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Acetobacter pasteurianus および Agrobacterium gelatinovorum の制限修飾系遺伝子の解析

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Academic year: 2021

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Title Acetobacter pasteurianus および Agrobacterium gelatinovorumの制限修飾系遺伝子の解析( 内容の要旨 ) Author(s) 鈴木, 利彦 Report No.(Doctoral Degree) 博士(農学) 甲第100号 Issue Date 1997-03-14 Type 博士論文 Version URL http://hdl.handle.net/20.500.12099/2441 ※この資料の著作権は、各資料の著者・学協会・出版社等に帰属します。

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氏 名(国籍) 学 位 の 学 位 記 番 号 学位授与年月 日 学位授与の要件 研究科及び専攻 研究指導を受けた大学 学 位 論 文 題 目 審 査 委 点 言Jゝ 自問 鈴 木 利 彦 (静岡県) 博士(農学) 農博甲第100号 平成9年3月14日 学位規則第4条第1項該当 連合農学研究科 生物資源科学専攻 静岡大学 山地加地り劇加血祝および Ag和古畑血伊仙叩Wの制限修飾 系遺伝子の解析 主査 静 岡 大学 教 授 副査● 信州 大学 教 授 副査 岐 阜 大学 教 授 副査 静 岡 大学 教 授 副査 静 岡 大学 助教授 文 の 内 容 の 孝 光一男 治 康高 啓 公真 原 藤 合 山 山 田 寄 河杉徳 l僅制限修飾系は、DNAの特定の塩基配列を認識、切断する制限酵素と同酵素と 同一の塩基配列内の塩基をメチル化するメチラーゼによって構成されており、この うちの制限酵素は認識、切断の塩基配列が厳密であることから、遺伝子操作に不可 欠の酵素試薬として多用されている。本研究は、酢酸菌Acetob∂Cferp∂Sfeリー r/∂仙頭来のAp∂L制限修飾系の制限酵素とメチラーゼの遺伝子と海生細酢9rO-b肛fer山m9e/∂血0VOrUm由来のA9e欄隕修飾系のメチラーゼ遺伝子をクロ「ニ ングし、これら遺伝子の構造を解析したもので、得られた結果の要旨は次の通りで ある。 1)加efob∂Cterp∂S一山∂nUSIFO13753由来Ap∂L=別限修飾系遺伝子のクロ ーニングと解析:Sau3AJ7?吉相分解した同菌の染色体DNA断片をpUC18に挿入し、 組換えプラスミドを大腸菌DH5αMCRに形質転換して遺伝子ライブラリーを作製し た。ApaL(メチラーゼ(M・ApaLJ)遺伝子をApaL制限酵素(R■ApaLJ)に耐性を示す組 換えプラスミドとしてクローニングし、得られたR・ApaL冊性プラスミド(pAPA LM3・2)の挿入断片にM・ApaL憧伝子(429アミノ酸残基に相当する1287bp)とその 下流にR・ApaLJq)N末端アミノ酸配列(19アミノ酸残基)と一致するR・ApaL.(300bp)

