共起関係解析によるタンパク質の
共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... 目的 • 非常に多くのゲノム・プロテオームに関する情報の集積体（データ ベース）が構築されている。 • 疾病関連遺伝子やタンパク質の機能を示すドメインやモチーフ、薬剤 などの相互作用部位を現すリガンド相互作用サイト、タンパク質-タン パク質相互作用サイトなどが挙げられる。 ...
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共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... 方法 • 研究項目として、検出するターゲットは PROSITE, Pfamから 得ることのできる 機能ドメインと機能モチーフに対象を絞る 。 • 共起関係は１対１ の関係に絞って解析手法を確立する。 ...
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大腸癌においてWntシグナル経路により発現制御されるインターフェロン誘導タンパク質の解析
... -20/+20 の 領域を調節しているのか明らかにするために、すべての IRF メンバーの発現プラスミドを作製し、 pGL3-IFIT2-20/+16 と pGL3-IFIT2+20/+169 のレポーター活性に対する IRF1～9 の影響を検討した。その結 果、 IRF1、3、6 および 7 の過剰発現はそれぞれ 25 倍、31 倍、8 ...
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トマト相関ネットワーク内のSlHSP70-1、SlIAA9およびSlDELLAにおける相関関係に着目した遺伝子間共発現解析によるSlHSP70-1の機能解析
... トの公共マイクロアレイデータを用いた遺伝子共発現ネットワーク解析を行った。次に、各ネットワーク内 の近傍遺伝子に対し、遺伝子オントロジー (GO) 解析を行った。 SlIAA9 ネットワークでは、GO で定義された 用語である GO term が 18 個ハイライトされ、その term は多岐にわたっていた。その一方で、 SlDELLA ネッ トワーク内での GO ...
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定量的標的プロテオミクスによる血中タンパク質の病態変動 解析に基づく膵臓癌早期診断法の開発 ( 要約 ) 東北大学大学院薬学研究科 生命薬科学専攻 米山敏広
... IGFBP3 の発症前検体の診断に対する有効性を検証するため、多目的コホート研 究の約 20 年間の追跡調査期間中に膵臓癌を発症した患者 170 例および対照 340 例 の膵臓癌発症前検体の定量解析を行った。その結果、採血から膵臓癌の診断までの 期間が短期間 (7 ...
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1 研究開発のねらい 糖鎖は 細胞表面のタンパク質や脂質に結合し 血液型の決定 細胞接着 抗原抗体反応 ウイルス感染などの生体反応で重要な役割を果たす生体分子である 糖鎖による多様な生物学的機能のうち 糖鎖結合タンパク質による糖鎖の特異的認識があり 糖鎖 - タンパク質間の相互作用の解析に糖鎖アレイ
... - ２ - §１ 研究開発のねらい 糖鎖は、細胞表面のタンパク質や脂質に結合し、血液型の決定、細胞接着、抗原抗体反応、ウ イルス感染などの生体反応で重要な役割を果たす生体分子である。糖鎖による多様な生物学的 機能のうち、糖鎖結合タンパク質による糖鎖の特異的認識があり、糖鎖 ...
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一般に医薬品は標的タンパク質に結合する事によりその薬効 ( 効き目 ) を発現する ( 図 1) 近年タンパク質の発現 精製技術の進歩 ならびに X 線 NMR 等の構造解析技術の発達により 構造解析されるタンパク質の数が大変な勢いで増加している ( 図 2) タンパク質の構造情報を基に医薬品化合物
... ABINIT-MP による真空中の FMO 計算でドッキングモードを予測したところ、8 種類のリガンドの うち 5 種類のリガンドの結合モードを予測することができた。また、16 種類の LCK- リガンド複合体 における MP2/6-31G* の FMO 計算では、活性と FMO ...
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プロテオミクス解析の分析技術 プロテオーム解析概論 平野久 本年後半の入門講座は, プロテオミクス解析の分析技術 と題して, タンパク質の構造や機能の解析を行っておられる方々にご執筆いただきました タンパク質や, プロテオミクスになじみのうすい読者があることも想定して, プロテオミクスの基礎から,
... プロテオーム研究は，プロテオームを構成するすべて のタンパク質を同定し，その機能を解明することを究極 の目的としている。多くのタンパク質の機能が明らかに され，それらの機能的なつながりが解明されれば，複雑 な生体機能を包括的に理解できるようになるであろう。 また，フォーカストプロテオーム解析によって，たとえ ...
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The Ultimate Protein Analysis Tool 包括的タンパク質解析ツール Technology NF-κB の解析例より システムを利用することでタンパク質解析が行える例として NF-κB の解析例を紹介いたします ベクターに p65 遺伝子をクローニングし 細胞内で発現させ
... 細胞の固定後のイメージング HeLa 細胞に p65-HaloTag ® 融合タンパク質をコードするプラスミドを トランジェントにトランスフェクションし、発現した p65-HaloTag ® 融 合タンパク質を 5µM HaloTag ® TMR Ligand で 37℃、15 分間標識した。 細胞は 3.7% パラホルムアルデヒドで固定した後、1µg/ml mouse Anti- ...
