包括的タンパク質解析ツール
The Ultimate Protein Analysis Tool 包括的タンパク質解析ツール Technology NF-κB の解析例より システムを利用することでタンパク質解析が行える例として NF-κB の解析例を紹介いたします ベクターに p65 遺伝子をクローニングし 細胞内で発現させ
... ホタルルシフェラーゼの定量的な回収 HaloTag ® -ffLuc を発現する大腸菌 LB 培養液 50ml よりライセート上澄み 5ml を調製し（S）、HaloLink TM Resin 1ml を添加した。ルシフェラーゼの 活性は TEV を添加しても失活しないこと（S-TEV）、また効率よくレジン に捕捉できたことが示された（ FT）。室温で 1 時間かけて標的タンパク質 を捕捉後 HaloLink ...
20
時系列データ解析ツール Oscope Professional「音質評価パック」
... 「Oscope Professional 音質評価パック」は、時系列データ解析ツールOscope Professionalをベースに、 音質パラメータ演算機能、収録機能、周波数演算機能、統計演算機能などを搭載。 これにより、ラウドネス、シャープネスといった音質パラメータの算出、FFT解析やオクターブ解析、 ...
6
一般に医薬品は標的タンパク質に結合する事によりその薬効 ( 効き目 ) を発現する ( 図 1) 近年タンパク質の発現 精製技術の進歩 ならびに X 線 NMR 等の構造解析技術の発達により 構造解析されるタンパク質の数が大変な勢いで増加している ( 図 2) タンパク質の構造情報を基に医薬品化合物
... ABINIT-MP による真空中の FMO 計算でドッキングモードを予測したところ、8 種類のリガンドの うち 5 種類のリガンドの結合モードを予測することができた。また、16 種類の LCK- リガンド複合体 における MP2/6-31G* の FMO 計算では、活性と FMO で求めた相互作用エネルギーの間に良好な相 関が得られた。これらは FMO 法の有用性と信頼性を示すものである。水中 MD と FMO を組み合わ ...
8
大腸癌においてWntシグナル経路により発現制御されるインターフェロン誘導タンパク質の解析
... 【方法】 1. qRT-PCR IFIT1、IFIT2、IFIT3、IFIT5 特異的な PCR プライマーを作製し、 β-catenin またはコントロール siRNA で 48 時間処理した大腸癌細胞株 SW480、HCT116 から RNA を抽出して作製した cDNA を鋳型として、 real-time PCR を行った。対照としては、GAPDH 遺伝子の発現を用いた。 ...
4
デザイン解析およびフロアプラン チュートリアル : PlanAhead ツール (UG676)
... このチュートリアルでは、PlanAhead ツールを使用して、インプリメンテーション ツールを実行する前に合成済みの デザインとターゲット デバイスを確認および解析しました。これにより、潜在的な問題やエラーを、インプリメンテー ション中ではなく、デザイン サイクルの早期段階で発見できました。また、デザイン リソースの概算、デザイン ルー ...
55
マウス神経発生における低分子量Gタンパク質Arl8bの機能解析
... 2. Arl8b ノックアウトマウスは神経隆起と蓋板の発生に異常を呈する Arl8b ノックアウトマウスで異常の観察された脳背側領域の構造体は、神経管 の蓋板領域から発達して形成される。 Arl8b ノックアウトマウスでは対照マウス と比較して、胎生 10.5 日目で蓋板の細胞死が減少し、Sox1 や Sox9 などの蓋板 に特徴的なパターンを示す遺伝子発現に異常が生じていた。これらの知見から、 Arl8b ...
2
成長円錐ラメリポディア領域におけるアクチン結合タンパク質fascinの観察と解析
... 内容記述 この博士論文は内容の要約のみの公開（または一部 非公開）になっています year 2019 その他のタイトル 成長円錐ラメリポディア領域におけるアクチン結合 タンパク質fascinの観察と解析 ...
23
黄色ブドウ球菌の表層タンパク質Skipの発現制御機構の解析
... MALDI-TOF/MS 解析により，黄色ブドウ球菌のグローバル制御因子の一つである MgrA (Multiple gene regulator A) と同定された。さらに，Skip 非発現株において mgrA を相 同組換え法により欠損させたところ，Skip の発現が顕著に増大した。また， sarT , sarU 及 び skip の発現の変化を比較したところ， mgrA 欠損株では sarT , sarU 及び ...
2
赤痢アメーバの新規βバレル型マイトソーム外膜タンパク質の解析
... 審 査 の 要 旨 筆者は、配列の類似度解析のみによっては検出できない新たな β-barrel型膜タンパク質(EhMBOMP30)を、構造 モチーフに注目した解析によって検出し、その二次構造を実験的に検証するとともに、詳細な生化学的・分子細胞生 物学的実験手法を用いて当該タンパク質の特徴づけを行った。 ...
3
世界初、ナノ"サクラ"でタンパク質・RNAを数秒解析 研究活動 | 研究／産学官連携
... 【研究の内容】 今回の研究では、 直径 10nm 程度のナノスケールの棒 （ワイヤ） をサクラの樹のよう に構築し、そのナノ ” サクラ ” が形成する空隙がタンパク質・ RNA と同程度の大きさを 持つことを発見しました。 このナノ ” サクラ ” を利用することによって、 タンパク質 ・ RNA をわずか数秒で分離（従来技術：数十時間）することに成功しました。 ...
