線結晶構造解析技術の開発
中性子関連技術解説書 1. はじめに 中性子利用技術名 ; 粉末中性子線回折解説書作成者 ; 技術士氏名伊東亮一 粉末中性子線回折は試料に中性子を当て 散乱される中性子線を測定して試料中の原 子構造を調べる分析法です 粉末のままで結晶構造解析ができます 2. 概要 2.1 粉末中性子線回折従来 結晶
... ③ 磁場をかけながら磁気構造を測定する装置：高性能の磁気ヘッド等を開発するために磁 場を制御できる装置が必要となります。 粉末 中性子回折 測定に必要な周辺機器や技術は殆ど特注となりますので、新たな開発が 求められます。研究者と密接な連携をとるため、茨城県内の中小企業にとって大きなビ ...
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JAIST Repository: 短時間結晶化を利用した次世代多結晶シリコン薄膜太陽電池作製技術の開発
... 膜 のラマンスペクトル。 (2) 図 2 に、同じく膜厚 3.5 µ m の a-Si に対 し FLA を行う前後の表面微分干渉顕微鏡像を 示す。FLA 前の a-Si 膜では、この倍率では顕 著な凹凸構造が確認できないのに対し、結晶 化後の膜表面においては、表面モホロジーに 大きな変化が確認される。固相核生成→固相 ...
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蛋白質X線結晶構造解析―放射光を利用した回折実験
... 結晶試料をその場で凍結させる場合には、まず結晶化プレートや母液バッチからクライ オループで掬う。母液には、氷形成による結晶損傷を防ぐため、多くの場合抗凍結剤（例 えばグリセロールやスクロース等）を溶かしておく必要がある。そして、吹き付け低温装 置の気流（窒素もしくはヘリウム）を一旦遮り、磁石ベースにマウントした後、なるべく ...
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33 MD-SAXS 法 [ 技術の概要 ] マルチドメインタンパク質や天然変性タンパク質など フレキシブルで結晶化しにくく X 線結晶構造解析が難しいタンパク質は数多く存在する また 結晶構造と溶液構造が異なると想定される場合もある そのような場合 低解像度ながら 溶液構造情報を X 線小角散乱
... • 製薬企業との共同研究実績を生かし、標的タン パク質ファミリーに特化したモデリングやドッキン グ計算技術による支援、高度化研究を実施。 GSHMASGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIP EGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRL LGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQI ...
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低速電子線チャネリング効果を用いたSiC結晶表面の終端構造評価
... SiC はダイヤモンド、ボロンカーバイド（B 4 C）に次ぐ高硬度の難加工材料あり、ウェハ からの切り出しやその後の研削・研磨工程においては、自身よりも硬いダイヤモンドや B 4 C などの高硬度砥粒を用いた機械加工が一般的に用いられる[37]。しかし高硬度材料であると ともに脆性も高く、これら機械加工工程における研磨ダメージが加工歪み層として加工面 ...
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JAIST Repository: 主鎖型縮合多環式ポリマーの結晶構造解析
... ドーピングなしでも多少の導電性を示すものがあり、近年、様々な化学修飾が試みられてい る。本研究では p oly(anthraquinone-1,5-diyl) (P AQ) 及び poly(4,8-dinitroanthraquinone- 1,5-diyl) (PNAQ) について結晶構造を明らかにした。低結晶性で配向試料が出来ない物 ...
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低速電子線チャネリング効果を用いたSiC結晶表面の終端構造評価
... 第４章では、本研究で用いた実験条件として、SiC 標準試料を再現性良く作製するための独自のプロセス 装置について、そして LE-ECC 評価に用いた SEM 分析装置の詳細について述べている。プロセス装置に ついては、特に、SiC 表面での原子配列を2100℃までの超高温領域で自在に制御可能な熱化学的エッチング を実現する超高真空炉、および新規耐熱部材である浸炭 ...
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酵素-阻害剤複合体のX線結晶構造解析に基づく薬物設計--劇薬研究への利用を目指して
... 応が進む．この触媒反応は『NAD + ＋ X → ADP-5’- リボース -1’-X ＋ニコチンアミド』という式で示 される．上式において，アクセプターである X は 反応を受ける蛋白質中のグルタミン酸残基 ( 開始 反応 )，ポリ (ADP- リボース ) 中の末端のアデニ ンリボースにおける 2’- 水酸基 ( 伸長反応 )，あ るいはポリマー中のニコチンアミドリボースにお ...
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創薬と結晶構造解析-3.key
... 感染症に効く」 L igand- b ased d rug d esign もう一つの例は，βラクタム系の薬の開発です． きっかけは， ペニシリン の発見ですが，当時，ペニシリ ンがなぜ病原菌の感染症に効くのかが分っていた訳では ありません．そもそもペニシリンそのものの構造が分る ...
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超臨界水中でのセルロース構造変化の解析および再結晶化法
... TOUR ： Tohoku University Repository コメント・シート 本報告書収録の学術雑誌等発表論文は本ファイルに登録しておりません。なお、このうち東北大学 在籍の研究者の論文で、かつ、出版社等から著作権の許諾が得られた論文は、個別に TOUR に登録 ...
