ファイルフォーマット 2

放射光施設で測定したデータは、付属のデータ変換にて変換を行うことで、EXAFS解析やXANES解析で読み込むことができます。本ソフトウェアがサポートしていない放射光施設のデータを解析する場合や、何らかの理由で変換ができない場合は、以下のフォーマットに従い*.ex3ファイルを作成してください。

[EX_DATA]

*EX_SAMPLE=

*EX_COMMENT=

*EX_GONIO=

*EX_ATTACHIMENT=

*EX_TARGET=

*EX_FILAMENT=

*EX_MEASURE=

*EX_ATOM=Cu

*EX_EDGE=K

*EX_I0_DETECTOR=

*EX_I_DETECTOR=

*EX_CRYSTAL=

*EX_2D=

*EX_KV=

*EX_MA=

*EX_SLIT_DS=

*EX_SLIT_RS=

*EX_SLIT_H=

*EX_AREA1=

*EX_AREA2=

*EX_AREA3=

*EX_AREA4=

*EX_AREA5=

[EX_BEGIN]

8627.2823 0.7928281 8633.4562 0.788423 ：： 10393.260 0.7130675 10400.224 0.7085426 [EX_END]

＊注意

・“*EX_ATOM=Cu”には吸収元素名を入力します（必須）。

・“*EX_EDGE=K” には吸収端種（KまたはL）を入力します（必須）。

・[EX_BEGIN] から[EX_END]の間に、エネルギー、吸光度をタブ区切りで入力します。エネルギーの値は、必ず、

上から下に向かって増加するように入力してください。値の大小関係が逆転（または、同じ値が入る）すると、読み込みに失敗する場合があります。

・その他の項目は特に入力しなくても問題ありません。

MJ13242B

AppendixIV FEFFnnnn.dat からχ(k)を計算するには

FEFFnnnn.datに保存される値は、k、real[2*phc]、mag[feff]、phase[feff]、red factor、lambda、real[p]@# の７つです、これらを用いてχ(k)を計算するにはどうすれば良いかを、下に記します。

まず、XAFSの基本公式

∑ ⁻ ⁺ ⁺ ⁻

ℜ

=

shells

c eff

eff

r kR k

kR S NF

k ) exp( 2 / ) sin( 2 ) exp( 2 )

(

₀² ₂

λ φ φ

σ

χ

は、以下の4つの式に分解することが出来ます。

∑

=

i i

k k ) ( )

( χ

χ

)) ( 2

sin(

) ( )

( k A

k kR

_i _i

k

δ

χ = ⋅ +

2 2

/ )) /

( 2 exp(

) , ( )

( k N

f

k

k R

kR

A = ⋅ π ⋅ − σ + λ

π δ

δ

δ ( k ) =

( k ) +

( k ) −

FEFFnnnn.datからχ(k)を計算するには、

) (k

A

= (mag[feff])*(red factor)*exp(-2R/(lambda))

)

(k

δ

= real[2*phc] + phase[feff]

とします。ただ、red factorとlambdaは、解析プログラムでフィッティングパラメータとして持っている場合がありますので、これらを組み込んでを導いた場合は、フィッティングのパラメータ設定に注意する場合があります。FEFFnnnn.datでは、ディスクスペースを節約するために、かなり間引いた値が保存されていますので、そのままプロットすると、カクカクしたグラフとなってしまいます。データを補間して計算するか、FEFFのオプションでchipNNNN.datを出力した方が、滑らかなグラフが得られます。

)

(k

A

AppendixV FEFF 計算における EXAFS/XANES カードの影響

FEFF計算においてXANESカードとEXAFSカードが、計算結果に与える影響について比較しました。計算に用いたFEFF.inpファイルは、章末にある物です。

0.00E+00 2.00E-01 4.00E-01 6.00E-01 8.00E-01 1.00E+00 1.20E+00 1.40E+00 1.60E+00

8800 9000 9200 9400 9600 9800 10000 10200 10400 10600

Energy (eV)

Absorbance

EXAFS and XANES XANES only EXAFS only

0.00E+00 2.00E-01 4.00E-01 6.00E-01 8.00E-01 1.00E+00 1.20E+00 1.40E+00 1.60E+00

8950 8960 8970 8980 8990 9000 9010 9020 9030 9040 9050

Energy (eV)

