• 検索結果がありません。

_08遺伝子解析_wa0121.indd

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2021

シェア "_08遺伝子解析_wa0121.indd"

Copied!
17
0
0

読み込み中.... (全文を見る)

全文

(1)

08

遺伝子解析

最適な実験系、解析方法のご相談、ご提案をいたします。 お送りいただいたサンプルはRNAの品質チェックおよび濃度 測定を行います。 実験は標準プロトコールに従い実験いたします。 得られた数値データからバックグラウンドの減算処理、データ の補正・標準化、発現比の算出等の処理を行い解析結果デー タを作成いたします。 解析結果として下記資料をお届けいたします。   解析報告書   解析結果データ

RNAサンプルをお送りいただき、ご希望の種類の3D-Gene

®

でメッセンジャー RNAやマイクロRNA等の遺伝子発現状態

を解析し、結果をご返却するサービスです。解析データからの統計・生物学的解析サービスについてもご相談いただけます。

3D-Gene

®

マイクロアレイ解析

マイクロ

アレイ解析

FFPE検体

ご提供いただくもの

サンプル Total RNA 組織・細胞 サンプル量 2 μg 以上 別途、お問い合わせ ください。 サンプル濃度 0.5 μg/μL 以上(推奨) 純度 OD260/OD280=1.8 ∼ 2.0 ※Total RNA量2 μg以下でも対応いたしますのでご相談ください。 ※血液・FFPEの場合はご相談ください。

ご注意

RNAの抽出方法は推奨するキットをご使用ください。 遺伝子発現解析とmiRNA解析では推奨するキットが異なりますの でご注意ください。 RNAサンプルはDNase-RNaseフリー水に溶解の上、必ず凍 結状態で、冷凍便にてご送付ください(予めご相談させてい ただいた日時指定でご送付ください)。なお、輸送時のトラブ ルに関し、当社はその責任を負いかねます。 感染性の高いサンプルはお受けできない場合がございます。 ご了承ください。 ご依頼いただくサンプルがヒトサンプルの場合、サンプル提供者の インフォームドコンセントを得てください。 お預かりできるサンプルは、文部科学省が「遺伝子組換え生物等の 使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律(通称:カルタ ヘナ法)」にて定めるP1レベルのものに限らせていただきます。 サンプルは原則としてご返却いたしかねますので、ご了承ください。 本受託解析は研究以外の目的(医療診断や医療用品・食品の 製造・検査等)には使用しないでください。

サービスの流れ

解析結果をもとに、下記のような解析のご相談をいたします。   群分け、群比較解析   GO(Gene Ontology)情報に基づく解析   パスウェイ解析   遺伝子機能・相互作用解析  等

ご注文方法

和光純薬工業のホームページよりお問い合わせください。 和光純薬工業のホームページ(http://www.wako-chem.co.jp) →試薬→受託サービス→マイクロアレイ解析→ ® 事前打ち合わせ サンプル受け入れ・サンプルQC レポートの送付 解析サポート DNAチップ解析 微量検体検出 3D-Gene® 基板 従来基板 同量の微量RNA からの検出画像

価格/納期

■価格 お問い合わせください。 ■納期 通常、サンプル到着後1 ヶ月以内ですが、サンプルの品質によって納期は変動します。ご了承ください。 解析方法 ヒト全遺伝子型DNAチップ マウス全遺伝子型DNAチップ ラット全遺伝子型DNAチップ ヒト、マウス、ラットmiRNA チップ (作製、解析受託)カスタムチップ 2 色法 ○ ○ ○ 1 色法 ○ ○ ○ ○ ○ ※ miRNAチップは1 色法のみとなります。 ※ miRNAチップはヒト、マウス、ラットからお選びください。 ※ FFPE(ホルマリン固定パラフィン包埋)サンプル、血液サンプルの場合は、別途ご相談ください。 '*HQH®基板 プローブ搭載部柱状構造

特長

■従来に比べて高感度化・高再現性・高正確性を実現 黒色樹脂・プローブ搭載部の柱状構造による低ノイズ化 表面ナノレベル修飾によるオリゴDNAプローブの高密度固定 マイクロビーズ攪拌によるハイブリダイゼーション反応促進 3D-Gene®の特長により、低発現遺伝子、 マイクロRNAの解析や微量検体、血液、FFPE (ホルマリン固定パラフィン包埋)からのRNA サンプルの解析に最適です。 ※血液・FFPEはRNA抽出から承ります。

(2)

08

遺伝子解析

ジャポニカアレイ

® * 1

は、国立大学法人東北大学東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)が構築した「全ゲノムリファ

レンスパネル(1KJPN)」を基に、COI 東北拠点が社会実装した日本人ゲノム解析ツールです。

日本人に特徴的な塩基配列を持つ約 66 万箇所の一塩基多型(SNP)を 1 枚のチップに搭載しており、短期間で日本人のゲ

ノム情報を解析するツールです。

特長

■ジャポニカアレイ® ジェノタイピングサービス3つの特長 ジャポニカアレイ® ジェノタイピングサービスは「日本人に特化」、「低コスト」、「短期間で解析」を特長としており、大学、病院、製薬企業等の研究 機関向けにご提供いたします。*2 ■日本人のSNP解析に適したアレイ ジャポニカアレイ® は解析可能な約66万個のSNPのうち99.7 %が日本人の全ゲノムリファレンスパネル(1KJPN)の中で多型であり、日本人の SNP解析に適しています。 ■全ゲノム情報を疑似的に再構成(インピュテーション)可能*3 ジャポニカアレイ® は解析結果から約30 億塩基の全ゲノム情報を疑似的に再構成(インピュテーション)できる設計となっています。ジャポニカアレ イ® はインピュテーションの性能を最適化するために、「全ゲノムリファレンスパネル(1KJPN)」の中のSNPのランキング付けの結果、約64万個の タグSNPを搭載されています。 ■既知のマーカーを利用した解析も可能 ジャポニカアレイ® には薬剤応答性に関係するSNP等、過去の知見に基づいたSNPを約2万個搭載しており、既知のマーカーを利用した解析も行 うことが可能です。 ■米・アフィメトリクス社製のAxiom® プラットフォームを採用 ジャポニカアレイ® は高品質かつコスト競争力のある米・アフィメトリクス社製のAxiom® プラットフォームを採用し、独自のコンテンツでカスタム デザインされたアレイです。 お客様より送付いただいた血液、唾液、またはDNA検体をジャポニカアレイ®にアプライしSNPのジェノタイピングを実施後、その解析結果をご提供し ます。 *1 : ジャポニカアレイ®は国立大学法人東北大学の登録商標です。 *2 : ジャポニカアレイ®ジェノタイピングサービスは研究者向けサービスであり、研究用途での活用を目的としています。本サービスの解析結果は、診療・診断用途ではありません。 *3 : インピュテーションには東北大学との共同研究が必要となります。インピュテーションはジャポニカアレイ®ジェノタイピングサービスには含まれません。 ジャポニカアレイ® ジェノタイピングサービス3つの特長 ジャポニカアレイ® と他社SNPアレイの日本人全ゲノム リファレンスパネル(1KJPN)で多型である割合の比較 図中の( )は(1KJPNで多型である数/総SNP数)