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電子線回折法によるヒト皮膚角層細胞間脂質膜の局所構造解析
... X 線結晶構造解析によって、皮膚のバリア機能にはこの細胞間脂質の側方充填配列構造が 重要であると示唆されてきた。他方、バリア機能の指標となる経皮水分蒸散量（ TEWL）と側方充填配 ...
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信号処理を用いた結晶性材料の構造解析 (ウェーブレット解析とサンプリング理論)
... 現在，画像解析の技術は向上し，ナノスケールの材料の形態の 3 次元構造の可視 化や内部の欠陥の状態を観察できるようになってきた．これらの技術は 3 次元結 晶構造を一度 2 次元画像に射影し，射影像を加工して情報を得るものである．し かし，3 ...
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シリアルフェムト秒結晶構造解析のための試料調製法：バッチ法による微結晶化と高粘度媒体を利用した結晶送液方法について
... もの蛋白質を必要としていたが、インジェクターや試料 の送液方法の開発を進め、現在では、1 mg 以下といった少量での SFX 実験が可能となり、 様々な蛋白質結晶の回折データ収集や構造決定が達成されつつある。 ...
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一般に医薬品は標的タンパク質に結合する事によりその薬効 ( 効き目 ) を発現する ( 図 1) 近年タンパク質の発現 精製技術の進歩 ならびに X 線 NMR 等の構造解析技術の発達により 構造解析されるタンパク質の数が大変な勢いで増加している ( 図 2) タンパク質の構造情報を基に医薬品化合物
... Discovery.Studio.2.5 の CHARM ｍ力場を用いて行った。このとき、最適化法は SD 法、誘電率は４R を採用した。最適化は次のような手順で行った、 （１）水素以外の原子を固定し、水素のみを最適化、 （２） タンパクの主鎖を固定し、側鎖のみを最適化、（３）全原子にハーモニックコンストレインをかけて最 適化。コンストレインの強さは 100 ...
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長波長X線利用による天然型タンパク質の結晶構造解析
... ・キャピラリートップマウントの利用(図 3) タンパク質結晶にダメージを与えずに、なおかつ、結晶の周囲にクライオ溶液がほぼ存 在しない状態で結晶をマウントする方法が開発されている(3)。この方法は、極細のガラス キャピラリーをマウントループの軸に用い、結晶を凍結させる寸前に、ガラスキャピラリ ...
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2-6 粉末 X 線構造解析概要 本節では 粉末試料によるX 線回折データを用いて構造解析をおこなうためのリートベルト解析ソフトを紹介し 結晶構造パラメーターから結晶構造モデルを可視化するための結晶構造描画 VESTA の使用方法について解説する リートベルト解析への第一歩構造解析を行
... 種類の結晶構造 の描画モードがあり、配位多面体を表示には ”polyhedral”モードを使用する。配位多面体を 表示するためには、まず原子間の結合を付加する必要がある。 ”メインメニュー/Edit/Bonds” を開き、結合を付加する原子 ”A1”と”A2”を選択し、結合距離の最小値と最大値を入力した 後、 ...
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超分子複合体の立体構造解析を目指したストラタジー～転写メディエーターの X 線結晶構造解析を例として～
... cMED の発現系構築にあたり、それぞれの遺伝子は異なる薬剤（アンピシリ ン、カナマイシン、ストレプトマイシン）耐性遺伝子を持つ 3 つの大腸菌プラスミド （pET-21b、pET-28b、pETDuet-1）に、ポリシストロニックに組み込んだ（図 1）。 cMED を構成するサブユニットは 2 つのモジュール（ヘッドとミドル）単位で機能する ...
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「蛋白質発現・相互作用解析技術開発」産業科学技術研究開発基本計画
... 産業利用上有用なタンパク質やその複合体等を特異的に認識できる抗体を系統的に創 製する基盤技術として、系統的な抗原の産生技術、高特異性抗体を創製する技術、抗 体の機能向上の基盤技術を構築する。これらの技術を用いて、産業上有用なタンパク 質を生体内における機能を有した状態で２５０程度産生し、これを抗原として産業上 ...
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二次元ハールウェーブレット解析による重力異常値の線状構造の定量評価
... 「値が 2 なら赤」「値が 1 なら黒」というように絶対的に 色を表示する方法と，「最大値なら赤」「最小値なら黒」 というようにデータ内の値を用いた相対的に表示する方 法である。この仮想データを画像化する目的はウェーブ レット変換の結果を把握することであるため，色は相対 的に表示している。X軸成分は画像のX軸に向かう変化 のことであり，X軸方向に値（色）が変化しているとこ ...
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結晶構造解析が解き明かす芳香環水酸化ジオキシゲナーゼの基質認識と電子伝達メカニズム
... CAR の活性中心近傍への結合状態を詳細に描画した ものが図 4C である。CAR は活性中心の Fe 2+ の直上に 結合しており，その際に angular dioxygenation を受ける 位置である C1 位，C9a 位が Fe 2+ から約 ...NDO の TO へ の酸素とナフタレンの結合様式が明らかにされており 28) ， ...
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