機能解析（GSEA解析）
ミクログリアにおけるMafBの機能解析
... ミクログリアは中枢神経系に存在する組織マクロファージである。近年の Fate mapping によって、 ミクログリアは、造血幹細胞由来のマクロファージとは発生系譜が異なり、卵黄嚢由来であることが明 らかになっている。また、特有の遺伝子発現プロファイルを示しており、独自の分子ネットワークが形 成されていることが示唆されている。granulocyte-macrophage colony-stimulating factor ...
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3次元可視化解析機能と 市民サイエンスデータの利活用
... – 大量データの取り扱いをサポートするツール群 • データアップロード、データ品質管理、データ公開、データ解析を統合 – 各ツールにおいてデータハンドリング作業が不要 • サーバ上にデータを蓄積 ...
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口腔扁平上皮癌におけるClaudin1の発現機構ならびに機能解析
... １ 今回研究では主に 1 細胞株を実験に使用しているが、今回の知見は口腔扁平上皮癌全 体に普遍化できる知見かどうか ２ Claudin family の正常および癌における機能について ３ Claudin1 の発現変化による tight junction のバリア機能の変化と、今回の知見との関 連性について ...
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ポリコーム群遺伝子Pcgf5の造血幹・前駆細胞における機能解析
... To exclude any influences of the loss of Pcgf5 on organs other than hematopoietic system, we transplanted BM cells from Cre-ERT control and Cre-ERT;Pcgf5 fl/fl mice with [r] ...
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γδT細胞の分化制御におけるSkintファミリーの機能解析
... Vγ5Vδ1 γδT 細胞以外のリンパ球への影響を調べるため、胸腺及び脾臓における γδT 細胞以外の主要な免 疫細胞をフローサイトメトリー法により解析した。野生型マウス及び SKLD マウスの胸腺における αβT 細胞の分 化に変化は見られなかった。また、 NKT 細胞や制御性 T 細胞の分化にも変化は見られなかった。さらに脾臓 における αβT 細胞、B 細胞、樹状細胞、ミエロイド細胞及び NK ...
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脳の発生、発達、病態におけるスフィンゴ糖脂質の機能解析研究
... 一方、スフィンゴ糖脂質のライソゾームにおける分解障害であるライソゾーム病は、 その多くが神経系に重篤な障害をきたす。治療法としては、酵素補充療法、骨髄移 植などの効果が報告されているが、神経病変に対する効果はいまだ極めて乏しい。 我々は、これまでの研究で、スフィンゴ糖脂質代謝関連遺伝子のノックアウトマウ スを作成し、その表現型の解析を行ってきた。本研究では、我々が作成したノックア ...
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共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... 方法 • 研究項目として、検出するターゲットは PROSITE, Pfamから 得ることのできる 機能ドメインと機能モチーフに対象を絞る 。 • 共起関係は１対１ の関係に絞って解析手法を確立する。 ...
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植物低温シグナル伝達におけるMCAsおよびPIF4の機能解析
... るが、その詳細な分子機構は明らかにされていなかった。そこで、論文第二部において著者は、光シ グナルに関与する転写因子PIF4に着目して、PIF4による低温ストレス応答および低温ストレス応答性 遺伝子の発現調節に関する機能解析について報告している。著者は、PIF4はICE1の相互作用因子とし て同定してきた。pif4変異体では、低温ストレスに対して抵抗性が増加するとともに、CBF/DREB1やそ ...
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CREBHによるChREBPを介した肝臓フルクトース代謝の機能解析
... The effects of CREBH on ChREBP-mediated hepatic fructose metabolism （CREBH による ChREBP を介した肝臓フルクトース代謝の機能分析） 主 査 筑波大学教授 医学博士 川上 康 副 査 筑波大学講師 博士（医学）福田 邦明 ...
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骨格筋発生分化における転写因子Lhx2の機能解析
... 本論文は、１）転写因子 Lhx2 が Msx1/2 遺伝子の発現誘導を介して骨格筋分化を抑制 することの発見、そして２）その分子メカニズムの解明が主な内容である。 Lhx2 は肢芽で 強く発現しており、その生理的意味と下流制御遺伝子を同定したことは、骨格筋発生分野 の進展に貢献する素晴らしい研究成果である。この研究を通じて、本論文提出者は転写制 ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... Pbp1 の Lsm ドメインは Pbp1 の機能に必要であることが示唆された（図 15）。 Pbp1 は Pab1 依存的に khd1Δ ccr4Δ二重変異株の細胞増殖を負に制御する これまでの解析から、 Pbp1 の機能には Lsm ドメインが必要であることが示唆 された。またその他のドメインとして、Pbp1 は C 末端に self-interacting region ...
