転写制御 タ
JAIST Repository: 遺伝子転写制御ヘムタンパク質CooAにおける一酸化炭素の光解離と再結合
... 【序】ヘムタンパク質は活性中心として鉄−ポルフィリン錯体を有するタンパク質の総称である。 光合成細菌 Rhodospirillum rubrum (R. rubrum)のヘムタンパク質 CooA は、遺伝子転写制御機能 を持つヘムタンパク質としては初めての報告例である。R. rubrum に含まれる一酸化炭素（CO）の代 謝に関わる酵素系は CO よって誘導される。 CooA のヘムに CO が結合すると ...
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Aspergillus属糸状菌における解糖系酵素遺伝子の選択的プロモーターによる転写制御機構の解析
... 本章では、enoA 以外の複数の解糖系酵素遺伝子において、AP もしくは複数の TSSs の存 在を示した（ Fig. 11）。いずれの遺伝子においても、TSSs の違いに起因してタンパク質一次 構造が多様化する可能性は認められなかったため、主に遺伝子発現量の調節において AP も しくは複数の TSSs の存在が重要な意味を持つ可能性が考えられる。特に、fbaA は、enoA と 非常によく類似した AP を有しており（Fig. ...
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肺腺癌細胞株を用いた癌細胞変異・遺伝子発現および転写制御パターンの統合解析
... TopHat2 http://tophat.cbcb.umd.edu/ スプライスジャンクションを考慮したマッピングをおこな う（Kim et al. 2013 Genome Biol）。 遺伝子発現解析 Cufflinks http://cufflinks.cbcb.umd.edu/ 異なるスプライスバリアントごとの発現量の計算や新 規転写産物のアセンブルを行う（Trapnell et al. 2010 ...
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ChIP-seqデータベースの構築による遺伝子転写制御機構の解明
... ことを容易にし、当該分野の研究を促進させることが期待される。 ChIP-seq データを用いた二次 データベースの例として ReMap 7 では約 3,000 件のデータセットを元におよそ 300 種類の転写因 子の情報を提供し、また再解析結果を元に転写因子共結合パターンの大規模な可視化を行った 8 。 このように、可用性の高いデータの共有基盤となる二次データベースの構築は、既存の実験デー ...
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家族性卵巣機能不全原因遺伝子FOXL2による核内受容体エストロゲンレセプターβの転写制御機構の解明
... Mutant Forkhead L2 (FOXL2) proteins associated with premature ovarian failure (POF) dimerize with wild-type FOXL2, leading to altered regulation of genes associated [r] ...
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学位論文要旨 ( 修士 ( 理学 )) 転写活性化因子と抑制因子によるクロマチン構造の 拮抗的な制御が mrna の転写開始点を決定する 浅田隆大 [ 序論 ] 真核生物のゲノム DNA はクロマチン構造をとり高次に凝集して核内に収納されている そのため 転写などの DNA 上で起こる反応を制御する
... 先行研究によるTup11, Tup12のグルコース飢餓後の結合分布の解析から、Tup11, Tup12は UAS1とUAS2にピークを持つことがわかっている 30 。これは、Fig.7Aで示したPhp2の結合分 布と同様であった。そのため、他の転写活性化因子についても同様に解析した。その結果、 Atf1とRst2についてもUAS1からUAS2にかけての2ピークを示した(Fig.10)。Atf1はUAS1が、 ...
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シトクロムP450(CYP1A1)遺伝子の転写制御に働く配列BTEとその結合因子の解析
... 論文審査の結果の要旨 本論文はシトクロムP-450c(CYPlA1)遺伝子の転写調節に働くDNA配列とそこに作用す るタンパク質因子の解析を目的に,HeLa細胞核抽出液を用いて,タンパク質因子依存的に転写 活性が発現するinvitro転写系を構築した。この転写系を用いてBTE配列が転写活性に必要で ...
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低酸素環境におけるHIF-1αとSMAD3の協調的な転写制御が尿細管上皮細胞に与える影響
... HIF-1αによる転写制御が細胞特異的であることを確認するため、HK-2 と HUVEC における HIF-1 αのゲノム上の結合部位を ChIP-seq で調べた。MACS で p 値 < 10 -5 をかつ fold-enrichment 30 以 上を閾値にしたところ、HIF-1αの結合部位の数は、HK-2 で 713 か所、HUVEC で 442 か所であった。 ...
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遺伝子発現制御機構 クロマチン，転写制御，エピジェネティクス - ダウンロード, PDF オンラインで読む
... び Dnmt3b が、 Rhox クラスターにおける遺伝子発現を細胞系列特異的に抑制していることを明らかにした。着床後のマウス胚において、 Rhox クラスターを含む広 範囲 . DNA のメチル化はクロマチン構造変化や転写制御因子の DNA 結合阻害をもたらし、その領域に含まれる遺伝子の発現を抑制することが知られる。この ような発現コントロールは、発生に伴う細胞系列 . 医学のあゆみ 237 巻 13 号 ...
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プロテアソーム発現制御転写因子Nrf1の活性化機構
... 本論文は真核生物において必須のタンパク質分解酵素複合体であるプロテアソームの発現制 御機構の解明を目的としたものである。プロテアソーム遺伝子群を転写制御する転写因子 Nrf1 の活性化因子の網羅的同定を試みた結果、アスパラギン酸プロテアーゼ DDI2 を新規 Nrf1 活性 化因子として同定するに至った。 ...