基本サービス

ジャポニカアレイ

®

ジェノタイピングサービス

マイクロ

アレイ解析

(3)

08

遺伝子解析

サービス(解析)の流れ

ご注文方法

検体条件

〈郵送にて送付〉 ゲノム解析サービス報告書 〈専用のクラウドサーバーへのアップロードによりご提供〉 お客様の検体管理番号と東芝の検体管理番号の対応表 東芝の検体受け入れ時および検体解析工程中の検体品質試験結果 ジェノタイピング解析結果

1) Kawai Y , J Hum Genet 2015, doi: 10.1038/ jhg.2015.68 お問い合わせください。 サービス利用規約、申込書、検体確認シートをお送りいたします。 96検体をサービスの単位としております。 解析する検体は、お客様が自己の費用と責任において、事前に提供者からのインフォームドコンセントを取得していることおよびお客様が ご自身の倫理審査委員会の審査・承認等 必要な手続きを得ていることを条件とさせていただきます。 1.DNA抽出済検体の場合   検体を入れる容器は0.2 mL 96ウェルPCRプレートといたします。 2.全血、バフィーコート、細胞塊、細胞懸濁液の場合 3.唾液検体の場合 * 4:検体が条件に満たない場合は、販売店または東芝までお問い合わせください。 * 5: 東芝が検体受け入れ後に検体品質の確認を行います。その上で上記の品質を満たさない場合は、本サービスの受託を辞退させていただく場合がございます。 その場合でも販売店および東芝で発生した費用(検体品質確認を含む)はお客様よりお支払いただきます。またこの場合、お客様より送付いただいた血液、唾液または DNA検体の残余分の返却は別途費用によりお受けいたしますが、販売店および東芝は返却する血液、唾液またはDNA検体の品質の保証はいたしかねます。 * 6:唾液からのDNAの抽出は検体の状態により異なるため、DNA収量を保証するものではありません。唾液採取は必ずOrageneが定める方法に則って採取してください。

納入物

参考文献

お客様 お問い合わせ(電話・メール) 販売店または東芝 見 積 契 約 内容確認、 納期回答 解析、 納品(クラウドサーバー) 注文、 契約 サービス申込書と検体確認シートの送付 サービス申込書の写しを同梱の上、 検体送付 データダウンロード、 確認 ゲノム DNA 濃度 ≧ 50 ng /μL*4, *5 溶媒 いずれも分子生物学グレード

Nuclease(DNase/RNase) -free water (DEPC-treated water は不可) Low TE buff er, pH 8.0(10 mM Tris-HCl / 0.1 mM EDTA)

TE Buff er, pH 8.0(10 mM Tris-HCl / 1 mM EDTA)*4, *5

送付容量 ≧ 20 μL(≧ 1.0μg)*4, *5 A260/A280 >1.6*5 鎖長 ≧ 10 kbp*5 送付容量 ≧ 1.0 mL*4, *5 抗凝固剤 ヘパリン、CPD、EDTA*4, *5 検体の形態 全血、バフィーコート、細胞塊(1× 107 Cells 以上)、細胞懸濁液(1× 107 Cells 以上)*4, *5 送付容量 2 mL(容器にある採取ラインまでの量)*6 送付容器 Oragene(OG-500)*6 唾液採取方法 Oragene が定める使用方法により採取*6

(4)

08

遺伝子解析

AgilentTechnologiesのマイクロアレイを使用し、網羅的な発現解析を行い、高精度なデータをご提供

いたします。RNAサンプルをお送りいただくだけでRNAの増幅、ラベリングから数値解析までのトータ

ルソリューションシステムでサービスをご提供いたします。

アジレントアレイ解析

マイクロ

アレイ解析

各種サービス

サービス名 遺伝子発現アレイ解析サービス CGH アレイ解析サービス miRNA アレイ解析サービス 特長 ・ ガ ラ ス 基 板 に 直 接 オ リ ゴ マ ー を 合成した高品質なアレイです。 ・ 60 mer のロングオリゴで 5 log のダ イナミックレンジを実現。 ・ アジレント社指定のプロトコル、試薬、 純正機器を使用し、高精度なデータを ご提供。 ・ ご要望に応じて、RNA 抽出からデー タ解析までトータルにサポート。(オ プション) ・ ゲノムワイドのコピー数変化を網羅的 に、高解像度に解析。 ・ 実験するサンプル数や解像度に合わせ てマイクロアレイのフォーマットを選 択可能。 ・ アジレント社指定のプロトコル、試薬、 純正機器を使用し、高精度なデータを ご提供。 ・ Cy5 の蛍光の減衰を低減するオゾン フリーブースを完備。 ・ ユニークなプローブ設計で mature な miRNA を選択的に検出。

・ total RNA 中の miRNA を直接ラベル 化するので、small RNA 精製等の手 間が不要。 ・ 5 log のダイナミックレンジで高感度 に検出。 ・ miRBase の情報に基づいた、最新の コンテンツを搭載。 ・ アジレント社指定のプロトコル、試薬、 純正機器を使用し、高精度なデータを ご提供。 ・ ご要望に応じて、RNA 抽出からデー タ解析までトータルにサポート。(オ プション) サービス内容 ・RNA 抽出 / 精製 (オプション) ・サンプル品質検査 ・アレイ解析 ・スキャン・数値化 ・データマイニング (オプション) ・サンプル品質検査 ・アレイ解析 ・スキャン・数値化 ・RNA 抽出 / 精製 (オプション) ・サンプル品質検査 ・アレイ解析 ・スキャン・数値化 ・データマイニング (オプション) 納品物* ・解析用データ(xls または xlsx) ・ マイクロアレイスキャン画像(tif & bmp) ・数値化データ(txt) ・サンプルの品質検査結果 ・ そ の 他 PDF フ ァ イ ル( 作 業 内 容 の プロトコル、解析用データの見方、 Q&A 集等) ・作業報告書 ・ マイクロアレイスキャン画像(tif & bmp) ・数値化データ(txt) ・サンプルの品質検査結果 ・作業報告書 ・解析用データ(xls または xlsx) ・ マイクロアレイスキャン画像(tif & bmp) ・数値化データ(txt) ・サンプルの品質検査結果 ・ そ の 他 PDF フ ァ イ ル( 作 業 内 容 の プロトコル、解析用データの見方、 Q&A 集等) ・作業報告書 *:データは、CD-RまたはDVD-Rで納品いたします。また、Windowsをご利用の場合のみ、データを暗号化することも可能です。

取り扱いアレイ一覧

■遺伝子発現解析用マイクロアレイ ヒト マウス ラット イネいもち病菌 シロイヌナズナ キイロショウジョウバエ イネ(NIAS-RAP-DB) ワタ アフリカツメガエル トウモロコシ タルウマゴヤシ ウシ 大豆 線虫 ゼブラフィッシュ 大麦 ハマダラ蚊 ブタ ヨーロッパイノシシ トマト ヨーロッパアナウサギ ニワトリ 小麦 タイセイヨウサケ アカゲザル セイヨウアブラナ イヌ タバコ ウマ 酵母 大腸菌 ヒツジ ■miRNA解析用マイクロアレイ ヒト マウス ラット ■ CGH/CGH+SNP/CNV用マイクロアレイについても各種取り 扱っております。詳細はお問い合わせください。