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慢性呼吸器疾患におけるIL-17F及びNrf2の機能解析
... - ２ は IL-17F の機能として、P-TEFb を活性化することで、気道平滑筋から IL-8 の発現を誘導することを 確認したものである。また著者は、従来ステロイドは NFκB を抑制することで炎症性サイトカインの 発現を抑制すると考えられてきたのに対し、IL-17F による IL-8 の発現には NFκB は関与せず、ステ ロイドは P-TEFb を抑制することで IL-17F による IL-8 ...
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多孔質弾性体と流体の連成解析 (非線形現象の数理解析と実験解析)
... デル化した「容器に封入された流体に飽和した多孔質弾性体が浮かんでいる．容器に衝撃 を与えたとき，流体を介して多孔質弾性体内部にどのような応力が発生するか． 」という 問題を解析することで，反衝損傷などの損傷が起こる機序を明らかにしたいと考える． そのためには，飽和した多孔質弾性体と流体が連成する系の物理モデルが必要である． ...
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マウス神経発生における低分子量Gタンパク質Arl8bの機能解析
... 哺乳動物には Arl8a と Arl8b の 2 種類のアイソフォームが存在するが、 「マウ ス神経発生における低分子量 G タンパク質 Arl8b の機能解析」と題した本論文 では、Arl8b ノックアウトマウスの表現型解析を行っている。その結果、Arl8b が初期胚において Bmp シグナルの制御を介した脳神経発生に重要であることを 見出した。 ...
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リンパ管内皮細胞及び腎臓がん細胞におけるTGF-βファミリーの機能解析
... 6. 腎細胞がん細胞における c-Ski の機能を調べるために、腎細胞がん細胞 Caki-1 に c-Ski を安定発現させた株を樹立し、腫瘍形成能を評価した。腎皮膜下移植では、コントロ ールの細胞を移植したマウスと比べて c-Ski 安定発現細胞を移植したマウスで有意に 腫瘍形成が亢進していることがわかった。腎細胞がんでは c-Ski が腫瘍形成に寄与して いることが示唆された。 ...
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目次 生命科学系の研究分野において主にゲノムデータ解析用の プラットフォームとして使われている Galaxy について オンデマンドクラウド機能を活用して解析環境を提供する 事例をご紹介します 1. データ解析プラットフォーム Galaxy とは 2. Galaxy によるNGSデータ解析について
... ▪ データ解析者（利用者）とツール開発者（実装者）は必ずしも 同じではない ⇒ 利用者がツールの挙動を完全に把握しているとは限らない ▪ 昨今は、ツールの「コンテナ化」が解決の一助となっている ...
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シャペロニンGroELの機能発現におけるドメイン構造変化の速度論的解析
... ｌ 変異体ＧｒｏＥＬＲ231Ｗの基礎的な特徴を調べるため，様々な基質タンパク質のリフォールディング 実験を行った結果，非常に厳密にＧｒｏＥＳとＡＴＰを要求する基質タンパク質めリフォールディング を補助することができ，野生塑ＧｒｏＥＬと同等の機能を保持していた。また，この変異体ＧｒｏＥＬは 大腸菌の生育を補助できたことから，メ乃Ｖル0においても野生型と同様に機能発現す[r] ...
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ヒトの上肢運動に関連した脊髄固有ニューロンの機能解析
... れてきた 5） 。しかし Pierrot-Deseilligny らは刺激強度を上 げると抑制効果に反転すると報告しているが，刺激が弱け れば抑制効果に妨害されず促通効果が必ず観察できるのか， 被験者ごとにどの刺激強度を用いれば促通効果が観察され るのかは検討していない。患者で PN の機能検査を行う上 で，どの被験者でも観察できる手順を確立することは重要 Fig. 7 Three possible mechanisms ...
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インフルエンザウイルス感染における肺由来エクソソーム内microRNAの同定と機能解析
... 5. miR-483-3p を導入した MLE12 では転写因子である IRF3 と NF-κB の核移行が 促進しており、さらに RIG-I like receptors を介するシグナル伝達に重要な分子であ る MAVS をノックダウンした細胞では miR-483-3p による IFN-β発現増加が認めら れないことから miR-483-3p は RIG-I シグナル経路依存的に機能していることが示 された。 ...
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マウス嗅神経回路形成におけるKirrel3陽性僧房細胞の機能解析
... 本論文では kirrel3という単一の分子に着目した解析に留まっているが、僧帽細胞にお ける遺伝的サブタイプに着目した投射解析の有効性を初めて示したという点において 先駆的な研究であり、学位申請者の業績は博士（医科学）の称号を受けるにふさわしい と審査委員全員が判断した。 ...
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