2
新しいタンパク質間相互作用のツール 生きた細胞で リアルタイムなタンパク質間相互作用を観察できます 従来法に比べ 系の構築が簡単です 反応が可逆的で阻害剤のスクリーニングに最適です Fluoppi (Fluorescent based technology detecting Protein-Pro
... Keima-Red ◎マイトファジーの研究ツールとして、蛍光タンパク質 Kiema-Red が注目されています。 マイトファジーとは、オートファジーを介したミトコンドリアの選択的分解機構であ り、古くなったミトコンドリアの代謝に関与しているとされます。これにより、ミト コンドリア機能障害が関与する疾患から生体を防御すると考えられています。マイト ...
20
研究者を笑顔にするウェスタン解析ツール Changing the face of westerns ウェスタンブロッティング解析ワークフロー Complete, innovative western workflow solutions
... Detect – タンパク質の検出 – • iBind ™ Western System ：ウェスタン解析の抗体反応を自 動化したシステムです。最初に抗体液・洗浄液をセットした ら、あとは 2.5 時間静置して待つだけです。また、システム は外部電源の必要がなく、実験室のどこでも使えて全くの 無音で反応が進みます。さらにマニュアル法よりもクリア で感度・再現性に優れたデータが得られます。 ...
16
建物全体の解析のためのWebサービスツール スタートアップガイド
... 4 http://www.autodesk.co.jp/ecotect-analysis はじめに Autodesk Ecotect Analysis 2011 は、企画から詳細までの包括的なサステナブルデザイン解析ツ ールで、デスクトップおよび Web サービスプラットフォームを使って、シミュレーションや解析の幅広 い機能を提供します。強力な Web ...
26
ECU キャリブレーション 測定 キャリブレーションから診断まで 幅広いタスクを効率化するベクターソリューション 包括的なツールサポートで ECU キャリブレーションを簡単に ECU キャリブレーション用の万能ツール CANape なら あらゆるタスク に対応できます ECU ECU Develop
... して利用しているそうです。 排ガス規制対応建機の開発を 予定通り完了 石河氏は、 「 CANape 」の導入でもたらされた もっとも大きな成果は、多数の「 Tier4 Interim 」 対応の開発の中で、予定通りに ECU 開発を完 了することが出きたことだと述べています。 「 CANape を導入したことにより、複雑に絡み 合った問題の要因を解析・特定する力が向上し ました。これは開発をスケジュール通り進めて ...
60
アルファテック ( ビージェーソフト ) 製品 FlexNet ライセンスログ解析ツール ユーザガイド 本書は アルファテック ( ビージェーソフト ) 製品の FlexNet ネットワークライセンス使用ユーザ向けのライセンスログ解析ツールのユーザガイドです
... 追加プロパティの表示 チェックを入力すると設定ファイルの選択が可能になります。 設定ファイルを指定することで「対象ユーザ」項目にプロパティを表示することが可能となります。 プロパティ情報は絞り込みユーザの情報を目安として表示することだけが目的となります。 この情報が解析のグラフに影響を与えることはありません。また、反映させることもできません。 設定ファイル(.csv)はユーザ様にて事前に準備して頂く必要があります。 ...
26
「IBM SPSS Statistics_統計解析ツールの基本操作 データ分析手法」
... 9. 質的データと量的データ間の関係性 : t 検定 ST5Z7 IBM SPSS Statistics 基礎統計 IBM SPSS Statistics 予測のための回帰・ロジスティック回帰分析 ■ 受 講 料 ■ 期 間 ■ 対 象 者 ■ 前提条件 ...
2
プロテオミクス解析の分析技術 プロテオーム解析概論 平野久 本年後半の入門講座は, プロテオミクス解析の分析技術 と題して, タンパク質の構造や機能の解析を行っておられる方々にご執筆いただきました タンパク質や, プロテオミクスになじみのうすい読者があることも想定して, プロテオミクスの基礎から,
... 6 プロテオーム解析のこれから プロテオーム研究は，プロテオームを構成するすべて のタンパク質を同定し，その機能を解明することを究極 の目的としている。多くのタンパク質の機能が明らかに され，それらの機能的なつながりが解明されれば，複雑 な生体機能を包括的に理解できるようになるであろう。 また，フォーカストプロテオーム解析によって，たとえ ...
6
α1,3-フコース転移酵素9ノックアウトマウスを用いた糖鎖および糖タンパク質の網羅的な解析
... 次にルイス型フコースを持つ糖鎖を結合しているキャリア蛋白質を同定するため、AAL(+)糖鎖ペ プチドを IGOT-LC/MS 法で解析した。さらに、新規に開発したグライコプロテオミクス解析法を用 いて、ルイス x キャリアを選別、同定した。その結果、野生型マウス腎臓では、32 種類の糖蛋白質 （51 個の糖鎖付加部位）の内 24 種類（42 個の糖鎖付加部位）がルイス x 構造を含み、その内 21 個は ...
4
α1,3-フコース転移酵素9ノックアウトマウスを用いた糖鎖および糖タンパク質の網羅的な解析
... Plausible combinations of a core peptide and glycan compositions of each glycopeptide cluster were predicted using the following simple equation and a set of three mass lists using in-[r] ...
65
プロテアソーム相互作用タンパク質Ecm29の解析
... 次にストレス応答性を解析した。 Ecm29遺伝子欠損マウスから胎児線維芽細胞を単離し、過 酸化水素に対する感受性試験を行った。その結果、 Ecm29遺伝子欠損細胞は野生型よりも高い 生存率を示すことが明らかになった。この生存率の向上の原因を解明するために、細胞抽出液を 密度勾配遠心法によって分画し、酸化ストレス誘導下でのプロテアソームの構成サブユニットを 比較した。その結果、野生型では酸化ストレス処理下で ...
3