発現データから興味ある遺伝子を見つける
アルツハイマー病患者におけるcDNAサブトラクション法を用いた脳部位特異的遺伝子発現の解析
... （考察） 本研究において、TRIM-32及びTRIM-37は共に、AD後頭葉皮質にて発現が亢進していた。TRIMはユビキ チンプロテアソームシステム（UPS）の中心的役割を有するE2リガーゼ活性を有しており、UPSの異常蛋 白質の除去機構はAD発症に非常に重要と考えられる。AD後頭葉皮質にてTRIM32/37が活性化することに ...
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脂肪肝に特異的に発現する新規PPARγ標的遺伝子に関する研究
... LPD1 遺伝子の発現解析 第一節 概要････････････････････････････････････････････････････････････････24 第二節 PPARγ 欠損マウスの肝臓における LPD1 の発現性･･･････････････････････24 第三節 各脂肪肝モデルマウスの肝臓における LPD1 ...
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ス化した さらに 正常から上皮性異形成 上皮性異形成から浸潤癌への変化に伴い有意に発現が変化する 15 遺伝子を同定し 報告した [Int J Cancer. 132(3) (2013)] 本研究では 上記データベースから 特に異形成から浸潤癌への移行で重要な役割を果たす可能性がある
... 15 遺伝子を口腔癌の進展に関与する遺伝子として既に報告した。本研究 では、上記データベースを基に、正常上皮から上皮性異形成でほとんど変化せず、上皮性異形成 から浸潤癌で発現が有意に増加する４遺伝子（HtrA3,MMP11，LARP6，COL5A1）を選択した。 これは、4 ...
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汽水産端脚類を用いた底質毒性評価へのcDNA-AFLPによる遺伝子発現プロファイリングの適用
... 近年、次世代シーケンシング（Next generation sequencing, NGS）技術の進展により迅 速に大量の遺伝子発現データを取得できるようになった。しかし新規あるいは低発現のバ イオマーカーを探索するには、NGS は依然として高価でありデータ解析の手間を要する。 ...
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miRNAによる線維芽細胞の活性化・線維化誘導遺伝子発現制御の解明
... よって、私たちはブレオマイシンとシリカ誘導マウスモデルの2つのモデルを使用し、両者に おいて発現が増加または低下したmiRNAをリストアップした。また、肺線維芽細胞において変 化するmiRNAを調べるため、Collagen I(α)2-green fluorescent protein (GFP)レポーターマウスを使 ...
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グリオーマ細胞へのp16遺伝子導入はsurvivinの発現低下を伴った中心体増幅と核形態異常をもたらす
... p16 遺伝子導入はアデノウイルスベクターを用い、コントロールとして遺伝子発現しない mock ウイルスを使用した。放射線照射した細胞と、非照射の細胞との比較を行なった。Day3 および day5 で細胞を回収した。中心体を構成する主要蛋白であるγ-tublin に対する抗体 ...
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遺伝子発現データの クラスタリングの理論的背景
... 自己組織化マップとは？ • K平均アルゴリズムは、あらかじ めクラスター数Kを設定し、互い に近い値を持った各要素が同一 クラスターに所属するように所属 クラスターを決めてゆく ...
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1M5-3 行列因子分解による遺伝子データからの潜在的因子の抽出
... 生物学でのタンパク質間相互作用を測った大規模な実験結 果からも，細胞内の多くの現象が多機能性のタンパク質をとおし て直接関連する可能性が指摘されている．したがって，用語とし て認識され定義された時には独立に見出された用語（概念）で あっても，大規模に収集されたデータを解析すると，実はいくつ ...
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酵母CbHap複合体によるメタノール誘導性遺伝子の発現制御機構
... 本論文では、メチロトローフ酵母Candida boidiniiにおいて、転写因子CbHap複合体 がメタノール誘導性遺伝子発現の制御に関わることを新たに見いだした。Hap複合体は 真核生物に広く保存された転写因子であり、Saccharomyces cerevisiaeにおいては呼 吸代謝関連遺伝子を制御することが知られている。しかし、C. ...
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網羅的遺伝子発現解析を用いた白色腐朽菌のリグニン分解酵素生産制御機構に関する研究
... 本 研 究 で は 白 色 腐 朽 菌 の モ デ ル 生 物 と し て 認 知 さ れ て い る Phanerochaete chrysosporium の LiP と MnP の生産に関与する遺伝子群の検索を目的として、Long Serial Analysis of Gene Expression（LongSAGE）を用いたトランスクリプトーム解析を行った。 ...
