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平成30年度研究プロジェクト年次報告書 1.研究プロジェクト概要

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平成 31 年 4 月 9 日

平成30年度研究プロジェクト年次報告書

1.研究プロジェクト概要

研 究 プ ロ ジ ェ ク ト の 名 称 感染症国際共同拠点プロジェクト 研究プロジェクト・リーダー 部局・専攻

・氏名

医学研究科附属感染症センター・森 康子

研 究 員 数 人(学術研究員,学振特別研究員(DC1, DC2は除く),外国人招へい研究員 等)

外 部 資 金 獲 得 実 績

科学研究費補助金 千円,受託研究経費 千円,

奨学寄附金 千円,その他(AMED J-GRID 98,417千円(間接経費込)

特許出願件数 0

2.構成員とその役割分担

氏 名 部局・専攻

森 康子 医学研究科附属感染症センター・臨床ウイルス学分野

勝二 郁夫 医学研究科附属感染症センター・感染制御学分野

白川 利朗 科学技術イノベーション研究科・先端医療学分野

亀岡 正典 保健学研究科・パブリックヘルス領域

林 祥剛 保健学研究科・国際保健学領域

矢野 嘉彦 医学研究科・感染病理学

Maria Inge Lusida アイルランガ大学熱帯病研究所

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3.研究成果の概要等について

インドネシアのアイルランガ大学熱帯病研究所に神戸大学拠点を設置し、国際共同研究を行っ ている。

「 鳥 イ ン フ ル エ ン ザ ウ イ ル ス に 関 す る 研 究 」

季 節 性 イ ン フ ル エ ン ザ ウ イ ル ス と 鳥 ウ イ ル ス の 重 感 染 か ら 世 界 的 大 流 行 を 引 き 起 こ す 新 型 イ ン フ ル エ ン ザ が イ ン ド ネ シ ア で 発 生 す る こ と が 懸 念 さ れ て お り 、当 地 の ア イ ル ラ ン ガ 大 学 熱 帯 病 研 究 所 と 共 同 で そ の 出 現 予 測・早 期 検 知 の 為 に ヒ ト 及 び 鳥 の ウ イ ル ス の 監 視 を 行 な っ て い る 。本 年 度 は イ ン フ ル エ ン ザ 様 疾 患 患 者22検 体 で 季 節 性 イ ン フ ル エ ン ザ ウ イ ル ス を 検 出 し た 。 生 鳥 市 場 の 疾 病 家 禽16検 体 で はH5N1高 病 原 性 鳥 イ ン フ ル エ ン ザ ウ イ ル ス を 検 出 し た 。 現 在 もH5N1ウ イ ル ス が 蔓 延 し て い る こ と が 示 さ れ た が 、ヒ ト へ の 感 染 は 検 出 さ れ な か っ た 。ま た 、健 常 家 禽 か らH2N2、H3N2、H3N6 H4N2H4N6、 及 びH9N2亜 型 の 低 病 原 性 ウ イ ル ス を 分 離 し 、 イ ン ド ネ シ ア の 家 禽 で は こ れ ら ウ イ ル ス も 常 在 化 し て い る こ と を 明 ら か に し た 。H2N2及 びH3N2亜 型 の 鳥 イ ン フ ル エ ン ザ ウ イ ル ス はHA遺 伝 子 の 供 給 源 と し て そ れ ぞ れ1957年 の ア ジ ア か ぜ 大 流 行 と1968年 の 香 港 か ぜ 大 流 行 に 関 与 し た 履 歴 が あ る 。 特 にH2N2亜 型 は1968年 の 香 港 か ぜ の 発 生 と と も に 姿 を 消 し 、人 類 は50年 間 こ の 亜 型 を 経 験 し て い な い 。従 っ て 大 部 分 の 人 類 が 免 疫 を 持 た な い た め 、 次 の 新 型 ウ イ ル スHAの 供 給 源 に な る 可 能 性 が 高 い と 考 え ら れ る 。

H2N2亜 型 ウ イ ル スHA遺 伝 子 の 系 統 樹

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イ ン ド ネ シ ア に お け る ヒ ト 免 疫 不 全 ウ イ ル ス(HIV)の 分 子 疫 学 調 査 」

イ ン ド ネ シ ア に お け るHIV流 行 は 現 在 も 拡 大 傾 向 に あ る 。 特 にHIV 1型(HIV-1)が 流 行 を 引 き 起 こ し て い る 。こ れ ま で ア イ ル ラ ン ガ 大 学 のHIV-1研 究 グ ル ー プ と のJ-GRID共 同 研 究 課 題 と し て 、 イ ン ド ネ シ ア 全 土 か らHIV-1感 染 者 の 末 梢 血 試 料 を 収 集 し て 、 ウ イ ル ス の 遺 伝 子 解 析 を 行 っ て き た 。 そ の 結 果 、 ア ジ ア 諸 国 に 広 く 蔓 延 す るCRF01_AE亜 型 が イ ン ド ネ シ ア の 主 な 流 行 株 で あ る こ と 、欧 米 諸 国 に 流 行 す るsubtype B亜 型 も パ プ ア を 中 心 と し て 流 行 し て い る こ と 、ア フ リ カ 型CRF02_AG亜 型 の 侵 入 が 複 数 都 市 で 認 め ら れ る こ と 、 亜 種 間 の 組 換 え 型 ウ イ ル ス が 多 数 出 現 し て い る こ と 等 が 明 ら か に な っ た 。

