JMPの解析機能の活用
3次元可視化解析機能と 市民サイエンスデータの利活用
... 3次元可視化解析アプリケーション • 衛星プロダクツや再解析データの3次元データを処理し て仮想空間に表示するWebベースの可視化システム • 衛星プロダクツのための任意鉛直断面可視化 ...
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目次 生命科学系の研究分野において主にゲノムデータ解析用の プラットフォームとして使われている Galaxy について オンデマンドクラウド機能を活用して解析環境を提供する 事例をご紹介します 1. データ解析プラットフォーム Galaxy とは 2. Galaxy によるNGSデータ解析について
... 2. 自分の環境にGalaxyをインストールして利用 専用サーバを用意する。一般的な LinuxやmacOSが搭載されたマシン であればインストールはそれほど難しくない。 • インターネットにアップロードできないデータを解析したい ...
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小細胞肺がんにおけるTGF-βシグナルの機能解析
... TβRII の機能喪失が起こることが知られている。小細胞肺がん細胞では TGFBR2 の発現 が低下しているが、そのメカニズムについては充分に理解されていない。これまでの小細 胞肺がんに関する報告では、TGFBR2 における変異については、否定的な所見が見られる。 このことから、小細胞肺がんにおける TGFBR2 の発現低下には、別のメカニズムによる転 ...
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SNSを活用した観光経営情報の形態素解析
... われる投稿を機械的に除外するなど、一定のバイアス のもとでの解析結果である点は本研究の制約条件であ る。よって、本稿で示した結果をもって地域の観光活 性をペイシミックにとらえたり、施策に否定的な立場 をとるものではないことを改めて付しておきたい。 敷衍して、「燕三条」という語そのものを検証して ...
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骨格筋発生分化における転写因子Lhx2の機能解析
... 作用があると想定し、 Lhx2 過剰発現時に変動している遺伝子をマイクロアレイ解析によっ て探索した。すると、パスウェイ解析の結果、 Tgfβ ファミリー遺伝子群の発現レベルが増 加していることがわかった。先行研究において、 Tgfβ は筋分化を抑制していることが報告 されているため、 Msx 遺伝子の他に Tgfβ ファミリー遺伝子を介した筋分化抑制作用があ ...
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リボソームアッセンブリーにおけるrRNAメチル化修飾の機能解析
... tRNA の CCA 末端と相互作用する場所であり、タンパク質合成反応に おいても重要な役割を担う。45S は H92 の配置が成熟した 50S とは異なるため、翻訳能を持たないと考えられる。 実際、45S は 30S と会合できないことが知られている。したがって、50S の後期アッセンブリーにおいて、Um2552 修飾形成に伴う H92 ...
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目次 1. SAR 画像の活用 被害状況把握の手法 衛星 SAR 画像の浸水対応への活用 衛星 SAR 画像の活用の流れ 2. 浸水解析 判読 解析 判読可能規模 後方散乱強度 一時期単偏波 単画像からのポリゴンデータ 後方散乱強度 二時期カラー合成 SAR 浸水解析の留意事項 ( 水田 都市部 )
... 高い建物が、衛星から近い距離にあると 判断され、倒れて見える現象 レイオーバー、レーダシャドーの事例 ・ SAR画像は、観測手法の特性上、以下のような現象が発生するので注意が必要 ...
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小脳プルキンエ細胞におけるmTORシグナルの機能解析
... 4. 3, 4, 6, 12 週齢における L7-mTOR Tg マウスのプルキンエ細胞数の経時的変化を 定量したところ、Control マウスと比較して、3 週齢から有意にその数が減少している ことが示された。また、 L7-mTOR Tg マウスのプルキンエ細胞の形態を抗 Calbindin 抗 体による蛍光免疫組織染色を用いて検証したところ、Control ...
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組織・器官形成におけるゼブラフィッシュDdx46 の機能解析
... かし，造血幹細胞の異常を起こす pre-mRNA スプライシングの詳細な機構に関しては，未 だ不明な点が多く残されていた。 Ddx46 は SF2 helicase family に属する RNA ヘリカーゼの一種であり，酵母では pre-mRNA スプライシングに機能する事が報告されていたが，脊椎動物における Ddx46 ...
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ヒトの上肢運動に関連した脊髄固有ニューロンの機能解析
... である。 今回，我々は組み合わせ刺激の両刺激強度を系統的に変 え，促通が観察できる条件を検証した。その結果，どの被 験者でも空間的促通が観察された（Fig. 5）。しかしこの効 果は刺激強度に依存しており，最適刺激強度より弱くても 強くても促通が見られなくなった（Fig. 4）。この刺激強度 を上げても促通効果が見られなくなる事は，上述の feed- forward ...