Absorbance

EXAFS and XANES XANES only EXAFS only

MJ13242B

EXAFSカードとXANESカードを両方入れて計算した結果と、XANESカードのみで計算したxmu.datと

chi.datは、完全に一致します。EXAFSカードのみ有効にして計算した結果は、これらとは異なります。相違

点は、EXAFSカードのみでの計算は、E0より低エネルギー側の計算結果が無い点と、バックグラウンド（mu0:

continuum）の形状が違う点です。EXAFSカードを入れた場合のmu0は、長い周期でうねっていることから、

Atomic backgroundを考慮しているのではないかと思われます。chi.datに関しては、E0より低波数側のデータ

が無い点は、xmu.datと同じですが、それ以外のデータは、全領域において、ほぼ一致します（EXAFSカードのみの計算では、低波数領域における振幅が、若干大きい。サンプリング間隔は、どちらも同じ。）。

-2.00E+00 -1.50E+00 -1.00E+00 -5.00E-01 0.00E+00 5.00E-01 1.00E+00

-5 0 5 10 15 20

Wave Number

EXAFS and XANES XANES only EXAFS only

0.00E+00 2.00E-01 4.00E-01 6.00E-01 8.00E-01 1.00E+00 1.20E+00

8800 9000 9200 9400 9600 9800 10000 10200 10400 10600

Energy (eV)

EXAFS and XANES XANES only EXAFS only

mu0の比較

---

* This feff.inp file generated by ATOMS, version 2.50 * ATOMS written by and copyright (c) Bruce Ravel, 1992-1999 * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- *

* total mu = 2545.2 cm^-1, delta mu = 2201.6 cm^-1 * specific gravity = 8.934, cluster contains 79 atoms.

* -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- *

* mcmaster corrections: 0.00052 ang^2 and 0.514E-06 ang^4 * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- * -- *

TITLE Cu

EDGE K S02 1.0

* pot xsph fms paths genfmt ff2chi CONTROL 1 1 1 1 1 1 PRINT 1 0 0 0 0 3

* r_scf [ l_scf n_scf ca ] *SCF 5.62362 0 15 0.1

* ixc [ Vr Vi ] EXCHANGE 0 0 0

EXAFS 20 RPATH 11.24724

* kmax [ delta_k delta_e ] *XANES 4.00 0.07 0.50 * r_fms [ l_fms ]

