LU分解の逐次プログラムを並列化する
連載講座 : 高生産並列言語を使いこなす (5) 分子動力学シミュレーション 田浦健次朗 東京大学大学院情報理工学系研究科, 情報基盤センター 目次 1 問題の定義 17 2 逐次プログラム 分子 ( 粒子 ) セル 系の状態 ステップ 18
... TBB を用いて並列化し, その評価結果について述べた. 三重ループを, OpenMP では parallel for プラグマで, Cilk は直交再帰分割を spawn 構文で, TBB は parallel reduce, parallel for を用いて 小さい変更で並列化し, いずれも 24 コアで 17-19 ...
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講義の流れ 並列プログラムの概要 通常のプログラムと並列プログラムの違い 並列プログラム作成手段と並列計算機の構造 OpenMP による並列プログラム作成 処理を複数コアに分割して並列実行する方法 MPI による並列プログラム作成 ( 午後 ) プロセス間通信による並列処理 処理の分割 + データの
... 他のプロセスが持っているデータを参照するには、通信する MPIルーチンの種類 MPIルーチンの種類 MPIの環境に関するルーチン MPI_Init, MPI_Finalize, MPI_Comm_rank 等 一対一通信 MPI_Send, MPI_Recv, MPI_Isend, MPI_Irecv, MPI_Wait ...
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フローチャートの書き方 プログラムの開始と終わり 処理の流れの表記 ( アルゴリズム ) 逐次型 ( 直線型 ) 分岐型 ( 開始 ) 処理 1 条件 条件 処理 2 の処理 の処理 の処理 ( 終了 ) 処理 3 プログラムや人間の判断などのアルゴリズムは基本的に 逐次型 分岐型 ループ型の組み合
... ・ 100 円玉を 1 枚だけ入れられ る ・商品は 1 つだけ ・商品切れランプは無し ・お金返却ボタンは無し ・つり銭切れランプは無し ・お金を入れて一定時間たっ たら自動的にお金返却は無し ...
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連載講座 : 高生産並列言語を使いこなす (4) ゲーム木探索の並列化 田浦健次朗 東京大学大学院情報理工学系研究科, 情報基盤センター 目次 1 準備 問題の定義 αβ 法 16 2 αβ 法の並列化 概要 Young Brothers Wa
... inlet を定義する構 文は C の関数定義の構文とほぼ同じである. ただしプログラムのトップレベルではなく, それを用 いる Cilk ...inlet を指定することが できるよう, spawn の構文が拡張される. 以下は, spawn f(...) を実行しつつ, ...
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内容に関する質問は まで 第 1 講プログラム高速化の基礎 東京大学情報基盤センター 片桐孝洋 1 座学 並列プログラミング入門 in 金沢
... K（キロ）は１,０００（千）、M（メガ）は１,０００,０００（百万）、G（ギガ）は１,０００,０００,０００ （十億）、 T（テラ）は１,０００,０００,０００,０００（一兆） だから、 一秒間に一兆回の浮動小数点演算の能力がある こと。 PFLOPS（ぺタ・フロップス） ...
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Mode Modylas NAREGI において並列化チューニングを開始 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 において京コンピュータに最適化した並列化チューニングを実施 MODYLAS CMSI MateriApps に登録 論文公刊 Y.Andoh et al., J. Chem
... ✓基本セル各辺の分割数 = 2 k (均等分割, 3 ≤k≤6) 2 k *3 l (不均等分割) ✓分割されたサブセルの一辺長さ > 0.5*カットオフ半径 ✓立方体の基本セル 直方体 ・プロセス数: 2 n (3≤n) 2 n (1≤n) 2 n *3 m (1≤n, 1≤m) ...
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高速度ビデオでの運動解析プログラムの開発 - OpenMP 等を用いた相関計算並列化によるトレース高速化 - 横山直樹 ( 東海大学総合科学技術研究所 ) Development of versatile motion analysis program based on normalized cor
... 3.35 1.56 0.49 Fig.10 ROI size’s effects to traceability 結局矩形のテンプレートを用いる限り、対象部位にちょうど外接するサイズが最適なテンプレ ートということがわかった。しかし内部の均一な部分の計算は省ける可能性がある。そこで主 ...
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コンピュータ将棋と並列化
... • 横山 大作, 田浦 健次朗, 近山 隆. ハッシングに基づく大規模探索問題の耐故障 分散処理手法, 情報処理学会論文誌: プログラミング, Vol. 48, No. SIG4 (PRO 32), pp. 1--13, 2007. • 野澤康文, 横山大作, 近山 隆. 分散ハッシュ表に基づく大規模探索問題の耐故障 並列化手法, 第58回 プログラミング研究発表会, 2006. ...
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ウェルプレートと塩橋を用いた並列の電気分解 研究発表一覧 第４６回関東理科教育研究発表会千葉大会
... ，純水50ｇに塩化カリウム10ｇを溶かした塩 化カリウム水溶液，寒天，ビーカー，駒込ピペット ストローをＵ字に曲げ，熱湯に５秒ほど入れて柔らかくし，熱湯から取出し，水で冷やしてＵ字に固 定する。固定した後，ウェルプレートに合わせて切断する。用意した塩化カリウム水溶液60ｇを加熱し ...
