MiSeq Reporterによるデータ解析
MATLAB®によるビッグデータ解析
... Hive ™ : Facebookによって開発されたデータウェアハウス Pig ™ : Yahoo!によって開発されたデータフロー言語および実行環境 HBase ™ : GoogleのBigtableを参考にした列指向の分散データベース Cassandra ™ : Facebookによって開発された列指向の分散データベース ...
26
統計的データ解析
... ただし、もともとのデータ数が小さい場合は適用付加。。。 最尤法の直接利用 複雑なモンテカルロ計算が必要になるような場合（例：K中 間子の寿命測定）も最尤法の直接利用が効果的 ...
61
R Commanderを用いたデータ解析
... データの読み込み 要約統計量 分割表の作成 ロジスティック回帰モデルによるオッズ比の推定 結果の保存 使用するデータについて • Matsuyama Y, et al. Second cancers after adjuvant tamoxifen therapy for breast cancer in Japan. Ann Oncol. 2000; 11: 1537–1543. ...
82
Deep Learning によるビッグデータ解析 ~ 手法や CUDA による高速化 2014 年 9 月 5 日 G-DEP ソリューションパートナー株式会社システム計画研究所奥村義和
... 目次 •DeepLearningとGPU •DeepLearningとは •仕組みと計算 •初期化の1手法：Layer-wise Pretraining •SAEによる次元圧縮例 •G-DEPテストドライブ •ビッグデータ・GPU・DeepLearningの接点.. 苦労話など… •ハイパーパラメタは試行錯誤 •層の数、非線形関数の種類、 学習係数、[r] ...
38
RTKLIBによる解析
... 測位衛星システムの3文字（1文字）略号：GPS (G), GLO(R), GAL(E), QZS(J), SBS(S), BDS(C), IRN(I) 電波が通過する層：Ionosphere（電離層）, Troposphere（対流圏）。層の状態により伝搬遅延（誤差）が生じる エポック・サイクル：取得する測位衛星システムのデータの単位（頻度と同じ） ...
71
NGSデータ解析入門Webセミナー
... Differential Expression for RNA-Seq 発現量データを用いて、サンプル間の発現変動遺伝子 解析を行うためのツール サンプル間の発現変動を示すFold ChangeとP値が 計算され、発現変動遺伝子のフィルタリングやボルケー ノプロットによる表示が可能 ...
30
心理データ解析演習（前半）藤野
... １ −５−１. fMRI − 脳機能統合研究 脳機能局在研究 → 脳機能統合研究 （田邊 ,2009） Fox & Greisius (2010) ◯主な実験デザイン：特に何も考えずにリラックスした状態の脳活動を測定 ―信号変化の相関による脳部位の機能的結合性を捉える ...
29
データ解析実習マニュアル
... 配列に データを保存します。保存するデータは、ポート７の入力値とディップスイッチ値となります。 152 行で次回の保存に備えて、配列の添字（[]の中の数字）である、saveIndex 変数を＋１しておきます。 153 行で配列の上限に達していないかチェック、上限になったなら saveFlag を 0 にして、保存を止めます。 saveData は下図のようなイメージです。SAVE_SIZE は 1000 ...
105
Rによるデータ解析入門
... Internet に接続しており、利用しているパソコンのみにパッケージをインストールすることを考える *5 。メニューの “ パッケージ とデータ ” から “ パッケージインストーラ ” を選択し、 “ 一覧を取得 ” をクリックし、ミラーサーバーとして、筑波大学 ...
12
天文データ解析概論
... （補足）データ”処理”とデータ”解析” よく使う言葉だが、境界はあいまい。人によって違う。 ※ここでは（馬渡式） ・（一次）処理・・・観測生データからいろいろなノイズを取り除き、すぐ物理量 を取り出せるデータにする作業 ...
61
HOKUGA: 経営科学とOR のためのWeb プログラミングによる需要予測の時系列データ解析
... ⚓．Web プログラミングによる 需要予測の時系列データ解析 3.1 HTML5 の Canvas と JavaScript Web ページ上でグラフを作成するには， HTML5 から導入された Canvas 要素を用 い，JavaScript と連動することにより，線や 円 を 描 く こ と が で き る。Canvas 要 素 は， Safari，Opera，Firefox ...
16
データ解析チュートリアル
... 第24回天文情報処理研究会「天文学データ解析における誤差--その2--」 (1995) 第26回天文情報処理研究会「天文教育と情報処理」 (1996) 第27回天文情報処理研究会「CCDによる観測方法/データ処理方法徹底解剖」 (1996) 第29回天文情報処理研究会「データベースとネットワーク」 (1997) ...
