生化学Ⅲ 第2回 核酸の種類・構造と特徴
SBOs 教科書 ページ
DNAの構造について 説明できる
核酸の構造と機能 396-407 RNAの構造について
説明できる
DNA鎖とRNA鎖の類似 点と相違点を説明で きる
生化学ⅢSBO-1 DNAの構造について説明できる
5ʼ
3ʼ
p396~
SBO-1課題(予習&復習)-1
DNAの構造に関連する基本的な用語の意味について確認 し、ノートにまとめること。
DNA、デオキシリボース、リン酸、塩基、塩基配 列、ヌクレオシド、ヌクレオチド、ホスホジエ ステル結合、3ʼ末端と5ʼ末端、逆平行2重ら せん構造、X線構造解析
SBO-1課題(予習&復習)-2
ミーシャー(JohannesMiescher)の研究 シャルガフの(ErwinChargaff)の研究 フランクリン(RosalindFranklin)の研究 ワトソンとクリック(J.Watson&F.Crick)の研究 遺伝学に関する歴史上重要な研究(研究者・実験方 法・研究結果・定説など)について確認し、ノートに まとめること。
DNAのヌクレオチドの構造-1
リン酸基
塩基
デオキシリボース
OH
水酸基 5位の炭素にリン酸基が結合P+P+P
(五炭糖)
4種類 (アデニン) (シトシン) (グアニン) (チミン)
1 3 2
4 5
ヌクレオチドの重合反応-1
5
リン酸基
3
水酸基
5
3
OH
P+P+P
OH
5 3
5
3
OH
P+P+P P+P+P
P
P+P
ホスホジエステル結合が形成される
DNAの構造-1
ヌクレオチド同士がホスホ
ジエステル結合で連結する
ことにより、繊維状のDNAが 形成される。3 5
リン酸基
五炭糖 塩基
3 5
3 5
OH水酸基 P
ホスホジエステル 結合 ホスホジエステル 結合
DNAの構造-1
3 5
リン酸基
五炭糖 塩基
3 5
3 5
OH 水酸基 P
ホスホジエステル 結合 ホスホジエステル 結合
鎖状につながった DNAには、頭としっ ぽがあるよ。
直鎖状DNAの5ʼ末端にはリン
酸基が突き出ており、3ʼ末
端には水酸基が突き出ている。p398図34-2
B型DNAの二重らせん構造モデル
右巻(時計回り)
1回転は10塩基対3.4nm 幅2nm
DNAの長さ
ヌクレオチドの間隔は3.4Åで、らせん1回転は 34Å(10ヌクレオチド)に相当する。
ヒト:6x109bp
遺伝子数:数万~十万?
大腸菌K12:4.6x106bp 遺伝子数:約4千6百
1bp=0.34nm(3.4Å)
=3.4x10-7mm
DNAの構造-2
細胞内のDNAは、基本的に二重らせん構造であ る。
DNAの塩基対
塩基間(アデニンとチミン、グアニンとシトシ ン)の水素結合によりDNAの二重らせん構造が形 成される。
p398図34-3塩基間の水素結合モデル
AT間は2つ CG間は3つ
重要キーワード DNAの融解温度(Tm) ハイブリダイゼーション DNA分子の溝
弛緩と超らせん
水素結合
水素結合は分子間力の一種で、ファンデルワー ルス力より強く、共有結合やイオン結合より弱 い。
電子を引っ張る力の強い原子と水素が結合して いるところへ、電子を引っ張る力の弱い原子が 近づくと水素結合ができる。
DNAの構造-2
DNA複製やRNAの転写など、必要に応じて二重ら せん構造がほどけて一本鎖構造に変化する。こ の構造変化は可逆的である。
DNAの二重らせん構造をほどく装置(DNAヘリカー ゼ)が存在する。
DNAの構造-3
?
Q.2本鎖構造(二重らせん構造)のDNAについて、
DNA鎖同士はどのような方向で並ぶのか?