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極小の発光タグ HiBiT 実験特集 2017 年秋号 Promega KAWARABAN NanoLuc 8 NanoLuc NanoLuc RNA ID NanoLuc 頁 発光タグ HiBiT によるタンパク質発現解析新時代の幕開け 4 頁 HiBiT
... ルシフェラーゼ遺伝子を応用した分泌タンパク質の解析 NanoLuc ® ユーザーセミナー プロメガ HiBiT 検索 私は細胞内タンパク質の細胞内ダイナミクスに興味があり、細胞内あるいは細胞内から細胞外への各タンパク質の 動態を様々なスクリーニング系を用いて解析を行っています。その中でも IL1 β ...
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熊本大学学術リポジトリ Kumamoto University Repositor Title 融合プロテオミクスによる NF1 腫瘍抑制タンパク質の神経 系細胞内発現抑制を介した異常シグナル分子群の解析 Author(s) 平山, 未央 Citation Issue date
... IC2、GR、COX-1 の発現変動を含む一連のシグナルネットワークが検出さ れ、これらの分子相互作用が重要であることが推測された。次に NF1 病態モデル細胞にお いて Dynein IC2、GR、COX-1 の発現亢進をウエスタンブロット法で確認し、GR アンタゴ ニスト、Dynein IC2 siRNA、COX-1 siRNA ...
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α1,3-フコース転移酵素9ノックアウトマウスを用いた糖鎖および糖タンパク質の網羅的な解析
... (結果) トリプシン分解後に Amide 80 カラムを用いて HILIC (hydrophilic interaction chromatography）法に より精製した野生型マウス腎臓由来の糖ペプチドには、多数のルイス型フコシル化糖鎖が見出され、 Fut9 ノックアウトマウスの腎臓でルイス x 構造が消失していた。従って、ルイス x 構造は腎臓で広 範に存在することが明らかになった。 ...
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加藤晃一 ( 教授 )(2008 年 4 月 1 日着任 ) A-1) 専門領域 : 構造生物学, タンパク質科学, 糖鎖生物学,NMR 分光学 A-2) 研究課題 : a) NMR 分光法をはじめとする物理化学的手法による複合糖質およびタンパク質の構造 ダイナミクス 相互作用の解析 b) 生化学
... 矢木真穂, 「NMR 法を用いたアミロイドβの構造研究」, 第４回「アルツハイマー病診断・治療薬創出に向けた革新的探索系 構築に関する研究会」, 大府, 2013年 6月. 加藤晃一, 「立体構造からみた糖鎖の不均一性」, 第３２回 日本糖質学会年会, 大阪, 2013年 8月. 山口拓実，加藤晃一, 「NMR ...
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世界初、ナノ"サクラ"でタンパク質・RNAを数秒解析 研究活動 | 研究／産学官連携
... 【成果の意義】 本技術を展開することによって、健康・疾病等に関連するタンパク質・ RNA を超高 速で解析することが可能となり、 我々の安心・安全を見守る科学技術へと発展すること が期待されます。 ...
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出芽酵母の高浸透圧応答HOG経路に関与する新規足場タンパク質Ahk1の同定と機能解析
... 本研究は、機能未知のタンパク質 Ydl073w = Ahk1 が HKR1 副支経路ではたらくシ グナル因子 Hkr1, Sho1, Ste11, Pbs2 と結合し、HOG 経路の足場タンパク質として機 能することを初めて示したものである。 HOG 経路ではこれまで Pbs2 MAPKK が Sho1, Ste11, Hog1 ...
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コンビナトリアル・ヒスチジン・スキャニングによるタンパク質間相互作用のpH感受性変換
... 第３章「コンビナトリアル・スクリーニング」では、前記ライブライを用いたスクリー ニングの実験方法と実験結果について述べられている。複数回のセレクション操作を通し て配列の収束を確認し、その収束配列群の各部位のアミノ酸出現頻度解析から、pH感受性 変換に効果的な部位を推定し、3か所を特定した旨が記されている。 ...
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タンパク質受託解析カタログ
... 二次元電気泳動におけるスポットの変化は、タンパク質の存在量 の変化だけを示すものではありません。リン酸化などの翻訳後 修飾や部分的切断によってタンパク質の等電点と分子量が変化 し、結果的にスポットの座標や濃度の変化として観察されます。 二次元電気泳動分析では、遺伝子解析では得られない情報にも ...
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[PDF] 蛍光タンパク質FRETプローブを用いたアポトーシスのタイムラプス解析
... 35mm デッシュ中 5 つのポイントを、40 倍の対物レンズを用いて、2 分毎のタイムラプス測定を行った。そのうちの視 野 1 に関して 1hr26min から 1hr40min までの蛍光及び位相差イメージを Fig.2 に示す。矢印で示した細胞において、 1hr32min 付近で、Venus に由来する赤色の蛍光強度が減少し、ECFP ...
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黄色ブドウ球菌の表層タンパク質Skipの発現制御機構の解析
... 15kDa のタンパクが選択的に結合することを見出した。単離したタンパク は MALDI-TOF/MS 解析により，黄色ブドウ球菌のグローバル制御因子の一つである MgrA (Multiple gene regulator A) と同定された。さらに，Skip 非発現株において mgrA を相 同組換え法により欠損させたところ，Skip の発現が顕著に増大した。また， ...
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プロテアソーム相互作用タンパク質Ecm29の解析
... 文 の 要 旨 選択的タンパク質分解は様々な生命現象の制御に重要である。この選択的タンパク質分解を担 うプロテアソームは巨大な複合体型のプロテアーゼである。プロテアソームは、活性中心である 20S core particleと19S regulatory particle、PA28やPA200といった制御因子が会合することに ...
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