第4章
反応検索
I. 検索条件の設定
Reaxys では全反応、半反応のどちらも検索可能です。構造式作画ソフトで出発物質や生成物を作画し
たり、名称から自動的に構造式を作画させることもできます。
検索例:エソメプラゾール
(Esomeprazole)
とその類縁体の合成法を探す
1. 反応検索画面です。“ Generate structure from name”のアイコンをクリックしま す。 2. 名称の入力画面です。 “esomeprazole”と入力し、Submit ボタンをクリックします。 化合物名称は、完全一致(is)、前方一 致(starts with) 、 後 方 一 致 (ends with)、部分一致(contains)から選択 可能です。 候補化合物が表示されるので、必要な ものを選択します(詳細は P.24 参 照)。 3. 構造式の編集を行います。 自動的に名称から構造式が生成され ます。ここでは、esomeprazole の 骨格を含むものを検索したいので、作 画ソフトを立ち上げて、編集を行いま す。編集後、Transfer query ボタン をクリックすると、Reaxys の検索画 面に転記されます。 今回は環上の置換基をすべて削除し、 骨格部分を検索に利用します。 反 応 検 索 で は 、 全 反 応・半反応のどちらで も 検 索 す る こ と が で きます。
Reaxys 基本検索ガイド
4. 反応検索画面です。 検索オプションを設定したら(設定方 法はP.8 参照)、Searchボタンをク リックします。II. 検索結果の閲覧
検索結果は表形式で表示されます。異なる論文・特許由来の反応条件が並列表示されるので(デフォ
ルトでは
3 件表示)、条件同士を容易に比較・検討することが可能です。
ブレッドクラムと呼ばれる、検索結果の絞込みなどの軌跡をナビゲーションする機能や、各種フィー
ルドを活用したフィルター機能も用意されています。
検索結果からフルテキスト、引用情報などにアクセス可能なリンクも付与されています。
検索例は前項からの続きです。
5. 検索結果画面です。 ① ブレッドクラム 操作の軌跡をナビゲート。 ② Create Alert Alert の設定を行います(詳細は 第10 章参照)。 ③ フィルター機能 各種反応情報、書誌情報での絞 込みが可能です(P.15 参照)。 ④ 反応・文献タブ(Reactions/Citations) 表示を反応・文献で切替ます。 ⑤ ツールバー レコードの限定表示、出力、並 べ替えなどを行います。 ⑥ フローティングボタン レコードを簡単にスクロールし ます。 ⑦ 反応検索結果 異なる論文・特許由来の反応条件 が並列で表示されます (詳細は次ページ以降参照)。 こ こ で は 、Show All Remaining Detailsをクリックして、その他の反 応条件を表示させます。6. 検索結果画面の続きです。 先ほどは表示されていなかった、その 他の反応条件についての記載を確認 することができます。 こ こ で は 、Show Experimental Procedure をクリックして、特許レ コードの実施例該当部分を表示させ ます。 7. 実施例・実験方法表示 反応条件、精製方法などの実験方法詳 細を特許実施例や学術論文(※)記載 内容から確認することも可能です。 ※学術論文は一部のタイトルのみが 対象です。 8. リンク機能 ①文献のフルテキスト、②Scopus で の引用情報、③特許のフルテキストや ④文献の詳細情報を表示させること ができます。
Reaxys 基本検索ガイド
9. リンク情報 ①文献のフルテキスト、②Scopus で の被引用文献情報、③特許明細書で す。 ※Scopus とは※ Scopus はエルゼビアが提供する世 界最大級の書誌・引用情報データベー スです。Reaxys で見つけた文献を引 用して書かれた文献を調べることが できます。10. 文献詳細情報 ④文献の詳細情報です。 文献のタイトル・アブストラクトに加 えて、その文献から収録された反応や 化合物の一覧も表示可能です。 特許については、明細書のフロントペ ージ情報、パテントファミリーについ ても収録されています。
11. 各種アイコン 構造式の下部には、化合物に関する各 種情報を提供可能なアイコンが用意 されています。 ①各種アイコン 化合物の市販情報 化合物サブメニュー ビューワー機能 ②類似反応を検索することも可能で す。 構造式をクリックするか、 をク リックすると、サブメニューがポップ アップウィンドウで表示されます。 ここでは Show Details をクリック して、物質・物性値のデータへジャン プします。
