網羅的遺伝子発現解析
網羅的遺伝子発現解析を用いた白色腐朽菌のリグニン分解酵素生産制御機構に関する研究
... 現在までのところ、 P. chrysosporium は全ゲノムデータが公的に利用できる唯一の白色 腐朽菌である。すなわち、トランスクリプトーム解析やプロテオーム解析などの網羅的発 現解析、いわゆるポストゲノム解析が可能な唯一の白色腐朽菌である。これまで他の研究 ...
4
網羅的遺伝子発現解析から同定したDAB2とIntelectin-1は上皮型悪性中皮腫と肺腺癌の鑑別診断に有用な免疫組織化学的染色の陽性マーカーである
... Identification of DAB2 and Intelectin-1 as Novel Positive Immunohistochemical Markers of Epithelioid Mesothelioma by Transcriptome Microarray Analysis for its Differentiation from Lung[r] ...
16
目次 緒論 1 第 Ⅰ 章 M. bovis 刺激下におけるウシ免疫担当細胞および乳腺上皮細胞の網羅的遺伝 子発現解析 1. 序文 4 2. 材料と方法 6 3. 結果 考察 小括 44 第 Ⅱ 章 M. bovis 刺激がウシ免疫担当細胞の機能発現に及ぼす影響 1. 序文
... 皮細胞の免疫応答に関連した遺伝子発現を明らかにする目的で、マイクロアレ イを用いた網羅的遺伝子発現解析を行い、定量的リアルタイム PCR 法により 免疫応答に関連する遺伝子発現量を検討した。M. bovis はウシ単核球および好 ...
131
肺癌の進展に関連した遺伝子の統合的解析
... 近年 EGFR 阻害剤が一部の症例で著効を示すこと、EGFR 阻害剤の効果と EGFR 変異 に強い相関があることが明らかとなり注目を集めている。本邦では EGFR の変異は肺腺癌 の 30-50％にみられ、女性、非喫煙者の腺癌に多い。一方古典的癌遺伝子の KRAS 変異は、 本邦の腺癌の 5-15％に認められ、EGFR 変異とは相互排他的 mutually exclusive な関係 ...
15
The Ultimate Protein Analysis Tool 包括的タンパク質解析ツール Technology NF-κB の解析例より システムを利用することでタンパク質解析が行える例として NF-κB の解析例を紹介いたします ベクターに p65 遺伝子をクローニングし 細胞内で発現させ
... HaloCHIP TM と従来法の比較 PCR 増幅結果：HaloCHIP TM および標準的な ChIP 法で回収した DNA を用いて、p65 特異的 IκB プロモーター（300bp）領域を PCR 増幅した後、2% アガ ロースゲルで電気泳動し、エチジウムブロマイド染色した。HEK 293T 細胞は p65-HaloTag ® を安定に発現する細胞とトランスフェクションしていない細 ...
20
が入れてあり Multiple Cloning SiteにPCR増幅した任意 のプロモーターをサブクローニングすることができて 直ちに発現解析に供することができる 発現パターンが分かった場合 そのプロモーターを用 いて異所的に種々の遺伝子を発現することで機能解析を 行うことが重要となる 例えば 変異
... 直ちに発現解析に供することができる。 発現パターンが分かった場合、そのプロモーターを用 いて異所的に種々の遺伝子を発現することで機能解析を 行うことが重要となる。例えば、変異体に本来の遺伝子 を導入することで、表現型の回復を検証するレスキュー 実験の場合、本来のプロモーターではなく、既知の異な ...
5
日本のイネコアコレクションにおける胚乳澱粉の鎖長分布の多様性と澱粉生合成関連遺伝子の発現解析
... つの澱粉生合成関連遺伝子の発現 解析を行った．複数品種を供試した 20% ≦ Fr. ＜ 25% と 30% ≦ Fr. のグループについて，グループごとに発現量の 平均値を算出して比較を行ったが，調査した 8 つの遺伝子 の発現量に有意差はなく，明瞭な差異を見いだすことは出 来なかった（第 3 図）．SSI 遺伝子内に TOS17 ...
4
トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析
... By co-expression analysis to construct the network of genes related to SlIAA9 and SlDELLA during tomato growth and development, we realized that SlHSP70-1 appeared in both SlIAA9 and S[r] ...
130
トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析
... 本審査対象論文では、オーキシンおよびジベレリンを介した応答性遺伝子の制御に関わる SlIAA9 および SlDELLA に着目し、トマトの公共マイクロアレイデータを用いた遺伝子共発現ネットワーク分析を行った。 共発現ネットワーク解析は、着目した遺伝子と高い相関性を持つ遺伝子群に対しグラフ理論を用いて視覚化 ...
3
2. 手法まず Cre 組換え酵素 ( ファージ 2 由来の遺伝子組換え酵素 ) を Emx1 という大脳皮質特異的な遺伝子のプロモーター 3 の制御下に発現させることのできる遺伝子操作マウス (Cre マウス ) を作製しました 詳細な解析により このマウスは 大脳皮質の興奮性神経特異的に 2 個
... ができます。 『三つ子の魂百まで』という諺もあるように、そうした可塑性に富ん でいるのは、子供のある一定の時期だけであり、その時獲得したものは一生持続さ れます。そうした大脳皮質の生後発達のメカニズムはまだ良くわかっていません。 近年の分子生物学の進歩は、生命現象を単なる表面的な現象の記述ではなく、分 子レベルで根本的に理解することを可能にしつつあります。脳の発達に関しても同 ...
