 細胞と XCR1 陽性樹状細胞が密に相互作用していることも明らかにな

るマウスを解析したところ XCR1 陽性樹状細胞欠失マウスと同様に 腸管 T 細胞の減少が認められました さらに XCL1 の発現が 脾臓やリンパ節の T 細胞に比較して 腸管組織の T 細胞において高いこと そして 腸管内で T 細胞と XCR1 陽性樹状細胞が密に相互作用していることも明らかにな

... 樹状細胞は、ウイルスや細菌など病原体感染を認識し、炎症性サイトカイン[2]など 免疫系活性化因子を産生したり、T 細胞に抗原を提示し、ヘルパーT 細胞(Th 細胞)へ 分化を誘導することにより、抗体産生など免疫応答を誘導します。また、細胞傷害性 T 細胞(cytotoxic ...

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新規視細胞特異的アンキリンリピート蛋白質PankyはCRXによって転写調節を受ける視細胞遺伝子群の発現を抑制する転写コファクターである

新規視細胞特異的アンキリンリピート蛋白質PankyはCRXによって転写調節を受ける視細胞遺伝子群の発現を抑制する転写コファクターである

... が必須 役割を果たしている。Crx ノックアウト(KO)マウス網膜は、視細胞 運命決定は行われるが終末分化が起こらない。Crx 上流因子ある Otx2 視細 胞特異的コンディショナルノックアウト(CKO)マウスは、視細胞前駆細胞が ...

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黄色ブドウ球菌の表層タンパク質Skipの発現制御機構の解析

黄色ブドウ球菌の表層タンパク質Skipの発現制御機構の解析

... 15kDa タンパクが選択的に結合することを見出した。単離したタンパク は MALDI-TOF/MS 解析により,黄色ブドウ球菌グローバル制御因子一つある MgrA (Multiple gene regulator A) と同定された。さらに,Skip 非発現株において mgrA を相 同組換え法により欠損させたところ,Skip ...

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HTLV-1 Taxの散発的な一過性発現はウイルス性白血病細胞の集団の維持に必要である

HTLV-1 Taxの散発的な一過性発現はウイルス性白血病細胞の集団の維持に必要である

... Tax 散発的な一過性発現はウイルス性白血病細胞集団維持 に必要ある) (論文内容要旨) がんウイルスは宿主免疫存在下持続感染を確立し感染細胞をがん化する。 ヒト T 細胞白血病ウイルス 1 型(HTLV-1)は主に CD4 陽性 T リンパ球に感染 し、成人 T ...

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学位論文 Doctoral Thesis 口腔扁平上皮癌における癌幹細胞関連分子 Nucleostemin, Notch1 の発現と機能解析 (Investigation of the expression of cancer stem cell related molecules, Nucleos

学位論文 Doctoral Thesis 口腔扁平上皮癌における癌幹細胞関連分子 Nucleostemin, Notch1 の発現と機能解析 (Investigation of the expression of cancer stem cell related molecules, Nucleos

... OSCC 発生や進展に関わるかについては現在も研究が進められている 状況ある。 本研究においては、OSCC における Notch signaling 機能を明らかにするた めに Notch1 および代表的なリガンド一つある JAG1 に着目し、舌正常上 ...

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肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析

肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析

... TopHat2ベース、シングルまたはペアエンドリードか ら融合遺伝子を抽出する(Kim and Salzberg. 2011 Genome Biol)。 deFuse http://compbio.bccrc.ca/software/defuse/ ペアエンドRNA Seqリードから、融合部位を抽出す る(McPherson et al. 2011 PLoS Comput Biol)。 SOAPfuse ...

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MHCIIとEpCAMの発現解析による2型肺胞上皮細胞の高純度単離法の確立

MHCIIとEpCAMの発現解析による2型肺胞上皮細胞の高純度単離法の確立

... (proSP-C 陽性率)を蛍光免疫染色とフローサイトメトリーを用いて評価した.本 研究において新しく確立した AT2 単離法を,異なる系統や週齢マウス,さら に肺傷害モデルを用いて検証した. 【結果】 ...

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ラット体性感覚野におけるconnexin36発現抑制性神経細胞の化学的解析

ラット体性感覚野におけるconnexin36発現抑制性神経細胞の化学的解析

... ギャップ結合(ギャップジャンクション)は、電気的シナプスとも呼ばれ、 神経細胞同期発火に重要な役割を果たしている。ギャップ結合を構成する基本 分子は、膜蛋白質コネキシン( Cx)あり、Cx が 6 個集まってコネクソンとい うヘミチャネルを形成し、他細胞が形成するヘミチャネルと結合すること、 ギャップ結合となる。現在までに 20 種を超える Cx ...

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( 図 1) 脂肪細胞肥大に伴うアディポネクチン発現低下と関連する新規 Znフィンガー型転写因子の同定 (2) 脂肪細胞由来のインスリン感受性ホルモン インスリン抵抗性惹起因子の探索と機能解析 : 脂肪細胞由来レジスチンの過剰発現マウスを作製 解析したところ 血糖値 インスリン値は下記の様に野生型に

( 図 1) 脂肪細胞肥大に伴うアディポネクチン発現低下と関連する新規 Znフィンガー型転写因子の同定 (2) 脂肪細胞由来のインスリン感受性ホルモン インスリン抵抗性惹起因子の探索と機能解析 : 脂肪細胞由来レジスチンの過剰発現マウスを作製 解析したところ 血糖値 インスリン値は下記の様に野生型に

... 「脂肪細胞分化・形質転換とその制御」 1.研究実施概要 脂肪細胞由来ホルモンインスリン感受性物質あるアディポネクチン特異的な受 容体を世界初めて単離・同定することに成功した。画こと、脂肪酸燃焼に関わる遺伝 ...

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