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1. 薬物や機能性化合物デザインの基本と環境の変化 2. 多変量解析 / パターン認識に基づく インシリコスクリーニングとインシリコデザインの基本原理 3. 並列創薬 ( 複数特性の同時最適化 ) の提案 4. 並列創薬 と 逐次創薬 の開発成功確率に基づく比較シミュレーション 5. 分類 / 予測

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(1)

早期ADMETの基本と

早期ADMETの基本と

21世紀の創薬手法、「並列創薬」のご提案

21世紀の創薬手法、「並列創薬」のご提案

富士通(株)

富士通(株)

バイオIT事業開発本部

バイオIT事業開発本部

大阪大学臨床医工学融合研究教育セン

大阪大学臨床医工学融合研究教育セン

ター

ター

2009.2.27

湯田 浩太郎

(2)

All Rights Reserved, Copyright (C) FUJITSU LIMITED 2009

1.薬物や機能性化合物デザインの基本と環境の変化

2.多変量解析/パターン認識に基づく、

インシリコスクリーニングとインシリコデザインの基本原理

3.「並列創薬(複数特性の同時最適化)」の提案

4.「並列創薬」と「逐次創薬」の開発成功確率に基づく比較シミュレーション

5.分類/予測率向上を目指す、新たな手法の提案

6.

ADMEWORKSシリーズ

7.

ADMEWORKSを用いたインシリコ脱毒性シミュレーション事例

8.

ADMEWORKSによる安全性予測のデモ (20分)

(3)

1.薬物や機能性化合物デザインの基本と環境の変化

□創薬における開発失敗要因?

創薬における開発失敗は、

薬理活性よりもADME(薬物動態)、T(安全性)での失敗が大きい

□化合物関連の規制(安全性)強化

副作用防止の他、一般化合物も環境の観点で規制が強化

日本:化審法、EU:REACH、米国:

HPV

(4)

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医薬品開発の流れ(前臨床過程)

最適化

最適化

最適化

コンビナトリアル

ケミストリー

HTS

インシリコ

スクリーニング

コンビナトリアル

コンビナトリアル

ケミストリー

ケミストリー

HTS

HTS

インシリコ

インシリコ

スクリーニング

スクリーニング

薬動試験

薬動試験

薬動試験

毒性試験

毒性試験

毒性試験

探索

探索

探索

QSAR

3D-QSAR

SBDD

RDD

de novo DD

QSAR

QSAR

3D-QSAR

3D-QSAR

SBDD

SBDD

RDD

RDD

de novo

de novo

DD

DD

実験のHTS化

新プロトコル開発

キメラマウス

メタボノミクス

超微量スクリーニング

実験のHTS化

実験のHTS化

新プロトコル開発

新プロトコル開発

キメラマウス

キメラマウス

メタボノミクス

メタボノミクス

超微量スクリーニング

超微量スクリーニング

□現在の創薬プロセスの特徴

1.独立性:各プロセスは独立して展開されている。

1.独立性:各プロセスは独立して展開されている。

2.展開性:各プロセスで急速な技術革新が展開されている。

2.展開性:各プロセスで急速な技術革新が展開されている。

3.流動性:各プロセス間の流れは殆ど固定されている。

3.流動性:各プロセス間の流れは殆ど固定されている。

(5)

□開発失敗による損失は開発後期になるほど大きくなる

・リード化合物発見および最適化 :

230億円 & 開発期間

230

・前臨床

:

17億円+(230億円:それまでの開発費用)=

247

247億円 & 開発期間

・フェーズ1:

56億円+(247億円:それまでの開発費用)=

303

303億円 & 開発期間

・フェーズ2:

169億円+(303億円:

同上

)=

472億円 & 開発期間

472

・フェーズ3:

169億円+(472億円:

同上

)=

641億円 & 開発期間

641

フェーズ3での開発失敗は、641億円

641億円

の投資回収を不可能

投資回収を不可能

とし、開発期間の無駄使い

開発期間の無駄使い

、利益の減少

利益の減少

、商機の消滅

商機の消滅

を伴う

創薬環境、創薬技術、創薬研究手法の急激な変化

創薬環境、創薬技術、創薬研究手法の急激な変化

(6)

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1.創薬過程でのADME、毒性による高い開発中断率

*WEBサイトより借用

http://www.camitro.com/

薬理活性(30%) <

ADME、毒性(60%)

薬理活性:

30%

ADME

ADME

39%

毒性/副作用

毒性/副作用

1%

□創薬における開発失敗要因?

(7)

創薬環境、創薬技術、創薬研究手法の急激な変化

創薬環境、創薬技術、創薬研究手法の急激な変化

□今後の創薬に要求され、実現必要な事項

1.

開発時間の短縮

開発時間の短縮

開発経費の縮小と、開発競争に勝つために重要

2.

開発失敗比率の減少

開発失敗比率の減少

創薬における開発失敗は極めて大きなダメージを

会社に及ぼす。この危険率の低下が極めて重要

3.

ADME-Tの考察(早期ADME-Tの実現)

ADME-Tの考察(早期ADME-Tの実現)

・ADME不適合や毒性発現による開発失敗率が高い

・開発の後期過程での開発中断に結びつきやすいために、

ダメージも大きくなりやすい

(8)

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□毒性関連規制のひろがり

・生体毒性

・生態毒性

・環境毒性

医薬

農薬

一般化製品

・香料

・添加物

・顔料

・液晶

・その他

薬事法

食品衛生法

化審法

労働安全衛生法

廃棄物処理法

家庭用品規制法

水質汚濁規制法

バーゼル法

PRTR法

MSDS法

毒物及び

劇物取締法

製造物責任法

(PL法)

土壌汚染対策法

環境関連分野

環境関連分野

厚生労働省

農林水産省

文部科学省

環境省

経済産業省

□化合物関連の規制(安全性)強化

(9)

REACH

REACH

規則の概要と特徴

規則の概要と特徴

◇概要

◇概要

1.環境/毒性を目指した化合物に関する

EUでの法的規制。

2.総ての化合物に登録義務を課した、世界で最も厳しい化合物関連規制。

3.5年後の完全実施を目指した、段階的実施が特徴。

4.

EUで企業活動を行うにはクリアが必須。

5.この種の環境規制は今後世界に波及する。

◇特徴

◇特徴

1.既存化合物(規制以前から存在していたため、規制対象とされずに

生産が認められている化合物、約3万)をも規制対象とする。

2.生産量にかかわらず、総ての化合物が規制対象となる。

3.製造/販売企業のみならず、二次利用企業も規制対象となる。

現状

現状

1.生産/流通量が多いものは規制対象となる。

2.規制実施後の新規化合物が規制対象となっている。

(10)

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OECDでの企業負担総費用見積もり⇒今後11年から15年

28億から52億ユーロ(4480億円から8320億円)

REACH規則で規制対象となる登録内容

1~10

t

10~100

t

100~1000

t

1000

t~

in vitro皮膚・眼刺激性

・皮膚感作性

in vitro変異原性

・急性毒性

・急性水生毒性-ミジンコ

・微生物分解性

・急性水生毒性-藻類

in vitro皮膚・眼過刺激性

・更なる

in vitro変異原性

・亜急性毒性(28日間)

・生殖毒性スクリーニング

・更なる変異原性試験

・亜慢性毒性(90日間)

・更なる生殖毒性試験

・更なる変異原性試験

・発ガン性

・慢性毒性

・更なる生殖毒性試験

・急性水生毒性-魚類

・活性汚泥

・吸着・脱離スクリーニング

・長期水生毒性-ミジンコ/魚類

・更なる分解および

環境中運命・挙動の研究

・陸生生物への短期的影響

・更なる分解および

環境中運命・挙動の研究

・陸生生物への長期的影響

生体毒性

生体毒性

生態毒性

生態毒性

(11)

