RNA2次構造、タンパク質高次構造
セルロースナノファイバーの化学構造の調査 ( 工学部 1 年林俊輔 ) パルプ木材の繊維をほぐし, 漂白, 精製したものである 製紙などに使われる 1 次構造,2 次構造, 高次構造 1 次構造は, 原子の配列によって決まる構造,2 次構造は分子内の相互作用によって決まる構造であるのに対し, 高次構
... 結果として，ミクロからマクロへの各々の構造の積み重ねによってセルロースナノファ イバーの性質が発現していることが明らかになった。 １．はじめに 2015 年 9 月にマルクス・バーレンベリ賞を東京大学の磯貝教授ら 3 人の研究者が受賞 した。この賞は，バーレンベリ財団が毎年 1 名または 1 グループを表彰する森林・木材 科学分野におけるノーベル賞に相当する権威ある賞である。磯貝教授らはセルロースナノ ...
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枯草菌芽胞形成制御因子Spo0Mタンパク質の構造と機能に関する研究
... 1. 枯草菌芽胞形成制御因子Spo0Mの機能解析 枯草菌のゲノムDNAに存在するspo0M遺伝子をクローニングし、Spo0Mタンパク質 を大腸菌で大量発現した後に、その単離と精製を行った。同様にCcpAタンパク質と CcpAのエフェクター タンパク質である HPr-Ser-P（Ser46がリン 酸化された histidine- containing phosphotransfer ...
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青色光センサータンパク質TePixDの光反応中間体の構造揺らぎ検出とその機能的重要性に関する研究
... （論文内容の要旨） タンパク質分子は通常室温下で機能するためその構造は熱揺らぎに曝されて常に 揺らいでいる。近年NMRや熱力学的測定などを用いてこのようなタンパク質分子の揺 らぎが検出され始めそれが機能に重要であることが示唆されて来ているが、本当に揺 らぎがタンパク質反応に関与しているかは未だ明瞭ではない。本研究は圧力条件下に ...
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JAIST Repository: 結晶性-非晶性２元ブロック共重合体の薄膜表面における高次構造
... 以上の結果より、調製初期段階では、 PCL- b-PB の薄膜表面はガラス基板に対して平行 なラメラ繰り返し構造をとっていることが予 想される。その後、薄膜中のトルエン溶媒が 蒸発することで表面に存在する PCL-b-PB が ...
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アミノ酸配列解析によるタンパク質構造形成における重要部位とその頑強性予測
... In chapter 2, the commonality of folding units in the protein structural space is validated using Globin-like fold, based on the study that insists a protein can be decomposed into som[r] ...
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二次医療圏からみた地域活力の国土構造
... 森川 洋 【摘要】 都道府県や市町村に代わる地域単位として二次医療圏を用いて，地域活力とその将来の方向性について考 察した．その結果，活力のある東京大都市圏を中心に 3 大都市圏が東海道メガロポリスとしてほぼ連坦したパター ンを呈し，地方では広域中心都市が活力の拠点となるのに対して，国土の縁辺部には―沖縄県を除いて―活力に ...
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JAIST Repository: 高ガラス転移温度を有する結晶性ー非晶性2元ブロック共重合体の高次構造
... の分子特性を表に示す。 PCL 鎖の結晶化は融解状態から急冷し等温結晶化させる方法と、 溶媒キャスト法により結晶化させる方法を用いた。溶媒キャスト法では、両ブロック鎖の 共通溶媒であるトルエンを用い、種々の温度で溶媒を蒸発させた。試料の融点と PCL 部 分の結晶化度 は示差走査熱量計により求めた。また、結晶化後に形成する高次構造は ...
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正方形ダクト乱流中の秩序構造と二次流れ (乱流の多重性・階層性とその数理的構造)
... 矩形管路 (ダクト) 内乱流にはプラントルの第二種二次流れと呼ばれる管軸に垂直な速度をも つ平均流が存在し , 物質や熱 , 運動量の平均的な輸送を引き起こすため工学的関心がもたれて いる. これまでのダクト乱流中の二次流れに関する研究 1,2) では , 主に二次流れと各レイノル ズ応力成分や平均渦度成分などの統計量との関係について調べられているが , ...
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JAIST Repository: ２元ブロック共重合体を含む２成分混合系の高次構造
... =1.07) である。 2 成分混合系は、ベンゼンを 共通溶媒とする溶媒キャスト法によって調製した。種々の組成の PCL-b-PB/PCL 系、および、 PCL-b-PB/PB 系からの小角 X 線散乱 (SAXS) 曲線を種々の温度で測定し、融解状態でのミク ロ相分離構造の周期 D （または、均一状態での濃度ゆらぎの周期）と結晶化後のラメラくり返 ...
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[Introduction] タンパク質結晶のX線回折データを収集する際、長時間結晶にX線を照射することにより、タンパク質構造が変化することが報告されている
... ぞれ Nii3-WT(LD)及び Nii3-WT(HD)とよび、これらの活性中心の構造を Fig.2A, B にそ れぞれ示す。また測定した際の結晶学的パラメータは Table.1 に示す。まず、Fig.2A-B か ら、X 線照射の増加に伴い、矢印部位の水分子、Wat955 の電子密度が強く現れることが 確認された。さらに、シロヘム周辺の水分子については、X 線照射の増加に伴い、水分子 ...
