分子機能分類によるエンリッチメント解析
分子動力学法によるポリマー内部分子構造のモデル化と変形挙動解析
... 結合長の微小変化 による変形吸収，(2) 結合角の微小変化による変形吸収，(3)2 面角の微小変化による応 力緩和，というメカニズムにより線形弾性応答を示すこと，また，その後は一定応力 下で変形が進行する降伏挙動があり，引張後期に応力が急増すること，などが明らか となった．また，内部分子鎖構造変化の詳細な観察により，降伏⇒硬化過程では分子 ...
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実験心理学からみた機能的磁気共鳴画像法（fMRI）による脳画像解析
... 脳血流でみる脳活動 さて，NCCを評価する理想的なインデックスは脳の ニューロン集団の電気活動を脳皮質から直接とらえるこ とである。しかし，それはヒトの場合倫理的な理由から 不可能である。脳波のメリットは，頭骨を介した雑音の 混入した集合電位ではあっても，脳の電気活動を見てい るところにある。一方，脳のニューロン集合の活動を， それを支える血流によって間接的に捉える方法がある。 脳が正常にはたらくには，その神経系を形成するニュー ...
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機能性ペプチドによるβシート形成のための分子設計戦略
... シーケンスモデルを元に、新しいペプチドβシートの設計デザインを行った研究経緯について記されて いる。第２章ではペプチド合成について概説されている。ペプチドの合成は、液相合成と固相合成の 2 つ に大別できるが、固相合成法において、Boc 基や Fmoc 基と呼ばれる代表的な保護基を有するアミノ酸を 順次結合することで目的のシーケンスや長さのペプチドの合成について記述されている。本博士論文で は、18 ...
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膵β細胞機能における小胞体ストレスの役割の検討 : XBP-1および関連分子の解析
... 1. アデノウイルスを用いてXBP-1sを過剰発現させたMIN6細胞を用いて解析を行った。 XBP-1s過剰発現MIN6細胞ではインスリン遺伝子の発現低下を認め、グルコース応答 性のインスリン分泌を検討したこところ、 1wellあたりのインスリン分泌量およびイン スリン含量が低下していた。 ...
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間葉系幹細胞の新規マーカー分子メフリンの同定と機能解析 研究活動 | 研究／産学官連携
... また 研究 プ メフ ン 間葉系幹細胞 未分化 状態 維持す た 機能 す 培養細胞 ノッ アウト ウス 用いた実験系 示しました メフ ン 発見 未分化 間葉系幹細胞 効率的 採取や 間葉系幹細胞 関わ 疾患 機序 解明 さ 各種細胞療法 機序 解明 役立 可能性 あ ます ...
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小脳プルキンエ細胞におけるmTORシグナルの機能解析
... 1. L7-mTOR Tg マウスの小脳からタンパク質懸濁液を調整し、小脳における活性型 mTOR の発現時期をウェスタンブロットにより調べた。その結果、2 週齢から 4 週齢に おいて、活性型 mTOR が多く発現してることが確認された。次に、4 週齢の L7-mTOR Tg マウスの小脳において、mTORC1 シグナルの亢進を抗リン酸化 S6 抗体による蛍光 免疫組織染色により検証した。 Control ...
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リボソームアッセンブリーにおけるrRNAメチル化修飾の機能解析
... と相互作用しているが、RlmE による 2’-O メチル化 修飾は、U2552 のリボースのコンフォメーションを C3’endo 型へと傾けさせるため、U2552-C2556-U1955 の base triple の形成を促進させる効果がある（図 9）。その結果、H71 と H92 が会合し、隣接する H89 や H91 を含めた 近傍の構造を安定化すると考えられる（図 10）。H89 と H91 は L36 ...
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トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析
... 論 文 の 要 旨 トマトは世界中で栽培されている付加価値の高い野菜類の一つである。肥料投与量や栽培環境の最適化を 行っても、生育促進や果実収量増加の向上には限界があるため、植物ホルモンの投与が併用されることが多 い。数ある植物ホルモンの中で、オーキシンおよびジベレリンがトマト栽培の現場において主に利用されて おり、オーキシンおよびジベレリンを介した応答性遺伝子の制御には SlIAA9 および SlDELLA が大きく関わる ...
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ミクログリアにおけるMafBの機能解析
... ミクログリアは中枢神経系に存在する組織マクロファージである。近年の Fate mapping によって、 ミクログリアは、造血幹細胞由来のマクロファージとは発生系譜が異なり、卵黄嚢由来であることが明 らかになっている。また、特有の遺伝子発現プロファイルを示しており、独自の分子ネットワークが形 成されていることが示唆されている。granulocyte-macrophage colony-stimulating factor ...