サービスの流れ

ご注文方法

お問い合わせください。専用の注文書をお送りさせていただきます。 注文書受理後、RNAの送付方法等 折り返しご連絡差し上げます。 お問い合わせ 注 文 書 送 付 サンプル受け入れ アレイ解析 サンプル品質検査 納品

(5)

08

遺伝子解析

microRNAは、18 ∼ 25塩基からなる低分子non-coding RNA(small ncRNA)の一種であり、遺伝子の転写後制御に関

与しているといわれ、動物細胞から植物、線虫、節足動物、脊椎動物まで幅広い生物種に存在しています。

本サービスは、LC Sciences社が開発したμPalafl o™

in situ

合成法を使用して、最新のmiRBaseデータを基にmiRNAア

レイを作成し、発現解析を行うサービスです。新規miRNAを探索される方には、最大で3,918プローブ配列を搭載可能な

non-coding RNA受託サービスがおすすめです。

microRNA, non-coding RNA解析

マイクロ

アレイ解析

特長

microRNA(miRNA)、non-coding RNAを網羅的に測定・解 析いたします。 トータルRNAをお預りし、データ解析結果をCDでご返却いた します。 合成で、2015年1月現在miRBase 21に対応しています。 Multiple Species Array には1つのチップに複数の生物種の miRNAが搭載されています。 お客様の選んだ配列を、100個まで無料で追加可能です。

基本サービス

QCチェック(OD260/OD280 と濃度のチェック)  この段階で、規定の条件をクリアしないサンプルについては、お 客様にご連絡し、次のステップに進むかどうか確認いたします。 microRNA、small RNA の分離 ラベリング ハイブリダイゼーション スキャン : TIFF画像ファイル、数値生データをCDで返送いたします。 解析データ:バックグラウンドサブトラクション、ノーマライ ゼーションを行った後、Log2 レシオと t-test のp-value が 計算されます。データはエクセルファイルでお返しします。

サービスの流れ

解析例

合成により均一なアレイシグナル LC Sciences社のmicroRNA、non-coding RNAプロファイリング用 DNAマイクロアレイプローブは、シリコンチップ上に刻まれた約 3,700個のウェル(図)内で 合成されます。 合成し たアレイは、ピンスポットタイプやイ ンクジェットタイプのアレイに比べてス ポット-スポット間、アレイ-アレイ間の ばらつきが減少し、均一なアレイが得ら れます。 ■Tm値の最適化と高い特異性を実現 独自の修飾ヌクレオチドを使用しTm値の最適化を行いパーフェク トマッチ(PM)と1塩基ミスマッチ(1MM)とのシグナル差は30倍 以上となります。Let7 micro RNAファミリーのような21-23nt と短く配列の似たものも区別が可能です。

ご提供いただくもの

必要サンプル量:Total RNA 1-3 μg OD230/OD260 1.0以上 解 析 サ ン プ ル:Total RNA、miRNA、血液、細胞ぺレット、 組織、FFPE

ご注意

サンプルは必ず1.5 mL容チューブに入れてください。  小さいチューブはドライアイスで割れる恐れがあります。 RNA抽出後、送付までの期間は、RNAを−80℃で保存してく ださい。 non-coding RNA のプローブ配列は、お客様ご指定の配列にな ります (最大3,918配列搭載可能)。

価格/納期

■価格 基本料金 miRNA Array(ヒト、マウス) 140,000 円 miRNA Array(その他生物種) 190,000 円 non-coding RNA Array single color 220,000 円

RNA 増幅 80,000 円 Rush サービス 70,000 円 ※1回のご依頼につき、基本料金が必要となります。 ■納期 1 ヶ月 オーダー Total RNA RNA QC RNA 分画 ラベリング ハイブリ 解析結果 解析 スキャン sanger miRBase チップ合成 チップ QC 株式会社アライアンステクノロジー LC Sciences社

2MM

1MM

3MM

PM

(6)

08

遺伝子解析

生体サンプルからのDNA 抽出・RNA 抽出・cDNA 合成サービスです。

受託解析サービス『MOGERA

®

』シリーズ

DNA抽出・RNA 抽出・cDNA合成

「MOGERA

®

-Extraction/Synthesis」

東北化学薬品株式会社

生命システム情報研究所

核酸抽出・

cDNA合成

特長

さまざまな生体サンプルからのDNA 抽出・RNA 抽出・cDNA 合 成を行います。 サンプル数に応じた割引制度も設けておりますので、ご相談くださ い。

基本サービス

組織、培養細胞、血液、血清、パラフィン切片、植物、バクテリ アから抽出・合成いたします(その他の検体についてはお問い合 わせください)。ご希望の操作を下記の3つのコースからお選びく ださい。

DNA 抽出コース  RNA 抽出コース  cDNA 合成コース

サービスの流れ

ご提供いただくもの

サンプルタイプ 送付量 組織*1 50 ∼ 100 mg 細胞*2 1×107 細胞 Total RNA*3 5 μg 以上(100 ng/μL 以上) *1: 組織サンプルは採取後、すぐに液体窒素で凍結処理していただく か、保存試薬で処理してください。 *2: 細胞はPBSで洗浄後、上清を除去し、細胞ペレットの状態ですぐ に液体窒素で凍結処理していただくか、保存試薬で処理してくださ い。 *3: あらかじめ電気泳動にて品質をご確認ください。 ※上記以外のサンプルタイプ、輸送条件に関してはお問い合わせください。 お申し込み、サンプルご送付 報告、納品

ご注文方法

お問い合わせください。

価格/納期

■価格 お問い合わせください。 ■納期 DNA 抽出コース・RNA 抽出コース: サンプル到着後5 営業日∼。 cDNA 合成コース:サンプル到着後2 営業日∼。

納品物

サンプル調製報告書(濃度、Ratio(260 nm/280 nm)、電気泳 動写真、逆転写法を記載)をE-mailでお送りいたします。 サンプルは、RNA 抽出コースは20 μg 以上、DNA 抽出コー スは50 μg 以上、cDNA 合成コースはTotal RNA 1 μg の逆 転写産物を冷蔵(Total RNA のみ凍結)状態にて納品いたしま す。

(7)

08

遺伝子解析

qRT-PCRは、マイクロアレイデータからスクリーニングされた個々のmicroRNAの発現量を、正確に検証するために用

いることができます。また、研究対象とするmicroRNAがすでにお決まりの場合にも、その定量にご利用いただけます。

TaqMan MicroRNA Assay system は、その高い特異性から、生物学的に意味あるデータを得ることを可能にします。

特長

高感度なmicroRNAの検出・定量

microRNAの定量には TaqMan MicroRNA Assays を使用して います。すべてのTaqMan MicroRNA アッセイの反応条件は、 正確なデータを得るために最適化されています。

