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IMC の起動

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デスクトップアイコンクリックにより

IMC を起動する

もっとも一般的なIMC 起動方法です。

IMC 起動方法

1. 浮動ライセンス＝ドングル版を使用している場合は、ドングル :Sentinel Key を USB スロットに差し込んで おきます。（固定ライセンスの場合は不要です）

2. デスクトップ上の IMC のアイコン をダブルクリックして、IMC を起動します。

• Res. 初期画面が表示されます。

• Res. 初期画面が表示されます。

• Check　初期画面に表示されている情報は、IMC のエディション名、バージョン名、ライセンス ID、ドングル ID（ド ングル版の場合のみ）、登録日付、最新版へのアップデート期限。

• Check　初期画面が表示されない場合は、以下のようなケースが考えらます。 • Check　原因：IMC のインストールがうまくいっていません。

• 対処　インシリコバイオロジー社にメール等で対処方法を聞きます。

• 対処　Windows の場合は、コマンドプロンプトから IMC を起動してみます。「IMC_00103: コマンドプロンプ トからのIMC 起動方法」を参照してください。

• 対処　Mac の場合は、ターミナルから IMC を起動してみます。「IMC_00104 ターミナルからの IMC 起動方法」 を参照ください。なお、Mac の場合は、/Applications/imc_xx/bin にある imc_xx.command をダブルクリック することにより、簡単にターミナルからの起動方法を実行できます（ここでimc_xx の xx は se, ge, ae の 3 種 類があり、それぞれスタンダード版、ゲノミクス版、アレイ版を示します）。

• Check　原因：Java がインストールされていません。

• 対処　Java の RTE をインストールします。インストール方法は、「インストールガイド」を参照ください。 • Check　原因：ライセンスがありません。

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• 対処　IMC のライセンスを取得します。

• Check　原因：試用ライセンスの場合、試用ライセンスの試用期限が過ぎています。 • Check　原因：他の画面の裏に隠れています。

• 対処　他の画面を動かして、IMC の起動画面が見えるようにします。

• Check　原因：浮動ライセンス（ドングル版）の場合にドングル（Sentinel Key）が USB スロットに差し込まれて いません。

• 対処　ドングルを USB スロット（USB ハブ経由でも可能）に差し込みます。 • Check　原因：ドングル（Sentinel Key）のドライバーがインストールされていません。

• 対処　ドングルのドライバーをインストールします。ドングル・ドライバーのインストール方法「インストール ガイド」を参照ください。。

• Check 　原因：設定ファイル（option.dat や layout.dat など）が壊れています。

• 対処　ユーザ領域の imc_xx/data に格納されている option.dat や layout.dat を別名に変更してから起動します。 • 対処　コマンドプロンプト（Windows）やターミナル（Mac）からの起動方法で IMC を起動してみます。 3. 初期画面をクリックします。 • IMC のメインウィンドウが表示されます。 •

固定ライセンスの場合

• Res. 固定ライセンスの場合で、ライセンスファイル（license.properties）が正しい場所に保存されていな い場合には、以下のメッセージが表示されます。

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1. Ref ボタンをクリックしてファイル選択ダイアログを表示し、ライセンスの保存してある場所を指定します。

2. OK ボタンをクリックしてファイルを指定し、Set ボタンをクリックします。

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Start メニューから IMC を起動する（Windows ）

操作方法

1. Start ボタンをクリックし、「すべてのプログラム」⇒「in silico biology, inc.」⇒「IMC XX」⇒「in silico Molecular Cloning XXXXX Edition」をクリックします。

• Res. 初期画面が表示されます。

• Check　インストールされているエディションによって、XX には、SE, GE, AE のいずれかが表示されます。 XXXXX には Standard, Genomics, Array のいずれかが表示されます。

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コマンドプロンプトからの

IMC 起動方法 (Windows）

デスクトップのIMC アイコンをダブルクリックする方法では IMC を起動できない場合は、コマンドプロンプトを 使用してIMC を起動します。

コマンドプロンプトからの

IMC 起動方法

Windows xp の場合

1. コマンドプロンプトを起動します。 2. コマンドプロンプトのコマンドラインからコマンドを入力して操作します。 3. IMC がインストールされているディレクトリに移動します。 • >cd c:\Program fi les\isb\imc_xx\bin 4. IMC を起動するためのコマンドを入力します。 • >java -Xmx1000m -jar ImcLauncher.jar

• -Xmx1000m の数字部分は、実装されているメモリーサイズを超えないようにしてください。また、32bit の Windows の場合は、1400 以下の数値にしてください。

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IMC のターミナルからの起動方法

トラブルなどでIMC が起動しない場合などに、原因を調査する目的で起動します。

Mac OS X の場合（トラブルの場合などに使用）

1. ターミナルを起動します。 2. ターミナルのコマンドラインから操作します。 3. IMC がインストールされているディレクトリに移動します。 • >cd Applications/imc_xx/bin 4. IMC を起動するためのコマンドを入力します。 • >java -Xmx1000m -jar ImcLauncher.jar

• -Xmx1000m の数字部分は、実装されているメモリーサイズを超えないようにしてください。また、32bit の MacOS X 場合は、2000 以下の数値にしてください。

