平成 年 月 日受付 平成 年 月 日受理 元東京農業大学農学部バイオセラピ 学科 東京農業大学農学部畜産学科 東京農業大学名誉教授 東京農業大学客員教授 地鶏や小国およびその近縁品種において 品種内に生じた遺伝的差異に関する研究は少ない 本研究 はマイクロサテライト 多型情報を用いて地鶏 小国およびその近縁品種の遺伝的多様性および集団構 造につき分析を行なった 供試鶏として 品種 会津地鶏 岐阜地鶏 土佐地鶏 小国 尾長鶏 東天紅 唐丸 羽を用い マイクロサテライト 座位の分析を行なった その結果 小国系品種 小国 尾長鶏 東天紅 は地鶏や唐丸と比べて高い遺伝的多様性を示した また 同じ長鳴鶏でも東天紅の遺伝的多様性は 高く 唐丸は低い多様性を示した 地鶏は会津地鶏を除き 小国系品種よりも低い多様性を示した 一方 小国系品種はヘテロ接合体率の観察値と期待値の差が大きく 有意な正の 値が得られた これは 各品種 の採取地間で近親交配による遺伝的差異が生じているためと考えられた 各品種間のペアワイズ は有意 な値を示した および 系統樹において 小国 尾長鶏 東天紅の 品種は つのクラスタ を形成し た 一方 地鶏 品種および唐丸は両系統樹で各品種が明確に分かれる結果となった 解析も 系統樹の樹形を支持するものであり 小国 尾長鶏 東天紅は採取地間で遺伝的差異が生じていることが明 らかとなった 遺伝資源 遺伝的多様性 地鶏 小国 マイクロサテライト 多型 多型を用いた研究が行なわれている 田名部 水谷 は血液型と血液タンパク多型から小国およびその派生品種 現在 日本鶏の多くは地鶏 小国 軍鶏の 品種から成 である尾長鶏と東天紅の遺伝的類縁関係について 尾長鶏 立したとされている 軍鶏は闘鶏用のみならず 肉用品 は東天紅と近縁である一方 小国とは遠縁であることを示 種や観賞用品種など 多岐にわたる品種の作出に用いられ した は長鳴鶏を含む日本鶏の ている 岡ら はそれらの品種について遺伝的多様性およ 領域の解析を行ない 小国や長鳴鶏 品種が沖縄 びその集団構造の解析を行ない 品種内における内種や採 の軍鶏に次ぐ古い系統であり 多くの日本鶏品種と遺伝的 取地間の遺伝的差異を示した 一方 地鶏はその品種名に 背景を共有しているとした 一方 これらの説は古文献や 地名を冠するものが多く 岐阜地鶏 土佐地鶏 三重地鶏 尾羽の形状にもとづく従来説 とは大きく異なるものであ など 地域の銘柄鶏の作出に用いられているが 軍鶏のよ る このようなことから 小国とその近縁品種間および他 うな全国規模の飼育は行なわれていない 小国は長尾性と の日本鶏品種間の遺伝的類縁関係は今後精査する必要があ 長鳴性を合わせ持つ品種であり その派生品種も羽色など る はマイクロサテライト 座位を に厳密な基準が設けられている観賞用品種が多い それら は 座位を用いて主に小国やその派生品種を含む のことから地鶏 小国およびその近縁品種は 軍鶏やその 日本鶏の遺伝的多様性と類縁関係について分析を行なっ 近縁品種と比較して遺伝的多様性が低下しやすくなると考 た しかしながら これらの研究は主に品種間の遺伝的類 えられ その保全を行なうためには多様性の現状や集団構 縁関係に言及するものであり 品種内に生じた遺伝的差異 造を明らかにする必要がある については が名古屋種と尾長鶏について 日本鶏 特に地鶏 小国およびその近縁品種の遺伝的多 報告しているのみである そこで本研究ではマイクロサテ 様性や類縁関係についてはこれまでにも血液タンパク多型 ライト 多型情報から地鶏 小国およびその近縁品種 やミトコンドリア 多型 マイクロサテライト を中心とした日本鶏品種間の遺伝的類縁関係および品種内
岡 孝夫
高橋幸水
野村こう
花田博文
天野 卓
秋篠宮文仁
要約 キ ワ ドは じ め に
マイクロサテライト
多型情報にもとづく
日本鶏 特に地鶏 小国およびその近縁品種の
遺伝的多様性と集団構造
ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῐ ῏ ῐ ῎ ῍ ῌ ῍ ῌ ῏ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῐ ῍ ῌ ῍ ῏ ῍ ῍ ῐ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῏ ῍ ῍ ῐ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῏ ῐ ῍ ῎ ῎ ῎῍
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IS ST A AS AS , OMIYAMA SMAN ADANO ADANO * ** *** **** : DNA Structure : DNA DNA K mtDNA D-loop O T T DNA mt DNA*