生物学的に意味のあるデータ:

TaqMan MicroRNA アッセイではmature microRNA だけを測 定し、precursor microRNAは測定しません。そのため生物学 的に意味のある結果が得られます。 安定性の高いデータ アッセイは、全てn=3 で行うので、より安定性の高いデータが 得られます(1 アッセイとは1 サンプル・1 遺伝子 で n=3 の測 定を意味します)。 サービスの詳細は、 http://alliance-technology.jp/LCRT-PCR.htm をご参照ください。

サンプルフォームへの記入について

取り扱い生物種:ご相談させていただきます。 解析可能なmicroRNAのリスト:下記URLをご参照ください。 http://www.alliance-technology.jp/product/qRT-PCR/ miRNA_aif.xls 絶対定量か相対定量かをお選びいただきます。 相対定量の場合、コントロール遺伝子をご記入ください。各サン プルについて、少なくとも1 個、できれば2 個のコントロールを 使用することをおすすめします。 コントロールには、以下の small RNAが適しています。 ヒト組織 マウス組織 培養細胞

RNU48 snoRNA202 RNU24 U47  snoRNA234 RNU38B

RNU6B  Z30

ご提供いただくもの

■必要なサンプル量

Total RNA 30 ng/assay(1サンプル、1遺伝子、n=3) DEPC water は、酵素反応を阻害する場合があります。  サンプルはNuclease Free 水に溶解してください。

0.5 mLチューブは輸送中に破損する恐れがあります。  サンプルは1.5 mLチューブに入れて、ご送付ください。

microRNA 研究用に各社から発売されているRNA抽出キットは、 Norgen Total RNA Purificatipn Kitのご使用をおすすめします。 RNAの単離にトリゾールは使用しないでください。

サンプルはTotal RNA でご用意ください。 ■必要サンプル純度

Total RNA の品質チェックはLC Sciences社で行います。 UV 分光光度計ではOD260/OD230比が 1.0 以上、OD260/OD280

比が 1.8 以上である必要があります。 ご注意:もし、品質チェックの結果、お預かりしたサンプルが、測 定に十分な品質を満たしていない場合、本測定前にお客 様にご連絡し、測定を中止いたします。その場合には品質 チェック手数料をご請求させていただきます。

価格

解析数 希望納入価格 基本料金 − 50,000 円 / オーダー 1 アッセイ n=3 15,000 円 / アッセイ オプション ANOVA 解析 12,000 円 / サンプル 絶対量測定 100,000 円 / カーブ  Rush サービス 40,000 円 / オーダー QC by Bioanalyzer 2,500 円 / サンプル ※1 アッセイは、1 サンプル、1 miRNA につき、n=3 の測定です。 例)無処理、処理の2 サンプルについて、1種のmiRNA発現を定量する場合: 1 サンプルにつき、miRNA 1 種 + 内部コントロール 1 種 + non template 1 種

の3 アッセイを行います。従って、2 サンプル × 3 アッセイ=6 アッセイとなります。 ※1 回のご依頼につき、基本料金が必要となります。

納品物

すべてのサンプルについて、生データと解析データを返却いた します。 複数サンプルについて、相対定量を行うことが可能です。 個々のサンプルについて、標準曲線を作成し、 microRNA発現 量の絶対定量を行うことができます(絶対量測定:標準サンプ ルを、7濃度スパイクします)。

microRNA qRT-PCR 解析

定量PCR解析

表示価格はすべて税別価格です。 株式会社アライアンステクノロジー LC Sciences社

(8)

08

遺伝子解析

ご希望の遺伝子のmRNA発現量をリアルタイムPCR で定量いたします。新規遺伝子のmRNA発現レベルの評価やRNAiに

よるmRNA ノックダウンの評価、マイクロアレイの結果の評価等にご利用ください。

受託解析サービス『MOGERA

®

』シリーズ

リアルタイムPCR遺伝子発現定量

「MOGERA

®

-Real Time PCR」

定量PCR解析

特長

さまざまなサンプルタイプに対応  組織、血液、培養細胞、パラフィン切片、Total RNA、cDNA 等、 さまざまなサンプルに対応しております(解析目的のサンプルから のTotal RNA 抽出は別途料金が必要となります)。 最短2 週間で解析結果を提供  1,000 遺伝子以上のリアルタイムPCRの定量系を構築してきた実 績があり、豊富な経験と技術により正確で迅速なサービスを提供い たします。東北化学薬品で準備しているリストに含まれた遺伝子に 関しては、反応条件が至適化されておりますので、サンプル受領後 約2 週間で解析結果を提供できます(リストに含まれる遺伝子に関 してはお問い合わせください)。また、リストに含まれていない遺 伝子も約5 週間(サンプルにより異なります)で報告可能ですの で、お急ぎの方は是非ご利用ください。

基本サービス

ターゲット遺伝子と内部標準遺伝子(ハウスキーピング遺伝子等)に ついてmRNA 発現量を測定し、ターゲット遺伝子の発現量を補正 後、相対値として報告いたします。検出法は、SYBR® Green 法、

Hybridization Probe 法、TaqMan® Probe 法からお選びいただ

けます。なお、本解析ではRoche diagnostics 社製LightCycler®

および専用試薬を使用しております。 SYBR® Green 法  2 本鎖DNAに特異的にインターカレートする蛍光色素SYBR® Green Ⅰを用いる検出方法です。アニール段階および伸長段階の 2 本鎖DNA に挿入し、励起光の照射により蛍光を発します。ター ゲット遺伝子ごとにプローブを設定する必要がないのが特長で す。標識プローブを使用する方法と比較すると安価に抑えること ができます。 Hybridization Probe 法  3’末端が蛍光標識されたドナー色素と5’末端が蛍光標識された アクセプター色素の2 種類の配列特異的Probeを用いる検出方 法です。アニール段階に両者が接近した状態で配列特異的に結合 し、励起光の照射により励起されたドナー色素からアクセプター 色素へエネルギーが転移後、アクセプター色素が蛍光を発します。  2 種類の配列特異的Probeを用いるため、検出特異性が高いのが 特長です。 TaqMan® Probe 法  5’末 端を蛍光色素、3’末 端をクエンチャー物質で標識した TaqMan® Probeを用いる検出方法です。配列特異的に結合後、 TaqMan® Probeが、DNAポリメラーゼの5’→3’エキソヌクレ アーゼ作用による分解を受け、クエンチャーによる抑制が解除さ れるため励起光の照射により蛍光を発します。配列特異的な Probeを使用するため、検出特異性が高いのが特長です。

東北化学薬品株式会社

生命システム情報研究所

サービスの流れ

ご提供いただくもの

サンプルタイプ 送付量 組織※1 20 mg 血液※2 事前にご相談ください 培養細胞※3 1×105 細胞以上 パラフィン切片 厚さ5 μm ・5 枚以上 Total RNA 5 μg 以上(500 ng/μL 以上) cDNA 20 μL 以上 ※1 組織サンプルは採取後、すぐに液体窒素で凍結処理していただくか、保存 試薬で処理してください。 ※2 血液は必ず採取24 時間以内にサンプルをお送りください。 ※3 細胞はPBS で洗浄後、上清を除去し、細胞ペレットの状態ですぐに液体 窒素で凍結処理していただくか、保存試薬で処理してください。 ※血液およびパラフィン切片は冷蔵状態(4 ℃)にてお送りください。それ 以外のサンプルについては、十分なドライアイスを同梱し、冷凍状態でお 送りください。

