幼生研究のための小テクニック集(3) : 文献の収集と整理

幼生研究のための小テクニック集 (3)

文献の収集と整理

小 西 光

一

幼生研究における小テクニックの中で，これま でに微小なサンプルの観察と幼生飼育に関して述 べた （小 西 ，

2000, 2001 ).

ここで脇道に外れる かも知れないが，得たデータをまとめる際に不可 欠なものの 一つ，すなわち文献について考えてみ 論文を書くことが研究活動における大きな節目 であるのは ，分野を問わず異論はないであろう． 最近では論文作成術に関する本やサイ トが数多く 見 ら れ る が （たとえばサイト 1 )' その中に必ず 入っているのが文献の収集 ・整理の項目であり， これはそれだけ需要があることを反映しているの かも知れない．文献の扱いこそは，予想外に労力 と時間を費やすものであり，それ故に 他 人がどう 対処しているか知りたい部分ではないだろうか？ 一方，文献も含めたデー タ整理に関しては，デー タベースソフ トという 言 葉 を良く耳にする． し かし各研究者が これを具体的にどう使 っているか についてはほとんど聞くことがない ．そこで今回 は少し趣を変えて ， 自分なりの文献収集とデータ ベースソフトを使った整理法について，参考例と して供したい ．

1.

文 献 の 収 集 文献を集めるポイン トは 「何が必要で ，それを どう手に入れるか」 である ．一般論で言 えば，必 要 な 文 献 に つ い て は ，現 在 オ ン ラ イ ン 検 索 サ ー ビスが発達しているので，単にキーワードからリ ストア ップするだけならば，それほど大変なこと ではない ．次にその文献をどこから手に入れるか についてであるが，これも全国規模で所在情報の

Kooichi K ONISHI:

M iscalleneous techniques for

studies of decapod larvae

(3)

Collection and filing

of literatures

オンライン検索が可能なのであまり不自由はない と思われる．この様にして所在を確認した後，雑 誌や本の膳入あるいはコピーなどの手段で入手す ることになる．また最近では学術雑誌もデジタル 化 されてオンライン出版のものがあり，インター ネット上のサイトからP D Fファイルなどの形で ダウン ロー ドするという形で，以前 よ りはるかに 迅速かつ直接的な入手も可能である ．こ の様にい つでも欲しい文献が得られる環境ならば， 一つの 研究テ ーマを終えた後，廃棄して次に進むという 「文献使い捨て」方式も可能となり，大量の文献 を後生大事に抱え込むこともない ． しかしこのパターンがすべての研究分野に 当て はまる訳ではない ．残念なことに幼生の，特に記 載発生学の分野では上記の検索サービスの範囲外 にある文献が多い．具体的にはインパクトファク ター

(impact factor)

がある様な学術誌で ，かつ

1980

年代以降のものであれば良いが，これ以前の 年代，あるいは発行部数の少ない雑誌や和文の紀 要・報告書類はオンラインで探し出せない場合が 多い ．古い年代のものについては，

1930

年代まで であれば，

Gurney (1939)

に よる十脚目全般を扱 っ た幼生文献抄録があるが，その後の

1940- 1970

年 代については「

Zoological Record

」等でたんねん に調べて行くほかはない ． ただし ， カニ類につい ては，文献抄録ではないが，いくつかの図鑑や総 説

(Rice,1980;

Ingle, 1992;

Pohle

et

al.,

2000)

が

あるので，その中の文献データが使える．次に紀 要 ・報告書等ではまったくアクセスの手がかりが ない場合もあり ， これに対しては日頃から研究者 間の別刷交換等も含めて ，積極的に文献を集める 努力が必要である．他の分野でもしばしば「∼の 文献抄録集」が出されるのは，やはりこの様な研 究上の需要があるからであろう．

2.

文 献 の 分 類 と 保 管 集めた文献をいかにして上手に分類し ，す ぐ 取 り出せる様に保管するかということは研究上必 要 な技術の 一 つと思われる． 一般的な分類法として は ， 著 者 別 と 項 目 別 が あ る （図

lA, l B).