**
**
**
***
****
F F D D D et al. et al. et al. et al.DNA
-+ . , + / 0 1 2 ,, 2 / ,, +* ,, 1 +-0 ,2 - + -,* .*+
ῌ品種における対立遺伝子レベルの遺伝的多様性 本研究で用いた供試鶏 品種 品種におけるヘテロ接合体率および近交係数 に生じた遺伝的差異を明らかにすることを目的とした を用いた また 独立試行間の結果の 類似性は プログラム を用いて算出し 解析結果の図示には プログラム を用いた 会津地鶏 羽 岐阜地鶏 羽 土佐地鶏 羽 小国 羽 尾長鶏 羽 東天紅 羽 唐丸 羽 計 品種 羽を用いた 表 各採取地からの供試羽数が少ないた 多くの個体で増幅が認められなかった 座位 め 小国 尾長鶏 東天紅はそれぞれ 地域集団を同一集 と非特異的増幅が多く認められた 座位を除く 団として解析を行なった マイクロサテライトマ カ は 座位のデ タを用い 解析を行なった 座位で 個の が推奨する 座位 を用いた 抽出 対立遺伝子が認められたものの 岐阜地鶏と土佐地鶏は およびフラグメント解析は岡ら と同様に行なった 座位で 座位は全 品種で多型が認められな かった 各品種で算出した対立遺伝子レベルの遺伝的多様 性の尺度を表 に示した いずれの値も 遺伝的多様性を評価するため 各集団で総対立遺伝子数 小国系 品種 小国 尾長鶏 東天紅 は地鶏 品種 会 平均対立遺伝子数 対立遺伝子数をサン 津地鶏 岐阜地鶏 土佐地鶏 や唐丸よりも高い値を示す プル数で補正した ヘテロ接合体 傾向がみられた 特に東天紅は において土佐地鶏 岐 率の観察値 と期待値 および近交係数 を算 阜地鶏 唐丸の 品種より有意に高い値を示した 出した 集団内および集団間の近親交配の程度は 検定 の 統計量 にて求めた 遺伝子頻度から算出した各品種の および を および は にて 近交 表 に示した の比較において 会津地鶏と東天紅が高 係数 および 統計量は プログラム に い値を示す傾向がみられたが 品種間に有意な差異は認め て算出した 集団間の遺伝的分化の程度はペアワイズ られなかった 検定 一方 集団間および個体間の遺伝的距離は と を求め の比較では小国系 品種は会津地鶏を除く地鶏 品種や唐 近隣結合法 にて系統樹を作成した ペアワイズ の算 丸よりも高い値を示す傾向がみられた は地鶏 品種 出には プログラム 遺伝距離 の算出は プログラム 遺伝距離 の算出は 系統樹の作成には パッケ ジ の プログラムを用いた さらに分集団数 を仮定したベイジアンクラスタリン グ解析 を行ない 各個体の遺伝子型から最適な分集団数 と個体が各分集団に属する確率を求めた 本研究では を仮定し 各 について 回の の後 回のマルコフ連鎖モンテカルロシミュレ ションを 独立に 回試行し 分集団数 を仮定した時の個体の遺伝 子型が生じる対数尤度 を算出した 次に連 続する 間の対数尤度の変化率 を求めた 解析には プログラム を用い 祖先モデルは 対立遺伝子頻度モデルは 表 表 表 供試鶏 日本鶏品種間の遺伝的多様性の比較 デ タ解析
材料および方法
結
果
ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῌ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῐ ῑῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῌ ῍ ῐ ῍ ῍ ῑ ῐ ῐ ῑ῍ ῐ ῑ῍ ῍ ῍ ῑ ῐ ῑ῍ ῌ ῍ ῐ ῑ ῐ ῑ ῍ ῐ ΐ ῌ ῍ ῑῌ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῐ ῍ ῑῌ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῒ ῏ ῍ ῍ ῍ ῐ ῑ ῌ ῌ ῍ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῍ῌ
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ῌ ῌ ῍ ῍ O E IS O E IS O E O IS ST E A AS ST E A AS EIR OCKERHAM frequencies model CLUMPP . . Distruct .ISAG FAO DNA
PCR
TNA, MNA, AR
TNA MNA
Allelic Richness AR AR
W . Kruskal-Wallis
and C TNA MNA
Microsatellite Toolkit AR FSTAT . .
