東北大・生命科学・生命機能
分子進化モデルと最尤系統推定法 東北大 院 生命科学田邉晶史
... 最尤系統推定の手順 (発見的探索) 最も単純な分子進化モデルで NJ treeを作る ↓ 得た樹形で検討対象の全分子進化モデル での最大化対数尤度を求める ↓ モデル選択規準を算出して分子進化モデルを選択 ↓ 何らかの方法で初期系統樹を与える ↓ 選択された分子進化モデルにおける その樹形での各座位の形質状態の 実現確率 (対数尤度)を算出する ↓ 全座位の対数尤度の和[r] ...
32
顕微鏡の操作と細胞の観察 基礎生命科学実験・生命科学実験（東京大学 教養学部）実験概要
... ③ 異なる２カ所（ 葉の表 vs 裏、葉の先端 vs 基部、若い葉 vs 古い葉、等）を観察し、それぞれの典型的な細胞を １つずつ大きくスケッチする。. ④ 葉緑体が移動する時間を測定し、実長測定の結果を踏ま えて原形質流動の速度を算出する。[r] ...
5
生命科学と社会(長谷川)①
... ―― 動物機械論では細胞説はイメージしにくかったわけですが、 それでは細胞説の研究者たちは生気論よりだったのでしょ うか。 長谷川 細胞説をとった研究者たちが生気論者だったかどうかは、人 によって違いますが、顕微鏡が発明されて、動植物のさまざ まな切片をのぞいて細かいものが見えるようになると、いろ いろな核が見え、しかも核が分裂することも分かってきまし た。たとえ物理主義者でも、構造をきわめようという探求は ...
112
final_生命科学データ保存GL_ver
... ※1 本ガイドラインは、学術論文については東京大学大学院医学系研究科・医学部の生命科学系関 連分野の研究者が責任著者の場合、学位論文については学位取得者が東京大学大学院医学系研究科・ 医学部生命科学系関連分野等に所属する場合に適用する。 ※ 2 他機関の研究者が責任著者である共同研究の成果は、共同研究者と相談のうえ、他機関もしく ...
6
計算機生命科学の基礎II_
... cell innovator 機能解析 (functional analysis): GO, DAVID, GSEA • 発現している遺伝子、変動している遺伝子の集団があった時、 • 「生物学的に見て、どの機能 (biological function) を持った遺伝子が多いの か」を見る手法。 ...
42
弘前大学農学生命科学部学術報告
... d-2. Shibazaki, M., Takeuchi, T., Ahmed, S. and Kikuchi, H.: Blockade by SB203580 of Cyp1a1-induction by TCDD, and the possible mechanism. Chromatin 2004, Chromatin structure and gene expression mechanisms as therapeutic ...
24
次代の基礎生命科学者
... 昨年度の我が国の出生数が86万人と聞いて基礎 生命科学の将来に関連付けて危機感を持たれた方も 多いのではなかろうか．すでに大学院博士課程の学 生数の少なさはかなり深刻な状況である．現在24, 5歳の博士課程進学段階の学生たちは年間出生数が 120万人程の頃に生まれていてこの有様なのに，25 年後は博士課程進学者の母集団が現在の3分の2程 度の大きさしかない状況になるわけである．進学率 ...
1
科学的な生命論の限界
... なぜなら、「新しい」「法則関係」とは、まさしくそれまでの「理論体系」によって説明が不可 能という意味で「新しい」ものだからである（もちろん純粋に「机上の空論」的な「予想」が 可能かもしれないが、それは「不可逆性」判断の現実問題に対処するのに十分な根拠をもっと はいえないであろう。なお、科学理論の発達それ自体に「法則性」があるか否かは大問題であ り、この点に関しては態度を[r] ...
9
動物の諸器官の構造と機能（Ⅱ）アメリカザリガニの解剖 基礎生命科学実験・生命科学実験（東京大学 教養学部）実験概要
... （学名） Procambarus clarkii. 動物の諸器官の構造と機能[r] ...
7
生命・錯体分子科学研究領域
... b) 多くの動物は，視覚以外にも概日時計の調節などの用途に光情報を用いている。このような「非視覚」の光受容を 担うタンパク質は，視覚を担う光受容タンパク質とは異なる分子特性を持つと考えられる。今年度は，哺乳類の非 視覚の光受容機能を担うメラノプシンが，自発的に光受容能を失う特性を持つことで，活動環境からの強い光入力 にも細胞応答が飽和しないようにはたらくことを示唆する結果を得て， その成果を J. Biol. Chem. ...