どち ら の 方 法 も 数 が 増 え て 保 管 の た め の 入 れ 物 と 場 所が増えてしまうと，その文献データが把握しき れなくなる ．数ある研究者の中には記憶力に秀で た方がいて ，文献を「著者名順」にファイルした だけで，後はすべて頭の中で整理されている方も 知 っているが，これはなかなか真似できることで 図1 文献の分別と保管.A : 項目別 にファイル した例 で．この場合は科別に幼生文献 を入れてある， B : 著者別のフ ァイル. C : 入手 した別刷やコピー の左上にゴム印 で連番を付ける．

o:

番号順にポ ックスフ ァイルに入れて保管．

はない ．そこで出てくるのが，「入手した順」に 保管すること，すなわち文献カードを作ることに よって分類と保管を 別 々にする方法である．具体 的には， 別刷 や コピ ーについて入手順に通 し番号 を付け（図1 C ), ボ ックス型ファイ ルに入れて 保管する（図1 D ). 次に 一件について2枚の同 じカードを作り，著者別と項目別の 二通りでそれ ぞれを専用カ ードボ ックスに入れて保管する ． こ の方法ではどれだけ使いやすい所蔵文献カ ー ドの 目録を作れるかがポイン トとなる．この時に，文 献かカードどちらでも良いが， どこかに「∼ 氏か らコピー 」とか「 ∼研究室から」といった様 に入 手先やその方法をメモしておくと，後日役に立つ ことが多い． この入手順の整理法は所蔵数が増えても一元的 に管理できるが，それでもある程度以上に数が多 くなると ，特に項目別での分類が困難になり ，や がては第 二，第三のカードを作る羽目になる ． こ の点を克服するためには一つの文献デ ータを複数 のキーワードから同時に検索可能なシステムが必 要である ．場所もとらず，迅速にそれが可能なの は電子化，すなわちデータ ベース化しかない こと になる．ここで，所蔵数が増えて行 った場合，個 人レベルではどの段階でデータペースが必要に なるかを考えてみる ．籠者の経験では，扱う件 数 が100 - 300程度であ れば，手書きのカ ード等 の方が間違いなく効率的でかつ安価である ．コ ン ピュータによるデー タ管理がその力を発揮し始め るのは大体1,000件 を超えるあた りからというの が正直な感想である． 改めて述べる までもないが，文献の置き場所と 環境には気をつけたい ．湿度が嵩い (50% 以上） 所ではすぐにカビが生え，また日光に当たると 褪色してし まう． さらに旧来の酸性紙では時の経 過と共に褪色するだけでなく紙自体がボ ロボロに なってしまいがちであり，そうなる前に上質紙に コピーしておくなどの対策が必要である ．筆者 は 別刷・コピー類は取り出しやす く，ま た持ち運び も便利なので ，前述の様にボックス型ケース（フ 夕付き ） に50- 100冊単位で収納し，これを事務 用書棚に並べている ．場所によるのかも知れない が，それでも長期間気付かずにいると，紙魚が走 り回ることになりかねない ．経験上，文献は乾燥 した暗所に保管し，時々チェックも兼ねて取り出 して読むクセを付けるのがベストと言える ．いず れにしても 文献は読 まれてこそ存在価値があるこ とを忘れてはならない．

3.

文 献 カ ー ド の 電 子 化 と 実 際 上 の 問 題 点 カードや住所録等の整理に向いているのはも ちろんデータベースソフトである ． この 種のソ フトで文献整理をする場合，カードをそのまま電 子ファイル化したもの，いわゆるカード型データ ベースが直感的に分かりやすい．箪者の場合も同 様で，当初は所蔵文献カ ード の内容 「文献番号， 著者，年，タ イトル」の4項目について 当時の P Cパソコン用ソフト「μC O S M S O S ( 日本オフィ ス機器 ）」にそのまま入力しただけのものであっ た． これによって確かに

4

つもあったカード用 木箱が

1

枚の

5

インチ（当時） フロッピーに変っ たが，その内にこれではコンピュ ー タらしい機能 がほとんど生かされていないのに気付いた ．そこ で，その文献が扱っている「分類群，分野別キー ワード」の