ご注文方法

お問い合わせください。

価格/納期

■価格 サンプルタイプ、サンプル数および検出法により異なりま すので、お気軽にお問い合わせください。 ■納期 サンプル到着後2 週間∼(至適化を行う遺伝子数およびサ ンプル数により異なります)。

納品物

解析報告書(内部標準遺伝子による補正値)

ご注意

サンプルは、平日着指定、冷凍(血液およびパラフィン切片は冷 蔵)にてお送りください。 お申し込み RNA品質確認(RNAからの実験をご希望の場合) リアルタイムPCR実験 報告、納品

(9)

08

遺伝子解析

非バイアス 次世代 TCR/BCRレパトア解析

次世代シーケンサーを用いたT細胞受容体(TCR)およびB細胞受容体(BCR)遺伝子の多様性解析(レパトア解析)の受託を

行うサービスです。Adaptor-ligation PCR法を用いることで、定量性に優れた非バイアスのレパトア解析を提供します。

特定のTCRやBCRを遺伝子レベルで同定できるため、白血病や悪性リンパ腫における微小残存病変(MRD)の検出に有効

です。

特長

次世代シーケンサーを用いたTCR、BCR遺伝子のレパトア解析を行います。 検体をお預かりし、レパトアジェネシスにてレパトア解析、データ解析を完了した後、結果をご報告いたします。 ヒト、マウスの血液、組織、培養細胞、ソート細胞のTotal RNAを解析に用います。 一つの検体で最大11項目(TCR:α、β、γ、δ、BCR:IgM、IgG、IgA、IgD、IgE、IgL、IgK)のレパトア解析が可能です。 ご希望により納期の短縮(通常2 ヶ月、最速2 週間)も可能です。

〈原理〉非バイアス次世代レパトア解析

1:TCR、BCR遺伝子の多様性 TCR、BCR遺 伝 子 は、 ゲ ノ ム 上 で は 多 数 のV(variable)、D (diversity)、J(joining)およびC(constant)の遺伝子断片からな ります。分化、成熟の過程で遺伝子再構成が行われ、それぞれ1つ ずつがランダムに選ばれて結合します。さらにV-D間、D-J間にラ ンダムに塩基の挿入や欠失が起こり、遺伝子の多様性が高まりま す。その程度はTCRで10の18乗、BCRで10の14乗におよびます。 次世代レパトア解析では、この多様性を塩基配列レベルで網羅的 に解析します。 2:3つの技術 非バイアス遺伝子増幅、次世代シーケンサー、バイオインフォマ ティクスの3つの技術から成り立ちます。非バイアス遺伝子増幅 では、1セットのプライマーで全TCR遺伝子を増幅するAdaptor-ligation PCR法を採用しています。本法ではMultiplex PCR法の ような多数のプライマー間で生じるバイアスが原理的に発生せ ず、さらにBCR遺伝子で問題となるポイントミューテーションに よるミスハイブリの心配もありません。次世代シーケンサーは、 500-600 bpのロングリード解析ができるMiSeq(illumina)、GS Junior(Roche)を採用し、1つのリードでV、D、J、C領域をアサ インメントします。バイオインフォマティクスでは、レパトア解 析専用ソフト「Repertoire Genesis」を独自開発し、レパトアジェ ネシス内の専用サーバーで解析します。

用途例

対 象 遺伝子 目 的 悪性リンパ腫白血病 TCR、BCR 腫瘍細胞の TCR、BCR 遺伝子をクローンレベルで決定、追跡、微少残存病変の検出 免疫チェックポイント阻害薬 TCR 腫瘍特異的 TCR の検出、有効性評価 骨髄移植 TCR、BCR レパトアの多様性から免疫能回復を評価 がんワクチン免疫細胞療法 TCR 腫瘍特異的 TCR の検出、有効性評価 感染症 TCR、BCR ウイルス特異的 TCR の同定、ウイルス抗原特異的抗体遺伝子の同定 自己免疫疾患 TCR、BCR 自己反応性 T 細胞や自己抗体遺伝子の同定 消化管免疫 TCR、BCR レパトアと腸内細菌叢の関連性を評価 開発支援 TCR、BCR TCR 遺伝子治療法、新規 CAR-T、抗体医薬等 非バイアス遺伝子増幅方法

(10)

08

遺伝子解析

サービスの流れ

検体種類、検体数、解析項目数、納期をお伺いし、お見積も りを提出します。 見積もり内容をご確認の上、お客様が和光純薬工業の受託解 析サービスへ発注します。 お客様がRepertoire Genesisに検体を発送します。 レパトアジェネシスにてTotal RNA抽出、品質チェックを行い ます。品質に問題がある場合はご連絡させていただく場合も ございます。 レパトアジェネシスにて非バイアス次世代レパトア解析を実施 します。 解析が完了した時点でお客様にご連絡、解析結果を報告書と DVDにて納品いたします。

ご提供いただくもの

ヘパリン等で凝固防止された血液 RNAlater等のRNA安定化試薬で保管された組織検体 ISOGEN等のRNA抽出試薬で溶解された検体 ご自身で抽出されたTotal RNA ※ Total RNAは大変分解されやすいものであり、分解されてしまいますと 良好な解析結果を得ることができません。検体を適切に処理、発送す るためのプロトコールをレパトアジェネシスホームページ内に準備してお ります。検体処理を開始する前に必ずご確認ください。

ご注文方法

和光純薬工業の受託解析サービスへご連絡ください。 受託サービス見積依頼書をご利用ください。

価格/納期

価格 納期 お見積もり内容をご確認くださ い 検体受け取り後 2 ヶ月 (最短 2 週間)

納品物

納品書、解析報告書 DVD(シーケンスデータ、レパトア解析データ、集計データ) お見積もり ご発注 RNA抽出、 QC レパトア解析 検体発送 納品

実施例

BALB/cでは、マウス乳がんウイルス(mtv)による特定のβ鎖V遺伝子欠損を有する。C57BL/6とのレパトアの傾向を比較した。 健常者PBMCにおけるTCRα鎖β鎖レパトア解析例(VJレパトア3Dグラフ、ランキング)

(11)

