自動出力 (1日1回)
自動出力 (定期的)
登録者
DDBJ
データベース 構築データフロー
ann,fasta
2. 大量登録管理
mass @ddbj
MSM
DB(PostgreSQL) msgget
WebBrowser E-mail
ann,fasta
ddbjsub @ddbj
SAKURA
ddbjupdt @ddbj WebBrowser
DB(HiRDB) Mass-ftp
upd-sub
アノテータ
11. その他自動処理
MakeHUPFF
SecondaryManager taxonomy TaxLinker
Dj_mail DeleteRecords
DistributionNotifier
HUPEntryMonitor WorkingFlag
FF
未公開データ保存用FF作成 (兼アノテータ向けBLAST用)
セカンダリ化自動処理 taxonomy
NCBI taxonomy取込(毎朝)
登録者宛連絡などメール送信 リンク切れの不要レコード削除
登録者に対する公開予告メール送信
作業中フラグのチェック結果送信 近日公開データの査定状況一覧の 送信
アノテータ
sequin
FF FF
ff2ann
随時
公開 サービス
三極 データ交換
8. 公開・交換データ出力
KillList SupressList
LiveList FF QV
DeadOrAlive SupkillListLister
ann,fasta テキストベース管理
(WGS データ)
5. 受付/登録 ann,fasta 自動登録 (1日1回) 手動登録
(随時)
手動登録 (随時)
new-sub
7. アノテーション 独自ツール
Excel等
1. UME
jParser
ローカルで事前チェックや FFイメージ作成可能
FFconv
TransChecker AGPParser Cleaner Expander
E-mail 自動登録分のみ
自動登録 report
E-mail 自動メール登録(着信時)
ann,fasta
データ公開の予告 更新の連絡
大量登録の連絡
(RDBに移行中) Expander
Crtnw EntIdRegist Ent2Acc Fexcel FFmaker 他
4. Sakura2DB
jParser
AGPParser AGP2DB Cleaner
3. WGS/MGA登録
jParser
Cleaner TransChecker TaxChecker checkForDup 他 AGPParser
Submitter
DDBJ
AGPParser taxChecker transChecker primaryChecker
fastaMaker COMMONMaker Consolidator他 手動
チェック サイズが大き
い場合、FTP
手動登録 (随時)
DeleteList DeleteManager
随時
TSUNAMI AP Server
TSUNAMI
TsunamiGT YamatoSQL updHelper
Fexcel
6. DB編集作業
FFconv 9. WGS/MGAのFF作成
FFmaker 10. 通常データのFF作成
その他