AFLR, AFLJ タンパク質の機能解析
共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... 目的 • 非常に多くのゲノム・プロテオームに関する情報の集積体（データ ベース）が構築されている。 • 疾病関連遺伝子やタンパク質の機能を示すドメインやモチーフ、薬剤 などの相互作用部位を現すリガンド相互作用サイト、タンパク質-タン パク質相互作用サイトなどが挙げられる。 ...
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リボソームアッセンブリーにおけるrRNAメチル化修飾の機能解析
... tRNA の CCA 末端と相互作用する場所であり、タンパク質合成反応に おいても重要な役割を担う。45S は H92 の配置が成熟した 50S とは異なるため、翻訳能を持たないと考えられる。 実際、45S は 30S と会合できないことが知られている。したがって、50S の後期アッセンブリーにおいて、Um2552 修飾形成に伴う H92 ...
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多機能性タンパク質であるトリプトファニルtRNA合成酵素の機能制御機構の解明
... TrpRS の新規機能の発見と制御機構の解明 (1) ヒト TrpRS が Trp を細胞内に輸送する まず先行文献に倣い、ヒト培養細胞に IFN-γを処理したところ、無処理の細胞と比較して Trp の取り込みが著しく増加した（図 1 A）。このとき同時にヒト TrpRS の発現量は大きく上昇した （図 1 B）。IFN-γ処理細胞に ...
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赤痢アメーバの新規βバレル型マイトソーム外膜タンパク質の解析
... これらの実験結果を踏まえて筆者は、 Entaamoeba属のMBOMP30は構造的にも機能的にも新規のBOMPであり、 真核生物の MBOMPの7番目のクラスに位置付けられるものであるとの結論を下した。これにより、バクテリアの多 種多様な ...
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枯草菌芽胞形成制御因子Spo0Mタンパク質の構造と機能に関する研究
... 形成する可能性が報告されている。さらに、そのアミノ酸配列より、Spo0Mは哺乳類 の細胞内シグナル伝達に関与するタンパク質であるアレスチンと部分的な相同性があ ることが報告されている。しかしながら、現在までSpo0Mの詳細な機能や構造に関す る報告は無い。本研究は、表面プラズモン共鳴法（SPR法）による生体高分子間の相 ...
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成長円錐ラメリポディア領域におけるアクチン結合タンパク質fascinの観察と解析
... fascin の機能が成長円錐の形成と形態の維持に重要な ことが指摘されている。fascin はフィロポディアとラメリポディアの両方に分布しているが、これま でに行われたほとんどの研究は、太いアクチン線維束をもつフィロポディアにおける fascin の役割を 対象にしている。ラメリポディア領域における fascin ...
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黄色ブドウ球菌の表層タンパク質Skipの発現制御機構の解析
... 15kDa のタンパクが選択的に結合することを見出した。単離したタンパク は MALDI-TOF/MS 解析により，黄色ブドウ球菌のグローバル制御因子の一つである MgrA (Multiple gene regulator A) と同定された。さらに，Skip 非発現株において mgrA を相 同組換え法により欠損させたところ，Skip の発現が顕著に増大した。また， ...
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プロテオームガイド 発現 精製 & 相互作用解析 同定 Contents: イントロダクション 2 タンパク質発現 4 Flexi HaloTag ORF Clone TNT System タンパク質精製 & 相互作用解析 6 HaloTag System タンパク質分析用プロテアーゼ 8 Prot
... HaloTag ® Mammalian Pull-Down and Labeling Systemは、HaloTag ® 融合タンパク質の特性を利用しており、HaloLink TM Resinとの 高い特異性と共有結合により濃度の低いタンパク質複合体を迅速、効率的に哺乳動物細胞ライセートより捕捉することができま す。HaloLink TM ...
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小脳プルキンエ細胞におけるmTORシグナルの機能解析
... mTOR の発現時期をウェスタンブロットにより調べた。その結果、2 週齢から 4 週齢に おいて、活性型 mTOR が多く発現してることが確認された。次に、4 週齢の L7-mTOR Tg マウスの小脳において、mTORC1 シグナルの亢進を抗リン酸化 S6 抗体による蛍光 免疫組織染色により検証した。 Control マウスと比較して、L7-mTOR Tg ...
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大腸癌においてWntシグナル経路により発現制御されるインターフェロン誘導タンパク質の解析
... の処置による、IRF ファミリータンパク質の安定化について検討した。その結果、IRF1、5、7 のタンパク 質がプロテアソーム系での分解により調節を受けることを見出した。そこで、ユビキチンプルダウンアッ セイを行なった結果、β-catenin もしくは dnTCF4 を処置するとコントロールと比べ、IRF1、IRF5、IRF7 ...
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胃癌におけるUc.160+の発現・機能解析
... 種存在することが知られている。T-UCR の発現制御には microRNA による制御と DNA メチル化による制御の二通りの機構が存在することが知られて いる。近年の研究から、T-UCR が疾患特異的な発現パターンを示し、いくつかの T-UCR がが んにおいて発現異常を示すことが報告されている。このことから T-UCR ががん関連遺伝子とし ...
