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クローバー葉脈黄化ウイルスゲノム複製における

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Academic year: 2021

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博 士 ( 農 学 ) 関 口 博 史

学 位 論 文 題 名

クローバー葉脈黄化ウイルスゲノム複製における 3 末端領域シス因子の解析

学位論文内容の要旨

  クローバ ー葉脈黄 化ウイル スclover yellow vein virus(CIYVV)は、ポティウイル ス科ポテ ィウイル ス属に属する。そのゲノム構造は、ピコルナウイルスと類似してお り、一本鎖(十)RNAで、5 末端にVpgタンパク質が結合しており、3 末端にポリアデニ ル鎖を持 つ。その 遺伝子発 現機構はウ イルスにコードされているーつのORFが翻訳さ れた後、 自身のプ ロテアーゼにより切断され、成熟したタンパク質となる。これまで にピコル ナウイル スでは、複製に関与するシス因子の研究が数多くなされているが、

ポティウ イルスに 関しては 、殆ど知見 がない。そこで本研究は、CIYVVの感染性cDNA を用いて、ゲノムの3 末端領域に存在する、複製に関与するシス因子を特定すること を第一の目的とした。

  ポティウイルスの複製において、ポリアデニル鎖(ポリA鎖)は重要なシス因子であ ることが 知られて いる。ピ コルナウイ ルスの感染性cDNAには、長鎖(50塩基以上)の ポリA鎖が 含まれており、ウイルス感染におけるポリA鎖の重要性が指摘されている。

しかしな がら、CIYVVの 感染性cDNAで は、ポリA鎖 がなくと も感染す ること、親ウイ ルスが持たないポリA鎖が子孫ウイルスでは付加していたこと.が、すでに明らかとた っている 。これは ポリA鎖がCIYVV感染に必ず しも必要 ではなく 、複製の 段階でポリ A鎖付加の ステップ が存在す ることが考 えられる 。そこで 本研究は 、ポリA鎖付加の メカニズムを解明することを第二の目的とした。

1)ゲノムの3 末端領域に存在する、複製に関与するシス因子

  ウイルス複製に必要な3 末端領域に存在するシス因子を解明する目的で、3 非翻訳 領域を欠損させたcDNAクローンを作製した。3 非翻訳領域の塩基配列解析より、5 ー UAAGUGAGG−UUUUACCUC―3 の繰り返し配列が2カ所見っかり、二次構造解析の結果、こ の繰り返 し配列が ヘアピン構造に隣接していることが見出された。この結果を基に、

2つの繰り 返し配列 のどちら か一方、も しくはその両方を欠損させるよう、cDNAクロ ーンを作 製した。 接種試験では、作製したクローン全てで感染性が消失していた。ま た、3 末端領域を重複させたクローンを作製し、接種した結果、野生型と比較して感 染率は低 かったも のの、感 染性が認め られた。その感染植物の子孫ウイルスRNAを解 析したところ、親ウイルスが持つ3 末端領域の重複配列は消失し、野生型と同じ配列 に回復していることが明らかとなった。これらの結果から、3 非翻訳領域はウイルス 複製における非常に重要なシス因子であること、また3 末端領域に重複配列が存在し

(2)

て も 、 組 換 え 現 象 に よ り 、 野 生 型 の 配 列 に 復 帰 す る こ と が 示 唆 さ れ た 。   シス因子解明のための実験系確立を目的に、bean yellow mosaic virus(BYMV)のCP 遺伝 子をCIYVVのNIb/CP遺伝 子間 に挿 入し、pCIYVV CP/BYCP/Wを構築して感染性を 調べ た。野生型のCIYVVと同様の感染性を示した。BYMV―CPの発現をウェスタンプロ ッティングにより確認したところ、CIYVV−CPと移動度が同じ、あるいはCIYVV―CPと BYMV→CPとの中間の移動度を示すバンドが確認された。BYMV―CP遺伝子挿入部位をRT― PCRに より解析した結果、BYMV−CP遺伝子を保持しているもの、あるいは欠失してい ると思われるバンドが複数存在するものが、一個体の接種植物から確認され、異なっ たCP遺伝子を持つ子孫ウイルスRNAが存在していることが示唆された。BYMV−CPと同 じ移 動度 を示し た子 孫ウ イル スRNAの3 末 端領 域を 解析 した ところ、CP遺伝子のN 末端 側がBYMVーCP遺 伝子695塩基 、C末端側がCIYVV―CP遺伝子127塩基からなるキメ ラウ イル スであ るこ とが 分か り、 両CP遺伝子の間で組換えが起こったことが明らか とな った。CP遺伝子の大部分がBYMV−CP遺伝子であってもCIYVVは野生型と同様の感 染性 を示したことから、ウイルス複製において、CP遺伝子のC末端領域が非常に重要 なシス因子である可能性が示唆された。