2

項目を，さらに日本語が扱える様に なった時点で「邦文タイトル」の項目を追加 した ． その後何度かソフトの変遷を経て ，現在はハード ウェアがMacintoshT Mである関係もあり，ソフ ト ( ファイルメ ーカー 社）」を使っている．ちなみにデータベースソフ トは以前に比べれば使いやすくて低価格のものが 入手可能で，ウィンドウズ系であれば「A C E S S （マ イクロソフト社）」等が良く知られている ．さ らに文献整理だけが目的ならば「EndNote 4 (ISi Research Soft社）」とい う専 門ソフトもある． 筆 者の場合は後述の様にデータに画像も含み，また データベースソフトを使っている次第である ．な お各ソフトの具体的操作法については ，こ こで述 べるスペースはないので ，それぞれのマニュアル や市販されている解説書を参照されたい． こうして出来た文献所蔵ファイルの画面表示 例を図

2 A

に示す ． このファイルではどの項目 からでも自由に検索可能であり，ここの例では 「Kurata」という 文字列で引いている ．こ の検索

結果 はた とえば発行年によって昇順あるいは降順 に並べ替え，テキストファイルとしてワープ ロソ フ トヘ出力可能である．これは確かに便利 である が，こ こま でで感じたいくつかの問題点を述べる ． 第一 には ，一つのファイルでの「入力項目数は 少なくまとめた方が良い」ということである．そ のためには，いわゆる任意の文字列検索が可能な 項目 はできる限り 一 つにまとめた方が効率的で， これはフ ァイルの構造 （項目数，項目名，デー タ 形 式） を決める時点で考えておいた方が良い ．意 出力の時に何が本 当に 必要になるかを予想してお くことである ． 第二 にデー タベース 化 で「最も労力を要するの はデー タ入力」であるのは間違いなく，おそらく 全 労力の

90%

以上がこれに割かれる ．入力の省力 化 については， O C R (文字認識）ソフ トがあれば， スキャナ ーやデジタルカメラで取り込んだ文字の 画像をテキス トファイルに変換することも可能で ある ． しかし ，実際の作業時間を考えると，摘要 (abstract) でも入れない限りは，自分でキーボー ドから入れた方がはるかに速い ． またデータベー スに似た機能があるのが表計算ソフトであり，場 合に よって はこち らで入力してから，データ変換 によりデ ー タベ ース フ ァ イ ル に 取 り 込 ん だ 方 が． 簡単でかつ入カミスも少なくなる ． また 入力に当 た っては，特に全角 漢字 などの

2

バイト系文字で は，O Sな ど に よ り コ ー ド が 異 な る 場 合 が あ る の で，特殊な文字を避けるのがコツである ．同じ理 由で文字データには太字や斜字体等の制御コ ード 付 き の 文字列も避 けた方が良 い． 第三 には間違いチェックなどの「データの保守 が大変」なことである ．データ ベ ースとは常に “生 きている＂べきものであり ，時間を重ねるほどそ の力を発揮するものであるから，途中で投げ出し てし ま う様であれば，結果として時間の浪費であ り，最初 か らやら ない 方が良い ．ま さに「継統は 力な り」である．他人のデー タを検索するのはい とも簡単であるが，そこには

1

人にせよ多人数に せよ膨大な 労力と時間がつぎ込まれて いる ．商業 データベースで検索すると，かな り高 額の請求が 修正作業をした者には

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~-·- '"心 匝ョコ Eニコ 図 2 データペ ースフ ァイルでの検索画 面例.A : 所蔵文献データのファイル，

s:

幼生文献抄 録データのファイルで，検索結果を 一覧表形 式で画面に出している，

c:

同 じフ ァイルで 画像も含めたカード形式 で一件ずつ画面に出 している ． この根拠が，それこそ頭ではなく体で理解できる と思う ．

4.

