例題1 高脂血症の食事療法 に関する国内の論文を探す。 ① 医中誌Web ログイン画面で、「ログイン」ボタンをクリック。 ② 検索語を入力し、検索ボタンをクリック。 *キーワード1つずつ検索するのがおすすめ。 ③ 検索結果が表示される。 *必要に応じて、履歴検索や、絞り込み検索が可能。 ④ 文献番号をクリックすると、詳細画面が表示される。
⑤ 本文を探すには「メディカルオンラインPDF」、「UT Article Link」等のアイコンをクリック。 ⑥ 画面右上の終了ボタンをクリックして終了。 ★POINT! 検索履歴に表示される「TH」や「AL」とは? /TH ⇒シソーラス用語(Thesaurus)を検索。主題による検索が可能。 /AL ⇒全項目を検索。 (例) ・「食事療法/AL」 ⇒ タイトルや抄録などに、「食事療法」という 単語(文字列)が含まれているものを検索。 ・「食事療法/TH」 ⇒ シソーラス用語としての「食事療法」というキーワードが 付けられているものを検索。 ※医中誌Web では、自動マッピング機能により、入力語に対応する
医学・生命科学系論文の探し方
【1】日本語論文を探す ~ 医中誌 Web ~
医中誌Web http://login.jamas.or.jp/enter.html 【同時アクセス12】 い②
-1
②
-2
←②-1 の検索結果 ←②-2 の検索結果③
-1 【履歴検索】
検索結果を組み合わせた 検索が可能 (AND/OR/NOT を選択) 【シソーラス用語とは】 論文の内容を表すキーワード。 専門スタッフがシソーラス(上位 語・下位語を整理した用語集)に 基づき、統制されたキーワードを 各論文に付与している。 これによって検索モレを防ぐこと や、探したい主題の論文を検索(前のページから続く) 【絞り込み検索画面】 例:「論文種類:解説」、「日本語」「ヒト」 など条件指定して、「絞り込み実行」 ボタンをクリック
⑤
文献管理ツールへデータを保存 (RefWorks、EndNote、EndNote Web) 【検索結果一覧】 印刷、ダウンロード、メール送信、 クリップボード(一時保存&まとめ印刷)④
【検索結果詳細】③
-2 【絞り込み検索】
【シソーラス用語】 医中誌が作成する「医学用語 シソーラス」に登録された用語。 【医中誌フリーキーワード】 上記のシソーラスには 登録されていないが、索引上重要として別途管理 されている語。 *の付いた語は中心的な主題。(メジャー統制語) 【チェックタグ】 論文の「対象」を表す。■補 足 <Pre 医中誌>データ シソーラス用語などがまだ付与されていない、新しいデータ。タイトル、著者名、収録誌の情報、一部について は抄録のみが表示。(最短で1ヶ月で掲載。正式なデータになるには4~6ヶ月程度要する。) ■補 足 【アイコンについて】 全文を入手するためには有料の場合もあるため、注意が必要。 ■補 足 【My 医中誌機能】 メールアドレスをユーザID として登録することにより、医中誌 Web をカスタマイズできる。検索画面の様々な 環境設定や、自動的に絞り込み検索を行うフィルター設定など。詳細はHELP を参照。 ※9 月以降は検索式の保存やメールアラート機能も追加される予定。 例題1-応用 子供のアトピー性皮膚炎の治療 に関する論文を探す。 東京大学OPAC へのリンク。東大に冊子体の雑誌が所蔵されているか検索可能。 東京大学UT Article Link ボタン。本文入手可能なアイコンが無ければこれをクリック。 電子ジャーナルへのリンクや、冊子体の所蔵等を確認可能。 参照:「文献探しのヒント② データベースの検索結果で本文へのリンクがなかったら?」 メディカルオンラインデータベースへのリンク。 ・「FAX」⇒FAX で全文を入手可能。FAX 送信申込画面に必要事項を入力し送信する と、記入したFAX 番号に全文が届く。(自宅の FAX でも OK)
・「PDF」⇒全文入手可能。
国立情報学研究所(NII)の論文情報提供データベース CiNii Articles へのリンク。 「本文あり」⇒フルテキスト(PDF)を入手可能。雑誌によっては有料提供の場合もあり。 文献単位でPubMed とリンク。 一部の文献については、フルテキストの閲覧が可能な場合もあり。 文献単位でオンラインジャーナルへリンク。 東大で契約している電子ジャーナルの場合、無料で入手可能。 文献単位でオンラインジャーナルへリンク。 東大で契約している電子ジャーナルの場合、無料で入手可能。
AND 検索 OR 検索 NOT 検索
① 複数検索語の掛け合わせ
② 検索対象の限定(絞り込み条件)
・絞り込み条件・・・検索をする前にも、ヒトの年齢、動物の種類、出版年、論文の種類等の条件設定が可能。③ 検索項目を限定した検索
・検索語入力欄の「その他」プルダウンメニューで、特定の項目に限定して検索することが可能。 ・入力欄にタグをつけて検索することも可能。 項目 タグ 入力例 備考 清野宏/au フリガナでの検索は キヨノヒロシ/au 著者名 /au kiyonohiroshi/au 所属機関 /in 東京大学/in 第一著者のみ 論文 タイトル /ti エビデンス/ti 看護教育学研究/jn 収載誌名 /jn 看教研/jn 略称も可(プルダウンメニューでも可) 統制語 (シソーラス) /th 花粉症/th メジャー統制語は 花粉症/mth④ 完全一致検索
