thermofisher.com Silencer Select pre-designed / validated siRNA 検索マニュアル

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Silencer

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_{Select pre-designed / validated siRNA}

検索マニュアル

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• Silencer®_{Select predesigned siRNA}_{：同一ターゲット遺伝子に対する2種類のSilencer Select} predesigned siRNAを同時にご購入頂いた場合、2種類ともにmRNAレベルで70％以上のノックダウンを保証致します*1_{。保証レベルを満たさない場合、1回限り無償で別デザインのsiRNAを提供致します。} • Silencer®_{Select validated siRNA}_{: 1種類のsiRNAから、mRNAレベルで80％以上のノックダウンを}

保証致します*1_{。保証レベルを満たさない場合、1回限り無償で別デザインのsiRNAを提供致します。} • 保証の際、以下の条件がクリアしていることを確認してください：

• 導入効率の確認として、Positive control siRNAを設定し 80％以上のノックダウンが得られた*2_。

• siRNAは5nM以上の濃度で導入 • mRNAのチェックは導入後48時間後 • リアルタイムPCR法による確認方法を推奨 • 保証の依頼およびお問い合わせはテクニカルサポート部までご連絡下さい： • 電話：0120-477-392 • メール：[email protected]

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_{Select siRNAの保証内容}

*1：タンパク質/フェノタイプレベルでの保証は行っておりません

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• Thermo Fisher Scientific ホームページ

（http://www.thermofisher.com/jp/ja/home.html）の上部のメニューのオンライ

ンオーダーにカーソルを置くとプルダウンメニューが展開されます。 メニュー内から Silencer Select をクリックします。

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• AmbionシリーズのSilencer Select siRNAsの画面の

Silencer® Select RNAiの検索 のボタンをクリックします。

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• 表示された画面を下にスクロールすると検索ツールが表示されます。

検索ツールはsiRNA と Silencer Select siRNAが選択された状態になってい ます。Silencer Select siRNAを購入の場合は 7ページに進みます。

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• Silencer®_{Select siRNAだけでなく、4種類のsiRNAタイプからご希望のsiRNA} をご選択できます。

ディホルトでは Silencer®_{Select siRNAが選択されていますが、ご希望に応じてその他のタイプのsiRNAも選択することができます：}

• Silencer®_{Select siRNA ：最新のデザインアルゴリズムとLNA化学修飾により低濃度で高い抑制効果が得られるsiRNAです。細}

胞レベルのRNAi実験に最もお薦めのsiRNAです。

• Ambion®_{In Vivo siRNA ： Silencer}®_{Select siRNAに追加の化学修飾が施されたsiRNAです（配列はSilencer® Select siRNAと}

同じです）。追加の化学修飾によりRNase耐性が強化され、血清中の安定性が改善されています。In Vivo 実験に最適なsiRNAです。

• Stealth RNAi™ siRNA ： 25bpサイズからなるユニークで特異性の高いsiRNAです。細胞毒性誘導を抑える化学修飾が施されて

います。

• Unmodified siRNA ：非修飾タイプのsiRNAです。 Silencer® Select siRNAとはデザイン（配列）が異なります。Ambion の旧 siRNA(Silencer® _{siRNA) をご希望の場合に選択します。}

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• 対象の生物種を選択し、Enter target informationのボックスに検索キーワードを入力し、Searchをクリックして検索します。

siRNAの検索

検索キーワードの入力 • siRNA ID • 遺伝子シンボル名 • Entrez Gene ID • UniGene ID • RefSeq アクセッション番号 • GenBank mRNAアクセッション番号 • Protein ID など

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• 複数のターゲットのsiRNAをまとめて検索することが可能です。

siRNAの検索：（オプション）Multiple Target Search

Enter target informationボックスの下の

Enter/Upload Multiple Targets リンクをクリックします

Multiple Target Search画面が表示されます。検索には2つのオプションがあります

Option 1 : ではEnter Keywordsのボックスに

複数の検索キーワードを入力して検索を行います。 Option 2 : キーワードをリスト化したファイル をアップロードして検索を行えます。ファイルは、拡張子が .txt 、.txtN(Nは数字）または .vcf のANSIファイルがご利用可能です。