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ポスト・ゲノム関連技術 蛋白質レベルでの解析とIT活用
... 2000年 2010年 2020年 機器・ Ｉ Ｔ 医薬品分野 農畜水産・ 食品 化学品 単 位； 億 円 2000年 2010年 2020年 2000年 2010年 2020年 ゲノム 創薬 0 9, 800 53, 600 0 45, 800 324, 500 遺伝子治療 40 2, 800 26, 600 480 25, 000 174, 000 遺伝子診断 20 1, 000 7, 200 80 10, 000 44, 200 ...
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共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... • すでに前研究でUniprotを利用しタンパク質構造情報の冗長化は 行っているので、それをドメイン・モチーフにも適応させる。 タンパク質構造の冗長化 問題点： モチーフの位置が微妙にずれることがある。 ...
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脳の発生、発達、病態におけるスフィンゴ糖脂質の機能解析研究
... は髄鞘形成細胞であるオリゴデンドログリア、シュワン細胞に特異的に発現し、髄鞘 の主要な構成脂質であるガラクトシルセラミドを主要な基質とする。クラッベ病患者で は、中枢および末梢神経系において進行性の脱髄が起こり、患者の多くは生後数ヶ 月で神経症状を発症し、2歳までに死にいたる。骨髄あるいは臍帯血移植が酵素補 ...
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遺伝子発現の転写後調節におけるPbp1の機能解析
... 域に結合するのか検討した。 Pbp1 は RNA 結合ドメイン Lsm および Lsm AD、C 末端領域に self-interacting region を持ち（Ralser et al., 2005; Mangus et al., 1998; Takahara et al., 2012）。Pbp1 を様々な長さにデザインしたフラグメントを構築し、 two-hybrid アッセイを用いて Rpl12a および ...
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粘膜免疫におけるFcα/μ受容体の機能解析
... IgD の 5 種類に分類される。免疫細胞上には 抗体の Fc 部分に対する受容体である Fc 受容体が発現しており、抗原複合体を形成した抗体との 結合の結果、様々な免疫応答を誘導することが知られている。これまでに複数の Fc 受容体が同定 され、貪食、細胞障害活性には IgG を介した反応が、アレルギ一反応には IgE を介した反応が必 ...
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脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析 [全文の要約]
... 制することにより、動脈硬化形成の過程で重要な役割を果たす。我々の以前の報告、および今回 の検討に先んじて行った検討では、M1 マクロファージの浸潤が顕著であったプラーク内には PLIN2 の発現が著明であるのに対し、M2 マクロファージの比率が高いプラーク内には PLIN1 の発 ...
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共起関係解析によるタンパク質の機能モジュール探索法の開発
... • 今回はタンパク質構造（ PDB）を情報を結びつけるための媒体とし て活用した。それにより、情報を 3次元の構造中に表すことにより 有機的に結び付けることができた。 これまで作られてきた統合データベースの新たな 活用法について ...
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ミクログリアにおけるMafBの機能解析
... 遺伝子欠損ミクログリアは、RhoA の過剰な活 性化を介して、円形の細胞形態を示した。以上の実験結果によって、著者らは、 MafB がミクログリアにおける GM-CSF シグナリングの負の制御因子であるこ とを明らかにした。本研究は、ミクログリアの GM-CSF ...
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目次 1 SAP2000 概要 SAP2000 基本解析機能 SAP2000 の解析モデル要素機能 材料特性 ジョイント フレーム要素 シェル要素 平面 / 軸対称 / ソリッド要素
... 周期解析では、周期的な外力荷重として機械振動のような調和振動波形（SIN、COS 波）や、 風荷重や波浪荷重のような定常振動波形 （調和振動波形でなくてもかまいません）を与え、 モード重ね合せ法を適用して 1 周期分の線形応答値を計算します。 過渡応答解析では、地震荷重（地動加速度入力）やランダム振動荷重（ = 荷重条件 x 時間 ...
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脂肪滴周囲蛋白Perilipin 1の機能解析
... 去に作製し、報告したものを用いた 23,24 。Plin1Tg は白色脂肪細胞において 2 倍 程度に PLIN1 発現が増大するが、普通食の飼育下においては対照群と比較し、 体重、糖脂質代謝に、有意な差を認めないマウスである。Apolipoprotein E knockout mice (ApoeKO) は Jackson Laboratory より購入した。C57BL/6J は日 ...
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