DNAマイクロアレイによる遺伝子発現解析
内容 1.DNA マイクロアレイの概要 -DNA マイクロアレイで何ができるのか? -DNA マイクロアレイとは何か? 2.DNA マイクロアレイを使う -マイクロアレイ実験の流れ -Agilentのマイクロアレイの種類 -マイクロアレイ使用研究例 3. 遺伝子発現解析以外のDNA マイクロアレイ
... そのために、“どのような性質の検出”が必要か？ ・ある現象に関わる遺伝子群の 候補を新規に見つけたい ・多数の遺伝子の発現量を調べたい ・全遺伝子の発現プロファイルをとりたい ...
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生体内でのAicda遺伝子制御機構の解析:上流のエンハンサーとイントロン部のサイレンサーのバランスが最適な発現に必要である
... On the other hand, the selective deletion of E2F- and c-Myb-binding-sites in region 2 increased the frequency of the cells with active Aicda promoter in germinal center B cells, indi[r] ...
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網羅的遺伝子発現解析を用いた白色腐朽菌のリグニン分解酵素生産制御機構に関する研究
... 3）培養 2 日目から 3 日目に発現量が変動する遺伝子群 リグニン分解酵素生産開始時に転写物量が変動する遺伝子を LongSAGE ライブラリーの 比較によりリスト化した。多くの遺伝子の発現量が変動しており、MnP の主要アイソザイ ム遺伝子である mnp3 （Protein ID 878）、 mnp2 （Protein ID 3589）、LiP ...
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肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析
... 田中 知明 千葉大学 p53転写因子複合体によるクロマチン機能調節とiPSリプログラム制御機構の解明 後藤 由季子 東京大学 胎生期大脳新皮質神経幹細胞による多様な細胞の産生機構の解析 坂山 英俊 神戸大学 陸上植物の２倍体多細胞体制の起源をシャジクモ藻類の遺伝子から探る 三室 仁美 東京大学 ヘリコバクターピロリの胃粘膜感染機構と炎症惹起メカニズムの研究 ...
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酵母CbHap複合体によるメタノール誘導性遺伝子の発現制御機構
... （論文内容の要旨） 天然ガスやバイオマスから合成可能なメタノールは、石油・石炭に替わる炭素資源 として期待されている。メタノールを原料とした微生物生産には、メタノールの効率 的な代謝や遺伝子発現制御系の理解が重要である。メタノールを単一の炭素・エネル ギー源として生育できるメチロトローフ酵母は、メタノールによって誘導される強力 ...
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頭蓋内主幹動脈狭窄の遺伝子解析研究―もやもや病関連遺伝子RNF213の解析―
... 虚血性脳卒中（脳梗塞）の主要な原因の一つである頭蓋内主幹動脈狭窄はアジア人種に多い発症が知られてお り，遺伝的要因の関与が示唆されてきた．近年，もやもや病の疾患感受性遺伝子として ring finger protein 213 （RNF213）が同定された．我々は RNF213 上の単一のミスセンス変異（c.14576G>A, p. R4859K, rs112735431）が ...
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Agilent miRNAアレイ 解析資料
... 6. 生物種を確認して OK をクリック 7. しばらくするとインポートが完了します。 Single Experiment Analysis Single experiment analysis は自分の解析したエクスペリメント 1 つと既知のパスウェイデー タとの関連を調べることができます。マイクロアレイ解析では主にこちらを使います。ま た、 Multi-Omic ...
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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析
... 39）。しかし、マイクロアレイ解析は、アレイにスポットされている 遺伝子のサブセットにおける異なる発現は同定できるが、新しい遺伝子を同定することができ ない。一方、Caoらによって提唱されたサブトラクション法は、信頼度の高い方法であって、未 ...
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Bcr-Abl陽性慢性白血病細胞によるストローマ細胞の遺伝子発現と増殖および機能の修飾
... のストローマ細胞株（OP9）を共培養し、OP9 細胞に誘導される遺伝子発現変化の 網羅的解析によりその機能変化を検討した。KOBA 細胞と共培養した OP9 細胞 （OP9/L）では対照 OP9 細胞に比べ、CDK 抑制遺伝子の低下と強い増殖能の亢進が 認められ、これは OP9 細胞における Notch の活性化に依ることが示された。さらに OP9/L ...
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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析
... （考察） 本研究において、TRIM-32及びTRIM-37は共に、AD後頭葉皮質にて発現が亢進していた。TRIMはユビキ チンプロテアソームシステム（UPS）の中心的役割を有するE2リガーゼ活性を有しており、UPSの異常蛋 白質の除去機構はAD発症に非常に重要と考えられる。AD後頭葉皮質にてTRIM32/37が活性化することに より、脳内の異常蛋白が分解され、神経細胞死に対し抵抗性を示すとも考えられ、異常蛋白質の分解促 ...
