核酸タンパク質複合体(SPIC)
酵母におけるRNA結合タンパク質Puf5とCcr4-Not複合体による遺伝子発現の転写後制御
... protein Puf5 and the Ccr4-Not complex in yeast （ 酵母におけるRNA結合タンパク質Puf5とCcr4-Not複合体による遺伝子発現の転写後制御 ） ○ 指 導 教 員 人間総合科学研究科 生命システム医学専攻 入江賢児 教授 ...
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鉄硫黄クラスター生合成系SUFマシナリーにおける中核成分SufBCD複合体の機能解析
... sufB 、 sufD に対する部位特異的変異は inverse PCR 法、または QuikChange 法を利用して 導入した。具体的には、pBBR-sufAB 、 pBBR-sufD 、 または pRK-sufCDSE プラスミドを鋳 型として、inverse PCR 法の場合には片方のプライマーの 5’末端に目的の塩基置換が入 るように設計したプライマーを用いて PCR を行った。続いて DpnI によって鋳型のプラ ...
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TGFα切断を用いたGタンパク質共役型受容体の活性化検出系の開発とその応用
... いため、特定の細胞内イベントを測定するだけでは、網羅的に GPCR の活性化を検出できな い。さらに、Gα 12/13 シグナルの検出系の開発は遅れており、Gα 12/13 共役型受容体の機能を解 明する上で大きな障壁となっている。 これまでに私は生理活性脂質リゾホスファチジン酸（LPA）の産生酵素の遺伝子欠損マウ スの解析から、LPA が毛髪形成に必須の役割を果たしていることを明らかにした（Inoue et al., ...
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メチル化CpG結合タンパク質MeCP2とJCウイルスタンパク質の相関に関する研究
... メチル化 CpG 結合タンパク質 MeCP2 と JC ウイルスタンパク質の相関に関する研究 【背景と目的】 JC ウイルス (JCV) は simian virus 40, BK ウイルス等が含まれるポリオ ー マ ウ イ ル ス に 属 す る . 進 行 性 多 巣 性 白 質 脳 症 (progressive multifocal leukoencephalopathy, PML) は , ...
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青色光センサータンパク質TePixDの光反応中間体の構造揺らぎ検出とその機能的重要性に関する研究
... 0量体は5量体2つへと光解離をする。この10量体の解離反応には弱い励起光条件の下 で10量体中のモノマー1つが励起されたときにのみ起こり複数個が同時に励起される と起こらないという特異な性質があるが、その原因は全く分かっていなかった。本研 究ではこれが光反応中間体（I 1 とI 2 ）の持つ揺らぎの差異に起因するのではないかと予 ...
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ホリスタチン関連タンパク質はCD14とToll様受容体4を介して自然免疫反応を惹起する
... （論文審査の結果の要旨） 関節リウマチの自己抗原である FRP はこれまで免疫系での作用や分子レベルでの作 用機序について十分な解明がなされていなかったが、 FRP が CD14 と結合する知見が 得られていたことから、 FRP が CD14 と TLR4 を介して自然免疫反応を惹起する可能 性が検討された。ヒト FRP はヒト培養関節滑膜細胞の IL-6 産生を促進し、マウス FRP はマウス線維芽細胞株 NIH-3T3 の IL-6 ...
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高度化 我々は 多数回膜貫通型の膜タンパク質や高分子量ヘテロ複合体等の高難度タンパク質を標的とする創薬開発を支援することを目指して タンパク質調製のための新たな技術の高度化を行ってきた 当初計画に 本年度の本事業の支援 コンサルテーション等を通じて明らかになった新たなニーズを反映させて 高度な基盤的
... 262. "大腸菌無細胞タンパク質合成系を用いた膜タンパク質の発現", ポスター, ○田辺弘明, 横山 茂之 , JST 研究加速プログラム 平成 28 年度リトリート 膜蛋白質構造基盤プロジェクト 研究成果報告会 , 2016/9/20-21, 国内 263. "Crystal structures of the human adiponectin receptors", ...
