分子モデル
3Dプリンタ用の分子モデルの設計と作成
... - 12 - エタンを描画するコマンドによる OpenSCAD 言語のプ ログラムを F6 キーでコンパイルすると、Fig.4 のように 3D 分子モデルが描画される。これに対して 3D プリンタ 用の STL ファイルをメニュー[Design]で保存する。これで、 エタン分子のプリンタ用データの完成である。 ...
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ん細胞の標的分子の遺伝子に高い頻度で変異が起きています その結果 標的分子の特定のアミノ酸が別のアミノ酸へと置き換わることで分子標的療法剤の標的分子への結合が阻害されて がん細胞が薬剤耐性を獲得します この病態を克服するためには 標的分子に遺伝子変異を持つモデル細胞を樹立して そのモデル細胞系を用い
... CRISPR/Cas9 によるゲノム編集技術を用いた 白血病細胞への分子標的療法剤に対する耐性遺伝子変異の導入 ―新規治療薬を開発するためのモデル細胞系の樹立方法の確立－ 山梨大学医学部小児科学講座の玉井望雅と犬飼岳史准教授らの研究グループは、筑波大学お よび大阪大学との共同研究で、 CRISPR/Cas9 によるゲノム編集技術を用いて白血病細胞株に薬 ...
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非平衡条件下で発動するDNA分子の折りたたみ/解きほぐし振動 (反応拡散系 : 生物・化学における現象とモデル)
... 凝縮状態とコイル状態との問にある不連続転移 ( 折りたたみ転移 ) の臨界領域 近傍の条件を利用した。 $\mathrm{P}\mathrm{E}\mathrm{c}(\mathrm{p}\mathrm{o}[\mathrm{y}(\mathrm{E}\mathrm{t}\mathrm{y}\mathrm{l}\mathrm{e}\Pi ...
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JAIST Repository: モデル膜による分子ストレスセンシング
... ３．研究の方法 Research Plan and Method Outline 1 Using biomimetic membrane systems I planned to study i the interaction of amyloid beta with the membrane systems, interms of localization of th[r] ...
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分子構造変化のモデル化と反応速度の理論的解析 (計算機科学基礎理論とその応用)
... ミュレーションモデルを作成し, 化学実験の結果と比 較することにより , 我々の試みの正当性を検証する . また , この複雑なシミュレーションモデルに対する理 論的解析の第一歩として, 構造に制約を加えることに ...
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分子論モデル方程式の化学反応性複雑気流への適用(混合、化学反応、燃焼の流体力学)
... こではそれに着目し、 簡易化モデルの構築や適用性の検討を行い、 その解析法を確立するこ とを目指している。 ここでは化学反応を伴う複雑な流れの解析法として実用性の高い簡易な モデルを構築してこれに適用しようとすることにある。 化学反応項をボルツマン方程式やそのモデル方程式に取り入れる考え方自体は、 すでに ...
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3分子反応系の数理モデル : その背景と意義 (散逸系の数理 : パターンを表現する漸近解の構成)
... る。 Brusselator は当初は Belousov-Zhabotinsky 反応のモデルとして提案されたものであるが、 Prigogine の率いる Brussels スクールを中心に徹底的な検討が行われ、 化学反応系の散逸構造論や 非線形ダイナミックスの理解に著しい貢献をした数理モデルである。 この半世紀の流れを大きく 捉えると、「何でも出てくる」 びっくり箱のような数理モデルの骨格 ...
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魚の再生ウロコにおけるコラーゲン分子の積層過程に対する偏微分方程式モデル (第11回生物数学の理論とその応用)
... 準静的場の方程式 : (3b) $\{\begin{array}{ll}0=e\frac{\partial^{2}\phi}{\partial z^{2}}-\sqrt{p_{x}^{2}+p_{y}^{2}+p_{z}^{2}}, 0=f\frac{\partial^{2}\psi_{x}}{\partial z^{2}}+\frac{\partial p_{y}}{\partial z}, ...
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分子集団研究系 分子研リポート1998 | 分子科学研究所
... b) 液晶における反強誘電秩序の微視的起源を明らかにするために 13 C NMR による実験研究を行った。 その結果， 極 性分子間の双極子相互作用による安定化を実現するうえで有利に作用する分子構造（いわゆる屈曲鎖モデル）が 液晶状態で実現していることを立証した。また，回転系二重共鳴における過渡的磁化振動構造から，キラル中心 ...
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分子動力学法によるポリマー内部分子構造のモデル化と変形挙動解析
... 要 約 高分子材料は，内部に無秩序に存在する高分子鎖のからみ点数の変化や分子鎖セグメ ントの回転といった微視的構造変化に依存して複雑な変形挙動を示す．本研究では， 不規則かつ長い高分子鎖の変形挙動について，原子レベルから新たな知見を得ること を目的として，ポリエチレンを対象とした種々の分子動力学シミュレーションを行っ た．まず，200 万の粒子数からなる非晶性ポリエチレンナノ試験片を用いた引張シミュ ...