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9 • 検索結果が表示されます。多くの場合、1つのターゲット遺伝子に対して複数のsiRNAがリストアップされます。まず①～③のポイントについて確認をしてください

siRNAの検索：検索結果

① ① ☆Validatedの印が付いている siRNAは実際に細胞へ導入し、その抑制効果が検証済みのsiRNAです。 ☆印のないsiRNAは未検証の Predesigned siRNAです。

Validated / Predesigned siRNAは価格/保証内容が異なります。

② Transcript Typeを確認します。 Silencer®_Select

siRNAには、non-coding RNAを標的とするsiRNAもあります。 mRNAをノックダウンする場合は必ず Transcript TypeがCodingになっていることを確認してください。 ③ Availabilityでは、Inventoriedと Made-to-Orderがあります。 Inventoriedは本社に合成済みの siRNAが在庫されているため納期が短く、1nmolスケールの購入が可能です（まとめて4本購入時のみ）。 Made-to-Orderはご注文頂いてから合成を行います。Mouse/RatのsiRNA はほとんどがMade-to-Orderです。 ② ③

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10 • 検索結果の画面からヒットしたsiRNAに対する追加情報が確認できます。

siRNAの検索：検索結果から得られる情報 I

View Details: 標的遺伝子情報やsiRNAのデザインポジションが確認できます。 Related Assays: リアルタイムPCR解析用のTaqMan®_Assay カートに追加してこの画面から注文することが可能です

TaqMan®_{Gene Expression Assay}_{: 標的のmRNAのノックダウンレ}

ベルを定量することができます。

TaqMan®_{siRNA Assay}_{: このsiRNAを定量することができます（注：}

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siRNAの検索：検索結果から得られる情報 II

Related Antibodies: 標的遺伝子のタンパク質に対する抗体のリストが確認できます。 Western Blotをはじめとした抗原/抗体反応をベースとしたアッセイに使用できる抗体が確認できます。 Related Controls:

siRNA実験に必要なNagative Control siRNAおよび Positive Control siRNAsが確認できます。

Negative control siRNAは必須になります。

Positive control siRNAは必須ではありませんが、導入条件の検討や導入効率のモニターにご利用頂くと便利です。

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siRNAの検索：検索結果から得られる情報 III

☆Validated : 抑制効果の検証した際の結果および実験条件が表示されます。

注： Validated siRNAのみの情報です。predesigned siRNAにはこの情報はありません。

View Assay on Map:

siRNAのデザインされているポジションを感覚的に確認することができます。バリアントRNAとの相関性の確認もできます。

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13 • siRNAの純度/サイズを変更することが可能です。

siRNAの注文： siRNAの純度/サイズの確認と変更

ディホルトは Standard / 5nmolに設定されています。変更する場合は▼をクリックして、変更画面を開き、希望の純度/サイズに変更してください。純度/サイズの変更は以下のラインナップから選択できます： Standard: 培養細胞への導入に十分な純度 です。 HPLC: 培養細胞/In vivo両方に使用できる 純度です。 HPLC-IVR: In vivo導入用の最も高純度な精 製です。HPLC精製の他、透析/フィルター滅菌/エンドトキシンチェックを行っています。

注： 1nmol / Standardは、Inventoried siRNAのみのサービスで、1回の注文で4種類以上のsiRNAを購入される場合のみ選択可能です。

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siRNAの注文：製品をカートに追加

• 購入を決定した siRNAのチェックボックスにチェックを入れ、をクリックします。 • 画面右上のカートに製品が加えられていることを確認し、カートマークをクリックします。 クリック 製品がカートに加えられるとカート内の製品数が表示されます

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siRNAの注文：製品をカートに追加

• カート内の製品リストが表示されます。 注文手続きを始める をクリックします。購入を見直したい製品はチェックボックスにチェックを入れてリストから削除することが可能です ※注文手続きに関しては、別途のご注文マニュアルをご参照ください。 カート クリック チェックボックスにチェックを入れると削除ボタンがアクティブになります。この状態で削除ボタンをクリックするとチェックを入れた製品はリストから削除されます。

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研究用にのみ使用できます。

診断目的およびその手続き上での使用は出来ません。

otherwise specified. TaqMan is a registered trademark of Roche Molecular Systems, Inc., used under permission and license.

本誌に記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。

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