・[ ]を付けると完全一致検索。不要なものがヒットするのを防ぐ。 ★完全一致の指定ができる項目は、 著者名、収録誌名、所属機関名、特集名のみ。 例) [清野宏]/AU 著者名「清野宏」のみヒット。「清野宏美」等は除外される。 外科手術 not 内視鏡手術 胃癌 緩和ケア 胃癌 or 胃潰瘍【 医中誌 Web の効果的な検索のために 】
■ 自動的にではなく、自分でシソーラスを参照して検索に使う場合(シソーラス用語だけで検索する方法) 例題2 リラックス に関する論文をシソーラス用語を使って探す。 ① メニューバーの「シソーラス参照」をクリック。キーワードを入力し参照ボタンをクリック。 ② 入力したことばから導き出された同義語と候補リストが表示される。 ③ 候補リストから適切なものを選んでクリック。 ④ そのシソーラス用語の副標目や上位語・下位語の階層構造が表示される。 ④ 階層構造を確認して、適宜「下位語も検索する」を選択し、「このキーワードで検索」をクリック。
■番外篇
:こんな機能も
参考文献リスト内の、掲載雑誌略称の正式な誌名を調べる。 ⇒シソーラス参照画面で「収載誌名」を選択して略称を入力し、「参照」をクリック。①
③
②
④
対応するシソー ラス用語へ誘導 階層(ツリー構造) の表示 思いつくことばを入力 「リラックス」のシソーラス用語が 「リラクゼーション」であることが わかる。ちょっと上級編【シソーラス用語による検索】
例題3 stomach cancer(胃癌)についての英語論文を探す。
① 検索画面で検索語を入力。(必要に応じて、論理演算子(AND/OR/NOT)を半角大文字で入力。) ② Search ボタンをクリック。
③ 検索結果一覧が表示される。(Display Settings で表示形式を「Abstract」などに適宜選択可能。) ④ 必要に応じ、Filters で絞り込み条件を設定。
⑤ 論文名をクリックすると詳細画面が開く。
⑥ 本文を見るには、Full Text ボタンまたは「UT Article Link」ボタンをクリック。
表示形式の変更
【2】英語論文を探す ~ PubMed ~
精度の高いフレーズ検索の場合は ””(ダブルクォーテーション)が必要。 例) “blood pressure” ほとんどの場合は無くても自動的にフレーズ検索。 (※検索式の確認が必要。⇒ ページ参照) PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=ijputmlib 【 東 大 専 用 入 口 】 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ P GACoS にリンクしている東大専用入口 から利用すると「UT Article Link」 (リーフレット「文献探しのヒント②」参照) ボタンが表示され、電子ジャーナルへの アクセス等に案内される。①
stomach cancer
②
選択したデータの保存・メール送信など ・File:データのダウンロード ・Citation manager:文献管理ツールへ保存 ・Clipboard: 一時保存 (ブラウザの印刷機能でまとめ印刷) ・E-Mail: メール送信③
④
クリックすると、レビュー論文 (総説)だけに絞り込み。 Filters で条件設定が可能。 (例) Humans、Review、English Filters(絞り込み) 全解除 Filters の項目 画面表示を加除■検索式の確認
検索した後、どのような検索式が実行されたかをSearch details で確認。 必要なら修正して再検索。 入力した検索語(CABG)だけで検索 されている。このようにMeSH 用語を自動 的に検索しない場合もあるので注意。 【参考: CABG(冠動脈バイパス術、coronary artery bypass graft)と入力して検索した場合】MeSH=Medical Subject Headings
米国国立医学図書館作成のシソーラス。
MeSH Terms(シソーラス用語)
MeSH に基づいて付与された、論文の内容を表す キーワード。 自動マッピング機能により、適切なものがあれば、入力した検 索語だけでなく、MeSH Terms からも自動的に検索。 データベース側で付与 したMeSH 用語(シソーラス用語)⑤
⑥
入力した「stomach cancer」だけ でなく、対応するシソーラス用語 「stomach neoplasms」でも 自動的に検索している。肉腫?
癌腫?
癌 ?
悪性腫瘍?
例
シソーラス用語をマスターしよう
論文の内容を表すキーワード。専門スタッフがシソーラス(上位語・下位語を整理した用語集)に 基づいて、統制されたキーワードを各論文に付与している。 これによって検索漏れを防ぐことや、探したい主題の論文に絞り込むことができる。 例えば、ガンに関する論文を探したい 思いついたことばだけで検索すると そのことばが論文のタイトルや抄録等 に無ければ、ヒットしない。 検索モレが生じる・・シソーラス用語(統制語)
◆上位語:腫瘍
(広義)
◆
◆下位語:乳癌
(狭義):子宮癌
:肺癌
:皮膚癌
癌
肉腫 ツリー構造 データベース提供側で各論文に シソーラス用語を付与 ↓ 検索モレの防止、多様な検索が可能に 悪性腫瘍 ひとつの概念に対して表現が 複数ある場合、表現を統一精度の高い検索が
できる!
