がん遺伝子パネル検査を用いたクリニカルシーケンスの課題と現状

− 43 −− 5 −. O1-3 がん遺伝子パネル検査を用いたクリニカルシーケンスの課題と現状. ○西村貞德 1,2,3,8）、杉本敦史 1,2,3）、櫛山周平 1,2,3）、栂野真吾 1,2,3）、黒田顕慈 1,2,3）、山内真 4）、. 角俊幸 4,10）、金田裕靖 5）、川口知哉 6）、加藤実 7）、木村健二郎 1,8）、永原央 1）、六車一哉 1）、. 李栄柱 1）、高島勉 1,9）、久保正二 8）、大平雅一 1,9）、八代正和 1,2,3,10）. １）大阪市立大学大学院医学研究科消化器外科学、２）大阪市立大学大学院医学研究科癌分子病態制御学、３）大阪市立大学大学院医学研究科難治癌 TRセンター、４）大阪市立大学大学院医学研究科産婦人科学、５）大阪市立大学大学院医学研究科臨床腫瘍科学、６）大阪市立大学大学院医学研究科呼吸器内科学、７）大阪市立大学大学院医学研究科泌尿器科学、８）大阪市立大学大学院医学研究科肝胆膵外科学、９）大阪市立大学大学院医学研究科乳腺内分泌外科学、 10）大阪市立大学大学院医学研究科がんゲノムセンター、. Does clinical sequencing bridge to clinical benefit in cancer treatment? ○ Sadaaki Nishimura1,2,3,8）, Atsushi Sugimoto1,2,3）, Shuhei Kushiyama1,2,3）, Shingo Togano1,2,3）, Kenji Kuroda1,2,3）, Makoto Yamauchi4）, Toshiyuki Sumi4,10）, Hiroyasu Kaneda5）, Tomoya Kawaguchi6）, Minoru Kato7）, Kenjiro Kimura1,8）, Hisashi Nagahara1）, Kazuya Muguruma1）, Shigeru Lee1）, Tsutomu Takashima1,9）, Shoji Kubo8）, Masaichi Ohira1,9）, Masakazu Yashiro1,2,3,10）. 1）Department of Gastroenterological Surgery, Osaka City University Graduate School of Medicine 2）Molecular Oncology and Therapeutics, Osaka City University Graduate School of Medicine 3）Cancer Center for Translational Research, Osaka City University Graduate School of Medicine 4）Department of Obstetrics and Gynecology, Osaka City University Graduate School of Medicine 5）Department of Clinical Oncology, Osaka City University Graduate School of Medicine 6）Department of Respiratory Medicine, Osaka City University Graduate School of Medicine 7）Department of Urology, Osaka City University Graduate School of Medicine 8）Department of Hepato-Biliary-Pancreatic Surgery, Osaka City University Graduate School of Medicine 9）Department of Breast and Endcrine Surgery, Osaka City University Graduate School of Medicine 10）Cancer Genomic Center, Osaka City University Graduate School of Medicine. In this study, we recruited approximately 30 patients with refractory tumor and analyzed their genomic profiling for detecting a novel therapeutic by multiplex gene panel testing. And, we found that almost 30% of all patients had a druggable gene for therapeutic target. However, there were no patients who received novel targeted therapy. the further explorations of clinical sequencing will facilitate more reasonable and beneficial therapeutic approaches for refractory tumor.. 【背景・目的】がんゲノム医療の一環として , 2019年 6月よりがん遺伝子パネル検査（以下パネル検査）が保険収. 載された . 