. Kruskal-Wallis
FSTAT . .
DISPAN
Microsatel-lite Toolkit PHYLIP . NEIGHBOR K K K burnin K Ln Pr X K K K Structure .
admix-ture model, correlated allele
MCW LEI MCW H H F P F H H F H H H F F F P H D D F H D D ,* ,+ 3 , +* ++ +, +- +. +/ +0 ++ +1 +2 +3 +2 1 1 1 + + , + + ,* -, +. +/ +, +- -* 1 +-0 + - ,2 ,2 +-. -* 0 1 , - -* -*+ , 3 -* -*/ - , , 3 -- / , 1 .**** 0**** ,* , -*,2. *+3, **32 , +
-,
-D ῌ日本鶏 品種間の 遺伝距離に基づく 系統樹 枝上の数字はブ トストラップ値 全 個体間の 遺伝距離にもとづく 系統樹 品種間のペアワイズ 右上 および遺伝距離 左下 では会津地鶏が高く 尾長鶏 よりも高い値 と において 各試行間で地鶏 品種のクラスタリング を示した 特に東天紅は土佐地鶏 岐阜地鶏 唐丸の 品 が異なる結果が得られ 類似度が低下する結果となった 種より有意に高い値を示した しかしながら 各試行においては各品種に属する個体は 検定 また 小国や尾長鶏 東天紅は と の差が大き 以上の確率で同じクラスタ に含まれ 高い 値を く 近交係数 も有意な値を示した 全集団に おける個体間の近交係数 は 集団間の分 化の程度を示す は 分集団内における個 体間の近交係数 は であり いずれも有意 な値であった 各品種間の遺伝的分化の程度を示すペアワイズ およ び品種間の遺伝距離 を算出し表 に示した 品種間の ペアワイズ はいずれも有意 な値であった 地鶏 品種間のペアワイズ は と高い値を 示した 一方 小国系 品種間のペアワイズ は であり 地鶏 品種間と比べると低い値を示した 遺 伝距離 もペアワイズ と同様の傾向が認められ 地 鶏 品種間では高く 小国系 品種間では 低い値 を示した 品種間の遺伝的類縁関係を明らかにするため 遺伝距離 をもとに無根系統樹を作成した 図 本研究で用い た 品種は明確なクラスタ を形成せず 低いブ トスト ラップ確率 にて星型の樹形を示した 小国系 品種は低い遺伝距離にてまとまる傾向がみられた ブ ト ストラップ確率 一方 地鶏 品種や唐丸の間の遺 伝距離は小国系品種間のものより大きく 系統樹において もクラスタ を形成しなかった 本研究で用いた全 個体について 座位の遺伝子型 から遺伝距離 を算出し 系統樹を作成した 図 系 統樹において 地鶏 品種と唐丸はそれぞれがクラスタ を形成する結果となった 一方 小国 尾長鶏 東天紅は つのクラスタ に混在する結果となった しかしながら 各品種は尾長鶏 高知 の 個体を除き 採取地ごとにサ ブクラスタ を形成した プログラムによる解析結果 を図 に示した 各 における 回の試行間の類似度は の順に高い値を示した 図 図 表 日本鶏品種間の遺伝的類縁関係 日本鶏品種内の遺伝的集団構造 ῐ ῑ ῐ ῑ ῐ ῑ ῎ ῐ ῑ῍ ῐ ῑ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῐ ῍ ῍ ῑῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῐ ῑῌ ῒ ῍ ῒ ῍ ῒ ῍ ῐ ῑῌ ῌ ῐ ῑ ῌ ῏ ῌ ῍ ῏ ῍ ῌ ῍ ῐ ῏ ῑ῍ ῐ ῏ ῑ ῌ ῍ ῐ ῑῌ ῍ ῐ ῏ ῑ ῌ ῐ ῑῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῐ ῑῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῐ ῑ ῍ ῌ ῐ ΐ ῏ ῑ ῌ ΐ ῐ ῑ῍ ῐ ῑ῍ ῐ ῑ ῌ ΐ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῌ ῍ ῌ ῌ ῌ ῌ A AS ST A O E ST IS IT ST IS ST A ST ST ST A ST A AS NJ NJ . . . Kruskal-Wallis . . . . . . . . . . . . . . . . . Structure K K K . . . K D D F D P H H F F P F F F P F D F P F F D F D D 1 +-0 1 * .*+ * -31 , . -* -*+ 3* * *+ * /.- * *,+ * ..- * *,+ * +2* * *-. * *+ . * *+ - * .22 * /-3 - * +.. * ,-3 -- * -3+ * .11 -* +0. * +2* + 1 .. 0. 0. -+-0 ,2 , -+ + , 1 -,* / * 3/0 - * 2.1 0 * 2-2 + , .