「 イ ン ド ネ シ ア に お け る デ ン グ ウ イ ル ス の 分 子 疫 学 調 査 」

イ ン ド ネ シ ア は 東 南 ア ジ ア 最 大 の デ ン グ 流 行 国 で あ り 、日 本 に も バ リ な ど か ら 毎 年 多 数 の 輸 入 感 染 例 が 報 告 さ れ て い る 。 ア イ ル ラ ン ガ 大 学 の 研 究 グ ル ー プ と のJ-GRID共 同 研 究 課 題 と し て 、 イ ン ド ネ シ ア 全 土 か ら デ ン グ 疑 い 患 者 の 血 清 と 媒 介 蚊 試 料 を 収 集 し て 、 ウ イ ル ス 分 離 と 遺 伝 子 解 析 を 行 い 、イ ン ド ネ シ ア に 流 行 す る デ ン グ ウ イ ル ス 遺 伝 子 情 報 を 蓄 積 さ せ た 。一 連 を 通 じ て 、イ ン ド ネ シ ア 国 内 外 、ア ジ ア 諸 国 、世 界 規 模 で の デ ン グ ウ イ ル ス 流 行 推 移 の 一 端 を 明 ら か に す る と と も に 、日 本 国 内 の デ ン グ ウ イ ル ス 対 策 に 役 立 つ 調 査 結 果 を 得 た 。

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「 イ ン ド ネ シ ア に お け る 薬 剤 耐 性 菌 (AMR) の 研 究 」

近 年 、WHOは 多 剤 耐 性 菌 の 蔓 延 に よ る 世 界 的 な 公 衆 衛 生 上 の 深 刻 な 脅 威 を 繰 り 返 し 訴 え て い る 。特 に カ ル バ ペ ネ マ ー ゼ 産 生 肺 炎 桿 菌 を は じ め と す る カ ル バ ペ ネ ム 耐 性 腸 内 細 菌 (CRE) や 、ESBL( 基 質 特 異 性 拡 張 型 β ラ ク タ マ ー ゼ ) 産 生 大 腸 菌 な ど の 脅 威 が 挙 げ ら れ て い る 。

こ れ ま で の 研 究 で 、 イ ン ド ネ シ ア で 分 離 さ れ るCREが 保 持 す る カ ル バ ペ ネ マ ー ゼ は 、 NDM-1(New Delhi metallo-beta-lactamase) が 非 常 に 多 く 我 が 国 のCREと は 異 な る こ と が 判 明 し て い る 。ま たESBL産 生 大 腸 菌 に つ い て は 、ESBLと し てCTX-M1 5 型 が 最 も 多 く 、 そ の う ち の 半 数 以 上 が 染 色 体 性 のCTX-M15を 保 有 し て い た こ と が 判 明 し た 。 ま た 染 色 体 性CTX-M15を 保 有 す るESBL産 生 大 腸 菌 の 表 現 型 、 系 統 発 生 群 と し て は 内 因 性 感 染 を 引 き 起 こ し や す いB2お よ びDが 多 い こ と が 判 明 し て い る 。

「 イ ン ド ネ シ ア に お け る ノ ロ ウ イ ル ス 感 染 症 の 分 子 疫 学 解 析 」

急性胃腸症患者の糞便検体中のノロウイルスゲノム配列を解析した。2015-2016のノロウイルス 陽性検体ではGII.4 が最も多いgenotypeであったが、興味深いことにGII.13というマイナー genotypeが2番目に多く(17%)、 GII.17がそれに次いで多かった。ノロウイルス感染症の伝播 様式を明らかにするために、2015-2016年の1年間、インドネシアにおいて無症候者18人から糞便 検体を継続的に収集したところ、512検体中14検体(7人の無症候者)からノロウイルスゲノムが 検出された。異なる遺伝子型同士の組換えノロウイルスも検出された。これらの結果から、無症 候者から高率にノロウイルスが検出されることを分子疫学的に証明した。さらに無症候者の家族 から有症患者の出現例についてウイルスゲノム解析を行い、ウイルス株の相違や特徴について解 析を行っている。

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「 イ ン ド ネ シ ア に お け る ロ タ ウ イ ル ス 感 染 症 の 分 子 疫 学 解 析 」