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加藤晃一 ( 教授 )(2008 年 4 月 1 日着任 ) A-1) 専門領域 : 構造生物学, タンパク質科学, 糖鎖生物学,NMR 分光学 A-2) 研究課題 : a) NMR 分光法をはじめとする物理化学的手法による複合糖質およびタンパク質の構造 ダイナミクス 相互作用の解析 b) 生化学
... 加藤晃一, 「NMR とSANS によるタンパク質の動的構造解析」, 中性子連携研究会, 東京, 2013年 3月. 加藤晃一, 「NMR を用いた生体分子のダイナミクスの解析」, 大阪市立大学分子ナノ情報解析センターユーザーズミーティン グ, 大阪, 2013年 4月. 加藤晃一, 「生命分子のダイナミクスと自己組織化」, 国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺ら ...
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U snRNAの核外輸送複合体の形成に関与する因子の解析
... SMN 複合体も分子シャペロンとして働いており、U snRNA の Sm 配列上にヘテロ 7 量 体から構成される Sm タンパク質群をリクルートする。おそらく、本研究で解析を行った p54nrb と PSF も分子シャペロンのように機能し、U snRNA 核外輸送複合体である輸送 RNP の形成を保証しているのではないかと考えられる。 ...
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1. 背景血小板上の受容体 CLEC-2 と ある種のがん細胞の表面に発現するタンパク質 ポドプラニン やマムシ毒 ロドサイチン が結合すると 血小板が活性化され 血液が凝固します ( 図 1) ポドプラニンは O- 結合型糖鎖が結合した糖タンパク質であり CLEC-2 受容体との結合にはその糖鎖が
... ポドプラニンは O-結合型糖鎖が結合した糖タンパク質であり、CLEC-2 受容体との 結 合 に は そ の 糖 鎖 が 必 須 で す 。 ロ ド サ イ チ ン は マ レ ー マ ム シ （ Calloselasma rhodostoma ） より同定されたタンパク質性のヘビ毒です。ロドサイチンは糖鎖を持っ ていないのですが、CLEC-2 ...
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みどりの葉緑体で新しいタンパク質合成の分子機構を発見ー遺伝子の中央から合成が始まるー
... 次いで、国際的に葉緑体ゲノムの発現（働き）の研究が主流となってきました が、分子機構の解明は遅々として進みませんでした。この閉塞状況を打破する ため、我々はタバコの葉から葉緑体を単離してその抽出液を用いて遺伝子の情 報をもとにタンパク質を合成する過程を正確に試験管内で再現する系の開発に 挑み、世界ではじめて成功しました（図２）。この技術（試験管内タンパク質 ...
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細胞損傷タンパク質パラスポリンを通して見るCryタンパク質の可能性
... 8 ループなど分子表面に露出すると考えられる 様々な領域が候補になっている。また，それ以外にドメ イン皿を介して N- アセチルガラクトサミンを含むタン パク質糖鎖と結合するトキシンも存在する。結合先とな る受容体についてもカドヘリン様タンパク質やアミノペ プチダーゼ N ，アルカリフォスファターゼ ¥P252 など 膜タンパク質や糖脂質など，毘虫幼虫中腸上皮組織の原 [r] ...
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核酸精製キット第5版カタログ(軽量版) (軽量版)
... （コレクションチューブ付） DNA 結合 100 個 ×2 ろ液回収 ①Buffer RL 100 mL×1 細胞溶解 ( 血液用 ) ②Buffer TL 30 mL×1 組織溶解 ③Buffer TB 50 mL×1 DNA 結合促進 ④Buffer BW 80 mL×1 カラム洗浄 ⑤Buffer TW 100 mL×1 カラム洗浄 ⑥Buffer AE 30 mL×1 DNA 溶出 ⑦Proteinase K 48 mg×1 ...
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４章 困難な課題への挑戦 核酸結晶学
... 4-2-6. 核酸の結晶調製 I. はじめに a. 核酸結晶学のあゆみ DNA に始まる核酸の構造研究は，タンパク質とは異なり線状の高分子であるが故に結晶 化が極めて難しく，１軸あるいは２軸方向に配向した繊維状の物質として扱い，タンパク 質に見られる単結晶とは異なる方法論によって進められてきた．その後 DNA や RNA など ...