12. 物質・物性値の詳細データです 物性値やスペクトルデータなどを参 照することができます。 13. 検索結果の並べ替え 発行年、参考文献の数、生成物の分子 量、収率などの項目でレコードを並べ 替えることができます。 ①並べ替え項目 Reaxys-RXID:Reaxys 反応番号 Reactant Availability: Reactant 側化合物の入手可能性 Product Availability: Product 側化合物入手可能性 Reaxys-Ranking:Reaxys ランキング Publication Year:出版年 No of References:参考文献数 MW of product:生成物の分子量 ← Reaxys 番号 ← 分子式 ← 分子量 ← CAS 登録番号 ← 化合物の詳細データ ← 構造式をクリップボードへコピー(mol 形式) ← 構造式を検索画面へコピー ← 部分構造フィルターとして利用 ← 反応式を検索画面へコピー ← 関連するMarkush 構造を確認
ビューワーでの
3 次元コンフォメーション予測機能
〔右クリック〕 ⇒ 〔
Edit〕 ⇒ 〔Clean〕
⇒ 〔
3D〕 ⇒ 〔Clean in 3D〕
上記の手順で表示可能です。
※
Reaxys Ranking とは※
様々な指標で反応情報の有用性を得点化し、ランキング
表示します。
Reaxys 基本検索ガイド
14. フィルター機能 収率、試薬・溶媒などのフィールドで 絞込み検索を行うことができます。 をクリックすると、選択可能な 項目が表示されます。 Moreをクリックすると更に多くの選 択肢が表示されます。 ここでは、試薬・触媒として用いられ ている上位 3 種を除く検索条件を追 加しました。<フィルターとして利用可能なフィールド・反応検索の場合>
☛
ワンポイント
フィルター機能では、検索結果で多くヒットした条件が降順で表示されています。絞込み機能以外に、
傾向を知る簡易ツールとしても利用可能です。
← 部分構造(※次ページ参照)
← 収率
← レコードの種類(全反応・半反応・多段階反応など)
← 試薬・触媒
← 溶媒
← 反応の種類
← 反応の段階数
←
Product 側化合物の入手可能性
←
Reactant 側化合物の入手可能性
← 資料の種類(文献・特許)
← 著者名
← 特許出願人
← ジャーナル名
← 発行年
<
Filter 機能からの利用>
検索例:
Na 塩を生成物とする反応の
みに絞り込む場合
①検索結果一覧画面の左部のフィルター 機能より、「Sub-structure」を選択しま す。 ②構造検索ダイアログが起動しますので、 絞込みに利用したい部分構造を作画しま す。 ③検索オプションを設定し、 ④ Limit to ボタンをクリックします。<目的化合物からの利用>
検索例:ラセミ体から光学分画している反応を除外する場合
①絞込みに利用したい候補化合物の構造式をクリックします。サブメニューが表示されるので、
「Use as Sub-structure filter」を選択し、構造検索ダイアログを起動させます。
②構造式を必要に応じて編集します。
③検索オプションを設定し、
④ Exclude ボタンをクリックします。
<構造検索ダイアログの各種機能>
Query 画面から構造式をコピー。 作画した部分構造に限定する。
Query 画面へ構造式をコピー。 作画した部分構造を除く。
☛
ワンポイント:部分構造による絞り込み
検索結果に対して、特定の構造を有するものに限定する(または特定の構造を有するものを除く)こ
とができます。フィルター機能から選択したり、検索結果の構造式から設定可能です。
Na
Reaxys 基本検索ガイド
III.
検索結果のアウトプット
検索結果を見やすい
PDF 形式や、XML、Word、Excel などのファイル形式でエクスポートすること
ができます。検索結果から任意のレコードやフィールドを選択して、エクスポートすることも可能で
す。
検索例は前項からの続きです。
17. 検索結果のアウトプット 検索結果画面で、 を クリックします。 15. 文献単位での結果表示 反応検索の結果でも、文献単位で表示 することができます。 のタ ブをクリックして、表示を切り替えま す。 16. 結果の詳細表示 タイトル/アブストラクトや、検索に ヒットした反応、その文献から収録さ れたすべての反応・化合物等を表示す ることができます。18. アウトプットの設定画面です。 (設定方法詳細については下記参照) ここでは、反応レコードの 1-3 件目 を表形式で、PDF ファイルとして出 力します。 ①から⑤までの設定が完了したら、 OKをクリックします。