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トラブル時の

IMC 起動方法（Windows）

トラブルの原因を探るために使用します。

デスクトップアイコンのリンク先を変更する方法

1. IMC のデスクトップアイコンの上で、マウス右クリックします。 • するとポップアップメニューが表示されます。 2. メニューの一番下にある「プロパティ」を選択します。 • するとプロパティダイアログが表示されます。 3. ショートカットタブを選択します。 4. ショートカットタブの「リンク先」の内容を編集します。リンク欄をマウスでクリックし、編集カーソルを 前方に移動させ、javaw.exe という文字列を表示させます。 5. javaw.exe の "w" という文字を削除し、下部の適用ボタンをクリックし、さらに OK ボタンをクリックします。 • ダイアログが閉じられます。 6. IMC のデスクトップアイコンをダブルクリックします。 • すると、コマンドプロンプトと IMC の起動画面が表示されます。

in silico biology 7. IMC の起動画面をクリックします。 • IMC がスタートします。それとともにコマンドプロンプトにメッセージが表示される場合があります。トラブルの 際にはこのメッセージの内容が参考になります。

コマンドプロンプト上に表示されたエラーメッセージのコピー方法

1. 左上隅のコマンドプロンプトアイコンをクリックします。 • するとメニューが表示されます。 2. 「編集」　→　「すべてを選択」をクリックします。 • メッセージ全体が反転表示されます。 3. 同様にメニューの「編集」→「コピー」を選択します。 • メッセージがクリップボードにコピーされます。 4. NotePad などのエディターを起動します。 5. エディターにペーストします。

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トラブル時の

IMC 起動方法（Mac）

トラブルの原因を探るために使用します。特に、通常の方法ではIMC が起動できない場合などに使用します。

アプリケーションのコマンドをダブルクリックする方法

1. FINDER を起動します。 2. アプリケーション /imc_xx/bin にある imc.command をダブルクリックします。 • するとターミナルウィンドウと IMC の起動画面が表示されます。ここでターミナルウィンドウにメッセージが表 示される場合があります。これらのメッセージはトラブルの原因を究明するために使用されます。 3. IMC の起動画面をクリックします。 • すると、ターミナルウィンドウにメッセージが表示される場合があります。これらのメッセージはトラブルの原因 を究明するために使用されます。

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浮動ライセンスにおける

IMC 起動方法

浮動ライセンスにおいては、IMC を起動するには、それ以前にドングルという装置を USB ソケットに差し込み、 そのLED が点灯しているのを確認する必要があります。

浮動ライセンスにおける

IMC の起動

1. ドングルを USB ソケットに差し込みます。 • ドングルの LED が点灯することを確認します。 • LED が点灯しない場合は、ドングルのドライバーがインストールされていないか、あるいはその Version が古 い可能性があります。最新のドングルドライバー（Sentinel Hardware Key ドライバー）をインシリコバイオロ ジー社のダウンロードサイトからダウンロードし、インストールしてください。

• USB HUB 経由でのドングル使用はなるべく避けてください。一部のメーカーの USB HUB 経由でドングルが破壊 されてしまう問題が発生しています。

2. IMC のデスクトップアイコンをダブルクリックします。 • IMC の起動画面が表示されます。

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IMC 最初の起動時に自動設定されるフォルダー・ファイル

IMC はマルチユーザ対応

IMC をそのユーザ名で最初に起動するときには、ユーザ専用に２つの領域が確保されます。IMC がインストール されている1 台のコンピュータ（Windows あるいは Mac）に登録された複数のユーザがそれぞれ独立した下記の領 域を使用するため、この領域範囲でIMC を使用している限りにおいて、お互いの操作は相互干渉しません。 • ユーザ専用書類（ドキュメント）保存領域 • ユーザ専用オプション設定・作業領域 • ユーザ専用書類（ドキュメント）領域の構成

Windows の場合は My Documents の下に imc_xx というディレクトリが生成され、Mac の場合は、ユーザの書類フォ ルダーの下にimc_xx というフォルダーが生成されます。

このディレクトリの下に、IMC 操作学習用サンプルファイルが生成されます。サンプル内容は、随時更新されます。 IMC 操作中にユーザが出力するファイルはこの領域以下に保存することを推奨します。他の領域に保存すること も可能です。

ユーザ専用オプション設定・作業領域

• Windows xpの場合は、Documents and Settingsディレクトリの下にimc_xxというディレクトリが生成され、 Mac の場合は、ユーザフォルダーの下に、imc_xx というフォルダーが生成されます。 • この領域の内容を編集したり、削除すると操作結果のリンクが切れたりする場合があります。 • このディレクトリ・フォルダーの下に、data および work の２つのディレクトリ・フォルダーが生成されます。 • data フォルダーの下に、IMC のオプション設定ファイルなどが生成されます。以降は、ユーザが変更内容は この領域にある設定ファイルに保存されます。また、data フォルダーの下にさらに、db というフォルダー が生成され、ユーザが独自のデータベースを登録した場合には、ここに保存されます。 • work フォルダーの下には、相同性検索結果などが保存されます。