遺伝子発現 (トランスクリプトーム) 解析とは
網羅的遺伝子発現解析を用いた白色腐朽菌のリグニン分解酵素生産制御機構に関する研究
... chrysosporium は全ゲノムデータが公的に利用できる唯一の白色 腐朽菌である。すなわち、トランスクリプトーム解析やプロテオーム解析などの網羅的発 現解析、いわゆるポストゲノム解析が可能な唯一の白色腐朽菌である。これまで他の研究 グループにより、マイクロアレイ解析、セクレトーム解析、プロテオーム解析など全ゲノ ...
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形態科学を基盤とした遺伝子発現解析法 in situ hybridization 法を中心に Methods for the Analysis of Gene Expression Based on Morphological Science Focusing on in situ Hybridiz
... ければ，遺伝子により引き起こされる精巧で多彩な生命現象 を理解したことにはならない． 培養細胞を用いた生化学的あるいは分子細胞学的解析によ り，多くの遺伝子産物の機能が明らかとなり，複雑なシグナ リングパスウエイのネットワークが次々と明らかになった． 培養細胞内で起こる総論的理解が進み，次に生体内での組織・ ...
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ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現制御機構 同様にいくつかの遺伝子における発現動態の異常が報告されており 15) 初期胚の遺伝子発現を比較解析するためには 様々な手法で作出された胚を用いることが望ましい そこで我々は ウシ体細胞クローン胚の遺伝子発現を個々の胚から抽出した RNA を用いて RT- リ
... mRNA 発現動態 前述したように、各種哺乳動物の体細胞クローンにみ とめられる様々な異常は、体細胞核の初期化不全による 遺伝子発現異常に起因する可能性が早くから指摘されて いた。そこで、ウシ体細胞クローン作出の成功直後か ら体細胞クローン胚の遺伝子発現解析が行われてきた 11）-13） 。それらの概要は Nimann ...
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肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析
... TopHat2 http://tophat.cbcb.umd.edu/ スプライスジャンクションを考慮したマッピングをおこな う（Kim et al. 2013 Genome Biol）。 遺伝子発現解析 Cufflinks http://cufflinks.cbcb.umd.edu/ 異なるスプライスバリアントごとの発現量の計算や新 規転写産物のアセンブルを行う（Trapnell ...
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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析
... （対象と方法） AD 発症の初期より病理学的変化のみられる側頭葉皮質、進行した AD においても病理学的変化の少な い後頭葉皮質について、AD 患者脳組織及び生理的老化患者脳組織より RNA を抽出し、cDNA サブトラク ション法によって相対的な遺伝子発現の増減についてサブトラクションを行い、遺伝子発現の相対的な ...
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アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析
... ものである。AD と生理的老化の両患者で、脆弱な脳部位と抵抗性を有する脳部位とい った視点により比較・解析することにより、ユビキチン・プロテアソームシステム、微 小管関連蛋白質及び新規遺伝子が、各部位において各々作用すること、そして、それら が相互作用していることが示唆された。長期間、加齢をはじめとする多くの危険因子に ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... の発現量 は両者で差が認められないが、タンパク質レベルでは健常者と比較して、 SCA2 患者では有意に減少した。さらに、 GRB2 mRNA の発現量は健常者と比較して、 SCA2 患者では有意に高いにも関わらず、タンパク質レベルでは有意な差は認め られなかった（ Drost et ...
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ヒトiPS細胞形成過程における遺伝子発現変動の生物情報学解析
... 4-1: Maturation might be the roadblock in the reprogramming of various somatic cell types into hiPSCs .... 54.[r] ...
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網羅的遺伝子発現解析から同定したDAB2とIntelectin-1は上皮型悪性中皮腫と肺腺癌の鑑別診断に有用な免疫組織化学的染色の陽性マーカーである
... Identification of DAB2 and Intelectin-1 as Novel Positive Immunohistochemical Markers of Epithelioid Mesothelioma by Transcriptome Microarray Analysis for its Differentiation from Lung[r] ...
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図 1 ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる因子ヘテロクロマチン化および遺伝子発現不活性化に関わる DNA RNA タンパク質 翻訳後修飾などを示した ヘテロクロマチンとして分裂酵母セントロメアヘテロクロマチンと哺乳類不活性 X 染色体を 遺伝子発現不活性化として E2F-Rb で制御
... ている。遺伝子の転写が抑制されているという観点から は、「ヘテロクロマチン化」と、何らかのシグナルを受けて 特定の遺伝子領域を転写許容状態から抑制状態へ変 化させる「遺伝子発現不活性化」は共通したクロマチン 構造変化とみなすことができるが、後者は単一遺伝子レ ...
