遺伝子マーカーによる選抜：QTL解析
悪性脳腫瘍の新たなバイオマーカー及び分子標的の探索とそれらの臨床応用に向けた多施設共同研究による遺伝子解析
... 次世代 ン 解析 得 日 DNA ン DNA Data Bank of Japan：DDBJ や遺伝子 現情報 ベ GE0 等 公的 ベ 録 可能性 あ 個 人情報 含 い形 行い 録 希望 い場 旨 申 出く い 岡山大学病院脳神経外科 研究代表機関 国立 研究 ン 研究所 試料 情報提供後 情報 ...
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様式 2 1. 調査 研究 [ 概要版報告書 ] 助成番号 助成事業名 所属 助成事業者氏名 ウイルス遺伝子マーカーを利用した河川水中の糞便汚染源解析法の開発 山梨大学大学院総合研究部原本英司 助成事業の要旨 目的 水環境中の糞便汚染源の解析を目的として 宿主 ( ヒトや動物 )
... 群は下水処理工程での除去率が他の 遺伝子群と比較して大幅に低いことが明らかとなった。下水流入水中においては、 II 群お よび III 群の平均濃度が I 群と IV 群の平均濃度に比べて高かったものの、その差は 1 log 程度と小さいものであった。また、下水 2 次処理水では I 群の平均濃度が最も高かったも のの、 II 群と III 群との差は 1 log ...
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トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析
... 機能欠損株では、節間および草丈の伸長の他、異常な葉の形態形成や単為結果性の獲得といった表現型を示 すことが知られている。本研究により筆者は、 SlHSP70-1 が高発現した条件下では、節間および草丈の伸長 に対して SlIAA9 および SlDELLA の上流もしくは同等の機能を持つと推測している。 第 5 章で著者は、TILLING 法による SlHSP70-1 の機能欠損もしくは低下株の作出を行った。作出した変異 ...
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遺伝子改変マウスを用いた椎間板変性におけるcaspase 3遺伝子の果たす機能解析
... In vivo 試験は， 11 週齢 C57BL/6 WT マウスと caspase 3 KO マウスに対して我々の確立した 外傷性椎間板変性モデルを適用した． 35G または 33G 針を L4/5 椎間板に穿刺貫通させ有意 な変性を生じる中心または背側領域貫通例だけを抽出した．腰椎を術後 2 ， 4 週で摘出し， MRI による画像的評価と組織学的評価を行った．腫瘍化，悪性化の有無も組織学的に評価 した． ...
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トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析
... By co-expression analysis to construct the network of genes related to SlIAA9 and SlDELLA during tomato growth and development, we realized that SlHSP70-1 appeared in both SlIAA9 and S[r] ...
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第１５回 遺伝子解析研究に関する
... ンニトールに対する無作為化第Ⅱ相試験 1829 内科学第三講座 山本信之 T790M 変異以外の機序にて Epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitor（EGFR-TKI）に 耐性化した EGFR 遺伝子変異陽性非扁平上皮非小細胞肺 がんに対するニボルマブとカルボプラチン＋ペメトレ キセド併用療法を比較する第Ⅱ相臨床試験 ...
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血漿中のmiRNAバイオマーカー探索からPathway 解析までのご紹介
... 損傷した Kidney 内で、Nucks1のdown-regulationを確認 ► miR-1897-3p の発現量の増加により Nucks1 のdown-regulation が生じたと思われる ► Nucks1 はmiR-1897-3p のTarget と思われ、Nucks1 のdown-regulation に より腎損傷に関連する下流遺伝子が影響を受けたと思われる ...
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網羅的遺伝子発現解析から同定したDAB2とIntelectin-1は上皮型悪性中皮腫と肺腺癌の鑑別診断に有用な免疫組織化学的染色の陽性マーカーである
... Identification of DAB2 and Intelectin-1 as Novel Positive Immunohistochemical Markers of Epithelioid Mesothelioma by Transcriptome Microarray Analysis for its Differentiation from Lung[r] ...
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ゲノム遺伝子解析研究説明同意文書
... 患者さまから提供を受けた血液試料は、依頼者（製薬会社）の解析研究機関 で遺伝子解析されて保存されます。当センターから解析研究機関に搬出される 前に、当センターでは氏名、生年月日、カルテ番号などの個人情報を削除し、 新たに符号（コード）をつけます。これを匿名化（コード化）といい、解析研 究機関では誰の血液試料を取り扱っているかが分からなくなります。解析研究 ...
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R で QTL 解析 以下で R への入力コマンドはゴシック赤字で表記しています # より右はコメントなの で入力の必要はありません 操作を再現する際 タイプミスに注意しましょう データの読み込み qtl ライブラリーを起動し ファイル IN-RIL.csv を読み込みます library(qtl)
... 各マーカー遺伝子座の分離比が期待値から大きくずれる場合 3 、遺伝子型の判別方法に問題 4 がある可能性が高い。期待比からのズレは geno.table 関数を使って調べることができ、ボン フェローニ補正 5 した 5%水準以下のマーカーは以下のように検出できる。 gt <- geno.table(testmap) ...
