動の分子動力学シミュレーション
分子動力学シミュレーションによるOLCの摩擦メカニズム評価
... 置にあるものと考えられる [23] ．しかし，これまでの検討でこのルールに従って原子数 が 60n 2 で表されるフラーレンを作成した場合，緩和を行うと五員環の部分が外側に突 き出し，正二十面体形状になることがわかった [34] ．このようにフラーレンの形状は五 員環の位置によって決まるため，球殻形状を実現するためには五員環の数を増やす必 ...
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モデルポテンシャルによるビクスバイト型酸化物と転位芯の分子動力学シミュレーション
... 要約 酸化物分散強化鋼 (ODS 鋼) は，原子炉被覆管材の有力な候補として期待されてい る．ODS 鋼中には酸化物が微細なナノクラスターとして存在し，転位の自由な運動を 妨げることで強度が高められていると考えられているが，試験観察が困難であるため その詳細は不明である．本研究では bixbyte 型酸化物と，らせん転位または刃状転位を 導入した bcc-Fe ...
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連載講座 : 高生産並列言語を使いこなす (5) 分子動力学シミュレーション 田浦健次朗 東京大学大学院情報理工学系研究科, 情報基盤センター 目次 1 問題の定義 17 2 逐次プログラム 分子 ( 粒子 ) セル 系の状態 ステップ 18
... 7 まとめ 分子動力学法の初歩である Lenard Jones ポテンシャルを用いたシミュレーションを, OpenMP, Cilk, TBB を用いて並列化し, その評価結果について述べた. 三重ループを, OpenMP では parallel for プラグマで, Cilk は直交再帰分割を spawn 構文で, TBB は parallel reduce, ...
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カーボンナノコイルの機械的特性に関する分子動力学シミュレーション
... 5 菱形断面の CNC 5.1 応力 - ひずみ曲線と変形の概要 Fig. 5.1 に菱型断面モデルの応力-ひずみ曲線を示す．ヤング率は armchair が 107[GPa]， zigzag が 124[GPa] となり，前章の円形断面より低い値となった．armchair と zigzag ...
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分子シミュレーション効率化の ためのアルゴリズム
... 分子動力学シミュレーションの手順 1. 講義のページからnamd2.exeとtcl85t.dllを ダウンロードし、デスクトップに保存 2. 講義のページからala14.zipをダウンロードし、 デスクトップに保存 ...
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分子動力学法によるポリマー内部分子構造のモデル化と変形挙動解析
... 要 約 高分子材料は，内部に無秩序に存在する高分子鎖のからみ点数の変化や分子鎖セグメ ントの回転といった微視的構造変化に依存して複雑な変形挙動を示す．本研究では， 不規則かつ長い高分子鎖の変形挙動について，原子レベルから新たな知見を得ること ...
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Ni基超合金微細析出構造における転位の分子動力学解析
... した種々の大規模分子動力学シミュレーションを行った．まず，γ/γ ′ 界面における転 位発生機構を，特に格子状 γ ′ 相のエッジや頂点などの界面会合部に着目して，周囲に γ ′ 相が存在する状態で検討した．その結果，γ ′ 相頂点近傍の原子配置が乱れた部分を 起点としてループ状の部分転位が発生し，γ ...
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分子シミュレーション効率化の ためのアルゴリズム
... 分子動力学シミュレーションの手順 1. 講義のページからnamd2.exeとtcl85t.dllを ダウンロードし、デスクトップに保存 2. 講義のページからala14.zipをダウンロードし、 デスクトップに保存 ...
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分子動力学によるMg-Zw-Y合金のLPSO構造の安定性ならびにキンク発生メカニズムの検討
... 田中克志先生へも屋代先生と同様に最大限の感謝を致します．研究が行き詰った時 に幾度となく有益なアドバイスを頂き，幅広く，かつ深い知識を持ちながらも，いつ も気楽にふらっと話しかけに来て下さった先生には何度救われたか分かりません． また，机を並べて未知の「シミュレーション」という壁に共に向かったシミュレー ション班（富平を含む）の 3 ...
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分子シミュレーションの応用
... 初期構造の作成（２） • 欠失残基への対応 – 欠失残基はモデリングなどで補う – N末端、C末端が欠失している場合は、欠失残基 の前後の残基をacetyl基、N-methyl基でブロック しても良い ...
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シリコンにおける非弾性変形開始時の局所力学状態に関する分子動力学的研究
... [100]，[110]，[111] の単結晶シリコン，2 ⃝のバンブー構造 へそれぞれ下向きに変位を与えて押し込みを行ったときの力−変位関係を図 ...[100] の単結晶を図 ...は圧縮を受ける側の結晶内部でエネルギーが高くなっているが，単軸引張または曲げ シミュレーションで欠陥生成したときに見られた高いエネルギー集中は見られず，結 ...
