創薬分子シミュレーション
1. 薬物や機能性化合物デザインの基本と環境の変化 2. 多変量解析 / パターン認識に基づく インシリコスクリーニングとインシリコデザインの基本原理 3. 並列創薬 ( 複数特性の同時最適化 ) の提案 4. 並列創薬 と 逐次創薬 の開発成功確率に基づく比較シミュレーション 5. 分類 / 予測
... １．ＣＣＫ－Ａ（ １．ＣＣＫ－Ａ（ Cholecystokinin Cholecystokinin - - A) A) 受容体拮抗剤； 受容体拮抗剤； Malonamide Malonamide 誘導体、急性 誘導体、急性 膵炎治療薬 膵炎治療薬 ２．Ｃａ ２．Ｃａ ２＋ ２＋ 遊離抑制作用； 遊離抑制作用； 1,5 1,5 - - benzothiazepine benzothiazepine ...
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分子動力学法によるアモルファスポリエチレン/グラファイト界面の剥離シミュレーション
... じる界面の破壊現象を高速度カメラによる観察などが行われている (1) ．また，界面 の強度を実験的に評価するものとして繊維引き抜き試験 (2) 等による評価がなされて いるが，様々な樹脂・繊維界面の組み合わせを考えると，高分子-炭素繊維表面のミ クロ挙動に関する基礎的な知見が必要と考える．原子シミュレーションで高分子-炭 素界面を検討したものとして，Frankland らはカーボンナノチューブ (CNT) をポリ エチレン ...
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モデルポテンシャルによるビクスバイト型酸化物と転位芯の分子動力学シミュレーション
... 要約 酸化物分散強化鋼 (ODS 鋼) は，原子炉被覆管材の有力な候補として期待されてい る．ODS 鋼中には酸化物が微細なナノクラスターとして存在し，転位の自由な運動を 妨げることで強度が高められていると考えられているが，試験観察が困難であるため その詳細は不明である．本研究では bixbyte 型酸化物と，らせん転位または刃状転位を 導入した bcc-Fe に，せん断を与えることで転位を酸化物に接近させるシミュレーショ ...
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PPARα/γ デュアルアゴニストの創薬研究 柴田憲宏
... 著者は、それらの中で特にインスリン抵抗性、高血糖および脂質代謝障害による各種合併症 の発症や進展に対する抑制薬である PPARγ 活性化を作用機作とするインスリン抵抗性改善薬に 注目した。 PPAR は、リガンド応答性核内受容体型の転写因子であり、α、δ、γ と 3 つのサブタイプが知られ ている。その中で PPARγ は、白色脂肪組織で脂肪生成やグルコース恒常性の中心的な役割を担 っている。 PPARγ ...
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ラクオリア創薬株式会社と 名古屋大学トランスフォーマティブ生命分子研究所の共同研究開始のお知らせ－体内時計のリズムを調節する新薬の創出を目指して－
... 屋 大 学 の 産 学 連 携 研 究 施 設 、 ナ シ ョ ナ ル ・ イ ノ ベ ー シ ョ ン ・ コ ン プ レ ッ ク ス （ National Innovation Complex, NIC ）施設を研究拠点の一つとして整備し、名古屋大学とのシナジーを 最大限に発揮できる体制を構築しました。 本共同研究はその一環として位置づけられ、 ラク オリア創薬が保有する産学協同研究講座と ITbM ...
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非破壊 迅速 低コスト に ips 細胞の状態を評価できる品質管理技術を開発 名古屋大学大学院創薬科学研究科 ( 研究科長 : 人見清隆 ) 基盤創薬学専攻創薬生物科学講座細胞分子情報学分野の加藤竜司 ( かとうりゅうじ ) 准教授 国立研究開発法人医薬基盤 健康 栄養研究所ヒト幹細胞応用開発室の古
... ・培養中の細胞の品質を容易に確認することができるようになり、高品質なヒト多能性幹細胞 を大量かつ安定に製造するシステム開発に貢献することに期待。 名古屋大学大学院創薬科学研究科（研究科長：人見清隆）基盤創薬学専攻創薬生物科学 講座細胞分子情報学分野の加藤 竜司（かとう りゅうじ）准教授、国立研究開発法人 医薬 ...
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Microsoft PowerPoint - プレシジョン創薬概論 P_ex_velvet.PPT
... クリック (Click) 26 ENSEMBLを使ったBLAST解析 クリック (Click) 27 ENSEMBLを使ったBLAST解析 ヒット遺伝子 ゲノムのヒット位置 正鎖か逆鎖か E値 染色体マップ上の位置 28 ENSEMBLを使った遺伝子情報取得 クリック (Click) Choose Ensembl Genes Choose Human gene[r] ...
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分子シミュレーションの応用
... 初期構造の作成（３） • リガンドの力場パラメータの取得 – リガンドの力場パラメータは分子動力学ソフトウェ アに含まれていないので、自分で作成するか、 Amber Parameter Database * 等から取得する ...
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カーボンナノコイルの機械的特性に関する分子動力学シミュレーション
... び伸張時の CNC と巨視的なばねの振る舞いを比較した (24) ．計算材料科学の分野で は，Lili らが分子動力学シミュレーションを行い，CNC の弾性係数が欠陥分布によ らないことを報告した (25) ．Lizhao らは armchair 型の CNC のモデルを作成し，非 平衡 Green 関数法をもちいて CNC の量子コンダクタンスについて検討した (26) ．Ju ...