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ダイズさび病抵抗性遺伝子 Rpp の準同質遺伝子系統を用いたダイズ宿主抵抗性の解析
... ダイズは、食料、油脂原料、家畜飼料など様々な用途に世界中で利用され，産業上重要な作物である。ダ イズの重要病害の一つとしてPhakopsora pachyrhiziによって引起こされるダイズさび病が挙げられる。P. pachyrhiziは元々東アジア地域に分布していたが、現在は世界中に分布拡大し、特にダイズの主要産地である ブラジルとその周辺諸国およびアメリカ合衆国に本菌が侵入した2000年代以降は、本病害の防除が極めて大 ...
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肺癌の進展に関連した遺伝子の統合的解析
... 類 (気管支上皮型と非気管支上皮型、あるいは Group I と Group II)についてみると、 EGFR あるいは MET の阻害剤に対して感受性のある細胞のほとんどは、気管支上皮型（あ るいは Group I）に属していた。 上皮成長因子受容体（以下 EGFR）変異を有する肺腺癌は、乳頭状あるいは肺胞上皮癌 様の組織像と相関することが示されている。このような遺伝子－形態相関についての系統 ...
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CEQ8000 ver7.0-ad 遺伝子解析システム CEQ8000 Tutorial Manual
... データのタイプ（Sample Elements） ファイル形式によって転送できるデータのタイプには制限がありますので、クリアになっている項目より選択 しチェックを入れてください。 CEQ8000 解析ソフトは scf 形式で転送した Analyzed Data を開くことが出来ます。 この場合に表示されるデータは波形のデータとテキストデータとなります。 なおプリントアウトも同じデータのタイプを使用しています。 ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... ・ Yeast two-hybrid screening Two-hybrid screening の方法および使用したゲノム DNA ライブラリーは既に確 立された方法に従った(Tadauchi et al., 2004; James et al., 1996)。pGBD-PBP1 とゲ ノムライブラリーを PJ69-4A に導入し、1mM 3-aminotriazole を含んだ SC –leucine –tryptophan ...
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疾患関連遺伝子の long-range PCR Nextera解析2.pptx
... Nextera DNA Sample Preparation Kit によるライブラリ調整 Nextera transposome と アダプターのテンプレート DNAへの結合 断⽚片化とアダプターの結合 (Tagmentation) PCR によるIndexと アダプター配列列の追加 90分 最⼤大96サンプル のマルチプレックス PCR産物10 [r] ...
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イネ出穂期遺伝子の開花前生育相に及ぼす効果の解析
... が座乗することが知られており，現在，この 遺伝子の解析が行われている．イネ染色体３上の感光性 遺伝子 Hd6 は CK2αをコードしているが ，オオムギ の該当領域に日長反応性遺伝子が存在すること，および コムギの該当領域には CK2αおよびフィトクロム遺伝子 PHYC が存在することが明らかになっている．著者らは ...
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計画研究 年度 ゲノムマッピングと候補遺伝子による日本人２型糖尿病原因遺伝子 の同定とその機能解析 門脇 孝1) 原 一雄1) 山内 敏正1) 窪田 直人1) 戸辺 一之１) 1) 東京大学 医学部附属病院糖尿病 代謝内科学 研究の目的と進め方 (1)全ゲノム解析と候補遺伝子アプロ
... 遂行のため、今後も３省庁による「ヒトゲノム・遺伝子 解析研究に関する論理指針」を遵守し、研究を遂行する。 我々はSNPの遺伝子型など、究極の個人情報ともいえる 情報が第三者に漏洩することがないよう、独自に特殊シ ー ル を 利 用 し た 個 人 情 報 匿 名 化 シ ス テ ム （ ...
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SSRマーカー遺伝子型に基づく日本と台湾のウメの過去の集団動態の推定
... 要旨：ウメ（Prunus mume）は Prunus 属の果樹であり，300 以上の品種が東アジアを中心に分布しているが，日本の実ウメ，小 ウメ，花ウメおよび台湾由来のウメもこれらに含まれる．そこで，日本と台湾のウメの過去の集団動態を推定するために，53 品 種（実ウメ 20 品種，小ウメ 8 品種，花ウメ 20 品種，台湾 5 品種）の SSR マーカー 20 座における遺伝子型のデータセットに基 ...
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遺伝子比較解析による珪藻類特異的なSET ドメインタンパク質ファミリーの同定
... バイオインフォマティクス解析 バイオインフォマティクス解析は国立遺伝学研究所の スーパーコンピュータを利用して行った．RNA シーケン ス解析から得られたリード配列に対し，アダプター配列 および低クオリティ配列をトリミングした．トリミング 後のリード配列をアセンブルすることでコンティグ配列 を取得した．3 種の珪藻，N. palea および A. kuwaitensis， P. lunata ...
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ロ構成要素の機能 目的遺伝子 発現調節領域 局在化シグナル 選抜マーカーその他の供与核酸の構成要素それぞれの機能 目的遺伝子及び選抜マーカーの発現により産生される蛋白質の機能及び当該蛋白質がアレルギー性 ( 食品としてのアレルギー性を除く ) を有することが明らかとなって
... ４ 遺伝子組換え生物等を不活化し又は拡散防止措置を執ってその使用等を継 続するための具体的な措置の内容 生物多様性影響を生ずるおそれがあると認められた場合、弊社は、モンサン ト・カンパニーの協力のもと、本スタック系統ワタが環境中に放出されないよ うに必要かつ適切な措置をとるとともに、環境中に放出された本スタック系統 ワタ及び本スタック系統ワタの親系統のうち２系統からなるスタック系統ワ ...
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