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分子進化モデルと最尤系統推定法 東北大 院 生命科学田邉晶史
... ● コドン置換モデル 同義置換と非同義置換を区別してそれぞれに異なるモデルを適用した上 で同義置換 /非同義置換速度比を導入したモデル．今後，モデルの改善と 優れた実装ソフトウェアが登場すればタンパクコード領域データの解析で 主流になると思われる． ...
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モデルを利用した分子の対称性学習ソフト
... 今回 ,さ らにモデル を展 開 し ,対 称操作 と対称性 の理解 にふ さわ しいモデル について と ,表 現行列 に 関す るプログラムについて報告す る。 2.対 称性 の学習のためのモデル 対称性の学習における初めの段階 として ,学 習者 は出題 されたモデルか ら対称操作 を見つ けてその 対称性 を判断す る。そのため出題者 は対称性にふ さ わ しい[r] ...
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二次元分子表現と三次元分子表現を用いたQSAR/QSPRモデルの予測能力の比較
... 3D 分子表現である。構造は OpenEye 社の立 体配座生成プログラム OMEGA により生成する。 構造の重なりは ROCS を用いて定量的に評価した。 参照化合物の立体配座は、 OMEGA によって生成 された初期構造のセットから、 MMFF94s 力場に 基づくエネルギーが最小化となる構造とした。参 照化合物に対する重なりは、 TanimotoCombo スコ ...
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モデルポテンシャルによるビクスバイト型酸化物と転位芯の分子動力学シミュレーション
... 要約 酸化物分散強化鋼 (ODS 鋼) は，原子炉被覆管材の有力な候補として期待されてい る．ODS 鋼中には酸化物が微細なナノクラスターとして存在し，転位の自由な運動を 妨げることで強度が高められていると考えられているが，試験観察が困難であるため その詳細は不明である．本研究では bixbyte 型酸化物と，らせん転位または刃状転位を 導入した bcc-Fe に，せん断を与えることで転位を酸化物に接近させるシミュレーショ ...
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気道上皮細胞のウィルス感染モデルにおけるINF-γのムチン分泌制御の分子基盤
... （２ 新潟大学大学院医歯学 合研究科小児 科学） ウイルス感染は気管支喘息などの慢性気道炎症性疾患 における主要な増悪因子であり, 気道内の過剰粘液産生 の原因となる.我々はこれまでヒト気道上皮細胞株NCI- H292に て, ウ イ ル ス 感 染 モ デ ル で あ る 合 成 dsRNA (Poly I : C) 刺激が, TGF-αによる気道内の主要ムチン MUC5AC 遺伝子の発現を相乗的に増強することを報告 してきた (J ...
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指数型混合則を用いた正則溶液モデルによる極性分子含む混合物の気液平衡の相関
... 理想溶液あるいは相互作用の弱い溶液のモル混合 Gibbs エネルギー ΔGm M と組成の関係は、 下に凸のカー ブで表される。一方、相分離を生ずるような相互作用 の強い無極性分子＋極性分子の混合物の ΔGm M と組成 のカーブは複雑な形を示し、少なくとも 2 点の変曲点 を有し、次式で表される 2) 。 ...
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指数型混合則を用いた正則溶液モデルによる極性分子含む混合物の気液平衡の相関
... った 19, 20) 。標準沸点は純物質の基本物性のひ とつであり、多くの物質について正確な値が 求められているので、使用には便利と考えら れる。一方、branching ratio に枝分れ鎖の結合 位置を識別する因子を導入して、分子構造の 知見からの予測を可能にする新しいパラメー タの考案も重要である。 ...
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アニオン重合初期反応系モデルとしての金属-分子クラスターの幾何・電子構造の研究
... [9】 美膏津文典､大下慶次郎､角山寛規､古屋亜理､大野公一 アルカリ金属原子_ビニル化合物系の気相クラスター内電子移動誘起化学反応 化学系7学協会連合東北地方大会 鶴岡 2001年9月 2pA25 (ポスター) [10] 美膏津文典､大下慶次郎､古橋匡幸､大野公一 サイズ選別負イオン光電子分光法による金属-分子クラスターの幾何･電子構造の 研究 化学系7学協会連合東北[r] ...
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分子擬態と自己免疫疾患の数理モデル (第9回生物数学の理論とその応用)
... つかあり、 (1) 制御性 $T$ 細胞が異常を起こす (2) ネガティブセレクションで異常が起きる (3) 分子擬態などである。分子擬態とは、病原体が宿主分子と類似した蛋白や炭水化物を発 現することである。 原因と考えられているものは他にもあるが、 多くの自己免疫疾患の発症 原因は分かっていないものの方が多い。 本研究では、 ウイルス由来の抗原が体内で突然変異 ...
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分子構造研究系 分子研リポート2004 | 分子科学研究所
... a) ナノスケール磁性薄膜は垂直磁化や巨大磁気抵抗などの興味深い磁気特性を示し， 基礎科学的にも応用的な見地か らも広く研究が行われている。 特に， 薄膜表面を分子吸着などで化学的に修飾することで磁気特性が劇的に改質さ れること （例えば， スピン再配列転移が生じるなど） に注目し， 磁気光学 K err 効果 （ M OK E ） やＸ線磁気円二色性法 （X MC D ） により検討を行っている。 今年度は， MOK E ...
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