2.多変量解析/パターン認識に基づく、

インシリコスクリーニングとインシリコデザインの基本原理

□コンピュータによる化合物特性予測上での問題点

・化合物の構造変化性

・メカニズム不明

□多変量解析やパターン認識適用の基本原理

「情報等価原理」によるデータ解析

□多変量解析やパターン認識適用の流れ(1)

化合物構造式と目的活性データを用いた予測

□多変量解析やパターン認識適用の流れ(2)

発現プロフィ-ルデータを用いた予測

□情報等価原理の特徴

□多変量解析/パターン認識による相関解析で得られる情報

(12)

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コンピュータによる安全性予測上での問題点

コンピュータによる安全性予測上での問題点

安全性(毒性)

安全性(毒性)

①メカニズム不明/複雑

①メカニズム不明/複雑

②化合物構造変化性極大

②化合物構造変化性極大

要因解析

要因解析

要因解析

QSAR

QSAR

SBDD

SBDD

多変量解析

多変量解析

パターン認識

パターン認識

人工知能

人工知能

形式上の

形式上の

ブラックボックス化

ブラックボックス化

種々ノウハウ

種々ノウハウ

(13)

ブラックボックス

ブラックボックス

(相関情報)

(相関情報)

化合物

化合物

蛋白

蛋白

ゲノム

ゲノム

薬理活性

毒性

副作用

代謝

分解性

薬理活性

薬理活性

毒性

毒性

副作用

副作用

代謝

代謝

分解性

分解性

原因

情報

説明義務

パターン認識手法

パターン認識手法

結果

情報

情報等価性/必然性

情報等価性/必然性

情報等価原理

情報等価原理

多変量解析やパターン認識適用の基本原理

多変量解析やパターン認識適用の基本原理

(14)

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化合物構造式

化合物構造式

種々パラメータ発生

種々パラメータ発生

種々の解析手法

・判別分析

・クラスタリング

・フィッティング

・その他

薬理活性

毒性

副作用

代謝

分解性

薬理活性

薬理活性

毒性

毒性

副作用

副作用

代謝

代謝

分解性

分解性

ブラックボックス

ブラックボックス

(相関情報)

(相関情報)

初期パラメータ群

初期パラメータ群

分子量

分子量

原子/結合数

原子/結合数

HOMO/LUMO

HOMO/LUMO

その他

その他

最終

最終

パラメータ群

パラメータ群

情報の

等価性/必然性

情報の

情報の

等価性/必然性

等価性/必然性

□化合物構造式と目的活性データを用いた予測

多変量解析やパターン認識適用の流れ(1)

(15)

□発現プロフィ-ルデータを用いた予測

多変量解析やパターン認識適用の流れ(2)

発現プロフィ-ルデータ

発現プロフィ-ルデータ

数値パラメータ

数値パラメータ

薬理活性

毒性

副作用

代謝

分解性

薬理活性

薬理活性

毒性

毒性

副作用

副作用

代謝

代謝

分解性

分解性

ブラックボックス

ブラックボックス

(相関情報)

(相関情報)

Hs.35092

Hs.35092

;5523

;5523

Hs.27935 ; 857

Hs.27935 ; 857

Hs.622

Hs.622

;3682

;3682

Hs.38677 ;2283

Hs.38677 ;2283

種々の解析手法

・判別分析

・クラスタリング

・フィッティング

・その他

情報の

情報の

等価性/必然性

等価性/必然性

最終

最終

遺伝子群

遺伝子群

(16)