プログラムにより得られたクラスタ 解析の結果 を図示 縦の棒グラフは各個体が 色で示されたある遺伝的クラスタ に含まれる確率を示す 尾長鶏 小国 東天紅はそれぞれ左側から表 に記載した採取地の順に示す 支持するものであった の値は の間で大きな り遺伝的多様性が維持されているためと考えられた 地鶏 差は認められなかったものの の時に最大値 品種の中では会津地鶏は他の 品種と比べて高い多様性 を示した を示した これは 現在の会津地鶏が銘柄鶏の素材鶏とし 唐丸は から 岐阜地鶏は からそれぞれが明 て系統的な維持が行なわれている ためと考えられた 尾 確に独立したクラスタ に含まれた が最大値を示し 長鶏は近親交配が進んでいると報告されている が 本結 た のとき 岐阜地鶏と唐丸はそれぞれが固有のクラ 果の低い遺伝的多様性と高い正の はそれを支持するも スタ に属し 他の 品種が同じクラスタ に属する結果 のと考えられた 長鳴鶏は長鳴性という特殊な形質につい となった 一方 試行間の類似度が最大値を示した て強い選抜圧を受けているため 他の品種と比べて遺伝的 のとき 小国 尾長鶏 東天紅が つのクラスタ に属し 多様性は低いとされる 著者らも長鳴鶏である声良は 残りの 品種がそれぞれ独立したクラスタ に含まれた 低い多様性を示すことを報告した 本結果では 唐丸は また のときも 品種が独立のクラスタ を形成し 声良と同様に低い多様性を示した一方 東天紅はもっとも 小国系 品種内にサブ構造が認められた このときのサブ 高い多様性を示した 構造は いずれも採取地間で生じているものであった 特 は 小国は愛好家の複数集団を 集団と に小国は のときに 採取地による遺伝的差異が認め して 東天紅は試験場の単一集団を分析している 小国は られる結果となった 本研究も も複数集団の分析であるが 遺伝 的多様性は愛好家集団 の方が試験場集団 本結果 より も高い値を示した 岡ら は愛好家所有の矮鶏地域集団は 保存会内での個体の交流により 明確な遺伝的分化が生じ 本研究で得られた および はベトナム在来 ていないことを示した 観賞用品種の多い小国系品種にお 鶏 やジンバブエ在来鶏 よりも低く はそれよりも いても 愛好家間の個体の移動は多様性や集団構造に影響 高い値であった このことは 日本鶏はアジアやアフリカ を与える一因と考えられた 東天紅は同じ試験場集団の分 の在来鶏と比べて遺伝的多様性は低い一方 遺伝的分化の 析であっても 遺伝的多様性は複数集団 本結果 の方が 程度が高い集団であることを示すものであった 特に本研 単一集団 よりも高い値を示す結果となった しかしなが 究で用いた地鶏や小国系品種は小集団化や人為選抜によ ら本結果は に対して が低く 有意に高い正の を り このような傾向が顕著に認められたものと考えられ 示した さらに などの座位 た では 採取地で主要な対立遺伝子が異なっていた また 本研究で分析した 品種を比較すると 地鶏や唐丸より 東天紅は分集団を考慮しても多くの対立遺伝子が認められ も小国系品種 小国 尾長鶏 東天紅 の方が遺伝的多様 た このことから 強い選抜を受けて作出された長鳴鶏で 性が高い傾向が認められた 本研究の小国系品種は複数集 あっても初期の段階では遺伝的多様性を保持しており そ 団を 集団として分析を行なったが 単一集団の分析を行 の後の分集団化 各分集団におけるさらなる選抜 遺伝的 なった の結果と比べても 本研究で分析し 浮動を経て現在の状態に至ったと考えられた た地鶏は低い値を示した これは 地鶏の多くが狭い地域 にて小集団で飼育されているのに対し 観賞用品種が多い 小国系品種は広範囲で飼育され 集団間の個体の交流によ 系統樹の樹形は 図 日本鶏品種間の遺伝的多様性の比較 品種間の遺伝的類縁関係および品種内の遺伝的差異
考
察
ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῑ ῐ ῒ ῏ ῑ ῌ ῍ ῍ ῌ ῎ ῎ ῌ ῒ ῏ ῌ ῒ ῐ ῑ ῌ ῌ ῍ ῒ ῍ ῒ ῌ ῌ ῍ ῒ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῒ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῌ ῌ ῍ ῍ ΐ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῌ ῍ ΐ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῐ ῑ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῐ ῑ ῌ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῐ ῍ ῍ ῑ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ ῎ῌ