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ChREBPアイソフォームによる糖・脂質代謝関連遺伝子の転写制御機構
... ChREBP は糖の刺激に応答して糖・脂質代謝関連遺伝子の発現を誘導する転 写因子であり、ChREBPαと ChREBPβの 2 つのアイソフォームが存在する。 ChREBPβは転写活性が極めて高いため、糖・脂質代謝の強力なレギュレータ ーとして機能する可能性が考えられるが、脂肪組織以外の組織・器官における 役割は不明である。そのため著者らは、肝臓における ChREBPβの役割を解明 ...
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がんの発生・進展における転写因子MafKの役割
... TGF-β によって発現が誘導される MafK は乳がん細胞株において恒常的発現が認められ、予後と の関連も示唆された。実際に MafK の発現を乳がん細胞株で抑制することにより、腫瘍形成および 転移を抑制することを見出した。一方、MafK の発現によって、非腫瘍性の乳腺上皮細胞に腫瘍形 成能を獲得させ、さらに上皮間葉転換（EMT）を誘導することを明らかにした。さらに MafK によ って発現が誘導される膜タンパク質 Gpnmb ...
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転写因子タンパク質Bach1の天然変性状態制御の物理化学的解析
... Here we developed multiple analytical methods for Bach1, and revealed Bach1 regulation mechanism by heme. These progresses can be applicable in the drug discovery for intrinsically disordered proteins. 和文アブストラクト 論文題目： ...
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転写因子Tcf21は腎臓発生において尿管芽の分岐に必須でありGdnf経路を制御する
... を制御していることが明らかになった。最後に腎臓間質細胞で発現する Bmp4 が Gdnf 経路を制御する因子として報告されていることから、この発現について RT-PCR 法及 び In situ hybridization 法を用いて検討すると、Tcf21 欠損マウスの腎臓において有意 に上昇していることがわかった。また、 Bmp4 のプロモーター解析を行うと、同部位に ...
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制御性T細胞の遺伝子発現制御におけるforkhead転写因子のDNA認識特性の重要性
... FKH 転写因子の DNA 結合活性と遺伝子発現制御活性の決定因子であるという 妥当な作業仮説を立てた。この仮説は FKH 転写因子間のアミノ酸配列アライメントから 1 アミ ノ酸残基の重要性を推測したものであり、鋭い洞察力と興味深い着眼点によるものである。 申請者はまず Foxp3 の Ala384 が DNA 結合特異性とそれを介した遺伝子発現制御活性を規定 ...
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酵母におけるRNA結合タンパク質Puf5とCcr4-Not複合体による遺伝子発現の転写後制御
... protein Puf5 and the Ccr4-Not complex in yeast （ 酵母におけるRNA結合タンパク質Puf5とCcr4-Not複合体による遺伝子発現の転写後制御 ） ○ 指 導 教 員 人間総合科学研究科 生命システム医学専攻 入江賢児 教授 ...
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植物の高温ストレス応答の初期に機能する転写因子HsfA1の活性制御機構の解析
... 審 査 の 結 果 の 要 旨 氏 名 大濱 直彦 本研究では、植物における高温ストレス応答のマスターレギュレーターとし て知られる A1 サブグループの Heat shock transcription factor（HsfA1）の活 性制御機構について解析した。植物では高温ストレスのシグナルが HsfA1 を活 性化することで高温ストレス応答が起こると考えられているが、高温ストレス ...
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転写因子タンパク質Bach1の天然変性状態制御の物理化学的解析
... HO-1 プロモータアッセイにより Bach1 の CP モチーフ変異体の転写抑制作用への影響を検討した 結果、いずれの変異体においても WT と同等の転写抑制作用が見られた。このことより、CP モチー フの変異では Bach1 の転写抑制作用は障害されないことが示唆された。また、CP モチーフ変異体の ヘム応答について詳細に検討した結果、CP ...
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細胞骨格制御タンパク質フィラミンAは転写因子PEBP2βと会合することでPEBP2βを細胞質に留め置き、PEBP2βのパートナーであるRunx1の転写調節機能を制御する
... 審査結果の要旨 Runxl/PEBP2β転写因子はヒト急性骨髄性白血病の最多原因遺伝子であり,またマウス胎 仔AGM領域における成体型造血能の発生に必須の遺伝子であることから,白血病・血液学の 領域では最重要な転写因子の1つである。転写因子であるからにはその機能発揮の場が,標的で ある遺伝子DNAの存在する細胞核であるのは自明であると思われがちであるが,実情がそうで ...
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低酸素応答転写因子HIF-1αによる乳がん幹細胞の機能制御機構の解明
... 著者は Aldefluor pos 細胞において HIF-1 αタンパクが発現上昇し、Snail と Slug の発現亢進と E-cadherin の発現低下が起こることを明らかにし、HIF-1αにより誘導された EMT が Aldefluor pos 細胞の性質に強く 関与していることを示唆した。また、クロマチン免疫沈降法により、HIF-1αタンパクが ALDH1A1 プロ モーターと相互作用することを証明し、HIF-1 αが ...
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