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微生物によるスクアレン高生産系構築を目指した糸状菌由来

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Academic year: 2021

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北海道大学 大学院農学院 修士論文発表会 2019年28

微生物によるスクアレン高生産系構築を目指した糸状菌 Rhizopus oryzae 由来 スクアレンエポキシダーゼ(SQE)遺伝子クローニング

応用生物科学専攻 生命分子化学講座 生態化学生物学 阿部 碧

1. はじめに

スクアレン(C

30H50)は,トリテルペンに属する油性物質であり, 抗酸化,殺菌,保湿効果があるこ

とから化粧品原料や医薬品基剤として利用される。スクアレンは,微生物,植物,動物細胞に含ま れているが,植物に含まれる量は微量であるためその供給源は深海鮫の肝油に依存している。しか し, 深海鮫は自然界より捕獲されることから,その供給源は極めて不安定であり,さらに生物資源 保護の観点からも,新規スクアレン供給源の探索・開発が強く望まれている。これまでに, 酵母, 微 細藻類などの微生物を用いたスクアレン生産系が検討されているものの, 現時点では実用化には 至っていない。当研究室の池田によってスクアレン代謝酵素スクアレンエポキシダーゼ(SQE)阻 害剤であるブテナフィン添加により, スクアレンを高蓄積する

Rhizopus oryzae

が分離されている ことから, 本研究では, 新たな供給源として

Rhizopus

属糸状菌に着目し, スクアレン代謝の鍵酵 素である

SQE

遺伝子のクローニングと

SQE

酵素活性解析のためのタンパク質大量発現系構築を目指 した。

2.材料・方法

R. oryzae NBRC9364

株(RO9364)の

SQE

遺伝子情報は未報告であったため,

Rhizopus 属や酵母

を含む

6

種の真菌

SQE

遺伝子情報を元にアミノ酸配列の保存領域から縮重プライマーおよびフォワ ード

3

種,リバース

4

種の特異的プライマーを作成した。これらのプライマーを用い

RO9364

ゲノ ム

DNA SQE

遺伝子の増幅を試みたところ,複数の組合せで予想増幅サイズ(600 bp)のバンドが検 出された。この増幅領域の

DNA

配列を決定し相同性検索した結果,

R. oryzae RA 99-880 (RO99-880) のHypothetical protein CH474632.1

98 %の非常に高い相同性を示した。そこで,

RO99-880

株の

SQE cDNA

配列から開始コドンと終止コドンを含む全長クローニング用プライマーを

作成した。

RO9364

株の菌糸より精製した全

RNA

から

oligo-dT/random 6 mer 混合プライマーを用いてcDNA

を調製し,全長クローニング用プライマーを用いて,

SQE

全長約

1.4 kbp

を増幅した。この

SQE

片を

In-Fusion

クローニングキット(タカラバイオ)を用いてタンパク質発現用ベクター

pET151/D-TOPO

に導入した。さらに, pET151/D/

SQE

ベクターをタンパク質発現用宿主大腸菌

BL21

株に形質転換した。

3.結果・考察

R. oryzae SQE

の全長クローニングプライマーを用い,RO9364 株より

SQE

遺伝子のゲノム

DNA

列と

cDNA

配列を得た。両者の

DNA

配列を比較したところ,

cDNA

配列には

189

–241 番目の塩基が欠

損していたことから,53 bp のイントロンの存在が示された。また, 1361 bp の

RO9364 SQE cDNA

配列から予想されたアミノ酸配列には前半部分に複数の終止コドンが含まれていたため, RO9364

SQE

ORF

307-309

番目の

ATG

を開始コドンとした全長

1053 bp

, 351

アミノ酸からなるタン

パク質である可能性が示された。

RO9364

SQE

は, ラット, 酵母, および糸状菌の

SQE

アミノ酸配

列と比較したところ, 100 アミノ酸以上短いものの

SE(squalene epoxidase)ドメインを有してい

たことから, 酵素活性は保持している可能性が示唆された。

参照

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