河野信（ライフサイエンス統合データベースセンター）
第 10 回 AI ツール入門講座 SPARQL による LOD (Linked Open Data) の活用 SPARQL の基礎 山本泰智ライフサイエンス統合データベースセンター 大阪
... SPARQL1.1 Query / Update / Graph Store protocolに準拠.. CREATE / LOAD[r] ...
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JAIST Repository: ライフサイエンス分野研究動向の可視化
... 本研究で用いた書誌データを表１に示す。なお、実際に使用した論文データは SCI Expanded および PubMed の積集合（前述のように結合されたレコード）に限られている。 表１ 本研究で利用した書誌データ SCI Expanded™（WoS） 1992-2011 年にデータベースに収録された論文（article, review, note, letter、article & proceedings ...
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ライフサイエンス研究分野で広く使われている PowerLab データ収録解析システムを用いた PC ベースで 使いやすい 新しいスタイルの学生実習システム ライフサイエンス研究分野で広く使われている PowerLab データ収録解析システムを用いて 生理学実習や薬理学実習を始めとするライフサイエンス
... 新しいスタイルの学生実習システム ライフサイエンス研究分野で広く使われている PowerLab データ収録解析システムを用いて、生理学実習や薬理学実習を 始めとするライフサイエンス分野の学生実習を行うシステムです。 多機能一体型の実習用 PowerLab と使いやすいソフトウェア LabChart、LabTutor を用いることで、装置を置くスペース ...
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岡崎国立共同研究機構の将来構想とＥ地区への統合バイオサイエンスセンターの設置 分子研リポート1999 | 分子科学研究所
... 5-3-2 統合バイオサイエンスセンター設置の必要性 生命現象の本質を，分子のレベルからその集合組織体としての生命体に統合する視点から解明しようとするバイオ サイエンス，すなわち統合バイオサイエンスは，新たな技法の導入により飛躍的に発展を続けており， ２ １ 世紀に向け ...
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STN バイオサイエンスデータベースセミナー資料
... *** 目 次 *** 1. 特 別 講 演 ············································································································································ 1 ウィルスからヒトまで ～ BIOSIS で広 く調 査 ～ トムソン・ロイター 矢 田 俊 文 氏 2. ...
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バイオ・ラッド ライフサイエンス総合カタログ
... ZOE蛍光セルイメージャーは日々の細胞培養並びに細胞イメー ジングアプリケーションに適したイメージングシステムです。 システムは倒立顕微鏡にタブレットの使いやすさを統合するこ とにより、細胞を画像化する際の複雑な手順を排除しました。 10.1インチタッチパネルスクリーンによりモータライズステー ジ、明視野並びに3蛍光検出チャンネル、および統合されたデジ タルカメラを制御することで簡単に観察することができます。 ...
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ベックマン コールター製品総合カタログ ライフサイエンス分野
... ● Pacific Blue、Krome Orange、 Fluorescein、PE、 ● PEタンデム色素（ECD、PC5、PC5.5、 PC7） ● APC ● APCタンデム色素（APC-A700、APC- A750） ● ビオチン 500μg ベックマン・コールターの抗 体、お客様ご提供の抗体で蛍 光標識抗体を作製 1バイアル マルチカラー 組み合わ[r] ...
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被引用数を用いたライフサイエンス論文検索システムの構築
... そこでこの研究では、ある論文を指定した場合、被引用をたどり最新の論文群を結果として表示すること で、ある特定の研究についての最新動向を効率的に把握することを目標とし、そのファーストステップとし て、ライフサイエンス分野の論文間の引用データを取得・整理し、特定の論文を指定しその論文を引用した論 文を検索できるデータベースを構築し、web 上で検索できる citation tracker ...
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資料2_ライフサイエンス研究におけるオープンサイエンスの推進（理化学研究所 小安重夫氏 説明資料）
... ⅲ）大学等の施設・設備の整備と情報基盤の強化 （前略）国は、資金配分機関、大学等の研究機関、研究者等の関係者と連携し、オープンサイエンスの推進体制を構築する。公的資金による研究成果について は、その利活用を可能な限り拡大することを、我が国のオープンサイエンス推進の基本姿勢とする。その他の研究成果としての研究二次データについても、分 ...
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岡崎統合バイオサイエンスセンター（1ページ） 分子研リポート2012 | 分子科学研究所
... 1). 環境分子の受容・応答機構研究 2). 環境分子による生理機能撹乱の統合的研究 3). 生殖細胞分化機構研究 4). 細胞のストレス応答・ストレス防御機構研究 5). 生体分子による正常生理機能制御の統合的研究 6). 環境分子の生物影響に関する統合的データベース構築 ...
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平成 26 年度研究開発実施報告書 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 統合化推進プログラム 研究代表者 [ 中村春木 ] [ 大阪大学蛋白質研究所 所長 / 教授 ] [ 蛋白質構造データバンクの高度化と統合的運用 ] 1
... SIFTS データベースを元にして、UniProt, PubMed, Pfam, Taxonomy 等の情報を wwPDB/RDF に追加し、wwPDB/RDF の外部データへのリンクを充実させた。機能拡 張としては、従来開発した SEEKQUENCER と DASH を基に MAFFTash によって配列と構造 の同時アラインメント機能を向上させた。eF-site については large structures ...