2)ポリA鎖付加のメカニズム

  ポティウイルスは、3 非翻訳領域の後にポリA鎖を持ち、どちらもウイルス複製に とっ て重 要であ ると いわ れて いる 。しかし、CIYVVの感染性cDNAでは、ポリA鎖がな くと も感染し、親ウイルスが持たないポリA鎖が、子孫ウイルスでは付加していたこ とが 報告されている(Tacahashi and Uyeda,1999)。これより、ウイルス複製の段階 でポ リA鎖 付加 のス テッ プが 存在 することが考えられる。そこで、ポリA鎖付加のメ カニ ズムを解明することを目的に、CIYVVの3 非翻訳領域を導入した3種類の形質転 換Nicotiana  benthamianaGFPAl OUC、GFPAOUC、GFPAOを作製した。GFPA10UCは、GFP 遺伝 子の 下流にCIYVVの3 非 翻訳 領域およぴポリA鎖とこれに統いてpUC配列をもつ DNAを 導入 して ある 。GFPAOUCは、GFP遺伝子 の下 流にCIYVVの3 非翻訳領域とこれ に 統 いてpUC配 列を もち 、ポ リA鎖 は持 たな い。 また 、GFPAOで は、GFP遺 伝子 の下 流にCIYVVの3 非翻 訳領 域を もつDNAを導入 して あり 、ポ リA鎖とこれに統いてpUC 配列を欠いている。  外来遺伝子mRNAの3 末端領域をRT−PCRして、塩基配列を決定 した。全ての形質転換植物において、3 非翻訳領域の1塩基目を1番とした場合、28、 115番 目でポリA鎖が付加したクローンが数多く検出された。また、3 非翻訳領域末 端の 正確な位置でポリA鎖が付加したクローンも確認された。ウイルスタンパク質を 供給 した 場合の ポリA鎖 付加 に対 する 影響を 調べ るた めに 、各 形質転換体に野生型 CIYVVを接 種し た。CIYVV接種GFPA10UC、GFPAOUCにおいて、3 非翻訳領域を通り越 して それ に統くpUC配列 内で ポリA鎖が付加したクローンが多く確認された。これら の結 果より、ウイルスタンパク質の非存在下で、植物の宿主因子のみでポリA鎖の付 加が起こり、3 非翻訳領域末端の正確な位置でポリA鎖が付加されることも明らかと なっ た。 この結 果に より 、ポ リA鎖を 欠損し たCIYVVの感 染性cDNAでも同様にポリA 鎖の付加が起こることが予想され、3 非翻訳領域末端の正確な位置でポリA鎖が付加 され たウイルスRNAがウイルス複製の鋳型として機能し、感染性を示したことが推測 された。

  以上の結果から、ポティウイルスのCP遺伝子のC末端領域および3 非翻訳領域は、

ウイルスの複製において非常に重要なシス因子であること、宿主因子と3 非翻訳領域

(3)

のみでポリA鎖の付加が起こることが明らかとなった。またポティウイルスのポリA 鎖 も、 ウイル スの 感染 性に おいて 重要 なシ ス因子であることが示唆された。

‑ 1251

(4)

学位論文審査の要旨

学 位 論 文 題 名

クローバー葉脈黄化ウイルスゲノム複製における 3 末端領域シス因子の解析

  本 論 文 は 、 図31、 表3、 引 用 文 献226を 含 み8章 か ら な る 総 頁 数104の 和 論 文である。他に参考論文2編が添えられている。

  本研究は、クローバー葉脈黄化ウイルスclover yellow 'vein virus(CIYVV)の感染 性cDNAを用いて、ゲノムの3 末端領域の、複製に関与するシス因子を特定すること を 第一 の目的とした。またポティウイルスの複製において、ポリアデニル鎖(ポリA 鎖 )は 重要 なシ ス因 子で ある が、CIYVVの感染性cDNAでは、ポリA鎖がなくとも感染 し て、 ポリA鎖 が子 孫ウ イルス では 付加されている。そこで本研究は、ポリA鎖付加 のメカニズムを解明することを第二の目的とした。その内容は以下のように要約され る。