5ʼ 5ʼ
3ʼ 3ʼ
5ʼ
3ʼ 5ʼ
3ʼ
5ʼ
3ʼ 5ʼ 3ʼ 1,同一方向 2,反対方向
DNAの構造-3
5'末端のりん酸基
3'末端の水酸基OH P
P OH
5' 3'
水素結合
DNA鎖には方向性が
あり(5ʻ末端と
3ʼ末端)、DNAの二
本鎖は塩基間の水
素結合を介して逆
平行で向かい合う。
DNAの長さ
Q.ヒトのDNAは約6x109bp(6百億塩基対)で構成さ れています。このDNAをまっすぐに伸ばした 場合、どのくらいの長さになるでしょう?
A.
1.約2μm(マイクロメートル) 2.約2mm(ミリメートル) 3.約2cm(センチメートル) 4.約2m(メートル) 5.約2km(キロメートル) 細胞の長さに対
して、DNAは約 100万倍の長さに なります!
細胞内のDNA
細胞内のDNAは通常、凝集した状態で存在する。
生化学ⅢSBO-2 RNAの構造について説明できる
5ʼ
3ʼ
SBO-2課題(予習&復習)
RNAの構造に関連する基本的な用語の意味について確認 し、ノートにまとめること。
RNA、リボヌクレオチド、RNAの構造
SBO-2小テスト-1
RNAは基本的に1本鎖の分子として存在するが、相補的 な塩基配列の間で水素結合を形成し、部分的に2本鎖 構造をとる場合がある。
Yes No
生化学ⅢSBO-3
DNA鎖とRNA鎖の類似点と相違点を説明できる
SBO-3課題(予習&復習)
DNA鎖とRNA鎖の基本的な類似点と相違点について確認 し、ノートにまとめること。
ヌクレオチド、塩基、ホスフォジエステル結合、
水素結合、安定性、化学修飾(メチル化、修飾塩 基)
SBO-3小テスト-1
DNA鎖とRNA鎖の性質は基本的に類似しているが、それ らを構成する糖の種類と、一部の塩基の種類が異なる。
Yes No
1.deoxyribonucleicacid(DNA)
デオキシリボ核酸 2.ribonucleicacid(RNA) リボ核酸
DNAとRNA
Q.次の単語を日本語で表しなさい。
サン
「デオキシ」
の意味がワカルカナ?
「リボ」はリボース(糖)を表す
OH
H HOCH
2H H
OH OH
リボースとデオキシリボース リボースとデオキシリボースの違いは、2位の 炭素の水酸基の有無である。
O C H
C C
C
ribose 1
3 2 4
5
OH
H HOCH
2H H
H OH
O C H
C C
C
deoxyribose 1
3 2 4
5
核酸の種類
DNA
RNA
デオキシリボース
リボース
アデニン(A)、シトシン(C)、
グアニン(G)、チミン (T) アデニン(A)、シトシン(C)、
グアニン(G)、ウラシル(U)
核酸 糖 塩基
一部の構成塩基が異なる
プリン塩基 ピリミジン塩基
核酸の種類
プリン塩基とピリミジン塩基がある
プリン塩基 ピリミジン塩基
アデニン(DNAとRNA) グアニン(DNAとRNA)
シトシン(DNAとRNA) チミン (DNAのみ) ウラシル(RNAのみ)
核酸の種類
DNAとRNAは高次構造が異なる
カク サン
コウジコウゾウ!
え、それって何?
核酸の種類
DNAとRNAは高次構造が異なる
カク
1次元(線)
2次元(平面)
3次元(立体)
DNAとRNAの高次構造の違い
通常、細胞内のDNAは二本鎖の分子として存在し、
RNAは一本鎖または二本鎖の分子として存在する。
RNAにはrRNA,tRNA,mRNAの他、様々な働きを持つものが 知られている。DNA鎖より短く二重らせん構造は希。
核酸の種類
DNAとRNAの違いは、糖(リボースorデオキシリ ボース)、構成塩基の種類、高次構造である。
カク サン
2本鎖分子 1本鎖分子
DNAとRNAの構造-2
カク サン
バランス悪いなー 安定!
苦しそうだね
2本鎖構造(二重らせん構造)のDNAは、1本鎖構 造のDNAより安定である。
核酸の修飾
DNA メチル化
RNA
mRNAのキャップ構造(5ʼ末端側)とポリAテール(3ʼ末 端側)、スプライシング
tRNAのアミノアシル化、メチル化、シュードウリジン (Ψ)など
rRNAのメチル化
サン 修飾も違うよ