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多変量解析/パターン認識による

多変量解析/パターン認識による

相関解析で得られる情報

相関解析で得られる情報

□構造-代謝/毒性/他との要因解析

□構造-代謝/毒性/他との要因解析

□構造-代謝/毒性/他との要因解析

係数

≧0

の時

パラメータXiの持つ情報は

・活性向上、・毒性強化要因

係数

係数

≧0

≧0

の時

の時

パラメータ

パラメータ

Xi

Xi

の持つ情報は

の持つ情報は

・活性向上、・毒性強化要因

・活性向上、・毒性強化要因

係数

<0

の時

パラメータXiの持つ情報は

・活性低下、毒性低下要因

係数

係数

<0

<0

の時

の時

パラメータ

パラメータ

Xi

Xi

の持つ情報は

の持つ情報は

・活性低下、毒性低下要因

・活性低下、毒性低下要因

構造-薬理活性/ADME-T/物性相関

構造-薬理活性/ADME-T/物性相関

構造-薬理活性/ADME-T/物性相関

±

±

±

±

±

±

±

±

const.

const.

Y:目的活性/ADME-T/他

Y:目的活性/ADME-T/他

・代謝活性あり

・代謝活性あり

・毒性あり

・毒性あり

・代謝活性無し

・代謝活性無し

・毒性無し

・毒性無し

相関

要因の種類

要因

相関の

方向性

方向性

相関の

強さ

強さ

(17)

情報等価原理の特徴

情報等価原理の特徴

□長所

□長所

①取り扱う化合物構造に制限が無い

①取り扱う化合物構造に制限が無い

②総ての化学パラメータの利用可能

②総ての化学パラメータの利用可能

③目的に応じて総ての解析手法の適用可能

③目的に応じて総ての解析手法の適用可能

④前提知識を必用としないので、新規分野の

④前提知識を必用としないので、新規分野の

データ解析も簡単に実施可能

データ解析も簡単に実施可能

□欠点

□欠点

①要因解析力が弱い

①要因解析力が弱い

(18)

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多変量解析/パターン認識による

化学解析実施上での留意点

(19)

ノイズデータを含んだN次元パターン空間

ノイズデータを含んだN次元パターン空間

ノイズデータを含んだN次元パターン空間

A;活性化合物

N;非活性化合物

;活性化合物

;活性化合物

;非活性化合物

;非活性化合物

線形判別関数

Y=a

1

x

1

+a

2

x

2

+・・+a

n

x

n

+const.

Y=a

1

x

1

+a

2

x

2

+・・+a

n

x

n

+const.

目的活性とパターン空間に

何ら相関関係が見出せない

目的活性とパターン空間に

目的活性とパターン空間に

何ら相関関係が見出せない

何ら相関関係が見出せない

(20)

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目的活性の説明力が高い

N次元空間

目的活性の説明力が高い

N次元空間

Linear

Linear

discriminant

discriminant

予測結果

予測結果

Y=a

1

x

1

+a

2

x

2

+・・+a

n

x

n

+const.

活性

化合物

非活性

化合物

活性および非活性化合物群と2分割可能なパターン空間

活性および非活性化合物群と2分割可能なパターン空間

本空間を作るパラメータ群には、活性/非活性と分類するに重要な情報

本空間を作るパラメータ群には、活性/非活性と分類するに重要な情報

(科学的根拠/相関

(科学的根拠/相関

を持つ

を持つ

(21)

線形判別関数で2分割不可能なパターン空間

パターン分布に合わせた分類

線形判別関数で2分割可能な

パターン空間

科学に基づいたパターン空間

科学に基づいたパターン空間

ニューラル

ニューラル

ネットワーク

ネットワーク

決定木

決定木

線形判別関数

線形分類と非線形分類

(22)

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外挿

外挿

科学に基づいたアプロ-チ

Y=a

Y=a

1

1

x

x

1

1

+a

+a

2

2

x

x

2

2

+・・+a

+・・+a

n

n

x

x

n

n

+const.

+const.

アウトライヤー

内挿

内挿

ニューラルネットワーク

R=0.99

>

R=0.70

真のアウトライヤー?

Linear regression line

外挿?