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Contents イントロダクション 2 NanoLuc アプリケーション 5 タンパク質の安定性 5 タンパク質間相互作用 6 タンパク質発現検出(HiBiT) 10 タンパク質 -リガンド相互作用 12 HaloTag アプリケーション 13 分子間相互作用 13 イメージング 16 タンパク質
... ■ 哺乳細胞内（ in vivo ）で形成されたタンパク質間相互作用の検出（ bait/prey = 哺乳動物細胞発現タンパク質） in vivo におけるタンパク質間相互作用の分析は、より生体内に近い状態で厳密な相互作用を再現できるため非常に重要です。 HaloTag ® Mammalian Pull-Down and Labeling System は、 HaloTag ® ...
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学位論文要旨 北里大学大学院薬学研究科薬科学専攻生命薬化学研究室 氏名木浦和哉印 題目 ナルトレキソンからメセンブランへの変換および中間体の誘導体を用いたメセンブラン アナログのオピオイド受容体に対する親和性の検討 1. 背景 目的 Gタンパク質共役受容体に属するオピオイド受容体には (MOR) (
... へと変換するとともに誘導化を行い、メセンブラン(4)および鍵中間体 6 の誘導体についてオピオイド受 容体に対する結合親和性を評価することとした(Scheme 1)。 Figure 1. Sceletium alkaloids 1 – 4 と naltrexone (5)の構造 Scheme 1. Naltrexone (5)から mesembrane (4)への変換における戦略 ...
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タンパク質を物性科学的に見た場合、単なるアミド結合の集合体であると片づけるにはもったいなさすぎる
... 17 。 SOD は細胞質からスーパーオキサイド O 2 - ･を O 2 と H 2 O 2 に不均化する反応を触媒する酵 素であり、医学的あるいは化粧品などの観点から興味深い酵素である。真核生物の SOD は 銅と亜鉛を活性中心に含み、銅イオンには３つ、亜鉛イオンには２つのヒスチジンがそれぞ れ配位し、ひとつのヒスチジンが銅イオンと亜鉛イオンに配位した架橋構造をとっている。酵 ...
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NiCo2S4とその複合体の合成、キャラクタリゼーション及び高性能スーパーキャパシタへの応用
... 14 Electrochemical performance of AC: (a) CV curve; (b) GCD curves; (c) specific capacitance versus different current densities; (d) cycle performance Prior to fabricating an ASC, the [r] ...
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Ligases の 分類クラス下に階層構造として表 検索機能を持つ 公共データベースサイトへのリンクと構成タンパク質の LSKB 内リンクにより 当該タンパク質をターゲットとする化合物をさまざまな角度から ることができるほか タンパク質を構成するドメインや PDB 複合体リガンド 文献を参照できる
... – タンパク質ドメインデータベースの搭載 同ドメインのデータベースを搭載。従来の Pfam と同時に利⽤することで、網羅性を上げることが目 的。情報量の少ないタンパク質をターゲットとする化合物を探しやすくなった。 また、Pipeline Pilot の利⽤で、距離情報を利⽤して PDB ligand とドメインの結合情報を取得するこ とができる。 ...
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タンパク質と核酸 遺伝子をはかる 核酸 (DNA RNA) の定量法 吸光分析法と蛍光分析法を中心に 柴山祥枝 1 はじめに 核酸 (DNA や RNA) はウイルスを含むすべての生物の遺伝情報を担う物質であり, 近年, 技術の進歩や社会的なニーズの増大に伴い様々な分野で定量が行われるようになってき
... A 混合物 ＝ A 化合物 A ＋ A 化合物 B ＋ … ＋ A 化合物 N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ( 4 ) そのため，核酸測定で用いる 260 nm の波長に吸収を 持つ物質が試料中に混入している場合，核酸の濃度とし ...
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