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内容梗概 本論文の目的は モンテカルロシミュレーションを取り入れた囲碁プログラムの作成である 今回は去年同研究室の上野謙二郎氏が作成した囲碁プログラムをベースに その棋力を上げるために候補手の思考部分に改良を加えた 具体的には 候補手のパターン化とモンテカルロ法の並列化である 候補手のパターン化はあ
... ために最初にある程度評価値の高い手を厳選し、その中から最も勝率の良い手を着手する のが理想的である。例として図 16（a）の局面を挙げる。この局面で候補手の作成を行うと、 評価値の高い手は図 16（b）の 12 と書かれた点となる。なぜ 12 ...
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高性能，高生産性を実現する 大規模メモリ・並列処理システムソフトウエアの研究
... クラスタ向けTransactional Memory APIの検討 担当者： 飯田凌大，二間瀬悠希，小林龍之介，川口優樹，津邑公暁（名工大） 赤黒木による評価 K-Meansによる評価 逐次プログラムから の容易な変更で記述可能， ...
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内容 イントロダクション スカラチューニング OpenMPによる並列化 最近のHPC分野の動向 まとめ
... 多重ループの並列化（続き） ● 多重ループでは最外ループを並列化するのが基本。ループ の内側に指示行を入れると、外側ループの回転数分スレッ ドのfork/joinが行われ、オーバーヘッドが大きくなる。 ...
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SGI AltixUV1000 並列化プログラミング講習会
... 環境変数OMP_NUM_THREADSを並列実行数に設定します。 OpenMPのプログラム中でMKLを使う場合、OMP_NUM_THREADSで 設定されたスレッド数で実行されます。また、OpenMPのスレッド数とは 違うスレッド数で実行したい場合はOMP_NUM_THREADS以外に MKL_NUM_THREADSを設定します。 ...
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モデルベース並列化ツールeMBPの紹介
... ◼ Structured Parallel Programming (～ Patterns for Efficient Computation～) • Michael McCool, Arch D. Robinson, James Reinders • ...
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目次 概要.. 3 演習 1: 静的 PARALLEL ヘルパークラスを使用した既存のアルゴリズムの並列化 6 タスク 1 実行時間の長いサービスを並列化する 6 演習 2: 並列タスクの作成と実行. 23 タスク 1 並列タスクを特別な設定なしに実行する 23 タスク 2 Wait() メソッドと
... メモ: 値を取得するには、data.Result プロパテゖを調べます。Result プロパテゖの 呼び出し時にタスクが完了していれば、値がすぐに返されます。完了していなけれ ば、タスクが完了して値を取得できるようになるまで、実行中のコードがブロック されます。上記の例では、Result プロパテゖをすぐに呼び出していますが、これは ...
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MPI または CUDA を用いた将棋評価関数学習プログラムの並列化 2009/06/30
... 表 1がMPIで並列化した反復計算部のソースコードである。 特徴ベクトルに関するループを分割して並列処理している。 表中の赤い部分が並列化のために書き直したところである。10数行の変更で並列化でき る。呼び出す ...
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情報処理学会研究報告 IPSJ SIG Technical Report 並列 FMO プログラム OpenFMO の性能最適化 稲富雄一, 眞木淳, 高見利也, 本田宏明, 小林泰三, 南里豪志, 青柳睦, 南一生 数万 ~ 数 10 万並列での効率的な実行を目指して, 並列フラグメント分子軌道プ
... 関数呼び出しを行うまで，片側通信に対 する要求に応答しない，という片側通信の実装が MPICH2 で行われているためだと考 えられる．例えば，図 9 の経過時間約 ...） の プ ロ セ ス が 片 側 通 信 の 同 期 関 数 で あ る MPI_Win _unlock 関 数 と 後 続 す る MPI_Bcast ...
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Stage 並列プログラミングを習得するためには : 1 計算機リテラシ, プログラミング言語 2 基本的な数値解析 3 実アプリケーション ( 例えば有限要素法, 分子動力学 ) のプログラミング 4 その並列化 という 4 つの段階 (stage) が必要である 本人材育成プログラムでは1~4を
... 2 を使用した。 CW-12 以降では三次元コードの並列版（MPI 使用）についての解説を実施した。時間が限ら れていたので，MPI に関する詳しい解説は省略し，主として並列データ構造，並列前処理アル ゴリズムについて紹介し，あとは実際に T2K オープンスパコンを使った計算を実施した。 ...
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1. 薬物や機能性化合物デザインの基本と環境の変化 2. 多変量解析 / パターン認識に基づく インシリコスクリーニングとインシリコデザインの基本原理 3. 並列創薬 ( 複数特性の同時最適化 ) の提案 4. 並列創薬 と 逐次創薬 の開発成功確率に基づく比較シミュレーション 5. 分類 / 予測
... ・フェーズ２： １６９億円＋（３０３億円： 同上 ）＝ ４７２億円 ＆ 開発期間 ４７２ ・フェーズ３： １６９億円＋（４７２億円： 同上 ）＝ ６４１億円 ＆ 開発期間 ６４１ フェーズ３での開発失敗は、６４１億円 ６４１億円 の投資回収を不可能 投資回収を不可能 とし、開発期間の無駄使い 開発期間の無駄使い 、利益の減少 ...
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並列・高速化を実現するための 高速化サービスの概要と事例紹介
... ▌ このようなお客様におススメ！ 1. 自社解析プログラムの高速化効果が知りたい 2. 自社解析プログラムの実行時間に不満がある 3. 自社解析プログラムの並列化アドバイスがもらいたい 4. 自社で並列高速化を実施したいが方法が分からない 5. ...
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