外挿?

外挿?

外挿?

パターンのみのアプロ-チ

パターンのみのアプロ-チ

パターンのみのアプロ-チ

特徴抽出

特徴抽出

特徴抽出

線形フィッティングと非線形フィッティング

(23)

□「早期ADMET」の必要性

・従来手法、「逐次開発」の問題点と限界

・化合物の「一元多様性」:化合物デザインを困難にする最大の要因

・「単一特性最適化」から「複数特性同時最適化」へ

□「並列創薬」の提案

・開発失敗率の低減

・開発効率の向上

・開発期間の短縮

□「並列創薬」と「逐次創薬(従来のアプローチ)」との比較

・シミュレーションによる比較

「並列創薬」による開発成功率

両手法の比=

「逐次創薬」による開発成功率

3.「並列創薬(複数特性の同時最適化)」の提案

(24)

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□ 従来手法、「逐次開発」の問題点と限界

「逐次創薬」が基本:

薬理活性→薬物動態(ADME)→安全性 ⇒⇒ 臨床試験

現在:目標薬理活性(単一特性)最適化のみをターゲットと

したアプローチ

問題:構造式が固定されるので、他の特性(ADME/毒性/

物性等)最適化過程の実施が困難

:手戻りが発生すると、最初からの繰り返しとなる

「早期ADMET」の必要性

(25)

■従来手法最大の問題点:多段階で連続処理

物性

物性

薬理活性

薬理活性

ADME

ADME

毒性

毒性

最適化1

最適化2

最適化3

*フィードバックが多発すると開発期間と費用が急激に拡大

*特に後期過程でのフィードバックのダメージが大きくなる

*段階型である限り、フィードバックは避けられない

*フィードバックの確率低下がもっとも効果的な創薬への道

*フィードバックが多発すると開発期間と費用が急激に拡大

*特に後期過程でのフィードバックのダメージが大きくなる

*段階型である限り、フィードバックは避けられない

*フィードバックの確率低下がもっとも効果的な創薬への道

*フィードバックの確率低下がもっとも効果的な創薬への道

フィードバック1

フィードバック1

フィードバック1

フィードバック2

フィードバック2

フィードバック2

従来型手法(段階的フィルター型アプロ-チ)

(26)

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化合物の「一元多様性」

O

N

O

O

Pharmacological

activity

Pharmacological

Pharmacological

activity

activity

Physico

Physico

chemical

chemical

properties

properties

ADME

ADME

properties

properties

Toxicity

Toxicity

All Rights Reserved, Copyright (C) 富士通株式会社 2005

構造式が決まれば総ての特性が同時に決まる

構造式が決まれば総ての特性が同時に決まる

化合物デザインを困難にする最大の要因

(27)

「インテグレーテッド」

薬理活性 + ADME + 毒性 + 物性

インシリコスクリーニング

探索部門

創薬部門

インシリコ

ドラグデザイン

化合物デザインへの、「インテグレーテッド」概念の導入

(28)

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□「インテグレーテッド」概念に基づいた創薬:1段階、並列処理

薬理活性/ADME/毒性/物性の同時・総合的考察による

薬理活性

薬理活性

ADME

ADME

P

P

I/II/III

I/II/III

並列/一段階創薬

並列/一段階創薬

「並列創薬」の提案

(29)

□従来の「逐次型」アプロ-チ

従来の「逐次型」アプロ-チ

従来の「逐次型」アプロ-チ

ノイマン型

コンピュータ

ノイマン型

ノイマン型

コンピュータ

コンピュータ

Job2

Job1

Job3

Job#

Job#

計算

結果

「並列型」アプロ-チと「逐次型」アプロ-チ

□「並列型」アプロ-チ(同時・統合型)

□「並列型」アプロ-チ(

□「並列型」アプロ-チ(

同時・統合型

同時・統合型

並列型

並列型

コンピュータ

コンピュータ

Job1

Job2

Job3

Job#

Job#

計算結果

計算結果

計算結果

コンピュータ技術に例えた比較

(30)

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4.「並列創薬」と「逐次創薬」の開発成功確率に基づく

比較シミュレーション

□「並列創薬」と「逐次創薬」の開発成功確率に基づく比較シミュレーション1

1.シミュレーション実施条件

1.シミュレーション実施条件

2.

