プロジェクトの作成

プロジェクトの作成

プロジェクトを作成するには、次の作業が必要です。

• プロジェクト設定を選択します。

• 新規のスペシメンを作成し、サンプルファイルをインポートします。

• プロジェクト設定の概要を表示します。

プロジェクト設定の 選択

プロジェクト設定を選択するには

1. MicroSeq ID Analysis のメインウィンドウで、「File」 > 「New Project」を選択します。

New Project _{ウィザードが開き、「}Select Project Settings_{」ダイアログボックスが表示さ} れます。

2. 「Project Name」フィールドに 500KitProject _{と入力します。}

3. _「Matches to Display_{」フィールドで} 5 _{を選択します。}

注：「Matches to Display_」は、Library Search Results Project ビューに表示されるライ ブラリマッチの数を示します。独自のプロジェクトを作成するときは、表示されるマッ チ数を 3 _〜 20 の範囲で指定できます。

4. _「Kit_{」フィールドで、「}Bacterial500Kit_{」を選択します。}

注：「Kit」は、プロジェクトのサンプルデータの作成に使用する MicroSeq _{ケミストリ} キットを示します。Bacterial500Kit は、MicroSeq^®500 16S rDNA Bacterial Identification Kit _です。

5. _「Analysis Protocol_{」フィールドで、「}GSG_AnalysisProtocol_{」を選択します。}

注：GSG_AnalysisProtocol は、サイエンティストが第 3 _{章で作成した} Analysis Protocol です。

第4章 アナリスト: プロジェクトの設定

6. _「Libraries Available_{」フィールドで、「}Bacterial500Lib_{」を選択します。}

注：このリストには、選択したキット（前述の手順4）を指定しているライブラリのみ が表示されます。

注：独自のプロジェクトを作成するときは、Applied Biosystems のライブラリと独自の カスタムライブラリを同時に検索することができます。ただし、最大限のパフォーマン スを得るため、Applied Biosystems では、まず Applied Biosystems のライブラリを検索 することをお勧めします。

7. 「Select Project Settings」タブが次のように完成されていることを確認します。

8. 4-7ページの「新規のスペシメンの作成とサンプルファイルのインポート」に進みます。

プロジェクトの作成

新規のスペシメンの 作成とサンプルファイル のインポート

MicroSeq ID Analysis _{ソフトウェアでは、}スペシメンは、バクテリアまたは真菌による単一の

未知の分離株から得られたサンプルデータ（サンプルファイル）が収容される容器を示しま す。

プロジェクトを作成するための次の手順は、新規のスペシメンを作成し、このスペシメンにサ ンプルファイルをインポートすることです。サンプルファイルのインポートは、個別に行う ことも、サンプルフォルダ単位で行うこともできます。

スペシメンにインポートされたサンプルファイルは、.ab1 ファイル形式になります。この時 点では、アセンブルされていません。この『Getting Started Guide』では、次の 2 つのサンプ ルファイルを使用します。

• MicroSeq041703_C03_H_5F_05.ab1

• MicroSeq041703_D03_H_535R_07.ab1

スペシメンの名前付けオプション

スペシメン名は、次の方法で割り当てることができます。

• _「New Specimen」をクリックして手動で

• 希望の開始および終了デリミッタを入力し、サンプル名またはサンプル ファイル名からス ペシメン名を抽出して自動的に

この『Getting Started Guide』では、4-8 ページの手順に従って手動でスペシメン名を割り当

てます。名前の自動割り当ての詳細については、MicroSeq ID Analysis _{ソフトウェアのオンラ} インヘルプを参照してください。オンラインヘルプにアクセスするには、[F1] _{キーを押すか、}

「Help_」 > _「Contents & Index_{」を選択します。「}Index_{」タブを選択して} new project _と入 力し、「New Project - Create Specimens Dialog Box」を選択します。

スペシメン名を自動的に割り当てます。

スペシメン名を手動で割り当てます。

第4章 アナリスト: プロジェクトの設定

スペシメンの作成とサンプルファイルのインポート

スペシメンを作成してサンプルファイルをインポートするには

1. New Project ウィザードの「Select Project Settings」ダイアログボックスで、「Next_」を クリックします。「Create Specimens」ダイアログボックスが表示されます。

2. 「New Specimen」をクリックします。新規のスペシメン（Specimen1）が「Samples to Add」セクションに追加されます。

注：デフォルトのスペシメン名（Specimen1）は、プロジェクトの作成後に「Project

Navigator」ペインでのみ変更できます。この手順は、プロジェクトの解析後に実行しま

す。4-11_{ページの手順}2_{を参照してください。}

3. _「Files_{」タブで、}500Ecoli _サンプルフォルダをブラウズして選択します。

ドライブ名\AppliedBiosystems\MicroSeqID\Tutorial Data\Bacterial500Samples\

500EColi

プロジェクトの作成

4. _「Add Sample_{」をクリックします。}500Ecoli _{サンプルフォルダ内のサンプルファイル} が「Samples To Add」セクションの Specimen1 に追加されます。

5. 4-9ページの「プロジェクト設定のサマリの表示」に進みます。

プロジェクト設定の サマリの表示

1. New Project ウィザードの「Create Specimens」ダイアログボックスで、「Next」をクリッ クします。「Finish」ダイアログボックスにプロジェクト設定のサマリが表示されます。

2. サマリですべての情報が正しく入力されていることを確認します。

3. 変更する場合は、次の手順に従います。

a.「Back」をクリックし、適切なダイアログボックス（「Create Specimens」または

「Select Project Settings_{」）に戻ります。}

b. _{情報を修正します。}

c._「Next」をクリックし、再度「Finish_{」ダイアログボックスを開きます。}

4. 4-10ページの「プロジェクトデータの解析」に進みます。

第4章 アナリスト: プロジェクトの設定