大阪市立大学では 2018年 2月より固形癌に対し臨床試験を含めたパネル検査を開始してい. る .本研究では臨床におけるパネル検査の結果ががん治療に与えた影響を検討する。. 【材料と方法】 2018年～ 2020年 3月の時点で、大阪市立大学付属病院で標準治療を終えた固形がん 28例がパネル検査にエントリーした。パネル検査の種類は全部で. 4種類あり、保険適応で実施されたのが NCCオン. − 6 −− 42 −. コパネルと FoundataionOne®CDxであった。残り二つの OncomineTM Target Test、ION Ampliseq ™ hotspot panel v2は臨床研究として行われた。手術もしくは生検標本で得た FFPE標本から抽出された DNA検体は NGSによる各パネル検査独自の解析パイプラインにより解析されて、解析結果は最終的. に “expert panel” と呼ばれる専門家会議によりキュレーションされた。. 【結果】 28例中 2例は検体品質不良のため解析できず、残りの 26例が解析対象となった。26例中、20例（77％）に病的変異遺伝子を認め、最も頻度の多かった変異遺伝子は TP53（35%）であり、その他 KRAS などが検出された . コピー数異常を認めた症例は 7例あり、このうち 5例がERBB2 の遺伝子増幅であった .治療薬エビデンスレベルデータベースによるレベル C以上の Druggableな遺伝子異常が 8 例で認められたが、新規標的分子対象遺伝子は 5例であった。5例の内、2例は臨床試験に参加する前に PSの悪化により、新規治療を受けることができなかった。また 1例は国内承認適応外薬の投与の可能性があったため、倫理委員会に適応外使用申請の. 際が、最終的に投与とならなかった（Table 1）。また、遺伝性腫瘍における二次的所見が 1例（4％）で検出された。. 【考察】パネル検査間で検証される遺伝子数の違いは認め. られるものの、検出される actionable geneの検出. 率には大きな差は認められなかった 1,2,3。この結果. は検出される actionable geneが限定されていることを意味している。しかし、NGSの登場により新規標的遺伝子や新規分子標的薬の発見が劇的に認め. られているので、今後は探索遺伝子数を増やした方. が、新規治療薬に結びつくかもしれない。. 今回のがんパネル検査により新規治療に結び付か. なかった理由として 2つ挙げられる。一つは検査期間中の臨床状態の悪化である。もう一つは臨床試験. への参加の煩雑さである。両方の問題を解決するた. めには、今後ヴァーチャル臨床試験 4,5や NGS検査専用の多職種チームなどの作成 6が必要であると思. われる。. また適応外使用に関しても議論の余地がある。別. の試験では今回と同様の症例で適応外使用が認めら. れた症例が存在した 7。適応外使用に関して一定の. 見解が存在しないことが原因である。. パネル検査は病的遺伝子変異を同定し、がん治療. における治療指針に大きな影響を与える一方で、パ. ネル検査時期や適応外使用に関して更に検討してい. く必要がある。. 【文献】 1. K. Sunami, et al. 2. A. Zehir, et al. 3. DP. Sohal, et al. 4. M. Orri, et al. 5. MM. Saiyed et al. 6. LA. Chantrill et al. 7. T. Kou, et al.. Table 1. 8 candidates for molecular-targeted therapy based on their actionable gene alterations Age Sex Tumor type Gene Genetic Alteration Drug Received target Therapy. 79 F Stomach ERBB2 Amplification Approved Drug YES (standard therapy) 84 F Stomach ERBB2 Amplification Approved Drug YES (standard therapy) 75 M Stomach ERBB2 Amplification Approved Drug YES (standard therapy) 67 F Bile Duct ERBB2 Missense (V777L) Off-label Use No (refusal of off-label use) 68 F Ovary ERBB2 Amplification Investigational Drug No (poor performance status, PS2*) 72 M Bile Duct ERBB2 Amplification Investigational Drug No (poor performance status, PS2*) 51 M Lung CDK4 Amplification Investigational Drug Unknown 61 F Primary Unknown Site PIK3CA Missense (E777K) Investigational Drug Unknown. * PS means the scale of performance status developed by the Eastern Cooperative Oncology Group.. 第40回抄録集変換用 5 第40回抄録集変換用 6