2.シミュレーション指標の設定

3.シミュレーション全体の流れ

4.「並列創薬」概念適用によるアプロ-チ

5. 「並列創薬」と「逐次創薬」アプロ-チの差異

・手戻り発生無しの場合

・手戻りが3回あった場合

6.

「並列創薬」と「逐次創薬」比較結果

「並列創薬」と「逐次創薬」比較結果

(31)

シミュレーション実施条件

シミュレーション実施条件

◆再デザイン回数:繰り返し(不適合発生)回数◆

◆再デザイン回数:繰り返し(不適合発生)回数◆

1回および3回

1回および3回

□ADME関連項目及び安全性試験項目数

□予測実施確率

□繰り返し(手戻り回数)

◆試験項目数=8(ADME:5,毒性3)◆

◆試験項目数=8(ADME:5,毒性3)◆

従来手法=

従来手法=

50%

50%

(自分以外のプロセス考慮しないため)

(自分以外のプロセス考慮しないため)

「インテグレーテッド」=

「インテグレーテッド」=

100%,90%,80%,70%

100%,90%,80%,70%

(32)

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従来手法による創薬研究効率と「インテグレーテッド」

アプロ-チに基づいた次世代型創薬研究効率の違い

シミュレーションによる開発成功比率予測

開発成功比率 =

「インテグレーテッド」アプロ

-チ

従来手法による逐次型アプロ

-チ

計算条件1:試験項目数:全体で8項目

計算条件1:試験項目数:全体で8項目

ADME試験項目数=5

ADME試験項目数=5

安全性試験項目数=3

安全性試験項目数=3

計算条件2:予測率

計算条件2:予測率

100%、90%、80%、70%

100%、90%、80%、70%

従来手法は50%に設定

従来手法は50%に設定

計算条件3:再デザイン(不適合発生回数)は1回と3回

計算条件3:再デザイン(不適合発生回数)は1回と3回

シミュレーション指標の設定

(33)

薬理活性

最適化

薬物動態

試験

安全性

試験

CYP3A4

CYP3A4

CYP

CYP

D6

D6

PGP-ABC

PGP-ABC

HIA

HIA

BBB

BBB

Ames試験

Ames試験

染色体試験

染色体試験

発ガン性

発ガン性

試験項目5種類

試験項目5種類

クリア確率0.5

クリア確率0.5

試験項目3種類

クリア確率0.5

薬動クリア確率=0.031

薬動クリア確率=0.031

毒性クリア確率=0.125

毒性クリア確率=0.125

薬動/毒性全クリア確率=0.0039

薬動/毒性全クリア確率=0.0039

薬理活性

薬理活性

最適化

最適化

完了

完了

従来手法

シミュレーション全体の流れ

(34)

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「並列創薬」概念適用によるアプロ-チ

薬理活性最適化済み

薬物動態試験

5項目(

5項目(

個別クリア確率9

個別クリア確率9

0%

0%

安全性試験

3項目(

3項目(

個別クリア確率9

個別クリア確率9

0%

0%

CYP3A4

CYP3A4

CYP

CYP

D6

D6

PGP-ABC

PGP-ABC

HIA

HIA

BBB

BBB

Ames試験

Ames試験

染色体試験

染色体試験

発ガン性

発ガン性

薬動クリア確率

薬動クリア確率

0.591

0.591

毒性クリア確率

毒性クリア確率

0.729

0.729

薬動/毒性

薬動/毒性

全クリア確率

全クリア確率

0.4308

0.4308

個別クリア確率90%の場合

個別クリア確率90%の場合

(35)