癌腫 シソーラス用語: 癌 論 文AND 検索 OR 検索 NOT 検索
① 複数検索語の掛け合わせ
【参 考】
スペースでもAND 検索になるが、例えば egg allergy と入力するとフレーズとして認識されて検索される。 論理演算をしたい場合は、egg AND allergy と入力すると、指示が明確になる。
② 絞り込み
・Filters 機能を活用して条件を指定。文献タイプ、言語、動物/人間、性別、収録誌の種類、年齢等による 限定が可能。③ 検索項目を限定した検索
・特定の項目を対象に検索する場合は、タグをつけて検索。 ★タグ検索は自動マッピング機能は働かないため注意。 項目名 タグ 入力例 備考miyazono k[au] smith re[au](ミドルネームあり) smith r@[au](smith r だけをヒット)
著者 [au]
miyazono kohei[au] 2002 年以降ならフルネームでも検索可 所属機関 [ad] university of Tokyo[ad] 第一著者のみ
論文
タイトル [ti] stomach cancer[ti]
british medical journal[ta] The は入れない 収録誌名 [ta]
bmj[ta] 略称形も可
出版年 [dp] 2011[dp] 2009:2011[dp] 2009/09:2011/03[dp]
出版タイプ [pt] review[pt]
MeSH [mh] stomach neoplasms[mh]
④
Advanced Search
・タグを知らなくても、プルダウンメニューで検索項目を限定して検索することが可能。 ・検索履歴の掛け合わせ検索が可能。 例) #1 AND #2
⑤ 前方一致検索
・複数形のような語尾変化などに対応。★自動マッピング機能は働かないため注意。 例) bacter* ⇒bacteria 、bacterium など bacterで始まるものを検索
*もっと詳しく知りたい方は、医学図書館作成のマニュアル「PubMed の使い方」をご覧ください。
【 PubMed の効果的な検索のために 】
surgery NOT endoscopic surgery stomach cancer AND nutrition stomach cancer OR stomach ulcer stomach cancer OR stomach ulcer
① トップ画面において、「Search」のプルダウンメニューで検索対象を「MeSH」に選択。 (またはMore Resources で MeSH Database をクリック。)
② 検索語を入力し、Search ボタンをクリック。 ③ 検索結果のMeSH 用語一覧に適切なものがあれば選択して検索。
□
1~□
5 : MeSH 用語をクリックすると、上・下位語、関連語や Subheading(副標目)等が表示 されるので、適宜組み合わせをして検索することも可能。 対応するMeSH 用語へ誘導 選択したMeSH 用語の Subheadings(副標目)や ツリー構造の表示画面へ 組合せると、多様な検索が可能。○
①
○
②
○
③
Subheadings を複数選択する場合の検索方法 □1 MeSH 用語をクリック □2Subheadings を選択□3 画面右上の Add to search builder で、
Subheadings をどのように組合わせるか選択 □4 2 と 3 を繰り替えす(画面上部に検索式が表示 される、必要なら修正可) □5 Search PubMed ボタンをクリック
□
3□
4□
5 MeSH 用語の上位語・下位語表示 Stomach Neoplasms は最下位語と して位置づけられている。 選択したMeSH 用語 (例.Stomach Neoplasms) を 中 心 主 題 と す る 文 献 を PubMed で検索 選択したMeSH 用語 (例.Stomach Neoplasms) でPubMed を検索 チェックを付けなければ 下位語も自動的に検索ちょっと上級編【 MeSH 検索:シソーラス用語による検索 】
□
1□
2■番外篇
: こんな機能も
【参考】 CSLS search(PubMed に専門用語の日本語表示やクラスタリング機能等を搭載した検索システム) ⇒http://www.csls.c.u-tokyo.ac.jp/csls/index.html (東京大学教養学部附属教養教育高度化機構生命科学高度化部門が提供) 臨床医学分野の文献を、目的の テーマで短時間に検索するのに 便利です。 < アクセス > TOP⇒PubMed Tools ⇒Clinical Queries 雑誌の略称名から正式名称を 調べることができます。 < アクセス > TOP⇒More Resources⇒Journals in NCBI Databases
例) 雑誌の略称名 「Mol Cancer Res」の 正式名称を調べる
①
②
③
①
②
③
論文情報(雑誌名、巻号等) から特定の論文をピンポイント で探せます。 < アクセス > TOP⇒PubMed Tools⇒Single Citation Matcher
例) J Allergy Clin Immunol 123(1) p.3 – 11 に掲載された論文を探す 選択した雑誌名で PubMed を検索 臨床研究カテゴリー ・therapy(治療) ・diagnosis(診断) ・etiology(病因) ・prognosis(予後) ・clinical prediction guides