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加藤晃一 ( 教授 )(2008 年 4 月 1 日着任 ) A-1) 専門領域 : 構造生物学, タンパク質科学, 糖鎖生物学,NMR 分光学 A-2) 研究課題 : a) NMR 分光法をはじめとする物理化学的手法による複合糖質およびタンパク質の構造 ダイナミクス 相互作用の解析 b) 生化学
... 加藤晃一, 「NMR とSANS によるタンパク質の動的構造解析」, 中性子連携研究会, 東京, 2013年 3月. 加藤晃一, 「NMR を用いた生体分子のダイナミクスの解析」, 大阪市立大学分子ナノ情報解析センターユーザーズミーティン グ, 大阪, 2013年 4月. 加藤晃一, 「生命分子のダイナミクスと自己組織化」, 国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺ら ...
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目次 第一章序論 1-1. タンパク質の構造と変性 ドメインスワッピング シトクロム c の構造と生合成 シトクロム c の機能と構造 シトクロム c の生合成 1-4. シトクロム c のドメインスワッピング 好熱性水素細
... 11 1-4. シトクロム c のドメインスワッピング cyt c は単量体の状態で機能するタンパク質であるが、1962 年に Margoliash ら は cyt c がエタノール処理により多量化することを報告していた 58 。しかしその 多量化機構は不明であった。廣田らはエタノール処理により形成したウマ cyt c 二量体と三量体の X 線結晶構造解析に成功し（Figure 1-9）、ウマ cyt c ...
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二本鎖RNA結合タンパク質が結合するマイクロRNA初期転写産物の構造的特徴の解析
... 配列内部のステムループ 構造部分（pre-miRNA）の二次構造予測を実施した．得 られた RNA 二次構造より構造的特徴を探索した結果，現 在 miRbase に登録されているヒトの全 pri-miRNA と比較 し，NF90 が結合する候補 pri-miRNA では形成する二本鎖 領域（ミスマッチが 1 塩基以下のステム構造）が長いこ ...
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JAIST Repository: 蛍光標識アミノ酸の部位特異的導入によるタンパク質構造変化のFRET解析
... 様式 C-19 科学研究費補助金研究成果報告書 平成 22 年 4 月 10 日現在 研究成果の概要（和文） ：本研究では、これまで開発してきた 4 塩基コドンなどを用いたタンパ ク質の部位特異的二重蛍光標識法をさらに発展させることで、タンパク質の立体構造やその変 化を FRET により解析する手法の確立を行なった。実際に、マルトース結合タンパク質などに ...
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JAIST Repository: ウリ類炭疽病菌が分泌する病原性タンパク質DN3の構造機能解析
... orbiculareが植物細胞に分泌するDN3というエフェクターについて、その 構造と機能の一端を明らかにした。さらに、このDN3が機能を発揮するメカニズム、すなわち、感染機構に関し て、植物タンパク質CaMが重要な役割を担っていることを見出した。この研究結果は、学術的なインパクトだけ でなく、植物の感染予防薬を開発するうえでの有益な情報を与えるものである。従って、食糧問題の解決に寄与 ...
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JAIST Repository: 結晶性－結晶性２元ブロック共重合体の結晶化・融解に伴う高次構造変化
... ）とそれに伴う高次構造変化との関係を評価した。 1 【実験】 n- ブチルリチウムを開始剤とする高真空下リビングアニオン重合法により、poly( ε -caprolactone)- block -polybutadiene （ PCL-b-PB ）を合成した。得られた PCL- b-PB を酸化白金（ 触媒）を触媒と ...
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一般に医薬品は標的タンパク質に結合する事によりその薬効 ( 効き目 ) を発現する ( 図 1) 近年タンパク質の発現 精製技術の進歩 ならびに X 線 NMR 等の構造解析技術の発達により 構造解析されるタンパク質の数が大変な勢いで増加している ( 図 2) タンパク質の構造情報を基に医薬品化合物
... ABINIT-MP による真空中の FMO 計算でドッキングモードを予測したところ、8 種類のリガンドの うち 5 種類のリガンドの結合モードを予測することができた。また、16 種類の LCK- リガンド複合体 における MP2/6-31G* の FMO 計算では、活性と FMO で求めた相互作用エネルギーの間に良好な相 関が得られた。これらは FMO 法の有用性と信頼性を示すものである。水中 MD と FMO を組み合わ ...
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タンパク質のフォールディングを補助するシャペロニンの構造と働き
... タンパク質のフォールディングを補助するシャペロニンの構造と働き 溝端 知宏・河田 康志 鳥取大学大学院工学研究科・鳥取大学大学院医学系研究科 Structure and function of chaperonins, molecular assistants of protein folding Tomohiro MIZOBATA and Yasushi KAWATA ...
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カダベリン輸送タンパク質CadBの構造と機能に関する研究
... KCl, 2 mM 2-mercaptoethanol and 10% glycerol, collected by ultracentrifugation, and suspended in the same buffer at the protein concentration of 5-10 ...
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