「並列創薬」と「逐次創薬」アプロ-チの差異

従来手法によるアプロ-チ:逐次型

従来手法によるアプロ-チ:逐次型

個別クリア確率50%として

個別クリア確率50%として

薬動/毒性全クリア確率=0.5**8=0.0039

薬動/毒性全クリア確率=0.5**8=0.0039

一度のみの創薬トライアル

一度のみの創薬トライアル

の場合の成功度の比較と倍率

「インテグレーテッド」概念による

「インテグレーテッド」概念による

アプロ-チ:

アプロ-チ:

①個別クリア確率

①個別クリア確率

100%

100%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=1.000

薬動/毒性全クリア確率=1.000

①個別クリア確率

①個別クリア確率

90%

90%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=0.4308

薬動/毒性全クリア確率=0.4308

②個別クリア確率

②個別クリア確率

80%

80%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=0.1678

薬動/毒性全クリア確率=0.1678

③個別クリア確率

③個別クリア確率

70%

70%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=0.0576

薬動/毒性全クリア確率=0.0576

0.4308

0.4308

0.0039

0.0039

=

=

110.5

110.5

0.1678

0.1678

0.0039

0.0039

=

=

43.0

43.0

0.0576

0.0576

0.0039

0.0039

=

=

14.8

14.8

1.0000

1.0000

0.0039

0.0039

=

=

256.4

256.4

(36)

All Rights Reserved, Copyright (C) FUJITSU LIMITED 2009

従来手法によるアプロ-チ:逐次型

従来手法によるアプロ-チ:逐次型

個別クリア確率50%として

個別クリア確率50%として

薬動/毒性全クリア確率=0.0039**3=0.000000059

薬動/毒性全クリア確率=0.0039**3=0.000000059

3回の創薬トライアル

3回の創薬トライアル

の場合の成功度の比較と倍率

「インテグレーテッド」概念による

「インテグレーテッド」概念による

アプロ-チ:

アプロ-チ:

①個別クリア確率

①個別クリア確率

100%

100%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=1.000

薬動/毒性全クリア確率=1.000

②個別クリア確率

②個別クリア確率

90%

90%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=

薬動/毒性全クリア確率=

0.4308**3=0.07995

0.4308**3=0.07995

③個別クリア確率

③個別クリア確率

80%

80%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=

薬動/毒性全クリア確率=

0.1678**3=0.004725

0.1678**3=0.004725

④個別クリア確率

④個別クリア確率

70%

70%

の時

の時

薬動/毒性全クリア確率=

薬動/毒性全クリア確率=

0.0576**3=0.000191

0.0576**3=0.000191

0.07995

0.07995

59

59

E

E

-

-

9

9

=

=

1347824

1347824

0.00473

0.00473

59

59

E

E

-

-

9

9

=

=

79649

79649

0.00019

0.00019

59

59

E

E

-

-

9

9

=

=

3221

3221

1.0000

1.0000

59

59

E

E

-

-

9

9

=

=

16858005

16858005

「並列創薬」と「逐次創薬」アプロ-チの差異

(37)

「並列創薬」と「逐次創薬」比較結果

「並列創薬」と「逐次創薬」比較結果

■シミュレーション実施結果

「インテグレーテッド」概念に基づいた「並列創薬」と、

従来法の「逐次創薬」と比較した場合、「並列創薬」は

創薬における開発成功率を劇的に向上可能

である。

■研究業務の流れ

「インテグレーテッド」概念に基づく「並列創薬」は、

従来からの創薬の基本的な流れを大きく変えることなく

実施可能である。

最適化過程後は、検証過程として特化できる。

(38)

All Rights Reserved, Copyright (C) FUJITSU LIMITED 2009

5.分類/予測率向上を目指す、新たな手法の提案

□ 安全性予測分野に適した新しいデータ解析手法の提案

・「KY(

K-step Yard sampling)法」

クラス分類及びフィッティング

・「テーラーメード・モデリング」

クラス分類及びフィッティング

(39)