7
_08遺伝子解析_wa0121.indd
... 2：３つの技術 非バイアス遺伝子増幅、次世代シーケンサー、バイオインフォマ ティクスの３つの技術から成り立ちます。非バイアス遺伝子増幅 では、1セットのプライマーで全TCR遺伝子を増幅するAdaptor- ligation PCR法を採用しています。本法ではMultiplex PCR法の ような多数のプライマー間で生じるバイアスが原理的に発生せ ...
17
胃癌におけるUc.160+の発現・機能解析
... 転写超保存領域(transcribed-ultraconserved regions; T-UCRs)とは、ヒトやマウス、ラットなど 生物種を超えてほぼ 100%同一の配列を示す高度に保存されたゲノム上の領域(ultraconserved regions; UCRs)から転写されるタンパク質をコードしない RNA(non-coding RNA; ncRNA)の一 種であり、少なくとも 481 領域、962 ...
3
生体内でのAicda遺伝子制御機構の解析:上流のエンハンサーとイントロン部のサイレンサーのバランスが最適な発現に必要である
... On the other hand, the selective deletion of E2F- and c-Myb-binding-sites in region 2 increased the frequency of the cells with active Aicda promoter in germinal center B cells, indi[r] ...
39
頭蓋内主幹動脈狭窄の遺伝子解析研究―もやもや病関連遺伝子RNF213の解析―
... 性動脈硬化頭蓋内狭窄を含めた様々な表現型の頭蓋内 主幹動脈狭窄病変に有意に関連していることが示され た．これまで病因や遺伝的背景が異なると考えられて いたアテローム性動脈硬化の頭蓋内主幹動脈狭窄に， もやもや病と共通の遺伝的要因が存在しているという ことが示されたのが，本研究の新しい知見である． 今後の研究の発展のためには RNF213 の機能解析の 発展が不可欠で，また RNF213 ...
5
原発性免疫不全症に対する次世代シークエンサーを用いた網羅的な遺伝子診断法の確立 研究活動 | 研究／産学官連携
... ．背景 原発性免疫 全症 天的 要因 免疫系構成要素 損 機能 全 疾患 総称 症状 極 多彩 あ うえ 原因 遺伝子 300 種類以上報告さ い え 遺伝子変異 遺伝子 点突然変異 DiGeorge 症候群 う 広範 染色体 失 含 最重症型 あ 重症複合型免疫 全症 患児 出生後早期 ...
4
救命救急センター開設と外傷患者の搬送状況に関する地域網羅的解析 長崎市│長崎救急医療白書
... 病院前の搬送状況 表３に覚知から病院到着までの時間を示す。覚知 から現場到着までの中央値はいずれの年度でも８分 だが、統計学的には有意差が認められた。４年間で 若干の延長が認められるからである。総務省消防庁 の統計では、平成24年度（2012年度）の全国平均値の 8. 3分に対し、長崎医療地域の外傷直送例の平均値は 8. 9分であることから、全国平均に比較すると若干時 間がかかっている。現場到着から現場出発、車内収 ...
6
脂肪肝に特異的に発現する新規PPARγ標的遺伝子に関する研究
... 14. LPD1b-EGFP 融合タンパクを用いた局在解析･･････････････････････････････････79 15. 内在性 LPD1 タンパクの免疫蛍光染色･･･････････････････････････････････････79 16. 細胞分画 (1% Triton X-100 不溶性画分、脂質ラフト/カベオラ画分) ･････････････80 17. LPD1b-HA ...
89
ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現制御機構 同様にいくつかの遺伝子における発現動態の異常が報告されており 15) 初期胚の遺伝子発現を比較解析するためには 様々な手法で作出された胚を用いることが望ましい そこで我々は ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現を個々の胚から抽出した RNA を用いて RT- リ
... mRNA 発現の特徴として個々 の胚における mRNA 発現量のバラツキが顕著であるこ とが明らかとなった （図 -1, b, d）。 しかしながら、これら発現異常のみとめられた遺伝 子群にはその後の伸長期（EL）までの発育にともない mRNA の発現頻度（表 -2）や発現量（図 -2）が正常化 ...
6
遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... ・ Yeast two-hybrid screening Two-hybrid screening の方法および使用したゲノム DNA ライブラリーは既に確 立された方法に従った(Tadauchi et al., 2004; James et al., 1996)。pGBD-PBP1 とゲ ノムライブラリーを PJ69-4A に導入し、1mM 3-aminotriazole を含んだ SC –leucine –tryptophan ...
59
化学合成独立栄養細菌 Acidithiobacillus thiooxidans 由来アコニターゼの遺伝子解析と大腸菌での発現
... 結晶化され構造解析等，詳細に研究されている例は少な い．我々は，化学合成独立栄養細菌 A.thiooxidans 中に NAD 依存型のイソクエン酸脱水素酵素（ICDH）の存 在を見出し，研究を行ってきたが，その過程で ICDH の ORF 上流にアコニターゼ遺伝子と推測される ORF が， 下流にスクシニル-CoA シンテターゼと推測される ORF の存在を見いだしたことから，オペロンの存在が示唆さ れた ...
7