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遺伝子発現制御機構 クロマチン，転写制御，エピジェネティクス - ダウンロード, PDF オンラインで読む
... | 遺伝子発現制御機構 クロマチン、転写制御、エピジェネティ クス | 田村隆明 | 発売国 : 日本 | 書籍 | 9784807909179 | HMV&BOOKS online 支払い方法､配送方法もいろいろ選べ､非常に便利です！ エピジェネティクス実験スタンダード : もう悩まない ! ゲノム機能制御の読み解き方 / 牛島俊和 , 眞貝洋一 , 塩見春彦編集 ; 2 cover ...
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遺伝子の近傍に別の遺伝子の発現制御領域 ( エンハンサーなど ) が移動してくることによって その遺伝子の発現様式を変化させるものです ( 図 2) 融合タンパク質は比較的容易に検出できるので 前者のような二つの遺伝子組み換えの例はこれまで数多く発見されてきたのに対して 後者の場合は 広範囲のゲノム
... 東北大学大学院医学系研究科の 鈴木未来子 講師（ラジオアイソトープセンター）、山㟢博未 博 士（医化学分野）、清水律子 教授（分子血液学分野）、山本雅之 教授（医化学分野・東北メディカ ル・メガバンク機構 機構長）らは、3番染色体長腕の転座および逆位 ※1 を伴う急性骨髄性白血病に ...
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因子が 脂肪細胞分化に伴ってその発現が増加することを見出し その発現増加が脂肪細胞分化に伴うアディポネクチンの発現誘導にも少なくとも部分的に重要な役割を担っていることを見出した (2) 脂肪細胞肥大のメカニズム解明 : CBP ヘテロ欠損マウスと PPARγヘテロ欠損マウスを用いた網羅的な遺伝子発現
... (2) 脂肪細胞肥大による形質転換の内容とメカニズム解明 アディポネクチン遺伝子の転写制御領域の deletion mutant の転写活性化能を解析するこ とにより、肥満においてアディポネクチンの転写を抑制する転写因子の結合部位をマップ することに成功した。更に、肥満で同様に低下するアディプシン遺伝子と、アディポネクチ ...
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マウスにおける持続的なインターフェロン-γ発現によるアトピー性皮膚炎および癌の遺伝子治療
... In Chapter I, I showed that the hydrodynamic injection of pCpG-Muγ resulted in prolonged therapeutic serum concentrations of IFN-γ for more than 80 days, and this significa[r] ...
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化学合成独立栄養細菌 Acidithiobacillus thiooxidans 由来アコニターゼの遺伝子解析と大腸菌での発現
... 結晶化され構造解析等，詳細に研究されている例は少な い．我々は，化学合成独立栄養細菌 A.thiooxidans 中に NAD 依存型のイソクエン酸脱水素酵素（ICDH）の存 在を見出し，研究を行ってきたが，その過程で ICDH の ORF 上流にアコニターゼ遺伝子と推測される ORF が， 下流にスクシニル-CoA シンテターゼと推測される ORF ...
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イネおよびヨシの高親和性硝酸輸送システムに関わる遺伝子の構造と発現
... 第 3 章 イネの高親和性硝酸輸送遺伝子の発現と硝酸吸収との関係 第 3 章では、前章で抽出・同定した 4 つの OsNRT2 と 2 つの OsNAR2 の機能を明らかにす るため、硝酸誘導時における硝酸吸収とそれらの遺伝子の発現パターンを、硝酸処理前に ...
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複合病害抵抗性イネ（WRKY45 遺伝子発現イネ，Oryza sativa L.）栽培実験計画書
... 事業場外に遺伝子組換えイネの花粉が飛散していないこと を確認する予定です。 「モチミノリ」は移植時期を数段階に分けてポット栽培し、遺伝子組換 えイネと出穂期の合った集団を使用します。交雑の確認は、キセニア現象（モチ品種にウル チ品種の花粉が受粉して玄米が半透明になること）を利用して行います。キセニアが見られ ...
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シロイヌナズナの熱ストレス応答性遺伝子発現制御における70-kDa熱ショックタンパク質の役割
... (シロイヌナズナの熱ストレス応答性遺伝⼦発現制御における 70-kDa 熱ショックタンパク質の役割） Plants are typically sessile organisms, which are spending their whole lives at almost the same place. They face to changing surroundings and unsuitable growth ...
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Apc変異による遺伝子発現や細胞動態への影響は細胞種に依存する
... Apc 遺伝子欠損は胎児性致死であることが報告されており、RTC の多能性の欠如は Apc 遺伝子の不活性化によ るものと考えられた。変異した Apc 遺伝子の片アレルを相同組み換えにて正常 Apc 遺伝子で救済すると RTC に 多能性が付与された。この救済 Apc 遺伝子に loxP 配列を組み込むことで、分化させた ...
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肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析
... Browser http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway データをアップロードして表示することができる（Kent et al. 2002 Genome Res）。 IGV https://www.broadinstitute.org/igv/home BAM、BEDファイルなどを簡単に可視化でき、操作性 が高い（Robinson et al. 2011 ...
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