ῌ ῍ IS , O E ST E O IS A ADANO ADANO SMAN ADANO AKAHASHI Structure K K K K K . K K K K K K T K T MNA O T T F et al. et al. H H F H H F LEI LEI MCW et al. D et al. et al. ,. ,/ ,/ ,0 , 0 0 0 , ,, ,-0 / 0 ,1 , 1 + , / - 3*3 0+ - , , -/ / + . 0 . -+ 0 1 + *,-. **3. *,+0-.
D D小穴 彪 日本鶏の歴史 日本鶏研究社 東京 岡 孝夫 高橋幸水 野村こう 花田博文 天野 卓 秋篠 宮文仁 マイクロサテライト 多型情報にもとづ く日本鶏 特に軍鶏およびその近縁品種の遺伝的多様性と 集団構造 東京農業大学農学集報 田名部雄一 水谷正俊 日本鶏の蛋白質多型による品 種の相互関係と系統に関する研究 座位から求めた 品種間の遺伝的距離と系統樹 日本家禽学会誌 の結果を支持するものであった また た さらに 小国系品種は採取地間で遺伝的差異が認めら 系統樹において 小国 尾長鶏 東天紅は 品種で つの れるものの 各採取地では多様性が減少し 遺伝的に固定 クラスタ を形成し 品種レベルの明確な遺伝的差異は認 される過程にある集団であることが明らかとなった められなかった この点は 分析したすべての品種がそれ ぞれのクラスタ を形成するとした とは 貴重な日本鶏サンプルを提供していただきました福 異なる結果であった 地鶏は歴史が長く 各地域で長期間 島県農業総合センタ 畜産研究所 高知県畜産試験場 茨 にわたって閉鎖的に維持されており 羽色も品種により定 城県畜産センタ 養鶏研究室 新潟県農業総合研究所畜産 められている そのため 品種間の交流がない状態で遺伝 研究センタ 進化生物学研究所に厚く御礼申し上げま 的分化が進んだものと考えられた 唐丸の成立には小国が す 関与したとされているが 本結果からは小国の遺伝的寄 与率が小さいか 品種成立後のボトルネックにより遺伝子 構成が変化したものと考えられた 一方 尾長鶏と東天紅 は小国直系の品種とされており 尾長鶏は長尾性 東天 紅は長鳴性について選抜され 作出されたとされている また 小国自身が長尾性 長鳴性を有することから 品種 成立後も品種間で遺伝的交流が生じていた可能性が考えら れた それらのことから 現在でも小国系品種間で遺伝的 背景が共有されており 明確な分化が認められなかったも のと考えられた 一方 系統樹において 品種で形成 するクラスタ の中に品種と採取地によるサブクラスタ が認められたことから 各品種 各地域集団で近親交配が 進行し それぞれが遺伝的に均一な集団になりつつある状 態であると考えられた 解析における最適な分集団数 の評価につ いて 対数尤度の変化量 を用いる報告 と各 の 全試行の類似性を用いる報告 がある 本研究では は 試行間の類似性は のときに最大となった と のとき 各品種の個体は単一のクラスタ に含ま れる結果が得られ 高い 値を支持するものであると考 えられた 一方 ベトナム在来鶏 やジンバブエ在来鶏 の 解析において 在来鶏間に明確な遺伝的構造 は認められず ケニア在来鶏には地理的距離による連続的 な遺伝的構造が認められた これは アジアやアフリカ の在来鶏に対し 日本鶏の集団構造は地理的距離ではなく 品種や地域集団レベルで生じていることを示すものと考え られた は尾長鶏の 解析を行な い 内種間の遺伝的差異を報告している 本結果は と の結果から 同一品種であっても採取地により遺伝的 差異が生じていることを明らかにした のとき 小 国に認められる つのクラスタ 紫色とピンク色 のう ち 尾長鶏は紫色 東天紅はピンク色のクラスタ に高い 確率で含まれることが示された 図 これは 小国の複 数起源を示す の分析結果 を支持するもので あった さらに 小国も採取地により対立遺伝子構成が異 なり 遺伝的分集団化が生じていることが明らかとなっ た のとき 小国に認められる つのクラスタ 赤 色 紫色 ピンク色 のうち 尾長鶏は赤色 東天紅は紫 色のクラスタ の割合が減少している 図 このことか ら 多起源である小国をもとに選抜 淘汰を経て 遺伝的 に均一な集団になる過程にあるものと考えられた 本研究結果より 地鶏よりも小国系品種の方が遺伝的多 様性は高く 遺伝的分化の程度は低いことが明らかとなっ 引用文献 謝辞 ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῑ ῒ ῎ ῍ ῎ ῒ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῑ ῒ ῍ ῎ ῍ ῒ ῍ ῑ ῒ ῎ ῍ ῒ ῒ ῐ ῐ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῒ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ΐ ῍ ΐ ῌ ΐ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ῍ ῌ ΐ ῍ ῌ ΐ ῍ ῑ ῒ ῍ ῍ ῑ ῒῌ ῍ ῌ ῍ ῍ ῌ ΐ ῍ ῑ ῍ ῍ ῒ ῍ ῍ ῑ ῒῌ ῍ ῍ ῍ ῌ ῍ ῍ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ AS AS , ST
