脱離酵素
第4群
ブドウ糖 (glucose) ↓
ヘキソキナーゼグルコースー6ーリン酸 (glucose 6-phosphate) ↓
グルコースー6ーリン酸イソメラーゼフルクトースー6ーリン酸 (fructose 6-phosphate) ↓
6ーホスホフルクトー1ーキナーゼフルクトースー1、6ービスリン酸 (fructose 1,6-bisphosphate, FBP)
↓
アルドラーゼ↓ ↓
グリセルアルデヒドー3ーリン酸 + ジヒドロキシアセトンリン酸
(glyceraldehyde 3-phosphate) (dihydroxyacetone phosphate)
↓ ↑ ↓
トリオースリン酸イソメラーゼ↓
グリセルアルデヒドー3ーリン酸デヒドロゲナーゼ1、3ービスホスホグリセリン酸 (1,3-bisphosphoglycerate)
1、3ービスホスホグリセリン酸 (1,3-bisphosphoglycerate) ↓
ホスホグリセリン酸キナーゼ3ーホスホグリセリン酸 (3-phosphoglycerate) ↓
ホスホグリセリン酸ムターゼ2ーホスホグリセリン酸 (2-phosphoglycerate) ↓
エノラーゼホスホエノールピルビン酸 (phosphoenol pyruvic acid) ↓
ピルビン酸キナーゼピルビン酸 (pyruvic acid) → 乳酸 (lactic acid) ↓
ピルビン酸デヒドロゲナーゼアセチル補酵素A (acetyl CoA) ↓
TCA回路 TCA: TriCarboxylic Acid = クエン酸 (citric acid)
大事な化合物(1)
R
CH 2 C R'
OH C O
H
R C CH 2
OH
aldol = aldehyde + ol enol
aldol開裂とaldol付加
Aldol付加
R'
H O
R C CH
2O R
C CH
2O
H
2O
R C CH
3O
enolate
OH
aldol開裂
R C CH
2R' O
OH H
OH H
2O R C CH
2R' O
O H
R'
H O
R C CH
2O
R C CH
2O
enolate
H 2 O OH
R C CH 3
O
アルドラーゼ
1
2
3
4 5
Tyr
H2O
C
CH2OPO3H2
Hpro-S HO Hpro-R
O CH2OPO3H2
C
CH2OPO3H2 O H HO
H O H
H OH NH2
Lys
H2O
C C H HO
CH2OPO3H2
H CH2OPO3H2
C
CH2OPO3H2 H HO
H O H
H OH O
Schiff base
free enzyme O
O
O fructose
1,6-bisphosphate
NH2 Lys
NH
C C
CH2OPO3H2
H O
OH H
NH
NH CH2OPO3H2
H2C C O OH
glyceraldehyde 3-phosphate
dihydroxyacetone phosphate
H
2O
CH
2OPO
3H
2C
CH
2OPO
3H
2H
HO
H O H
H OH O
Schiff base
N H
Tyr CH
2OPO
3H
2C
CH
2OPO
3H
2O
H HO
H O H
H OH NH
2Lys
free enzyme O
O
fructose
1,6-bisphosphate
NH
25 Lys
1
2
(5→)1→2
C C H HO
CH
2OPO
3H
2H O C
C
CH
2OPO
3H
2H O
OH H
N H
glyceraldehyde 3-phosphate
CH
2OPO
3H
2C
CH
2OPO
3H
2H
HO
H O H
H OH O
Schiff base
N H
2→3
2
3
++33HH22 CC)) ((((11++NN)) ++33HH22 CC)) ((((11++NN))
C C H HO
CH 2 OPO 3 H 2
H O N H
3→4
3
4
C
CH 2 OPO 3 H 2
Hpro-S
HO Hpro-R
O
N H
C
CH
2OPO
3H
2Hpro-S HO Hpro-R
N H
2 1
4 3 1
4 2 3 1
3 2 4
1
3 2 4
1
3 1 4
1 1
4 3 1
4 1 3 1
3 1 4
1
3 1 4
1 1
3 4 1
4 1 3 1
3 1 4
proRとproS
優先順位 4>3>2>1
優先順位(上)と仮定
優先順位(上)と仮定
4,3,1は...
反時計回り S配置
proR
proS
4,3,1は...
時計回り R配置
4→5
4 5
Tyr
H
2O
C
CH
2OPO
3H
2Hpro-S HO Hpro-R
O free enzyme O
NH
2Lys
N H CH
2OPO
3H
2H
2C C O
OH
dihydroxyacetone phosphate大事な化合物(2)
N S R Me
R' H
H 2
C O P
O
OH
O H TPP(thiamin pyrophosphate)
C H 2 H 2 N
N
N Me
2
2 R=
R'=
ピルビン酸デカルボキシラーゼ 1
2
3
4
C O
C Me O
OH N
S R
Me
R'
H
N S
Me R
R'
H TPHPH
2TPP(ylide type)
pyruvic acid
このHは外れ易い
H