リレーショナル機能の利用

データベースで件数が増えて来ると，ファイル が巨大化してデータの保守も大変になり， また使 用 時 に 「 重 く 」 な っ て 来 る ． こ の 様 な 場 合 に は， 大きなファイルを 内容別に 複数のファイルに分散 させ，それらのデータ項目をリンクさせてまとめ ることに よ り，データ の重複入力による無駄を大 幅に

i

咸らすことが可能 になる ． この結果 ，入力 ・ 保守面の労力はかなり軽減される．これを実現さ せるのがデ ー タベ ースソフトのリレーショナル機 能であり ，会社 ・製品によってそれぞれ用語が異 なるが，その基本概念は共通している ． ファイル をリレ ー ショ ナル化すると単に扱いが楽になるだ けでな< . 用途別に次々とフ ァイルを派生さ せて 行くことが可能になる ． さて話を元に戻す．前出の所蔵文献デー タベ ー スを作った後，十脚目の幼生発生を扱った文献が 増えると共に ，過去の幼生記載に関する未入手文 献ファイルや成体の分類情報の関連情報が必要に なって来た ．そこでこれら関連フ ァイルを 別々に 作成・入力し始めたが，その内 に， これでは非効 率 的ではないかと感じた ．そこで リレ ー ショ ナル 機能を使い，ファイル間で重複 した項目 をキ ーと して リンクさせて一体化 を試みた． さらに幼生 の イメージがつかみやすい様に原 図例等の ファイル を加 えて行った結果，現在では合計4つのファイ ルから構成されるものとな った ．検索 ・出力のた めの主ファイ ル (Larva-N) は今の 所 ，画面表示 用に

4

種類のレイアウトを 設定しており ，例とし て図2に一 覧 表 形 式 (2 B ) とカ ー ド形式 (2 C ) の 表 示 例 を 示 す ．こ の主フ ァイルで は 種 名 や 著 者 名 ， 齢 期 な ど 項 目 数 は18にお よぶが，図3に 示した様に，このフ ァイル自 身の項目は5つしか なく (SPECIES, S f A G E, L O C A L ! 官 ，D E V E L O P , O T H E R S), 残 り は 他 の フ ァイル の 項 目 を い わ ば 「 窓 」 を 通 し て の ぞ い て い る に 過 ぎ な い ．こ の主ファイ ルを開 くと同時に「所蔵文献ファイル (Library-L)」, 「成体分類フ ァイル (Adult-N)」，「原 図例ファイル (Figures-L)」の3つ の フ ァ イ ル が 画面表示のレイアウトに応じてリンクしつつ開か れるようになっている ． ここでキー項目となって い る の は 「 種 名 (S P E C I E S)」，「文献番号 (REF. また，それぞれのファイルには操作する度に「最 終更新 （修正）日」が自動入力され，後々でのデー タチェックに役立つ．以上の4 つのファイルは， さらにこれらに関連する情報を まとめたいくつか のファイルにリンクしている ． この様なフ ァイル の分散とリレ ー ショナル化 により，そのまま単独 にファイル化した場合に 比べて，おそらく入力は 数分の 一以下に押さえられていると考えられる ． またファイル群 全体の サイズも

7 M B

前 後 と 比 較 的コ ンパク トにな っている ．ここで注意しなけれ ばならないのは， リンクしている項目間 では一つ を修正すれば，関連ファイルでも同時にその項目 が修正されることであり ，便利 であると同時に， これが思わぬトラブルを起こすことがあるので 注 意しなければならない ．

5.

デ ー タ ベ ー ス を ど う 使 う か ？ せ っかくデータベ ースファイルを作 っても ，使 わ な け れ ば 意 味 が な い ． そ の 利 用 法 の 第 一 は研 究 の た め の 文 献 検 索 で あ り ， こ れ が 最 も 一般 的 であろう ．ただ，これだけのためのデータベース では電子化された情報の活用という面からは少々 寂しいものにな ってし まう．第二 には論文原稿で の引用文献リストの半自動的作成がある．これは その原稿内容に必要な文献をリストアップし ，投 稿先のスタイルに応じて並べ替えなど必要な処理 をした後にテキス ト出 力 し，ワー プ ロ文書内に流 し込むという操作である．先に触れた「EndNote