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miRNAによる線維芽細胞の活性化・線維化誘導遺伝子発現制御の解明
... 論文の内容の要旨 論文題目 miRNAによる線維芽細胞の活性化・線維化誘導遺伝子発現制御の解明 相馬 邦彦 IPF(idiopathic pulmonary fibrosis: 特発性肺線維症)は、特発性間質性肺炎の典型的なタイプで、 特発性間質性肺炎の 50％から 60％を占める。IPF は慢性的に病態が進行する、不可逆性の疾患 である。IPF の予後は不良であり、診断後の平均生存期間は ...
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汽水産端脚類を用いた底質毒性評価へのcDNA-AFLPによる遺伝子発現プロファイリングの適用
... 結果、陽イオン交換樹脂 SIR-300 を添加した系よりも炭素系吸着剤 XAD-4 を添加した系で 有意に致死率および成長阻害が低減され、有機系物質による毒性の寄与が示唆された。さ らに sediment TIE における曝露試験中の溶存態濃度の分析結果から、亜鉛、銅と遊離アン モニアよりもニコチンの道路塵埃毒性への寄与が大きいことが明らかになった。ただしニ ...
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Apc変異による遺伝子発現や細胞動態への影響は細胞種に依存する
... Apc 遺伝子の変異によって発現に影響を受ける遺伝子を比較する とほとんど重複しておらず、細胞の初期化によって Apc 遺伝子変異により影響を受ける遺伝子群が大きく変化 することが分かった。 RTC は多能性を有しておらず免疫不全マウスの皮下に移植しても奇形腫は形成しなかったが、胎盤に存在する 巨細胞を含む腫瘍を形成した。また、RTC ...
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マウスにおける持続的なインターフェロン-γ発現によるアトピー性皮膚炎および癌の遺伝子治療
... In Chapter I, I showed that the hydrodynamic injection of pCpG-Muγ resulted in prolonged therapeutic serum concentrations of IFN-γ for more than 80 days, and this significa[r] ...
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日本のイネコアコレクションにおける胚乳澱粉の鎖長分布の多様性と澱粉生合成関連遺伝子の発現解析
... 東条由花・寺石政義・齊藤大樹・奥本 裕 京都大学大学院農学研究科（〒 606-8502 京都市左京区北白川追分町） 要旨：米の澱粉は直鎖状のアミロースと分枝構造をもつアミロペクチンの 2 種類のグルコース重合体によって構 成されている . 澱粉の物理化学的特性は , アミロース含量だけでなくアミロペクチンの鎖長分布や構造に影響を受 けることが報告されている . 本研究では , ...
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遺伝子解析による移植されたゲンジボタルの移植元判別法
... が見出されている。さらに，東日本グル ープは２つのサブグループ，西日本グル ープは３つのサブグループ，南九州グル ープは２つのサブグループに分かれ，サ ブグループを含めると８つの遺伝的グル ープに分かれることが見出されている （図１）。昨年度，本研究大会でこれら の８つの遺伝的グループは，地理的に独 立した場所に分布することを明らかにし ている。また， Suzuki et al. (2002) はミトコンドリア内のチトクロームオキ ...
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遺伝子比較解析による珪藻類特異的なSET ドメインタンパク質ファミリーの同定
... の光照射条件下で培養を行った． RNA 抽出および RNA シーケンス解析 藻体のトータル RNA の抽出は，acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction（AGPC）法に 基づく TRI Reagent（Molecular Research Center）を用 いて行った．対数増殖期の藻体を 9,000 g，10 分，4 ˚C で ...
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ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現制御機構 同様にいくつかの遺伝子における発現動態の異常が報告されており 15) 初期胚の遺伝子発現を比較解析するためには 様々な手法で作出された胚を用いることが望ましい そこで我々は ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現を個々の胚から抽出した RNA を用いて RT- リ
... mRNA 発現の特徴として個々 の胚における mRNA 発現量のバラツキが顕著であるこ とが明らかとなった （図 -1, b, d）。 しかしながら、これら発現異常のみとめられた遺伝 子群にはその後の伸長期（EL）までの発育にともない mRNA の発現頻度（表 -2）や発現量（図 -2）が正常化 ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... るため、 RNA 制御の全貌を明らかにすることが求められる。 遺伝子発現における転写後調節には種々多様な RNA 結合タンパク質が強く関 与しており、それぞれのイベントで mRNA の発現制御を厳密に管理している （ Hogan et al., 2008）。ヒト hnRNP K の酵母オルソログである RNA 結合タンパク 質 Khd1 は K-Homology domain を持ち、CNN ...
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cDNAマイクロアレイにより同定されたシェーグレン症候群における新規疾患関連遺伝子NR4A2の解析
... 一方、 IgG4-RD と比較し SS で発現が低下した遺伝子は選択しなかった。これは、 SS と同様に、IgG4-RD において発現が亢進し、その病態形成においてより重要な役 割を果たす遺伝子である可能性が考えられたからである。SS の病態形成において、 T 細胞が最も重要な役割を果たすとされることから、本研究では特に T 細胞機能との 関連に着目し、SS ...
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