ADANO EKINO ISHIBORI SUDZUKI OMIYAMA KEO OJOBORI
SMAN EKINO ISHIBORI AMAMOTO SUDZUKI
ADANO ISHIBORI SUDZUKI
ADANO ISHIBORI SUDZUKI
OFFMAN ARSAN ARKER OTHRAN ANOTTE ENSTRA ILAN EIGEND IMIANER EIR OCKERHAM ARK OUDET OUDET SMAN ADANO ADANO T R., S M., N M. and T M. ( ) DNA . .
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pro-O T : Structure K K K K K K K Structure T Structure K K mtDNA K Gene Asian-Australasian Journal of Animal Science Poul-try Science Animal Genetics Animal Genetics
Proceedings of the th International Conference on Animal Genetics, F Evolu-tion et al. D et al. D F et al. ,2 ,3 ,0 + + +3 2 -* -+ -* ,--, 2 --,**1 + +3/+ , ,*+* ,++ ,+2 - +32* - +0 ++0 +,+ . ,**. 3+ 33 / ,**/ 1// 10+ 0 .0* .03 1 ,**2 /01 /1+ 2 ,**3 # 323 33, 3 ,**. ++ +0 ,**. +* +32. +-/2 +-1* ++ ,**. # ,**+ +, ,**+ , 3 -+33/ + , - + -- / - / 0 1 0 , -1 -,3 // +1 ---+2 20 -3 .* -2 D D
仁 マイクロサテライト 多型による会津地鶏の 遺伝的多様性と遺伝的位置 日本家禽学会誌 小畑太郎 菊池和弘 居在家義昭 四国地域における 動物遺伝資源の調査と収集 動物遺伝資源探索調査報告 韮澤圭二郎 菊池和弘 新潟県における家禽遺伝資源 の調査と収集 新潟県における蜀鶏種の保存状況の調 査 動物遺伝資源探索調査報告 岡 孝夫 井野靖子 野村こう 花田博文 天野 卓 山内 克彦 小林雄治 泉田和子 西堀正英 山本義雄 秋篠宮文 ῎ ῏ ῍ ῌ ῏ ῏ ῌ ῌ ῎ ῏ ῍ ῌ ῏ ῌ ῎ ῏ ῏ ῍ ῍ ῌ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῏ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ ῌ AITOU EI
IXIER OICHARD ERRIER AILLARD OGNON
UC UCHADEYI AULAIN DING EIGEND ELSENSTEIN
OSENBERG
EIGEND
ANADA MANO AKADA AKAHATA AYASHI EI AJIMA ATENO
OWCOCK UIZ INARES OMFOHRDE INCH IDD AVALLI-SFORZA
AKAHASHI IRASAWA AGAMINE SUDZUKI AMAMOTO
HTA SMAN EKINO ISHIHATA AKENAKA
INOSHITA UWAYAMA ISHIBORI AMAMOTO SUDZUKI
RITCHARD TEPHENES ONNELLY
ADANO ISHIBORI MAMURA ATSUZAKI INOSHITA IZUTANI AMIKAWA SUDZUKI VANNO EGNAUT OUDET
AKOBSSON OSENBERG ERTHOULY EROY HU OANG HANH ED’HOM RONG GUYEN U HI ONICAT
RANEVITZE ILLEL ELDMAN IX DING OLLNY
WACHARO UCHADEYI DING OLLNY ROENEVELD
AKUZA HAMSELDIN IMIANER EIGEND KA NO OMURA AWASHIMA UWAYAMA KISHINONOMIYA
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F The Journal of Heredity
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Animal Genetics Animal Genetics +321 ,**1 +33-,**. ,**3 ,**2 .2/ .20 0+ 0/ +- +32- ,/ +33-+/- .- 0* +1* ,0 +33/ +. + +33. 2/ 31 ,1 .// ./1 +332 +/ .*0 .,/ /.- /.0 +0 +33- ,2 ,**0 +1 - / +2 ,*** +-03 +-12 ,3 3./ 3/3 +3 ,**/ ,**2 ,0++ ,0,* 1+ 12 ,* ,**1 -* +2*+ +2*0 ,**3 ,+ +-1 +-2 -+ ,, ,**0 020 03--, ,**2 3+, 3,* ,- --,**1 --, --3 ,. ,21 ,3-20 ./ . +3 / -02 . 23 +3 +// +. -3 ,-+* . .* / -2 -2