36
生命・錯体分子科学研究領域
... a) ヘム（鉄ポルフィリン錯体） ， およびビタミン B12（コバラミン錯体）は， 代表的な遷移金属含有型補欠分子族であり， タンパク質中に存在するこれらの分子が活性中心として機能することにより，多様な生理機能を発現することはよく 知られている。近年，遷移金属イオン・遷移金属含有補欠分子族の新規な生理機能として，こららが生体系におけ ...
34
生命科学機器分析部 [ 運営方針 ] 生命科学機器分析部は 各種生命科学研究機器およびサービスの提供を通じて 生命科学 理学 工学 医歯薬学 生命科学領域の教育 研究活動を支援することを目的として活動している さらに 最新の技術情報を講習会や技術セミナーなどを企画 開催することで提供し 研究者および
... 生命科学機器分析部 [運営方針] 生命科学機器分析部は、各種生命科学研究機器およびサービスの提供を通じて、生命科学、理学、工 学、医歯薬学、生命科学領域の教育・研究活動を支援することを目的として活動している。さらに、最新の ...
14
生命・錯体分子科学研究領域
... A -3) 研究活動の概略と主な成果 a) 古細菌型ロドプシンは 7 回膜貫通型ヘリックスからなり，通常， all-trans 型レチナールを発色団として結合する。trans– cis 異性化によって引き起こされるタンパク質の構造変化によって，イオンポンプ，イオンチャネル，光センサーと様々 な機能を発現することが知られている。時間分解赤外分光法により機能発現に至る分子構造の変化を解析することで， ...
30
高知大学 総合研究センター 生命・機能物質部門
... • Plasmodium malariae (erythrocystic stage, sporozoite) • Plasmodium ovale (erythrocystic stage, sporozoite) • Plasmodium vivax (erythrocystic stage, sporozoite) • Simian malaria[r] ...
5
21世紀の生命科学におけるRNA研究のインパクト
... ３ アーキアのプロテオームを機能で分類する、あるいは特定 の RNA 関連酵素に注目する 研究所に来たばかりの時点に話を戻そう。RNA の研究というと RNA 分子 ばかりを探求しているように思われがちだが、慶應に来る以前から RNA 分子 の制御に関わるようなタンパク質をゲノムレベルで同定すべきであると考え ていた。このために、そのタンパク質の生物学的な機能がわからないままで も、RNA ...
18
2019/5/13 5/14 論文準備ここからスタート in 農学生命科学図書館 共催 : 農学生命科学図書館 本部情報基盤課 [ 学術情報リテラシー担当 ] 東京大学 講習内容 テーマから雑誌論文を探す ( 医学 生命科学分野 ): PubMed 例題 1 - ( 参考 )U
... pressreader 【学内から】GACoS「pressreader」でキーワード検索 【学外から】学内から自分のアカウントでアクセス後 15 日間は利用可 LexisNexis Academic CiNii Articles 【学内・学外 OK】農学生命科学図書館ホームページ「定番データベース」から ...
12
DNAと形質発現－大腸菌の生育とPCR法による遺伝子の増幅 基礎生命科学実験・生命科学実験（東京大学 教養学部）実験概要
... C リアルタイム PCR 法による DNA 増幅の観察. ○選んだプライマーの種類と選択理由および増幅結果.[r] ...
6
Microsoft Word - 医学生命科学系_201208～.doc
... 全文を入手するためには有料の場合もあるため、注意が必要。 ■補 足 【 My 医中誌機能】 メールアドレスをユーザ ID として登録することにより、医中誌 Web をカスタマイズできる。検索画面の様々な 環境設定や、自動的に絞り込み検索を行うフィルター設定など。詳細は HELP を参照。 ...
11
上原記念生命科学財団研究報告集, 34 (2020) 上原記念生命科学財団研究報告集, 34(2020) 132. 翻訳停滞解消を阻害する薬剤の探索と作用機序の解明 栗田大輔 弘前大学農学生命科学部分子生命科学科 Key words: リボソーム, 翻訳,YaeJ, 抗生物質, リボソームレスキュー
... YaeJ の生理的役割を明らかにするために yaeJ 遺伝子欠損株の表現型解析を行った。ここでは BIOLOG 社の GEN Ⅲ MicroPlate TM を使用している。このプレートには 96 種類の様々な化合物が各ウェルに入っており、バクテリアの 培養液をそれぞれ加えて蒸散抑制機能付きのプレートリーダーで経時的に吸光度を測定することで、各種化合物が ...
5