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分子動力学シミュレーションによるOLCの摩擦メカニズム評価
... 第 3 章では径の大きさの異なる単一フラーレンに対して，初期構造緩和，圧縮，摩 擦のシミュレーションを行う．初期構造緩和シミュレーションにより緩和後のフラー レンの構造を示し，その半径について実験値との比較を行う．圧縮シミュレーション では頂点保持による圧縮とダイヤモンド壁による圧縮の 2 通りを行い，フラーレンの ...
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創薬と結晶構造解析-3.key
... Operational strategy Chem Biol Drug Des 2007; 70: 557–565 つまり，条件としてはこんなふうです． 右半分はCGP38560の構造をそのまま使うと，6つの水素結合のうち5つは残せます． あとは，さっきも見たように，P1とP3の2つの疎水ポケットにうまくはまるような疎水部 を繋いで，しかもSer219との水素結合を確保することが出来るような化合物を設計してみ ...
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創薬を志向した有機合成
... 図 3. オレキシン神経欠損マウス(orexin/ataxin-3 マウス)の睡眠覚醒の特徴を暗期（活動期）１２時間の典型的な睡眠図（ヒプノグラム）で示したもの。 R, REM 睡眠、NR,non-REM 睡眠、W,覚醒を示す。横軸は時間。オレキシン神経欠損マウスは野生型のマウスに比べ、頻繁に睡眠・覚醒のステージの間の相 転移を繰り返すことがわかる。 ...
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サカナに逃げろ！と指令する神経細胞の分子メカニズムを解明 －個性的な神経細胞のでき方の理解につながり，難聴治療の創薬標的への応用に期待-
... 本研究では、脊椎動物のモデル生物である小型魚類・ゼブラフィッシュの後脳に存在す る網様体脊髄路ニューロン群の一つであるマウスナー（M）細胞に着目しました。M 細胞 は入力量をいくら大きくしても単発の活動電位しか発生しないという単発発火特性を示し ます。M 細胞はこの単発発火特性によって、大きな音の開始にたった１回だけ活動電位 を発生させて、サカナに逃避運動を素早く駆動させることが古くから知られています。 しかし、 ...
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分子動力学法による非晶・結晶PP/PEとグラファイト層界面のせん断シミュレーション
... PE 分子鎖中から CNT を引き抜くシミュレーションによ り，界面せん断強度がマトリックスの密度に依存することを示している． (11) また， Coto らもエポキシ樹脂から CNT を引き抜くシミュレーションにより，CNT の半径 の増加に従い界面せん断強度が減少することを示してる． (12) ...
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橡創薬基盤技術の開発（トップ３）全部まとめた分.PDF
... 製薬メーカーだけで考えても限界があります。国 を含めたトータルな研究開発システムを構築し、 その中で総合プロデューサーが実際にやるべき ことをいち早くつかみ、国家プロジェクト、企業 研究、バイオベンチャーによる開発というように 研究・開発の主体を割り振りし、総合的に開発し ていく流れを作らないといけないと思います。残 念ながら先程からのお話にもありますように、ヒ トの遺伝子の数は３万から４万と言われており ...
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細胞環境下の生命システムを再現した1分子粒度シミュレーション
... 5. 核内の不均一な分子混雑が染色体を制御する 細胞核内，特に染色体領域の分子混雑の状況はさらに複 雑である．凝集したM期染色体はヌクレオソーム分子に よって高い分子混雑下にある．転写因子など染色体の制御 に関わる分子は，この入り組んだ状況で特定の対象を見つ け出し，適切に働くことが求められる．我々は国立遺伝学 研究所の前島一博教授との共同研究で，染色体の動的な構 ...
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( 様式 10) 16am j0005 平成 29 年 5 月 30 日 平成 28 年度医療研究開発推進事業費補助金 ( 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 ) 補助事業成果報告書 I. 基本情報 事業名 : 創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 ( 創薬等支援技術基盤プラットフ
... いる。分担者中川のグループは、タンパク質結晶構造を用いた計算化学シミュレーションを基にした 分子設計により、既存の阻害剤と同等の活性を有し化合物平面性を低下した阻害剤を見出した。さら に、同様の手法による分子設計をもとに既存の Pin1 阻害剤からの骨格変換を行い、既存の化合物に はないアントラニル酸を母核とした高活性な新規阻害剤を見出した。また、酵素活性部位のアミノ酸 ...
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分子標的薬の重篤な副作用 外部用
... 目的 : 免疫チェックポイント阻害薬によるirAEが報告された症 例に関するシステマティックレビュー 方法 : Medline / EMBASE / Web of Science / PubMed ePubs / Cochrane CENTRALのツールを用いて検索を行った. ...
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個別化医療時代の創薬ーデジタルトランスフォーメーションに賭ける製薬企業ー
... 【コンピュータ創薬】 コンピュータによるシミュレーション技術（インシリコ創薬）は、医薬品開発の基礎研究および前臨床 試験を効率化する技術として注目されている。従来は、医薬品の種となる化合物が病気の標的にどのよう に結合するのか、実験と検証で見いだしてきたが、コンピュータ創薬では、コンピュータ上で分子レベル ...
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分子シミュレーション効率化の ためのアルゴリズム
... 分子動力学シミュレーションの手順 1. 講義のページからnamd2.exeとtcl85t.dllを ダウンロードし、デスクトップに保存 2. 講義のページからala14.zipをダウンロードし、 デスクトップに保存 ...
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