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ミクログリアにおけるMafBの機能解析
... ンスクリプトーム解析でも、ミクログリアは、他の組織マクロファージとは異 なった特有の遺伝子発現プロファイルを示しており、独自の分子ネットワーク が 形 成 さ れ て い る こ と が 示 唆 さ れ る 。 granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF) は骨髄球系細胞の分化に関わるサイトカ ...
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学位論文 Doctoral Thesis 口腔扁平上皮癌における癌幹細胞関連分子 Nucleostemin, Notch1 の発現と機能解析 (Investigation of the expression of cancer stem cell related molecules, Nucleos
... 【方法】種々の口腔扁平上皮組織標本を用いて Nucleostemin と Ki-67 の免疫染色 を行った。次に OSCC 培養細胞株における Nucleostemin の発現を確認し、OSCC 培養細胞株 SAS 細胞に siRNA を導入して機能解析を行なった。また、Ca2 + 依存 的な培養細胞の角化誘導実験を行い、OSCC 培養細胞の分化と Nucleostemin の関 係を検討した。Notch1 ...
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R による統計解析入門
... 修正や使いまわしが簡単，保存しておけるメリット大 どちらというのではなく，両方を併用するのが効率的なやり方 ここからしばらくは，コンソールを使った対話的なやり方で説明します。 R Console について Windows, Mac どちらも統合環境として GUI 端末に 加えて簡単なエディタも備わっているので，小規模な処理には使い やすい。 Unix 用は端末機能のみで，エディタはユーザーの好みで という発想。 ...
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胃癌におけるUc.160+の発現・機能解析
... microRNA による制御と DNA メチル化による制御の二通りの機構が存在することが知られて いる。近年の研究から、T-UCR が疾患特異的な発現パターンを示し、いくつかの T-UCR がが んにおいて発現異常を示すことが報告されている。このことから T-UCR ががん関連遺伝子とし て機能することが示唆されているが、がんにおける T-UCR の詳細な発現調節機構や生物学的な ...
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共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... 方法 • 研究項目として、検出するターゲットは PROSITE, Pfamから 得ることのできる 機能ドメインと機能モチーフに対象を絞る 。 • 共起関係は１対１ の関係に絞って解析手法を確立する。 ...
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マウス神経発生における低分子量Gタンパク質Arl8bの機能解析
... 哺乳動物には Arl8a と Arl8b の 2 種類のアイソフォームが存在するが、 「マウ ス神経発生における低分子量 G タンパク質 Arl8b の機能解析」と題した本論文 では、Arl8b ノックアウトマウスの表現型解析を行っている。その結果、Arl8b が初期胚において Bmp シグナルの制御を介した脳神経発生に重要であることを 見出した。 ...
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Ni基超合金微細析出構造における転位の分子動力学解析
... 2 第 1 章 緒 論 た有限要素解析 (4), (5) や，界面近傍の転位蓄積に関する有限要素解析 (6) など界面近傍 の微視的挙動に着目した解析的アプローチもなされている．一方，界面が微小になる につれて，界面の原子構造など原子レベルの物性が無視できなくなると考えられるが， 連続体近似に基づく解析ではその影響を考慮することはできない．特に，界面近傍の ...
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第一原理分子動力学法による理想格子不安定解析
... 近年の計算機能力の飛躍的な向上を背景に，分子動力学法をはじめとする原子シミュ レーションによる変形破壊現象の解明が盛んに行われている (1) ．従来から行われてい る，原子間相互作用を簡略化したポテンシャル関数により表す古典的分子動力学法で は，すでに 10 億もの原子の集団的挙動を追跡することが可能となっている (2) −(4) ．し ...
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肺腺がんにおけるmiR-26a機能解析
... 26 3. 結果 3.1 26 種類のヒト肺腺がん由来細胞株における miRNA と mRNA の発現解析 次世代シークエンサーHiSeq2500 を用いて、26 種類のヒト肺腺がん由来 細胞株における small RNA 発現解析を行った。トータルで 1,341 種類の small RNA 発現を解析し、発現レベルを ppm(parts per million)の単位で評 ...
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共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... • タンパク質に存在するドメイン・モチーフの情報はPROSITEから得 た。 • 元々価値の高いドメインやファミリー同士の共起関係だけでなく、情報と して価値の低い機能サイトとの共起関係についてなども同時に検証す ...
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脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析
... 34 4.2.5 PLIN1a/1c 発現ベクターによる 強制過剰発現の確認 12-well plate に Y-1 を 1.0 x 10 5 個/well で播種し、翌日 Lipofectamine® 2000 Transfection Reagent (Thermo Fisher) 2 μl/well を用いて、手順書に 従い、インサートを挿入していないコントロールベクター (Gateway™ pEF- DEST51 ...
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