5
目次 生命科学系の研究分野において主にゲノムデータ解析用の プラットフォームとして使われている Galaxy について オンデマンドクラウド機能を活用して解析環境を提供する 事例をご紹介します 1. データ解析プラットフォーム Galaxy とは 2. Galaxy によるNGSデータ解析について
... gigascience-special-session-at-iscb-asia-on-workflows-cloud-for-reproducible-bioinformatics/ 入力データ データ取得先情報＝公共データベースの登録 IDなど ツール 公開リポジトリで版数付けされたものでコンテナ化 ワークフロー ツールの組み合わせ手順（パイプライン）をGalaxy Workflowとして定義 ...
26
悪い経時データ解析例の解説
... 経時解析のαエラー １）完全帰無仮説の下で，ある基準群に対して，他 の３群とDunnett型の平均値の比較を両側5%の ｔ検定で行うときの，αエラーの確率を求めよ． ２）１）の解析を，５時点について輪切りで検定を行 ...
73
理学療法研究におけるデータ解析の誤り
... う迷信があった。しかし，この判断は間違っている。 データが正規分布するかどうかを判断する方法は様々ある が，今のところもっとも妥当なのはシャピロ・ウイルク検定の 活用である。この検定は 3 例以上のデータに対して，母集団が 正規分布にしたがうか否かを判断できる。シャピロ・ウイルク 検定によってデータが正規分布にしたがわない，とはいえない （p ≧ ...
4
製品開発の現場では 各種のセンサーや測定環境を利用したデータ解析が行われ シミュレーションや動作検証等に役立てられています しかし 日々収集されるデータ量は増加し 解析も複雑化しており データ解析の負荷は徐々に重くなっています 例えば自動車の車両計測データを解析する場合 取得したデータをそのまま解析
... 図4. データの欠損、サンプリング周期の異なる二種類のデータ（左）と、欠損箇所のデータ補間、およびサンプリング周期の同期（リ サンプリング）を行った例（右） 使用するアルゴリズムが決まると、同じ解析や処理を多数のファイルやデータソースに適用するケ ースが、データ解析の現場では多く見受けられます。Parallel Computing ...
6
格子点データの解析 1 月平均全球客観解析データの解析 客観解析データや衛星観測データのような格子点データは バイナリ形式のデータファイルに記録されていることが多いです バイナリ形式のデータファイルは テキスト形式の場合とは異なり 直接中身を見ることができません プログラムを書いてデータを読み出して
... FORTRAN では、READ 文でデータを読みこみます。書式の指定はありませんが、REC=…でレコード番号を 指定します。2011 年 1 月のデータは 385 番目のデータですので、レコード番号は 385 です。C では、fseek 関 数を使ってデータファイル上の所定の位置に移動、つまり 384 個のレコードの分だけ前に移動した後で、fread ...
20
R による統計解析入門
... データフレームに読み込んで大略をつかむ > setwd("C:/R/Mydata") # データファイルのあるパスを指定 > BMI <- read.table("BMIdata.txt",header=TRUE) # データフレームに読 み込み。ヘッダ１行あり ...
23
解析プログラムの提出の可否( マクロの提出可否 仕様書の提出 ) 使用した解析ソフトウエアとそのバージョン 解析実施環境 (2) 電子データ提出を予定する各試験等の情報 ( 統合解析 ) 1 解析目的及び対象に関する情報 2 電子データに関する情報 3 解析実施に関する情報 (3) 電子データ提出を
... ただし、統合解析データの CDISC 準拠に関連した内容が相談事項に含まれる場合には、該当 する項目について可能な限り記載すること。 なお、統合解析に用いたデータセットと、個別の試験の解析で用いたデータセットが異なる 場合は（例えば、データ固定日等） 、適宜、４．の（１）の様式を用いて記載してもよい。 ...
12
時系列ビッグデータの解析と予測
... 自動特徴抽出 実用的な技術やシステムの開発を考えた際，最も重要 である課題が特徴抽出の完全自動化である。例えば，自 己回帰やフーリエ変換，特異値分解をはじめとする従来 の時系列処理技術では，使用する係数の個数や閾値等の パラメータの設定が必要である。しかし，解析するデー タが膨大になるほど，専門のエンジニアによる細やかな パラメータチューニングには時間的，金銭的コストが多 ...
7