1)ウイルス複製に必要な3 末端領域に存在するシス因子を解明する目的で、3 非翻 訳領 域を欠損させたcDNAクローンを作製した。3 非翻訳領域の塩基配列解析より、

5 ーUAAGUGAGGーUUUUACCUC−3 の繰り返し配列が2カ所見っかり、二次構造解析の結果、

この繰り返し配列がへアピン構造に隣接していることが見出された。この結果を基に、

2っ の繰り返し配列のどちらか一方、もしくはその両方を欠損させるよう、cDNAクロ ーンを作製した。接種試験では、作製したクローン全てで感染性が消失していた。ま た、3 末端領域を重複させたクローンを作製し、接種した結果、野生型と比較して感 染率 は低かったものの、感染性が認められた。その感染植物の子孫ウイルスRNAを解 析したところ、親ウイルスが持つ3 末端領域の重複配列は消失し、野生型と同じ配列 に回復していることが明らかとなった。これらの結果から、3 非翻訳領域はウイルス 複製における非常に重要なシス因子であること、また3 末端領域に重複配列が存在し て も 、 組 換 え 現 象 に よ り 、 野 生 型 の 配 列 に 復 帰 す る こ と が 明 に な っ た 。   シス因子解明のための実験系確立を目的に、bean yellow mosaic virus(BYMV)のCP 遺伝 子をCIYVVのNIb/CP遺伝 子間 に挿 入し 、pCIYVV CP/BYCP/Wを構築して感染性を 調べ た。このキメラは、野生型のCIYVVと同様の感染性を示した。BYMVーCP遺伝子挿

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郎 税

徳 児

一  

  久

田 田

戸 谷

上 増

伴 畑

授 授

授 師

教 教

教 講

査 査

査 査

主 副

副 副

(5)

入部 位をRTーPCRに より 解析 した 結果 、CP遺伝 子のN末端 側がBYMV―CP遺伝子695塩 基、C末端側がCIYVVーCP遺伝子127塩基からなるキメラウイルスであることが分かり、

両CP遺 伝 子の 問で 組換 えが 起こ った こと が明ら かと なっ た。CP遺 伝子 の大 部分 が BYMV―CP遺伝子であってもCIYVVは野生型と同様の感染性を示したことから、ウイル ス複 製において、CP遺伝子のC末端領域が非常に重要なシス因子であることが明らか になった。

2)ポ リA鎖付 加の メカ ニズム を解 明することを目的に、CIYVVの3 非翻訳領域を導 入した3種類の形質転換Nicotiana  benthamianaGFPAl OUC、GFPAOUC、GFPAOを作製し た。GFPA10UCfま、GFP遺伝子の下流にCIYVVの3 非翻訳領域およびポリA鎖とこれに 続 い てpUC配 列 を も つDNAを 導 入 し て あ る 。GFPAOUCは 、GFP遺 伝 子 の 下流 にCIYW の3 非翻 訳領 域とpUC配列を もち 、ポ リA鎖は 持た ない。 また 、GFPAOでは、GFP遺 伝子 の下 流にCIYVVの3 非翻 訳領 域を持っが、ポリA鎖とこれに続くpUC配列を欠い ている。導入された遺伝子mRNAの3 末端領域をRT−PCRして、塩基配列を決定した。

全て の形 質転 換植 物に おいて 、3 非翻訳領域の1塩基目を1番とした場合、28、115 番目でポリA鎖が付加したクローンが数多く検出された。また、3 非翻訳領域末端の 正確な位置でポリA鎖が付加したクローンも確認された。各形質転換体に野生型CIYVV を接種した場合は、.GFPA10UC、GFPAOUCにおいて、3 非翻訳領域を通り越してそれに 統くpUC配列内でポリA鎖が付加したクローンが多く確認された。これらの結果から、

ウイ ルスタンパク質の非存在下で、植物の宿主因子のみでポリA鎖の付加が起こり、

3 非翻訳領域末端の正確な位置でポリA鎖が付加されることもあることが明らかとな った。

  以 上の よう に、 ポテ ィウ イル スのCP遺伝子のC末端領域および3 非翻訳領域は、

ウイルスの複製において非常に重要なシス因子であること、宿主因子と3 非翻訳領域 のみ でポリA鎖の付加が起こることを明らかにした。さらに、ポティウイルスのポリ A鎖 も、ウイルスの感染性において重要なシス因子であることが示唆された。これら の研究成果は、関連学会で学術上高く評価されている。

    よっ て、 審査 員一 同は 、関 口博史氏が博士(農学)の学位を受けるに十分な資 格を有すると認めた。

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参照

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