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日本のイネコアコレクションにおける胚乳澱粉の鎖長分布の多様性と澱粉生合成関連遺伝子の発現解析
... 第 3 図 登熟途中における澱粉生合成酵素遺伝子の発現量 鎖長割合および発現解析の結果を用いて主成分分析を 行った．第 1 主成分（約 49％）と第 2 主成分（約 27%） によって全体の約 76% の情報を説明することができた（第 4 図）．第 1 主成分は重合度 10 以下の鎖長割合の因子負荷 量が負であり，重合度 11 ...
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遺伝子発現制御機構 クロマチン，転写制御，エピジェネティクス - ダウンロード, PDF オンラインで読む
... び Dnmt3b が、 Rhox クラスターにおける遺伝子発現を細胞系列特異的に抑制していることを明らかにした。着床後のマウス胚において、 Rhox クラスターを含む広 範囲 . DNA のメチル化はクロマチン構造変化や転写制御因子の DNA 結合阻害をもたらし、その領域に含まれる遺伝子の発現を抑制することが知られる。この ...
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p53標的遺伝子の発現制御剤による放射線防護
... その結果、5CHQ は、放射線細胞死に拮抗する p53 標的遺伝子 CDKN1A （遺伝子産物 p21） の発現を上方制御し、放射線細胞死を促進する p53 標的遺伝子 BBC3 （遺伝子産物 PUMA）の 発現を下方制御する p53 標的遺伝子発現制御作用を示し、放射線高感受性の p53 依存性細胞死 ...
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Bcr-Abl陽性慢性白血病細胞によるストローマ細胞の遺伝子発現と増殖および機能の修飾
... のストローマ細胞株（OP9）を共培養し、OP9 細胞に誘導される遺伝子発現変化の 網羅的解析によりその機能変化を検討した。KOBA 細胞と共培養した OP9 細胞 （OP9/L）では対照 OP9 細胞に比べ、CDK 抑制遺伝子の低下と強い増殖能の亢進が 認められ、これは OP9 細胞における Notch ...
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胃癌におけるUc.160+の発現・機能解析
... 転写超保存領域(transcribed-ultraconserved regions; T-UCRs)とは、ヒトやマウス、ラットなど 生物種を超えてほぼ 100%同一の配列を示す高度に保存されたゲノム上の領域(ultraconserved regions; UCRs)から転写されるタンパク質をコードしない RNA(non-coding RNA; ncRNA)の一 種であり、少なくとも 481 領域、962 ...
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頭蓋内主幹動脈狭窄の遺伝子解析研究―もやもや病関連遺伝子RNF213の解析―
... 虚血性脳卒中（脳梗塞）の主要な原因の一つである頭蓋内主幹動脈狭窄はアジア人種に多い発症が知られてお り，遺伝的要因の関与が示唆されてきた．近年，もやもや病の疾患感受性遺伝子として ring finger protein 213 （RNF213）が同定された．我々は RNF213 上の単一のミスセンス変異（c.14576G>A, p. R4859K, rs112735431）が ...
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ゲノム遺伝子解析研究説明同意文書
... ブがあります。また、HER2 は正常細胞では、増殖、分化、移動、生存などの 細胞機能調節に関与していますが、何らかの理由で HER2 遺伝子に増幅や変異 が起こると下流のシグナル伝達経路が活性化し、がん遺伝子として働きます。 胃癌、乳癌、卵巣癌等多くのがんで HER2 の遺伝子増幅がみられます。 ...
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The Ultimate Protein Analysis Tool 包括的タンパク質解析ツール Technology NF-κB の解析例より システムを利用することでタンパク質解析が行える例として NF-κB の解析例を紹介いたします ベクターに p65 遺伝子をクローニングし 細胞内で発現させ
... 細胞の固定後のイメージング HeLa 細胞に p65-HaloTag ® 融合タンパク質をコードするプラスミドを トランジェントにトランスフェクションし、発現した p65-HaloTag ® 融 合タンパク質を 5µM HaloTag ® TMR Ligand で 37℃、15 分間標識した。 細胞は 3.7% パラホルムアルデヒドで固定した後、1µg/ml mouse Anti- bIII Tubulin ...
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イネおよびヨシの高親和性硝酸輸送システムに関わる遺伝子の構造と発現
... 本研究では作物の効率的な硝酸同化の基礎研究として、硝酸同化の第 1 段階であるイネ科 植物の根の表皮細胞における NRT2 を介した硝酸吸収メカニズムに注目し、イネ( Oryza sativa L.)の NRT2 および NAR2 の解析を行なった。さらにヨシ( Phragmites australis )の 硝酸吸収能力の評価を生理学および分子生物学レベルで行なった。概要は以下の通りであ る。 ...
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肺腺癌におけるTGF-β標的遺伝子RBM47の発現と機能の解析
... protein RBM47 as a source of selectable metastatic traits in breast cancer. SMAD proteins control.[r] ...
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