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国際比較調査 ips 細胞の標準化に関する技術開発 推進戦略 規制動向 エグゼクティブ サマリー JST 研究開発戦略センター (JST-CRDS) ライフサイエンスユニット ( ユニットリーダー : 浅島誠上席フェロー ) では 2006 年 2008 年に開催してきた ライフサイエンス分野俯瞰ワ
... も含めて多岐に渡った。米国の幹細胞研究の重厚な研究者層と研究分野の Heterogeneity を尊重する懐の深さを肌で感じることができた。得られた視座から、 我が国の幹細胞研究、 なかでも iPS 細胞研究が今後進むべき道を以下考えてみたい。 iPS 細胞は現在、体細胞の由来、因子の組み合わせ、因子導入法により様々なものが樹 立され、 Nature、Science、Cell など科学誌で日々報じられている。先導的に iPS 細胞を ...
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S PECIAL INTERVIEW バイオスーパーコンピューティングが拓くライフサイエンスの未来 次世代生命体統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 の 6 年半をふりかえる 革新的なアプローチでライフサイエンス分野の未来を切り拓いてきたグランドチャレンジ 理化学研究所次世代計算科学研究開発プ
... ●「京」による数理解析で生命システム理解にブレークスルーを 2003年、13年の歳月と1千億円という費用をつぎ込んだ「ヒトゲ ノム計画」によって、ヒトのゲノムが解読されました。この年に、米国 国立衛生研究所（NIH）は、ヒトゲノム解読後のロードマップを出しま したが、そのなかに「Biology is changing fast into a Science of Information ...
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引用データを用いたライフサイエンス論文検索システムの構築
... 本学では平成年度に採択されたキャリア支援 *3「神戸常盤発！元気が出るキャリアガイドステムの構築」 にて、医療検査学科の教員が企業と共に臨床検査技師国試データベースを作成し、平成年４月より運用を開 始した。各問題毎に科目別の分類と共に正答率のタグ付けをしており、正答率が高い問題を難易度が低い問題 （易しい問題）、正答率が低い問題を難易度が高い（難しい問題）と識別出来るようにした。易しい問題を抽出 ...
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終了報告書（統合化推進プログラム_プロテオーム統合データベースの構築_石濱泰）
... E) 集積キューブ型 Globe およびフオーカスド DB Slice 開発においては、河野らのグループ によって RDF スキーマ、オントロジー設計を行い、データ統合に向けた基本設計をおこな った。 Globe の設計では、Cube からどこまでの情報をもってくるのかを検討した。さらに Slic e 開発ではプリセットマップに加え、カスタムマップのためのツール開発も行い、汎用性を 確保した。 ...
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JAIST Repository: 教育・学生統合データベース構築までの道程
... （１）教育成果測定用データベース構築の具体的内容（入学・学籍，学生調査等のデータ収集過程な ど）について，大阪府立大では，保有する学生データを法人プロパー職員（入試，教務，キャリアサ ポートに携わる現場職員 5 人程度）によって洗い出し，整理させた（2009 年）。期間的には 3 ヶ月間 かかったという。それを基に，リプレイス時期にあった教務学生支援システムを設計した。その先に は，戦略 GP ...
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オープンサイエンスを支える研究データ基盤：解説論文：2．統合データベースプロジェクトから学ぶこと
... ところで，この期に及んで恐縮だが，なぜデータベースの統合が必要なのだろうか？ それは生命科学 のデータには厄介な性質があるからである（図3）．生命科学以外でも類似の性質を持った分野があるのか もしれないが，ここでは生命科学特有と表現しておく．生命研究から出てくるデータはこのような性質を 持っているので，そのままではほかの研究者が出したデータをうまく活用できない．そこで，データやデ ...
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岡崎統合バイオサイエンスセンター 分子研リポート2005 | 分子科学研究所
... 研究の方向性 研究プログラムの方向性は，次に述べるような二つの判断基準に従って決定されるべきである。①研究者が利用可 能な研究資源によって追求し得る研究課題で重要なものは何か。②研究グループ間での強固な連携が可能であるよう な研究課題の選択について考慮すべきである。分子研を兼務する岡崎統合バイオの研究グループでは，上記二つの判 ...
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ライフサイエンス
... ¸¸¸¸¸ コラム（２） −プロテオーム− ¸¸¸¸¸ プロテオーム（pr ot eom e）は 1994 年に提起された概念であるが、蛋白質の動的・静的な挙動（発現 のレベル、 発現の場所、 翻訳後の修飾、 蛋白質同士の相互作用等） を大スケール （m as s i ve & par al l el ） で比較検討することにより、疾病／病態、細胞プロセス／ネットワーク等、生命現象に関する全体的 ...
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鳥取大学フィールドサイエンスセンター 森林部門に関する備忘録
... II. 演習林から教育研究林へ 1. FSC 森林部門および教育研究林 私が赴任した頃は、演習林の利用者が実習以 外では少なく、学生を連れて訪ねると事務官や 技官の方々に歓迎されたものだった。当時は犬 挟峠を直通する道路がなく、延々と曲がりくね った山道を通って鳥取県から岡山県側に渡って いった。蒜山の宿舎に宿泊するときは必ず職員 の誰かが宿泊する決まりになっており、職員は 大変だったと思うが、親睦して山の話を伺う機 ...
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