急性胃腸症患者糞便検体中のロタウイルスゲノム配列を解析し、2015年から2016年の1年間に DS-1-like遺伝子型構成をもつEquine-like G3ロタウイルスG3P[8]、G3P[6] がインドネシアで流 行していたことを明らかにしてきた。2015年から2018年の検体についてさらに解析をおこなっ た。432検体を収集し、ロタウイルスをマルチプレックスRT-PCR法、および次世代シークエンス 法で11セグメントを解析した。興味深いことに2017年5月まではequine-likeロタウイルスが優位 な株であったが、2017年7月より急激にウイルス株が通常のヒト型ロタウイルス(G1, G3)にシ フトした。インドネシアではロタウイルスワクチンの普及率が低いにも関わらず、急激な流行株 のシフトが起こり、ロタウイルス株の流行の全世界的な変化を反映しているものと推察された。

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4.論文・著書

[論文]

Screening for Middle East respiratory syndrome coronavirusamong febrile Indonesian Hajj pilgrims: A study on 28,197 returning pilgrims.

Amin M, Bakhtiar A, Subarjo M, Aksono EB, Widiyanti P, Shimizu K, Mori Y(国際共著)

J Infect Prev 19(5):236-239, 2018 Sep. doi: 10.1177/1757177418765634. Epub 2018 May 19.

Whole-genome sequence of an avian influenza A/H9N2 virus isolated from an apparently healthy chicken at a live-poultry market in Indonesia.

Novianti AN, Rahardjo K, Prasetya RR, Nastri AM, Dewantari JR, Rahardjo AP, Estoepangestie ATS, Shimizu YK, Poetranto ED, Soegiarto G, Mori Y, Shimizu K.(国際共著)

Microbiol Resour Announc 8:e01671-18, 2019 in press

New tetrahydroquinoline and indoline compounds containing a hydroxy cyclopentenone, virantmycin B and C, produced by Streptomyces sp. AM-2504.

Nakashima T, Suga T, Kameoka M, Ueno M, Inahashi Y, Matsuo H, Iwatsuki M, Shigemura K, Shiomi K, Takahashi Y, Omura S, Kimura T.

J Antibiot, 72(3):169-173, 2019

Genetic Diversity and Drug Resistance of HIV-1 Circulating in North Sulawesi, Indonesia. Ueda S, Witaningrum AM, Khairunisa SQ, Kotaki T, Nasronudin, Kameoka M.

AIDS Res Hum Retroviruses, in press

Appearance of drug resistance mutations among the dominant HIV-1 subtype, CRF01_AE in Maumere, Indonesia.

Indriati DW, Kotaki T, Khairunis SQ, Witaningrum AM, Yunifiar MMQ, Ueda S, Nasronudin, Purnama A, Kurniawan D, Kameoka M.

Curr HIV Res, 16(2), PP.158-166, 2018

Genotypic characterization of human immunodeficiency virus type 1 isolated in Bali, Indonesia in 2016.

Khairunisa SQ, Ueda S, Witaningrum AM, Yunifiar MMQ. Indriati DW, Kotaki T, Nasronudin, Kameoka M.

HIV AIDS Rev, 17(2), 81-90, 2018

Genotypic Characterization of HIV-1 Prevalent in Kepulauan Riau, Indonesia.

Khairunisa SQ, Ueda S, Witaningrum AM, Yunifiar MMQ, Indriati DW, Kotaki T, Nasronudin, Kameoka,

(7)

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M.

AIDS Res Hum Retroviruses, 34(6), PP.555-560, 2018

Structural Aspects of Betaherpesvirus-Encoded Proteins.

Nishimura M, Mori Y.

Adv Exp Med Biol. 2018;1045:227-249. doi: 10.1007/978-981-10-7230-7_11.

Glycoproteins of HHV-6A and HHV-6B.

Tang H, Mori Y. (国際共著)

Adv Exp Med Biol. 2018;1045:145-165. doi: 10.1007/978-981-10-7230-7_8.

Human CD134 (OX40) expressed on T cells plays a key role for human herpesvirus 6B replication after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation.

Nagamata S, Nagasaka M, Kawabata A, Kishimoto K, Hasegawa D, Kosaka Y, Mori T, Morioka I, Nishimura N, Iijima K, Yamada H, Kawamoto S, Yakushijin K, Matsuoka H, Mori Y.

J Clin Virol. 2018 May;102:50-55. doi: 10.1016/j.jcv.2018.02.011. Epub 2018 Feb 21.

[著書]

該当なし

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5.関 連 活 動 及 び 特 記 事 項

( 1 ) 受 賞 (賞名称,受賞対象,受賞者名,授与機関名、受賞年・月)

特 記 す べ き こ と な し

( 2 ) 研 究 集 会 の 開 催 特記すべきことなし

( 3 ) そ の 他 ,研 究 プ ロ ジ ェ ク ト の 活 動 と 関 連 の あ る 特 記 事 項 特記すべきことなし

参照

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