08

遺伝子解析

有限会社クロモソームサイエンスラボ

染色体ベースでの解析から凍結切片やパラフィン包埋切片の解析まで、FISH(fl uorescence

hybridization)法を

用いた幅広い解析を行います。染色体解析ではヒトやマウスのほか、ラット、ハムスター等のげっ歯類、ニワトリ、ニホ

ンウズラ等の鳥類、シマヘビ、スッポン等の爬虫類に至る広範囲な動物種に対応いたします。

基本サービス

高精度染色体マッピング  組織切片でのFISH解析  微生物FISH解析      ヒトおよびマウスでの染色体異常解析 ES細胞・iPS細胞の染色体検査 トランスジェニック動物のホモ・ヘテロ解析  減数分裂時の対合異常解析 解析メニュー 解析内容 希望納入価格※ 納期 高精度染色体マッピング ・cDNA、DNA クローン ( 数 kb ∼)の染色体上での位置の同定 ・遺伝子導入動物における遺伝子導入部位同定 300,000 円∼ 1.5 ヶ月 核 型 解 析 簡易核型解析 ギムザ染色による染色体数および染色体形状の確認 150,000 円∼ 1 ヶ月 マルチカラー解析 マルチカラー FISH による染色体異常の確認 400,000 円∼ 2 ヶ月 遺伝子型解析 遺伝子導入動物のホモ・ヘテロ解析 300,000 円∼ 1.5 ∼ 3 ヶ月 間期核での FISH 解析 パラフィン包埋切片、凍結切片、細胞スメアでの DNA クローン (100 kb ∼)の検出 組織切片の解析は組織や固定方法により解析条件が異なりますの で条件検討が必要となります。 条件検討用のサンプルは本解析 に使用するサンプルと同組織、同固定条件のものを使用します。 条件検討  300,000 円∼ 本解析 50,000 円∼ 照会 ※解析価格はサンプルや解析手法により異なります。解析内容、サンプルの種類、動物種等の情報をご用意の上、お問い合わせください。

価格/納期

解析例

表示価格はすべて税別価格です。

FISH法による染色体標本・組織切片の

解析

染色解析

■マウス脳パラフィン包埋切片でのY染色体とX染色体の検出 赤いY染色体ペインティングプローブのシグナルと、黄色いX染色 体プローブのシグナルが青い核の中に確認できます。 ■マウス培養細胞でのマルチカラー FISH解析 マルチカラー解析の結果、このマウス由来細胞は第6染色体のトリ ソミーおよび第16染色体の転座が確認されました。 ■トランスジェニックマウスの染色体マッピング 挿入遺伝子をプローブにFISHマッピング解析を行った結果、挿入 部位は2番染色体A2領域と同定された。 ■脳腫瘍組織での遺伝子領域のGain/Loss解析 ターゲットを黄色、リファレンスを赤色にプローブを設計しFISH を行った結果、腫瘍領域(左)ではターゲット領域のLossが確認され た。右は正常領域。 1 1 8  8   15  15 2 2 9  9   16  16 3 3 10 10  17  17 4  4  11 11  18  18 5 5 12 12  19  19 6 6 13 13  X  X 7 7 14 14   Y   Y

(12)

08

遺伝子解析

株式会社chromocenter

株式会社chromocenterは、多種多様な生物種の染色体取扱実績を有し、iPS細胞、株化細胞、組織切片等を対象とした

染色体解析サービスを受託しております。お客様の研究内容に沿った精度の高いオーダーメイドサービスにも対応でき、

全国の大学、研究機関をはじめ、製薬会社等 民間企業から高い評価をいただいています。

特長

ヒト、マウス、ラット、チャイニーズハムスター、ブタ、サル、 ウシ、その他、多数の動物種での解析実績がございます。 お客様のご希望に沿ったオーダーメイドサービスを提供いたします。 解析方法や結果についてのコンサルティング。

ご提供いただくもの

細胞(凍結細胞もしくは生細胞)、カルノア固定サンプル、スライ ド標本、組織切片のスライド標本等。 特殊な培養が必要な細胞の場合:培地および必須消耗品等。 FISH解析の場合:プローブ作製のための精製済みDNA断片、 PCR産物、BAC等。もしくは市販プローブ。

納品物

顕微鏡写真および解析データ

基本サービス

簡易核型解析(Q-band解析)  迅速に安定した解析が可能で、スクリーニングにも効果的です。 核型解析(G-band解析)   バンドの境界が明瞭なため、解像度の高い結果を得ることができ ます。 FISH解析  遺伝子の有無や染色体上での位置を特定します。 マルチカラー FISH解析  染色体の転座等を詳細に解析可能です。

主な用途

iPS細胞等の相互転座や逆位等 正常/異常判定 CHO細胞の遺伝子導入位置判定/モノクロナリティー担保 その他

FISH解析(Q-/G-band, マルチカラー)

染色体解析

サービス

納期

サービス 内 容 サンプル 納期(要相談) 簡易核型解析 (Q-band 解析) (ヒト iPS 細胞等の品質評価等へ)倍数性・異数性・染色体の構造異常の有無等を解析 ・細胞 ・カルノア固定サンプル ・スライド標本 2 週間∼ 核型解析 (G-band 解析) (ヒト iPS 細胞等の品質評価等へ)倍数性・異数性・染色体の構造異常の有無等を解析 ・細胞・カルノア固定サンプル 3 週間∼ FISH 解析 対象の遺伝子の有無の解析対象遺伝子の染色体上での位置の特定 ・細胞・カルノア固定サンプル ・組織切片のスライド標本 2 週間∼ マルチカラー FISH 解析 染色体の転座等を詳細に解析(ゲノム編集前の対象領域の解析等へ) ・細胞・カルノア固定サンプル 3 週間∼ ●FISH 解析 ●マルチカラー FISH 解析と FISH 解析 ●核型解析(G-band 解析) ●簡易核型解析(Q-band 解析)

解析例

ヒトiPS細胞 (46,XX) ヒトiPS細胞 (46,XX) CHO細胞の中のマウス人工染色体ベクター(赤)を検出し、目的遺伝子(黄緑)が搭載されていることを確 認しました。 マルチカラー FISH解析とFISH解析を 組み合わせることで、CHO細胞の染色 体構成を特定し、目的遺伝子の導入位 置を明らかにしました(黄緑)。細胞の 単一性の評価等にもご利用いただけま す。

(13)

08

遺伝子解析

8-OH-dG解析

有限会社OHG研究所

OHG研究所は、活性酸素による酸化ストレスによって生体内に生じる8-ヒドロキシ-2'-デオキシグアノシン(8-OH-dG)

を定量的に測定する独自の方法(特許取得済)をもとに、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)と紫外線検出器および電気

化学検出器を組み合わせた装置を作製しました。本装置では、尿中の8-OH-dGを高感度かつ定量的に測定することが可能

で、既存のHPLC法やELISA法よりも優れた方法です。OHG研究所では、本装置を用いた尿中の8-OH-dGの受託分析サー

ビスを提供しております。

特長

分析精度が高く、正確な測定データが得られます。 尿中濃度補正物質(クレアチニン)も同時分析できます(ヒト尿サ ンプルの場合)。

サービスの流れ

分析チャート例

ご提供いただくもの

■検体採取方法 尿をアシストの1.5 mLサンプリングチューブ(型式 A.1500)に 1 mL程度採取してください。クレアチニン補正法以外に、8-OH-dG 生成速度として評価を希望される場合は、蓄尿時間、尿量、体重の 情報も必要となります。各情報をお知らせください。 ■検体保存方法 採取した尿は、冷凍庫(−20℃以下)で長期保存が可能です。同時 に分析依頼予定の検体が集まるまで、採取済み検体は冷凍庫で保管 してください。