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-79-を見出した。この領域の塩基配列に基づいて、染色体DNAからインバースPCR法に よってR.ApaLJ遺伝子の塩基配列(375アミノ酸残基に相当する1125bp)を決定した。 これらの結果からApaL制限修飾系の遺伝子はM.ApaLl、R.ApaL[の順序で2bp離れ て、同一方向に座位していることが示された。ホモロジー検索の結果、M.Ap∂いの 推定アミノ酸配列はシトシンー5メチラーゼの遺伝子の一部(Sイデノシルメチオ ニン結合部位および触媒活性部位と推定される領域)と類似性(30-35%)を示した。 R.Ap∂Lt遺伝子と他の制限酵素遺伝子との間の類似性は見られなかった。さらに、 ApaL制限修飾系遺伝子の上流付近に転移に関与するリゾルベースと類似性の高い 遺伝子が存在した。制限修飾系の近傍にリソルベース遺伝子が存在する例は、Accl、 P∂eR7l、Sfnlの制限修飾系で報告されている。 2)ApaL制限酵素遺伝子の大腸菌における発現:R.ApaLl遺伝子(1125bp)を PCRによって増幅し、PETll-aプラスミドのT7プロモーターの制御下に挿入した。 この組換えプラスミドを大腸菌BL21(DE3)pLySに形質転換し、300cでIPTG添加に よってR.ApaLl酵素を誘導した。その生産量は湿菌体gあたり約4XlO6unitであり、 この値は酢酸菌A.p∂SteUr/∂ハリSの生産する酵素量の約200倍に相当した。 R.ApaL値伝子の発現にT7プロモーターを利用することによって、対応するメチラ ーゼ遺伝子の発現を伴わずにR.Ap∂Ll酵素を大腸菌で生産させることができた。 3)Agrobacteriumgela亡inovorum[AM12617由来Agelメチラーゼ遺伝子の クローニングと解析:Sau3A]で部分分解した同菌の染色体DNA断片をAgelサイト を導入したpUC18に挿入し、その組換えプラスミドを大腸菌DH5αMCRに形質転換 して遺伝子ライブラリーを作製した。AgeIメチラーゼ(M.AgeI)遺伝子をAgel制限 酵素(R.A9eりに耐性を示す組換えプラスミドとしてクローニングし、得られた R.AgeI耐性プラスミド(pAGEMl.7)の挿入断片にM.Agel遺伝子(429アミノ酸残基 に相当する1287bp)を見出した。M.AgeIの推定アミノ酸配列は上記のM.ApaLl遺伝 子と同様にシトシンー5メチラーゼの遺伝子の一部(S-アデノシルメチオニン結合部 位および触媒活性部位と推定される領域)と類似性(30-35%)を示した。 審 査 結 果 の 要 旨 本研究は、Acetobacterpasteurianus由来ApaL制限修飾系の制限酵素とメ チラーゼの遺伝子とA9rOb∂Cter山m9e/∂f血0VOrUm由来A9e欄j限修飾系のメ チラーゼ遺伝子をクローニングし、これら遺伝子の構造を解析したものである。 1)AcerobacterpasturianusIFO13753由来ApaLl制限修飾系遺伝子のク ローニングと解析:PUC18プラスミドを用いた同菌の染色体DNA断片の遺伝子ラ イブラリーから、ApaLlメチラーゼ(M.ApaLl)遺伝子をApaL制限酵素(R・ApaLl) に耐性を示す組換えプラスミドとしてクローニングした。得られたR.Ap∂Ll耐性 プラスミド(pAPALM3.2)の挿入断片にM.ApaL値伝子(429アミノ酸残基に相当

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-80-する1287bp)とその下流にR.ApaLIのN末端アミノ酸配列(19アミノ酸残基)と一 致するR.Apau(300bp)を見出した。この塩基配列に基づいて、染色体DNAから インバースPCR法によってR.ApaLl遺伝子の塩基配列(375アミノ酸残基に相当す る1125bp)を決定した。これらの結果からApaL制限修飾系の遺伝子はM.ApaLI、 R.ApaLlの順序で2bp離れて、同一方向に座位していることが示され、ホモロジー 検索の結果、M.Ap∂Llの推定アミノ酸配列はシトシンー5メチラーゼの遺伝子の 一部と類似性を示した。R.Ap∂Lt遺伝子と他の制限酵素遺伝子との間の類似性は 見られなかった。 2)ApaLl制限酵素遺伝子の大腸菌における発現:R.ApaLL遺伝子(l125bp)を PCRによって増幅し、PETll-aプラスミドのT7プロモーターの制御下に挿入した。 この組換えプラスミドを大腸菌BL21(DE3)pLySに形質転換し、300cでIPTG添加 によってR.ApaL働素を誘導した。その生産量は湿菌体gあたり約4XlO6unitで あり、この値は酢酸菌A.p∂S亡eur/∂ハリSの生産する酵素量の約200倍に相当した。 3)Agrobacteriumge/atinovorumLAM12617由来AgeJメチラーゼ遺伝子 のクローニングと解析:PUC18プラスミドを用いた同菌の染色体DNA断片の遺伝 子ライブラリーから、Agelメチラーゼ(M.AgeJ)遺伝子をAgel制限酵素(R.AgeJ) に耐性を示す組換えプラスミドとしてクローニングした。得られたR.A9el耐性プ ラスミド(pAGEMl.7)の挿入断片にM.AgeI遺伝子(429アミノ酸残基に相当する 1287bp)を見出した。M.AgeIの推定アミノ酸配列は上記のM.ApaLl遺伝子と同様 にシトシンー5メチラーゼの遺伝子の一部と類似性を示した。 このように本論文の内容は、Il型制限修飾系の遺伝子の研究に新しい知見を与 えるものであり、Il型制限修飾系の基礎と応用の発展に貢献するものと評価され た。本審査委員会は論文の構成、内容ならびに下記に示す基礎となる学術論文等・ について慎重に審議し、審査委員全一致をもって本論文が博士の学位を授与され るに値すると判定した。 (1)β/osc/・β正江ecわーβ/ocわemリ60(3),444-447,1996 ClonIngandNucleotideSequcenceoftheAgelMethyJaseGenefrom AgrobacteriumgelatinovorumlAM12617,aMarineBacterium (2)β/osc/・β/扉ecわ・β/ocわem.,60(9),140ト1405,1996 C暮onJngandNucleotideSequcenceofApauRestriction-mOdification SystemfromAcetobacterpasteurianusJFO13753

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