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析出強化超合金中における界面転位網の形態変化および形成過程の離散転位動力学シミュレーション
... m は転位の質量，M は刃状転位，らせん転位の可動性の差を考慮するための転位の 可動性を表すパラメータである．また v i はすべり速度，T は絶対温度，p は圧力であ る．(2.7) 式に基づいて転位曲線の時間発展を追跡していくが，Frank-Read 源のよう ...
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分子動力学法によるアモルファスポリエチレンの押し込み挙動評価－押し込み速度・架橋点の効果
... 子鎖長さは 1000CH 2 に統一している．作成時の密度は ρ=0.85g/cm 3 となる． まず，得られた初期構造に対し，全方向周期境界境界条件のもとで 10,000fs の初期 緩和計算を行い内部構造緩和を行った．数値積分には Verlet 法を用い，積分の時間ス テップは 0.1fs とした．温度は 300K とし，速度スケーリングにより制御した． ...
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整合界面の構造安定性ならびにミスフィット転位に関する分子動力学的研究
... (2) 半経験的ポテンシャル (3) 非経験的手法 (第一原理計算) 経験的ポテンシャルは，量子力学の厳密な理論に基づいて決定されるのではなく，ポ テンシャルを微分可能な未定係数を含む簡単な関数形で仮定し，従来の実験的事実に 合致するようにその未定係数が決められる．半経験的ポテンシャルは，密度汎関数論 より導出される形で定義されるが，そのポテンシャルパラメータは平衡状態でのマク ...
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繰り返し変形を受けるポリブタジエンのヒステリシス発現メカニズム：分子動力学法による検討
... し，引張り過程での応力変化を詳細に見ると，bond stretch は ε zz = 0.2 近傍でほぼ 一定応力となった後，ε zz = 0.6 近傍より再びわずかに応力は上昇している．van der Waals はほとんど変化していない．すなわち 4.2.1 節で示した，ポリエチレンとの違い である変形後期のわずかな応力減少は bond stretch，van der Waals ...
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バルク系およびO/Wエマルション系におけるリノール酸メチルとα-リノレン酸メチルの酸化動力学
... 食用油脂は各種の脂肪酸から構成されるトリアシルグリセロールの混合物であること が多い．そこで第２章では，飽和脂肪酸エステルと不飽和脂肪酸エステルの混合物をモ デルとして，オクタン酸，ラウリン酸またはパルミチン酸メチルエステルを混合したリ ノール酸メチルの酸化過程（ 65℃）を測定した．本系では，飽和脂肪酸エステルが酸化 ...
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動物行動の分子生物学 (立ち読み)
... ■ 1 章 多彩な動物行動と，遺伝子レベルの研究 1.2 動物行動学の開祖 19 世紀終わりに『ファーブル昆虫記』が出版されたように，動物の行動 は以前から研究者の観察の対象になっていたが，動物行動学を学問として創 設したのは（つまり，何が動物行動の問題かを指摘したのは），良く知られ ているように ...
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直動ガイドの数値シミュレーション ANSYS & Optimus による “高精度化” “自動化” “最適化”
... 2.2 FEM 適用による負荷分布理論の精度向上 負荷分布理論 + FEM ⇒ 解析精度の向上を実現 図6 各種モデルを適用した直動ボールガイド負荷分布理論 キャリッジ，レールの変形をモデル化 ...
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計算科学技術特論 A 古典分子動力学計算法の高速化 2019 年 7 月 4 日名古屋大学大学院工学研究科附属計算科学連携教育研究センター吉井範行
... • M. P. Allen, D. J. Tildesley，“ Computer Simulation of Liquids," Oxford Science, Oxford（１９８７）． • J. P. Hansen, I. R. McDonald, “Theory of Simple Liquids," Academic Press, London（１９８６）． • 岡崎 進, 吉井 範行, ...
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学会, 研究集会 9 月 1 日 -3 日 Workshop on Numerical Modeling of Earthquake Source Dynamics 加瀬祐子 関口春子 スロバキア ブラチスラバ郊外で開かれた, 震源 の動力学のシミュレーションに関するワーク ショップに参加した. 数
... イタリアでは 2002 年 10 月末にモリーゼ地震（内 陸地震）があり 30 名の死者（そのうち 27 名は学 校の倒壊による児童の犠牲）が出ており，全国の 地震危険度の見直しが急務で，今年の末までに， 地震危険度地図の改訂版を出すように要求されて いる．専門家によるチェックを受け，また誰でも ...
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