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有用化合物を生産・増産する代謝ネットワークを設計するアルゴリズム

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Academic year: 2021

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(1)Vol.2018-BIO-55 No.7 2018/9/18. 情報処理学会研究報告 IPSJ SIG Technical Report. 有用化合物を生産・増産する 代謝ネットワークを設計するアルゴリズム 田村 武幸1,a). 概要:制約モデルの代謝流束解析は、微生物を用いた有用化合物の生産に関するシミュレーションにおいて有 用である。近年の DNA 合成技術の発達に伴い、有用化合物を生産する最小の代謝ネットワークのデザインの 計算が近い将来重要になるかもしれない。そこで本研究では、細胞の成長率と目的化合物の生産率に関する制 約を小さなグリッドを用いて表し、グリッドごとに最小の代謝流束分布を計算して、準最適な代謝のデザイン を見つける手法を開発した。詳細は biorxiv: https://www.biorxiv.org/content/early/2017/07/24/166777 にて公開中であり、現在論文投稿中である。 .. An algorithm for design of metabolic networks for production of valuable metabolites Takeyuki Tamura1,a). 1. a). 京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター 京都府宇治市五ヶ庄 611-0011 [email protected]. ⓒ 2018 Information Processing Society of Japan. 1.

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