ご注文方法

「分析、見積り依頼書」をダウンロードし、必要事項をご記入の上、 FAX、E-mailでお送りください。 依頼書のダウンロード:和光純薬工業のホームページ(http:// www.wako-chem.co.jp)→試薬→受託サービス→8-OH-dG受託 解析→分析、見積り依頼書(xls)  ■検体送付方法 凍結した尿検体は、ドライアイスと共に適当な検体搬送ボックスに 入れ、冷凍宅配便にてご送付ください。配送料はお客様ご負担でお 願いいたします。送付先はお申し込み後にご案内いたします。

価格

■尿からの8-OH-dG分析 サンプル 測定物質 希望納入価格 ヒト尿 8-OH-dG、クレアチニン 12,000 円 / サンプル マウス・ラット尿 8-OH-dG 20,000 円 / サンプル マウス・ラット尿 8-OH-dG、8-OH-Gua 30,000 円 / サンプル ■DNAからの8-OH-dG分析 サンプル 希望納入価格 前処理済み DNA からの 8-OH-dG 分析 15,000 円 / サンプル 加水分解処理 + 8-OH-dG 分析 20,000 円 / サンプル DNA 抽出 + 加水分解処理 + 8-OH-dG 分析 40,000 円 / サンプル

納品物

結果報告書は通常E-mailで送付いたします。 ※書面での報告書、CD-ROMデータをご希望される場合はご連絡ください。

ご注意

検体は凍結保存し、必ず凍結状態でご送付ください。 ご提供いただいた検体についてお問い合わせさせていただく場合が ございます。 ご提供いただいた検体は、受付時に返却を求められない限り廃棄い たします。 表示価格はすべて税別価格です。 サービスお申し込み 正式に分析を依頼されることが決定 検体の送付・代理店への発注

(14)

08

遺伝子解析

日本薬局方参考情報「遺伝子解析による微生物の迅速同定法」に基づき、細菌16S rRNA遺伝子の一部、または、真菌

rRNA遺伝子のITS領域(Intemal Transcrided spacer:転写領域内部スペーサー)をシークエンス解析し、微生物の同定

を行います。

特長

日本薬局方に準拠  遺伝子解析による微生物の迅速同定法に基づく解析を行います。 簡便:コロニーが生じたプレートをお送りいただくだけです。 さまざまなオプション  16S rRNA全長解析等も承ります。

ご注文方法

解析依頼書に必要事項をご記入の上、FAXでお送りください。 厚手のビニール袋に入れて口を閉じ、緩衝材・保冷材・解析依頼書 を入れ、封をして発送してください。(代理店が回収いたします。) 依頼書のダウンロード:和光純薬工業のホームページ(http://www. wako-chem.co.jp)→試薬→受託サービス→遺伝子解析→微生物同 定試験→解析依頼書(pdf)

価格/納期

表示価格はすべて税別価格です。 対象 同定までの一式 PCR のみ※ 1 PCR および Seq※2 納期 細菌 30,000 円 15,000 円 20,000 円 3 ∼ 7 営業日 真菌 50,000 円 35,000 円 40,000 円 3 ∼ 7 営業日 細菌・ 真菌同時※ 3 65,000 円 50,000 円 55,000 円 3 ∼ 7 営業日 1サンプル(コロニー)当たり ※1:PCRでうまくいかなかった場合 ※2:Seq(シークエンス)、配列解析でうまくいかなかった場合 ※3:細菌/真菌の判別ができない場合にご利用いただけるサービスです。

オプション

表示価格はすべて税別価格です。 作業内容 希望納入価格 追加納期 16S rRNA 遺伝子全長解析(細菌同定のみ) 30,000 円 5 営業日 DNA 抽出(細菌同定のみ) 12,000 円 2 営業日 シークエンス解析の追試※ 1 5,000 円 5 営業日 シークエンスデータの提出※ 2 10,000 円 ※1:解析不良の場合、プライマーを変更して追加解析します。 ※2:E-mailで解析結果報告後、1 週間以内に送付します。 その他ご希望ありましたら、ご相談ください。

納品物

結果報告書はE-mailで送付いたします。 解析終了後のサンプルは東洋紡にて廃棄いたします。 返却をご希望される場合は、有償にて対応いたします。 菌回収 菌培養 解析対象の指定 落下菌などを 回収 冷蔵保存培養後 試験を行うコロニーにナンバリングし、ビニー ルテープなどで密閉 解析 依頼書 緩衝材 保冷剤

サンプルの準備

ご提供いただくもの

解析依頼書 生菌(プレート) ビーズ破砕と熱処理後、PCR シークエンス反応とDNAシークエンサーによるDNA配列の解析 相同性検索 結果報告書をE-mailで送付いたします。

ご注意

ヒト由来の検体もしくは病原性を有する可能性がある微生物の場 合、お受けできません。 診断目的には使用できません。 結果は候補であり、菌種の特定はお客様でお願いいたします。

サービスの流れ

解析依頼書に必要事項をご記入の上、サンプル(生菌(プレー ト))とともにご送付ください。 お問い合わせ 解析依頼書・サンプルご送付 解析作業 報告 検体名称 試験方法 結果 一致率 判定結果 備考 No.1 細菌同定 ○ 99.68 % ATCC=29974 99.44 % ATCC=49330 98.11 % 97.44 % 97.40 % No.2 細菌・真菌同時同定 ○ 99.75 % ATCC=10792 細菌を検出 99.63 % ATCC=33679 99.63 % DSM=6091

結果報告例

微生物同定試験

微生物

同定・分析

(15)

08

遺伝子解析

サザンブロット/ハイブリダイゼーション

ゲノムDNA 抽出/精製

パルスフィールド電気泳動

生体組織からゲノムDNA を抽出・精製し、サザンブロットを作製します。作製したサザンブロットを用いてハイブリダ

イゼーションし、オートラジオグラフィー(RI)によるジェノタイピングを行います。遺伝子改変動物等のジェノタイピ

ングに有用です。

遺伝子改変動物の組織からゲノムDNA を抽出・精製します。精製したDNA はPCR、サザンブロッティング等に使用で

き、ジェノタイピングに有用です。

アガロースゲル電気泳動で分離できない高分子DNAサンプルをパルスフィールド電気泳動にて分離・精製を行います。

約4 週間 約2 週間 約2 週間 遺伝子改変動物からの組織 ジェノタイピングデータ 分離されたDNA断片、電気泳動画像 1 検体あたり3,500 円(ただし基本料金として1回あたりのオー ダーにつき50,000 円加算) 価格例 10 検体の場合 3,500 円×10 検体+50,000 円=85,000 円 1 検体あたり2,500 円(ただし基本料金として1 回あたりのオー ダーにつき50,000 円加算) 価格例 10 検体の場合 2,500 円×10 検体+50,000 円=75,000 円 1 検体あたり300,000 円 パルスフィールド電気泳動装置