*FMS 5.62362 ********

*RPATH 0.10000

* emin emax resolution *LDOS -20 20 0.1

POTENTIALS

* ipot z [ label l_scmt l_fms stoichiometry ] 0 29 Cu -1 -1 0 1 29 Cu -1 -1 1

*NLEG 8

*CRITERIA 4.00 2.50 *DEBYE 300.00 340.00 SIG2 0.00360

*CORRECTION 3.00 1.00 ATOMS

0.00000 0.00000 0.00000 0 Cu1 0.00000

0.00000 -1.80750 1.80750 1 Cu1 2.55619

1.80750 0.00000 1.80750 1 Cu1 2.55619

1.80750 1.80750 0.00000 1 Cu1 2.55619

MJ13242B

1.80750 0.00000 -1.80750 1 Cu1 2.55619

0.00000 1.80750 -1.80750 1 Cu1 2.55619

-1.80750 1.80750 0.00000 1 Cu1 2.55619

0.00000 -1.80750 -1.80750 1 Cu1 2.55619

0.00000 1.80750 1.80750 1 Cu1 2.55619

-1.80750 0.00000 -1.80750 1 Cu1 2.55619

1.80750 -1.80750 0.00000 1 Cu1 2.55619

-1.80750 0.00000 1.80750 1 Cu1 2.55619

-1.80750 -1.80750 0.00000 1 Cu1 2.55619

3.61500 0.00000 0.00000 1 Cu1 3.61500

0.00000 3.61500 0.00000 1 Cu1 3.61500

-3.61500 0.00000 0.00000 1 Cu1 3.61500

0.00000 0.00000 3.61500 1 Cu1 3.61500

0.00000 0.00000 -3.61500 1 Cu1 3.61500

0.00000 -3.61500 0.00000 1 Cu1 3.61500

1.80750 1.80750 3.61500 1 Cu1 4.42745

1.80750 3.61500 1.80750 1 Cu1 4.42745

-1.80750 3.61500 -1.80750 1 Cu1 4.42745

-1.80750 -3.61500 1.80750 1 Cu1 4.42745

-1.80750 1.80750 3.61500 1 Cu1 4.42745

-1.80750 -1.80750 3.61500 1 Cu1 4.42745

-1.80750 -1.80750 -3.61500 1 Cu1 4.42745

-1.80750 3.61500 1.80750 1 Cu1 4.42745

-3.61500 -1.80750 -1.80750 1 Cu1 4.42745

3.61500 -1.80750 1.80750 1 Cu1 4.42745

-3.61500 -1.80750 1.80750 1 Cu1 4.42745

1.80750 -1.80750 -3.61500 1 Cu1 4.42745

-3.61500 1.80750 1.80750 1 Cu1 4.42745

1.80750 -3.61500 1.80750 1 Cu1 4.42745

-3.61500 1.80750 -1.80750 1 Cu1 4.42745

3.61500 1.80750 1.80750 1 Cu1 4.42745

1.80750 -3.61500 -1.80750 1 Cu1 4.42745

3.61500 1.80750 -1.80750 1 Cu1 4.42745

3.61500 -1.80750 -1.80750 1 Cu1 4.42745

-1.80750 1.80750 -3.61500 1 Cu1 4.42745

-1.80750 -3.61500 -1.80750 1 Cu1 4.42745

1.80750 -1.80750 3.61500 1 Cu1 4.42745

1.80750 1.80750 -3.61500 1 Cu1 4.42745

1.80750 3.61500 -1.80750 1 Cu1 4.42745

0.00000 3.61500 -3.61500 1 Cu1 5.11238

-3.61500 3.61500 0.00000 1 Cu1 5.11238

-3.61500 0.00000 3.61500 1 Cu1 5.11238

0.00000 -3.61500 3.61500 1 Cu1 5.11238

3.61500 0.00000 3.61500 1 Cu1 5.11238

-3.61500 -3.61500 0.00000 1 Cu1 5.11238

3.61500 0.00000 -3.61500 1 Cu1 5.11238

0.00000 -3.61500 -3.61500 1 Cu1 5.11238

3.61500 -3.61500 0.00000 1 Cu1 5.11238

0.00000 3.61500 3.61500 1 Cu1 5.11238

3.61500 3.61500 0.00000 1 Cu1 5.11238

-3.61500 0.00000 -3.61500 1 Cu1 5.11238

-5.42250 -1.80750 0.00000 1 Cu1 5.71582

0.00000 5.42250 1.80750 1 Cu1 5.71582

0.00000 1.80750 -5.42250 1 Cu1 5.71582

-1.80750 -5.42250 0.00000 1 Cu1 5.71582

5.42250 -1.80750 0.00000 1 Cu1 5.71582

-5.42250 1.80750 0.00000 1 Cu1 5.71582

-5.42250 0.00000 1.80750 1 Cu1 5.71582

-1.80750 5.42250 0.00000 1 Cu1 5.71582

0.00000 -1.80750 5.42250 1 Cu1 5.71582

1.80750 5.42250 0.00000 1 Cu1 5.71582

5.42250 0.00000 1.80750 1 Cu1 5.71582

ドキュメント内 Cat (ページ 104-110)

ファイルフォーマット 2

AppendixIV FEFFnnnn.dat からχ(k)を計算するには

∑ − + + −

ℜ

=

r kR k

kR S NF

k ) exp( 2 / ) sin( 2 ) exp( 2 )

(

λ φ φ

σ

χ

∑

=

k k ) ( )

( χ

χ

)) ( 2

sin(

) ( )

( k A

k kR

k

δ

χ = ⋅ +

/ )) /

( 2 exp(

) , ( )

( k N

f

k

k R

kR

A = ⋅ π ⋅ − σ + λ

π δ

δ

δ ( k ) =

( k ) +

( k ) −

) (k

A

)

(k

δ

)

(k

A

AppendixV FEFF 計算における EXAFS/XANES カードの影響

∑ ⁻ ⁺ ⁺ ⁻