4

」 などはこの様な目的に特化 したソフ トである． 第 三 は 研 究 （者 ）の 動 向 分 析 で あ る ． た か が 文 献 デ ー タ の 集 ま り で は あ る が ， そ の 使 い 方 に よ っ て は 研 究 （者 ）そ の も の が 数 値化 さ れ て 意 外 な 面 が 浮 き 上 が る こ と も あ り 得 る ． 籠 者 の 如 き 微小 な デ ー タ ベ ー ス は さ て お き ， あ る 程 度 の 業 務 規 模 の も の に な れ ば，かな りの副次的情報を引き 出すことが可能である ．こ の様な分野は計醤書誌 学 (bibliometrics) と呼ばれ， 一般 社 会 で も 活 用 されている （例： D e Bruin, et al., 1991 ). 実際に Rice (1993) はカニ類幼生について欧米の2世紀 にわたる研究動向とその要因を分析している．

で多人数によ って 運 営 さ れ る 分 散 型 デ ー タ ベ ー ス へ の 動 き も 活 発 で あ る ． さ ら に こ の 傾 向 が 強 ま れ ば，ネ ッ ト ワ ー ク 上 で お 互 い の デ ー タ を 操 作 す る こ と に よ り ， わ ざ わ ざ 個 人 が デ ー タベースを作る 必 要 が な く な る か も 知 れ な い ． 個 人 が 作 っ た デ ー タ ベ ー ス も ， や が て 一般 向 け に デ ザ イ ン し 直 し ネ ッ ト ワ ー ク 上 で 公 開 さ れ て 多 く の 研 究 者 に 役 立 って 行 く 場 合 が あ る （浜野他，

2000;

サ イ ト

2).

イ ン タ ー ネ ッ ト が こ れ だ け 普 及 し た 今 ， ア リ や 原 生 動 物 な ど で 試 み ら れ て い る 様 に （今井， 1997; サ イ ト 3), ネ ッ ト ワ ー ク 上 ファイル名： Adult-N ファイル名： Larva-N ファイル名： Library-L

□

二

□

曇

二

三

ロ

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三

フ ァ イル名： Figures-L

三

： ： リンクのみの項 目 実際にデ ータが入力 されている項 目

三

＊画像ファイル リレーショナルデ ータ ベースに おけるファイル間の項目の対応関係の例． それぞれのファイルは互いに共通のキー項目を介してリンクしている ． 図3

6.

お わ り に 一 文 献 を 捨 て る と き 今回紹介したデータベースは個人用のごく 小 さ なもので，また単なるエンドユーザーの使用法の 一 つ に 過 ぎ な い が，何かの 参考になれば幸いであ る． この幼生文献ファイルは項目や関連ファイル の新規作成に よ り，現在もわずかずつであるが成 長を続けている ．その様な中で改めて感じたのは ， コンピュータは大量かつ高速にデータを扱っては くれるが， デ ー タ そ の も の の 質 は 変 わ らないし ， 何かを創造してくれるわけでもないという 事 実 で ある．さらには人手で行っている作業を楽にして くれるとは限らず，逆に能率が下が っている場合 すらある．あくまで主役はデータを扱うヒ トその ものであることを忘れてはならない． さて最後に ，文 献 を 収 集 し 整 理 ・保管する場合， 私たちは案外無意識の内に無限の時間を想定して はいないだろうか？長い時間をかけ苦労して集め た文献を「捨てる」または「捨てられる」時は必 ずやって来る．籠者自身，かなり貴重な文献がゴ ミとして捨てられる現場を何度も見てきたし ， こ れは古今東西を問わず人類史上無数にくり返され て来たことである ． これに対しては，欲しい研究 者に譲渡したり ， あるいは公的機関に寄贈すると いう手がある ． しかし最善 の 手 段 と な る と ， 文 献 を学術論文という情報媒体の中に入れて「保存」 し後代に伝えて行く 他 はないと考えているが， 如 何なものだろうか？くり返すが，個人の研究の時 間は残念ながら有限なのである ．古しえの ローマ 人の「話された こ とは飛び去り，也かれたものは とどまる (Verba volunt, scripta m a n e n t)」という 言葉が何か説得力をもって感じられる．

文 献

今井弘民. 1997. カラー画像データベースによるアリ

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