安全性予測分野の一般的特徴

1.サンプルの構造変化性が極めて高い

2.サンプル数が多くなる

(40)

All Rights Reserved, Copyright (C) FUJITSU LIMITED 2009

①サンプル数の問題

①サンプル数の問題

サンプル数増大

分類率、予測率低下

分類率、予測率低下

②サンプル母集団の特性上での問題

②サンプル母集団の特性上での問題

サンプルの分散/重複が大

分類率、予測率低下

③分類手法上での問題

③分類手法上での問題

分類に不適切な分類手法の利用

分類率、予測率低下

④分類パラメータ上での問題

④分類パラメータ上での問題

分類能力の小さなパラメータ

分類率、予測率低下

◇分類率や予測率低下の原因となる要因

◇分類率や予測率低下の原因となる要因

(41)

分類率、予測率向上への4大アプローチ

分類率、予測率向上への4大アプローチ

①サンプル数の問題

①サンプル数の問題

サンプル数減少

サンプルのサブセット化

サンプルのサブセット化

②サンプル母集団の特性上での問題

②サンプル母集団の特性上での問題

サンプルの分散の減少

サンプルのグルーピング

サンプルのグルーピング

③分類手法上での問題

③分類手法上での問題

より強力な分類手法の利用

線形から非線形分類へ

線形から非線形分類へ

④より強力なパラメータの利用

④より強力なパラメータの利用

分類パラメータの変更

分類パラメータの変更

二次元から三次元へ

二次元から三次元へ

(42)

All Rights Reserved, Copyright (C) FUJITSU LIMITED 2009

◇分類率を極限(100%)まで高める手法

◇分類率を極限(100%)まで高める手法

開発目標(1)

開発目標(1)

分類/予測の困難性にかかわらず、

常に完全分類(100%)を実現。

開発目標(2)

開発目標(2)

サンプル数がどんなに大きくなっても、

常に完全分類(100%)を実現。

特許出願済み

KY

KY

K

K

-

-

step

step

Y

Y

ard sampling

ard sampling

法の特徴

法の特徴

開発目標(3)

開発目標(3)

(43)

分類率/予測率向上への挑戦

分類率/予測率向上への挑戦

K-step Yard sampling method

KY法

K

K

-

-

step Yard sampling method

step Yard sampling method

KY法

KY法

全く新規の考えに基づく、世界最初のアプローチ

全く新規の考えに基づく、世界最初のアプローチ

全く新規の考えに基づく、世界最初のアプローチ

分類率向上が極めて困難であった

分類率向上が極めて困難であった

6、965サンプル

6、965サンプル

Ames試験データ

Ames試験データ

を用いて、

を用いて、

100%分類

100%分類

に成功

に成功

(44)

All Rights Reserved, Copyright (C) FUJITSU LIMITED 2009

パターン分布とパターン分類:識別不可能な場合

パターン分布とパターン分類:識別不可能な場合

新たなサンプル空間を創出する、非線形化する、

新たなサンプル空間を創出する、非線形化する、

次元の拡張等行ったとしても100%分類の可能性は殆ど無い

次元の拡張等行ったとしても100%分類の可能性は殆ど無い

100%分類の実現は極めて困難

○:

○:

Positive

Positive

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Negative

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100%分類実現は極めて困難

100%分類不可能な識別線(判別関数)

100%分類不可能な識別線(判別関数)

(45)

AP

AP

AN

AN

判別関数の線形/非線形性の影響

判別関数の線形/非線形性の影響

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Positive Zone

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Grey Zone

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Negative Zone

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極めて高い信頼性

極めて高い信頼性

分類の結論出せず

分類の結論出せず

極めて高い信頼性

極めて高い信頼性

AP

AP

AN

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参照

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