IS
ST A AS
AS
(Received August , /Accepted October , )
* Former : Department of Human and Animal-Plant Relationships, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture ** Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture
*** Professor emeritus, Tokyo University of Agriculture **** Visiting professor, Tokyo University of Agriculture
KA AKAHASHI OMURA ANADA
MANO KISHINONOMIYA
: The genetic relationships between the and their related breeds, and their genetic population structure are unclear. In this study, microsatellite DNA polymorphisms were used to analyze the genetic relationships and structure among and related breeds. A total of individuals of seven breeds,
and were used in the analyses of the microsatellite loci. High genetic diversity was ob-served in and related breeds. In contrast, low genetic diversity was observed in the
and breeds, except in the A high and positive value indicating high inbreeding was also detected in -related breeds. Among long-crowing breeds, showed high ge-netic diversity, but showed low genetic diversity. The pairwise values estimated among breeds were high and significant. In the phylogenetic tree analysis, and
were located in the same cluster in the and trees. In contrast, three breeds and
were clearly separated in each tree. The structure analysis supports the topology of tree and reveals genetic di erentiation among sampling locations in the -related breeds as
and
: Genetic resource, genetic diversity, microsatellite DNA polymorphisms
By
Takao O
*, Yukimizu T
**, Koh N
**, Hirofumi H
**,
Takashi A
*** and A
Fumihito****
Genetic Diversity and Population Structure of
Jidori, Shokoku and Its Related Breeds of
Japanese Native Chicken based on
Microsatellite DNA Polymorphisms
Jidori, Shokoku
Jidori, Shokoku,
Aizu-Jidori, Gifu-Jidori, Tosa-Jidori, Shokoku, Onagadori, Totenko, Tomaru,
Shokoku Tomaru
Jidori Aizu-Jidori. F
Shokoku Totenko
Tomaru F
Shokoku, Onagadori, Totenko
D D Jidori Tomaru D Shokoku Shokoku, Onagadori Totenko. Jidori, Shokoku, Summary Key words / ,*+* ,, ,*+* +-0 ,2 #