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1 研究開発のねらい 糖鎖は 細胞表面のタンパク質や脂質に結合し 血液型の決定 細胞接着 抗原抗体反応 ウイルス感染などの生体反応で重要な役割を果たす生体分子である 糖鎖による多様な生物学的機能のうち 糖鎖結合タンパク質による糖鎖の特異的認識があり 糖鎖 - タンパク質間の相互作用の解析に糖鎖アレイ
... ClustalW のようなマルチプ ルアラインメントツールとして糖鎖構造のマルチプルアラインメントツール MCAW を開発した。この アラインメントツールを使用するためには更に改善が必要であることから、 MCAW ツールの改良を 目指す。現時点の MCAW ツールでは、複数の糖鎖構造の入力から糖鎖構造の単糖や結合情報 ...
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世界初、ナノ"サクラ"でタンパク質・RNAを数秒解析 研究活動 | 研究／産学官連携
... 今回の研究では、直径 10nm 程度のナノワイヤ構造体をサクラのように形成すること で、このナノ ” サクラ ” が生み出す空隙の大きさが、タンパク質・ RNA と同程度であるこ とを見出しました。 このナノ ” サクラ ” の空隙を利用することによって、 従来の分離技術で は不可能であったタンパク質・ RNA ...
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イネ開花遺伝子Hd3aの機能解析
... FT の 相 同 遺 伝 子 の mRAN は 接 木 間 を 移 動 し な い こ と が 示 さ れ た 。 ト マ ト に お い て FT 遺 伝 子 と 高 い 相 同 性 を 示 す SFT 遺 伝 子 の 欠 失 変 異 体 は シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ の ft 変 異 体 同 様 開 花 遅 延 の 表 現 型 を 示 し 、 35S プ ロ モ ...
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一般に医薬品は標的タンパク質に結合する事によりその薬効 ( 効き目 ) を発現する ( 図 1) 近年タンパク質の発現 精製技術の進歩 ならびに X 線 NMR 等の構造解析技術の発達により 構造解析されるタンパク質の数が大変な勢いで増加している ( 図 2) タンパク質の構造情報を基に医薬品化合物
... MP2/6-31G* の FMO 計算では、活性と FMO で求めた相互作用エネルギーの間に良好な相 関が得られた。これらは FMO 法の有用性と信頼性を示すものである。水中 MD と FMO を組み合わ せた計算においては、アミノ酸の 1 変異が周囲のアミノ酸の相互作用に影響を与えていることが分か ...
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遺伝子比較解析による珪藻類特異的なSET ドメインタンパク質ファミリーの同定
... LSMT（AtLSMT）および酵母 の HMT（ScHMT）をアライメントした結果，推定の活 性中心残基であるチロシンおよび，メチル基供与体であ る S-アデノシルメチオニンの結合に関わる残基は保存 されていたが，基質結合に関わる残基は保存されていな ...ンパク質が同定されたため，BacSET タンパク質は LSMT および HMT ...
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脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析
... 去に作製し、報告したものを用いた 23,24 。Plin1Tg は白色脂肪細胞において 2 倍 程度に PLIN1 発現が増大するが、普通食の飼育下においては対照群と比較し、 体重、糖脂質代謝に、有意な差を認めないマウスである。Apolipoprotein E knockout mice (ApoeKO) は Jackson Laboratory より購入した。C57BL/6J は日 ...
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マウス神経発生における低分子量Gタンパク質Arl8bの機能解析
... 蓋板は、神経管閉鎖期に神経板と呼ばれる板状の外胚葉が隆起（神経隆起）し、 神経隆起が互いに融合することにより形成される。そこで、神経隆起の細胞死と 遺伝子発現を検討したところ、 Arl8b ノックアウトマウスの神経隆起では、死細 胞数がコントロールと比べて顕著に減少し、Sox1 の遺伝子発現が陽性となって いたことから、神経隆起の発生に異常を呈することが示された。 ...
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出芽酵母の高浸透圧応答HOG経路に関与する新規足場タンパク質Ahk1の同定と機能解析
... HKR1、MSB2 の副支経路に分かれる。HKR1 副支経路で は高浸透圧センサーの Hkr1 が Sho1 センサー、Opy2 膜アンカーと協同して高浸透圧 を感知し経路下流へ情報を伝達する。MSB2 副支経路では、Hkr1 と重複した機能を持 つ Msb2 がセンサーとして、Sho1, Opy2 と協同的に高浸透圧感知を行う。Hkr1, Msb2 ...
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プロテアソーム相互作用タンパク質Ecm29の解析
... 文 の 要 旨 選択的タンパク質分解は様々な生命現象の制御に重要である。この選択的タンパク質分解を担 うプロテアソームは巨大な複合体型のプロテアーゼである。プロテアソームは、活性中心である 20S core particleと19S regulatory particle、PA28やPA200といった制御因子が会合することに ...
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