納期

納期

納期

解析サンプル

納品物

納品物

価格

価格

価格

解析例

(16)

08

遺伝子解析

クローニング・プラスミド構築

株式会社プロテイン・エクスプレス

ご希望の遺伝子をご希望のベクターに組み込むサービスです。

特長

ベクター、塩基配列確認データを納品いたします。 ご希望遺伝子をお持ちでない場合も対応いたしますので、ご相談 ください。

基本サービス

ご希望遺伝子の鋳型、必要であればご希望のベクターをご提供 いただき、PCR増幅後ベクターに、ご希望遺伝子を導入いたし ます。 ※TAクローニング、または制限酵素による導入もいたします。 クローニング後、塩基配列の確認(片側)を行います。

価格/納期

メーカー コード サービス項目 (1検体あたり)希望納入価格 納期 CS401 クローニング・プラスミド構築 110,000 円∼ 4 週間∼ 各種オプションはお問い合わせください。

オプション

長鎖遺伝子の導入     両鎖塩基配列確認 プラスミド大量調製    低エンドトキシンプラスミド調製 変異導入   ご希望遺伝子をお持ちでない場合の対応例   人工遺伝子作製   組織、培養細胞等からのcDNA調製   cDNAライブラリーからのクローニング 表示価格はすべて税別価格です。

non-GMPグレードのプラスミド精製

株式会社AMBiS

お客様からご提供いただいたプラスミドおよび宿主大腸菌を用いてnon-GMPグレードのプラスミド精製を行うサービス

です。

注文単位

μgスケール:50 クローンから承ります。 mgスケール:スタンダード・エンドトキシンフリーの         non-GMPプラスミドを必要量提供いたします。

ご提供いただくもの

プラスミド(濃度:0.1 μg/μL以上、液量:20 μL以上) 挿入遺伝子情報、ベクター情報、プラスミドマップ等のプラスミ ド生産確認に必要な情報

価格/納期

■価格 お問い合わせください。 ■納期 受け入れ検査 1 週間 1 ∼ 50 mg 2 ∼ 3 週間 50 mg 以上 3 週間∼ ※納期は、サンプル受領後からです。

試験項目

吸光度 アガロース電気泳動 エンドトキシン濃度 ■秘密保持契約について 遺伝子の名称および由来が最低限必要となります。 秘密保持契約が必要な場合にはご連絡ください。

(17)

08

遺伝子解析

GMP準拠の製造施設による高純度なプラスミド受託生産サービスです。治験薬の製造にも対応することが可能です。ま

た、TFF(タンジェンシャルフローフィルトレーション)システムを導入することにより、遠心分離操作を不要としたプ

ラスミドの濃縮および連続閉鎖系でのbuff er交換を可能にしました。ポンプを動力源にして、システム内に原液を還流

させ、膜面に平行に液を流し、不純物の除去や必要物の濃縮を行います。フィルター部分に各種の膜を選定することによっ

て、さまざまな分子サイズに対応することができます。

TFF膜利用による抽出、ろ過の特長

完全閉鎖系サニタリー配管で連結しています。 消泡装置を設置し培養容量効率70 %以上です。 CIP洗浄・殺菌、SIP滅菌が可能です。 完全自動で運転し運転記録を保存しています。 植菌、回収時の無菌化ができます。 特許第3547715 米国US 6,773,913B2

生産設備

■種菌培養室 お預りした検体をこの部屋でスケールアップ し、大量培養のための種菌の準備をします。 AMBiS社が開発した物理的消泡装置により、 培養装置の全容量の60 ∼ 70 %液量で培養が 可能です。 ■ハザード室 大量培養から粗精製までを行う部屋です。タンパク質の生産に関 しては下記ラインから菌体抽出し、破砕、精製へと工程を移して いきます。 ■精製室1 上記ハザード室の大 量培養・粗精製装置 から得られたものを クロマトで精製する 部屋です。 株式会社AMBiS ■精製室2 精製室としていますが、精製室1で精 製されたものを分注等 行う部屋です。

サービスの流れ

組換えプラスミドをお預りし、遺伝子配列の確認をします。 実製造の前に、培養条件検討や小スケールでの製造検討を行 い、収量の確認や精製条件の検討を行います。 GMP 準拠にてマスターセルバンク(MCB)、ワーキングセル バンク(WCB)を製造します。また、プラスミドDNAを1 ロッ ト500 mg以上精製します。 MCB/WCB品質試験(MCB/WCB試験項目例) 遺伝子組換え体: 塩基配列解析・エンドトキシン・純度試験・ 安定性試験 他 宿主 : 特性解析試験・純度試験・安定性試験 他 遺伝子組換え生物: 塩基配列解析・エンドトキシン・残留抗生 物質確認試験・純度試験・安定性試験 他

価格/納期

お問い合わせください。

オプション

MCB/WCBおよび精製したプラスミドは、ご要望に応じてバイア ルに分注して納品いたします。 プラスミドはご要望に応じて濃度調製も承ります。 MCB/WCB その他微生物の保管も承ります。

ご注意

上記品質試験項目はICH※の勧告に基づいた試験を予定していま す。詳細につきましてはお打ち合わせの上、決定いたします。 ※International Conference on Harmonisation of Technical Requirements

for Registration of Pharmaceuticals for Human Use(日米EU医薬品規制調 和国際会議) タンク ポンプ ポンプ ろ液 培養液 TFF膜 種菌培養装置 大量培養ライン 粗精製ライン 【90 L培養装置】 90 Lと小ぶりではありますが、この培養タンクに おいても独自の物理的消泡装置と高密度培養技 術により500∼1,000 L級のタンクに匹敵する能 力を有しています。 カラム1 DNAとRNAの分離 ocDNAとscDNAの分離カラム2 エンドトキシンの除去カラム3 ↑

DNA RNA↑ ocDNA↑ scDNA↑ scDNA↑

受け入れ検査 試験製造 製造 品質試験

GMP準拠設備での高品質なプラスミド生産

GMP準拠・

プラスミド生産

参照

関連したドキュメント

 本研究所は、いくつかの出版活動を行っている。「Publications of RIMS」

Supersingular abelian varieties and curves, and their moduli spaces 11:10 – 12:10 Tomoyoshi Ibukiyama (Osaka University).. Supersingular loci of low dimensions and parahoric subgroups

3 Numerical simulation for the mteraction analysis between fluid and

・Hiroaki Karuo (RIMS, Kyoto University), On the reduced Dijkgraaf–Witten invariant of knots in the Bloch group of p. ・Daiki Iguchi (Hiroshima University), The Goeritz groups of

Essential Spectra for Tensor Products of. Linear

Mochizuki, Topics Surrounding the Combinatorial Anabelian Geometry of Hyperbolic Curves III: Tripods and Tempered Fundamental Groups, RIMS Preprint 1763 (November 2012).

Research Institute for Mathematical Sciences, Kyoto University...

初 代  福原 満洲雄 第2代  吉田  耕作 第3代  吉澤  尚明 第4代  伊藤   清 第5代  島田  信夫 第6代  廣中  平祐 第7代  島田  信夫 第8代